MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	CTGTGG	2	12	4820	4831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384453060
2	NC_017291	GAGAAA	2	12	8592	8603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
3	NC_017291	AGGAAG	2	12	11322	11333	50 %	0 %	50 %	0 %	384453064
4	NC_017291	AAGAGT	2	12	12925	12936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453064
5	NC_017291	ATAGTT	2	12	13147	13158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384453064
6	NC_017291	AAAAGC	2	12	17202	17213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453067
7	NC_017291	TAAGTG	2	12	29027	29038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453073
8	NC_017291	TGATGT	2	12	34193	34204	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453081
9	NC_017291	TTTTTA	2	12	39397	39408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453085
10	NC_017291	CGATTT	2	12	40267	40278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453087
11	NC_017291	GATAAA	2	12	40418	40429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453087
12	NC_017291	TGCTGG	2	12	44640	44651	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384453092
13	NC_017291	CTTATC	2	12	54352	54363	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453099
14	NC_017291	AAATTT	2	12	55120	55131	50 %	50 %	0 %	0 %	384453100
15	NC_017291	TTGTTC	2	12	61426	61437	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453106
16	NC_017291	TTATGG	2	12	62248	62259	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453106
17	NC_017291	ATTTGG	2	12	62632	62643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453106
18	NC_017291	AAGTTG	2	12	65590	65601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453108
19	NC_017291	TAGGGC	2	12	72925	72936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384453115
20	NC_017291	CCTGAT	2	12	72950	72961	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453115
21	NC_017291	TGTTTC	2	12	75006	75017	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453118
22	NC_017291	CACCTC	2	12	78330	78341	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384453120
23	NC_017291	GCTGAT	2	12	80157	80168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453121
24	NC_017291	TCAAAA	2	12	85890	85901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384453127
25	NC_017291	GATATC	3	18	90712	90729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453130
26	NC_017291	CATTTC	2	12	90943	90954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453130
27	NC_017291	TTGGGG	2	12	91295	91306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453130
28	NC_017291	CTTTTG	2	12	91992	92003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453130
29	NC_017291	ACCACA	2	12	98183	98194	50 %	0 %	0 %	50 %	384453136
30	NC_017291	TGAATA	2	12	102279	102290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453142
31	NC_017291	CTCTTC	2	12	103792	103803	0 %	50 %	0 %	50 %	384453143
32	NC_017291	AAATTA	2	12	107051	107062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453147
33	NC_017291	TAAAGG	2	12	108837	108848	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453149
34	NC_017291	GTAAAG	2	12	112633	112644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453156
35	NC_017291	ATTCCT	2	12	115368	115379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453163
36	NC_017291	TGCATT	2	12	124580	124591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453175
37	NC_017291	TATACT	2	12	124787	124798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453176
38	NC_017291	ATATGA	2	12	127976	127987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453179
39	NC_017291	AGCAAC	2	12	129747	129758	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384453180
40	NC_017291	TTTCTT	2	12	131898	131909	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453182
41	NC_017291	TGATTC	2	12	134344	134355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453183
42	NC_017291	TGTTTT	2	12	145531	145542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453194
43	NC_017291	ATAGGC	2	12	146933	146944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453197
44	NC_017291	AAGTAA	2	12	147815	147826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453199
45	NC_017291	CTCTAT	2	12	152301	152312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453201
46	NC_017291	TGGATT	2	12	160820	160831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453208
47	NC_017291	AAGAGA	2	12	166639	166650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453213
48	NC_017291	TAAAGA	2	12	173144	173155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453220
49	NC_017291	GTTTTT	2	12	173482	173493	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453221
50	NC_017291	TGCTGG	2	12	174177	174188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384453222
51	NC_017291	GATAGA	2	12	174465	174476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453222
52	NC_017291	ACCAAC	2	12	182869	182880	50 %	0 %	0 %	50 %	384453229
53	NC_017291	TCCCTG	2	12	183863	183874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384453230
54	NC_017291	AAGGAG	2	12	188853	188864	50 %	0 %	50 %	0 %	384453235
55	NC_017291	GCCTTG	2	12	190272	190283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453235
56	NC_017291	ACAATC	2	12	194582	194593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384453237
57	NC_017291	CAAAGG	2	12	194713	194724	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453237
58	NC_017291	TGCAGA	2	12	202263	202274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453243
59	NC_017291	AAAGAC	2	12	205393	205404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453246
60	NC_017291	TATTAC	2	12	206395	206406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453248
61	NC_017291	AGGAAA	2	12	207781	207792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453248
62	NC_017291	CAGGAA	2	12	209304	209315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453250
63	NC_017291	TTTTTA	2	12	210486	210497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453252
64	NC_017291	AATGGT	2	12	221547	221558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453261
65	NC_017291	AGTAGA	2	12	222276	222287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453261
66	NC_017291	CAGGAG	2	12	222557	222568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384453261
67	NC_017291	GCCAAC	2	12	226312	226323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384453263
68	NC_017291	AAGACC	2	12	227307	227318	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384453265
69	NC_017291	ATATTT	2	12	228646	228657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453266
70	NC_017291	AATTGA	2	12	230833	230844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453270
71	NC_017291	ATTTTG	2	12	232876	232887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384453272
72	NC_017291	TGCGAA	2	12	235266	235277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453274
73	NC_017291	TAGGAA	2	12	235793	235804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453274
74	NC_017291	TTTCCT	2	12	244836	244847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453282
75	NC_017291	TTTAGG	2	12	245444	245455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453283
76	NC_017291	TAAAAG	2	12	245536	245547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453283
77	NC_017291	GTTAAT	2	12	257067	257078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384453296
78	NC_017291	TTTCAT	2	12	257582	257593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453296
79	NC_017291	GACTTT	2	12	258045	258056	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453297
80	NC_017291	AATTTA	2	12	258666	258677	50 %	50 %	0 %	0 %	384453298
81	NC_017291	GTGTAA	2	12	261435	261446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453299
82	NC_017291	TATTTC	2	12	271274	271285	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453307
83	NC_017291	TGAAAA	2	12	272448	272459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453309
84	NC_017291	TCTAGA	2	12	273369	273380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453310
85	NC_017291	CTGTTT	2	12	275564	275575	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453312
86	NC_017291	TTTTAT	2	12	276264	276275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453312
87	NC_017291	CTAAGT	2	12	279107	279118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453315
88	NC_017291	AGCACG	2	12	284132	284143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453319
89	NC_017291	GGATTA	2	12	290163	290174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453323
90	NC_017291	ATAGAA	2	12	290703	290714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453323
91	NC_017291	GATTTA	2	12	294241	294252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384453325
92	NC_017291	TCTTTT	2	12	294456	294467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453325
93	NC_017291	TTTTTG	2	12	297943	297954	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453326
94	NC_017291	ATTTGT	2	12	300921	300932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384453327
95	NC_017291	TAGGCG	2	12	302570	302581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384453328
96	NC_017291	GGTTAC	2	12	304047	304058	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453328
97	NC_017291	TATATT	2	12	304510	304521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453329
98	NC_017291	GCAATC	2	12	312580	312591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453331
99	NC_017291	GTCTTT	2	12	319965	319976	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453334
100	NC_017291	GTCTTT	2	12	325321	325332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453336
101	NC_017291	ACCAAT	2	12	329096	329107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384453337
102	NC_017291	TGTTGC	2	12	334639	334650	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384453340
103	NC_017291	AGCAAT	2	12	339320	339331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453344
104	NC_017291	TTGACT	2	12	345311	345322	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453350
105	NC_017291	ATGTTC	2	12	347648	347659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453351
106	NC_017291	TATTAA	2	12	349866	349877	50 %	50 %	0 %	0 %	384453354
107	NC_017291	ATGATC	2	12	351494	351505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453354
108	NC_017291	GCTAAA	2	12	352192	352203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453355
109	NC_017291	CCTTTT	2	12	355310	355321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453357
110	NC_017291	CTAAAG	2	12	355782	355793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453357
111	NC_017291	GCTGAT	2	12	361541	361552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453364
112	NC_017291	ATCGGG	2	12	363724	363735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384453365
113	NC_017291	CTAAAT	2	12	365311	365322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453367
114	NC_017291	AATTCC	2	12	366299	366310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453367
115	NC_017291	GAATGT	2	12	369919	369930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453371
116	NC_017291	TCTATG	2	12	377095	377106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453377
117	NC_017291	GTTTTT	2	12	378170	378181	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453378
118	NC_017291	AGAAAA	2	12	378840	378851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384453378
119	NC_017291	CTTAGG	2	12	382230	382241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453381
120	NC_017291	TAGGTG	2	12	385830	385841	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384453384
121	NC_017291	TCCTAA	2	12	391000	391011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453390
122	NC_017291	TAAAAC	2	12	391516	391527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384453391
123	NC_017291	CGGTAT	2	12	396262	396273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453396
124	NC_017291	ATTTAA	2	12	397099	397110	50 %	50 %	0 %	0 %	384453397
125	NC_017291	AGATGA	2	12	400263	400274	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453399
126	NC_017291	GTGCGC	2	12	402877	402888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384453402
127	NC_017291	CAGCGC	2	12	404581	404592	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384453403
128	NC_017291	ATTAAA	2	12	404865	404876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453403
129	NC_017291	GCGTAT	2	12	408022	408033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453406
130	NC_017291	ATTCCC	2	12	411356	411367	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384453410
131	NC_017291	CAGTGA	2	12	411750	411761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453410
132	NC_017291	AATATC	2	12	420109	420120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453420
133	NC_017291	GTTATT	2	12	421377	421388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384453421
134	NC_017291	GACTGT	2	12	422187	422198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453422
135	NC_017291	GTTGGA	2	12	422979	422990	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384453423
136	NC_017291	CTTTTG	2	12	426204	426215	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453426
137	NC_017291	TTTCTT	2	12	429313	429324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453428
138	NC_017291	GATTTT	2	12	429764	429775	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384453428
139	NC_017291	AGGAAT	2	12	432037	432048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453431
140	NC_017291	TCTTAT	2	12	432743	432754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453433
141	NC_017291	AGCAAG	2	12	433146	433157	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453433
142	NC_017291	CTTTCA	2	12	436067	436078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453436
143	NC_017291	AGATGC	2	12	437230	437241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453436
144	NC_017291	ACACGA	2	12	443420	443431	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384453442
145	NC_017291	TTGCTA	2	12	448058	448069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453448
146	NC_017291	GAGCGA	2	12	452035	452046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384453452
147	NC_017291	ATCCTC	2	12	461086	461097	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384453460
148	NC_017291	ATGCTA	2	12	463160	463171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453463
149	NC_017291	CCATGA	2	12	464559	464570	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453464
150	NC_017291	GGAGCC	2	12	465088	465099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384453464
151	NC_017291	TAGAGC	2	12	466160	466171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453465
152	NC_017291	TCGTCA	2	12	467158	467169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453466
153	NC_017291	ATCAAT	2	12	467244	467255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453466
154	NC_017291	ATCAAA	2	12	471458	471469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384453468
155	NC_017291	CCATTC	2	12	473355	473366	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384453470
156	NC_017291	GGTTTG	2	12	474423	474434	0 %	50 %	50 %	0 %	384453471
157	NC_017291	GCTGCA	2	12	477768	477779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384453473
158	NC_017291	AAAAAC	2	12	479600	479611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453475
159	NC_017291	TGTACT	2	12	486783	486794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453480
160	NC_017291	TAGCAC	2	12	489460	489471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453482
161	NC_017291	TTAGTT	2	12	491365	491376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384453484
162	NC_017291	TTTTCT	2	12	499181	499192	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453490
163	NC_017291	AGCAGA	2	12	505860	505871	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453498
164	NC_017291	TTTGGA	2	12	510074	510085	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453501
165	NC_017291	TTTTTC	2	12	512192	512203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453503
166	NC_017291	GTAAAG	2	12	517339	517350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453507
167	NC_017291	GAGTCA	2	12	518140	518151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453508
168	NC_017291	CACGAG	2	12	522007	522018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453512
169	NC_017291	TATCTG	2	12	525119	525130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453514
170	NC_017291	GCTCAA	2	12	525569	525580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453514
171	NC_017291	AAGAAA	2	12	532270	532281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384453520
172	NC_017291	TTGAGC	2	12	542136	542147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453527
173	NC_017291	TGAATA	2	12	547943	547954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453532
174	NC_017291	AAGCTG	2	12	549712	549723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453535
175	NC_017291	GTGCTT	2	12	550195	550206	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384453536
176	NC_017291	ATGGTC	2	12	552029	552040	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453536
177	NC_017291	AAAACA	2	12	554517	554528	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453539
178	NC_017291	CTATAC	2	12	554652	554663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453539
179	NC_017291	GTAGCT	2	12	557129	557140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453541
180	NC_017291	TTTATC	2	12	558448	558459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453542
181	NC_017291	TATTTT	2	12	559707	559718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453542
182	NC_017291	TATTTT	2	12	560118	560129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453542
183	NC_017291	TATTCT	2	12	566351	566362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453547
184	NC_017291	GAAATC	2	12	568861	568872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453548
185	NC_017291	TAATTT	2	12	573493	573504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453553
186	NC_017291	TATCAT	2	12	573526	573537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453553
187	NC_017291	ATTCTT	2	12	576286	576297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453554
188	NC_017291	CAGATA	2	12	578147	578158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453556
189	NC_017291	AAGATG	2	12	580090	580101	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453558
190	NC_017291	TTCATA	2	12	582133	582144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453560
191	NC_017291	GTTAAG	2	12	582295	582306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453560
192	NC_017291	CCATGC	2	12	589561	589572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384453568
193	NC_017291	TCGCAA	2	12	596575	596586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453575
194	NC_017291	ATCTCA	2	12	596681	596692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453575
195	NC_017291	TCTTTT	2	12	604557	604568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384453584
196	NC_017291	CCTATG	2	12	605879	605890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453585
197	NC_017291	CGCTAA	2	12	605895	605906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453585
198	NC_017291	TTGTTT	2	12	607770	607781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453586
199	NC_017291	GTGGTT	2	12	609992	610003	0 %	50 %	50 %	0 %	384453589
200	NC_017291	ATAAAG	2	12	616694	616705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453593
201	NC_017291	AATGAC	2	12	619291	619302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453595
202	NC_017291	TTCTCC	2	12	621589	621600	0 %	50 %	0 %	50 %	384453598
203	NC_017291	AGATAA	2	12	622620	622631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453599
204	NC_017291	CTTGTT	2	12	632287	632298	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453607
205	NC_017291	TCTTCG	2	12	634491	634502	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384453608
206	NC_017291	TTTCTA	2	12	637021	637032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453608
207	NC_017291	ATGGAT	2	12	637095	637106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453608
208	NC_017291	GCCATA	2	12	643323	643334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453609
209	NC_017291	CATGAA	2	12	650419	650430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453614
210	NC_017291	TTAGGG	2	12	660012	660023	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384453624
211	NC_017291	TCCCAG	2	12	664464	664475	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384453629
212	NC_017291	AGAATA	2	12	664546	664557	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453629
213	NC_017291	CCTAAC	2	12	674977	674988	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384453638
214	NC_017291	TCCATT	2	12	677704	677715	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453641
215	NC_017291	ACGGCT	2	12	683153	683164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384453645
216	NC_017291	TTCATT	2	12	687789	687800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453648
217	NC_017291	ACGTTC	2	12	688446	688457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453648
218	NC_017291	AAAGCA	2	12	691368	691379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453650
219	NC_017291	CTTTGA	2	12	692500	692511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453651
220	NC_017291	ACGATG	2	12	698891	698902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453653
221	NC_017291	TGCTAC	2	12	702040	702051	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453655
222	NC_017291	TTAGTG	2	12	705590	705601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453659
223	NC_017291	AAAGAC	2	12	709725	709736	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453660
224	NC_017291	GCTAAT	2	12	716869	716880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453664
225	NC_017291	CTCCAC	2	12	721155	721166	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384453669
226	NC_017291	ATTCAG	2	12	724309	724320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453672
227	NC_017291	TCATAA	2	12	725386	725397	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453673
228	NC_017291	TAACTG	2	12	725706	725717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453673
229	NC_017291	GGAAAA	2	12	726156	726167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453673
230	NC_017291	TTCTCA	2	12	734778	734789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453679
231	NC_017291	AATCTG	2	12	734815	734826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453679
232	NC_017291	AACCGC	2	12	741820	741831	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384453685
233	NC_017291	TAGCTA	2	12	742464	742475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453686
234	NC_017291	TCTATT	2	12	743249	743260	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453688
235	NC_017291	TATTTT	2	12	743426	743437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384453688
236	NC_017291	TCCGCA	2	12	743830	743841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384453688
237	NC_017291	CGGCGC	2	12	745264	745275	0 %	0 %	50 %	50 %	384453690
238	NC_017291	AGCTAC	2	12	746458	746469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384453691
239	NC_017291	AGTTTC	2	12	747401	747412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453692
240	NC_017291	CCTTCC	2	12	754889	754900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453696
241	NC_017291	AGAAAA	2	12	759679	759690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384453700
242	NC_017291	AATACA	2	12	765167	765178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384453705
243	NC_017291	CCATAT	2	12	766711	766722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453706
244	NC_017291	TGGATG	2	12	766866	766877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384453706
245	NC_017291	TCTAAC	2	12	768713	768724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453708
246	NC_017291	AAGCAA	2	12	771145	771156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453709
247	NC_017291	GTCACT	2	12	777425	777436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453710
248	NC_017291	AAGATA	2	12	782000	782011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453714
249	NC_017291	ATCCTA	2	12	782395	782406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453714
250	NC_017291	CCTTTA	2	12	788181	788192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384453719
251	NC_017291	GCTTTT	2	12	790448	790459	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453722
252	NC_017291	TGAATA	2	12	793554	793565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453723
253	NC_017291	CACCAG	2	12	799433	799444	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384453725
254	NC_017291	TGAAAG	2	12	801084	801095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453728
255	NC_017291	TTTAGC	2	12	802143	802154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453730
256	NC_017291	GGTGTT	2	12	804622	804633	0 %	50 %	50 %	0 %	384453733
257	NC_017291	GGGTAG	2	12	806688	806699	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384453735
258	NC_017291	AAACAT	2	12	810157	810168	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384453738
259	NC_017291	AAAAAC	2	12	821872	821883	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453749
260	NC_017291	TAAAGA	2	12	826582	826593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453753
261	NC_017291	GCTGAA	2	12	829610	829621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453757
262	NC_017291	ATACAC	2	12	831783	831794	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384453758
263	NC_017291	TTCCTC	2	12	832114	832125	0 %	50 %	0 %	50 %	384453759
264	NC_017291	TACACC	2	12	832729	832740	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384453759
265	NC_017291	ACATTA	2	12	833842	833853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453760
266	NC_017291	TCATTA	2	12	834457	834468	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453761
267	NC_017291	CAAAAC	2	12	837320	837331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453763
268	NC_017291	GAAGCT	2	12	843301	843312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453769
269	NC_017291	TTTTCC	2	12	843737	843748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453770
270	NC_017291	AAGTTC	2	12	846303	846314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453772
271	NC_017291	CAAGAG	2	12	846539	846550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384453772
272	NC_017291	GTTAGA	2	12	848188	848199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453774
273	NC_017291	GCTATC	2	12	852570	852581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453777
274	NC_017291	TTTAGC	2	12	853457	853468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453777
275	NC_017291	CTTATT	2	12	853512	853523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453777
276	NC_017291	CCTAAC	2	12	856451	856462	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384453779
277	NC_017291	CAAAAA	2	12	861015	861026	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453784
278	NC_017291	CAAAAC	2	12	862150	862161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453786
279	NC_017291	TGAAGT	2	12	867364	867375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453793
280	NC_017291	CCAACA	2	12	868937	868948	50 %	0 %	0 %	50 %	384453794
281	NC_017291	TTCCTG	2	12	869031	869042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384453794
282	NC_017291	AGACAA	2	12	869274	869285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453794
283	NC_017291	TAAGCT	2	12	871358	871369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453795
284	NC_017291	TATGCT	2	12	873842	873853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453797
285	NC_017291	CCAGCT	2	12	876363	876374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384453799
286	NC_017291	ACGTAA	2	12	876479	876490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453799
287	NC_017291	TCTTTC	2	12	878128	878139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453802
288	NC_017291	CGTATG	2	12	882393	882404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453807
289	NC_017291	ATAAAT	2	12	883039	883050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453808
290	NC_017291	GTTAGC	2	12	883727	883738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453808
291	NC_017291	ATAAAA	2	12	890603	890614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384453811
292	NC_017291	ACCTAT	2	12	894990	895001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453814
293	NC_017291	TGTACT	2	12	896553	896564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453815
294	NC_017291	CAAAAA	2	12	899129	899140	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453818
295	NC_017291	AAGTAA	2	12	900256	900267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453819
296	NC_017291	AGTCAG	2	12	909345	909356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384453825
297	NC_017291	TTTCTC	2	12	928608	928619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453834
298	NC_017291	ACAAGA	2	12	932456	932467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453838
299	NC_017291	TATCAG	2	12	933634	933645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453840
300	NC_017291	ACGAAA	2	12	938416	938427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453843
301	NC_017291	AGCTCT	2	12	943454	943465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453850
302	NC_017291	TTGCTG	2	12	951981	951992	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384453857
303	NC_017291	CTCTGA	2	12	956130	956141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453858
304	NC_017291	CAGTTA	2	12	960407	960418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453864
305	NC_017291	GGCACA	2	12	963970	963981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453867
306	NC_017291	AGACAA	2	12	965735	965746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384453868
307	NC_017291	AAATTG	2	12	973078	973089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453874
308	NC_017291	CTCTTC	2	12	977148	977159	0 %	50 %	0 %	50 %	384453879
309	NC_017291	AAGAAT	2	12	983455	983466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453886
310	NC_017291	AACGCA	2	12	986018	986029	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384453888
311	NC_017291	CTAAGA	2	12	988537	988548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453890
312	NC_017291	CTAAAG	2	12	989653	989664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453892
313	NC_017291	TGACTT	2	12	990675	990686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453892
314	NC_017291	TCTATT	2	12	995007	995018	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384453896
315	NC_017291	ATATCT	2	12	998101	998112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384453898
316	NC_017291	TTGCTT	2	12	998711	998722	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453899
317	NC_017291	AAAGAA	2	12	999832	999843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384453899
318	NC_017291	GTTAAA	2	12	1003074	1003085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453900
319	NC_017291	TTTCTG	2	12	1008300	1008311	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453904
320	NC_017291	CTAAAG	2	12	1011051	1011062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453905
321	NC_017291	AGCATT	2	12	1023002	1023013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453910
322	NC_017291	TATGGC	2	12	1026343	1026354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384453912
323	NC_017291	TACCAC	2	12	1027588	1027599	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384453914
324	NC_017291	TAAAGC	2	12	1033976	1033987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453920
325	NC_017291	TAGGGA	2	12	1039437	1039448	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384453924
326	NC_017291	ATACGA	2	12	1040253	1040264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384453926
327	NC_017291	TTGGTT	2	12	1051845	1051856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453938
328	NC_017291	AATTGA	2	12	1052113	1052124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453938
329	NC_017291	TTTTAA	2	12	1056962	1056973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453940
330	NC_017291	TGAATA	2	12	1057592	1057603	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453941
331	NC_017291	GTAAAG	2	12	1060953	1060964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453942
332	NC_017291	ATATCC	2	12	1069711	1069722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453948
333	NC_017291	TTTGCA	2	12	1078394	1078405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384453954
334	NC_017291	GCTTTT	2	12	1078476	1078487	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384453954
335	NC_017291	TCAGAT	2	12	1080431	1080442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453955
336	NC_017291	GATAAT	2	12	1085093	1085104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384453959
337	NC_017291	GAGATA	2	12	1088964	1088975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384453965
338	NC_017291	GTTTTT	2	12	1091237	1091248	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384453968
339	NC_017291	CATTGC	2	12	1092108	1092119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453969
340	NC_017291	CGCAAG	2	12	1102446	1102457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453977
341	NC_017291	CAAACA	2	12	1104631	1104642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453978
342	NC_017291	CACCAA	2	12	1105506	1105517	50 %	0 %	0 %	50 %	384453979
343	NC_017291	ATGACT	2	12	1108138	1108149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384453981
344	NC_017291	ACAAAA	2	12	1113831	1113842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384453986
345	NC_017291	TTACAA	2	12	1116125	1116136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384453987
346	NC_017291	GCTCTT	2	12	1122118	1122129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384453991
347	NC_017291	CGATTC	2	12	1127689	1127700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384453995
348	NC_017291	CTAACC	2	12	1142741	1142752	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384454011
349	NC_017291	TATCGA	2	12	1144042	1144053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384454012
350	NC_017291	GAGAAG	2	12	1144167	1144178	50 %	0 %	50 %	0 %	384454012
351	NC_017291	AAATAA	2	12	1148097	1148108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384454014
352	NC_017291	ACTCAC	2	12	1149922	1149933	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384454016
353	NC_017291	AAAATC	2	12	1150184	1150195	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384454016
354	NC_017291	AACGGA	2	12	1150604	1150615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384454016
355	NC_017291	GATAAC	2	12	1151497	1151508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384454017
356	NC_017291	TAATCC	2	12	1154225	1154236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454020
357	NC_017291	ATGAAC	2	12	1154624	1154635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384454020
358	NC_017291	TAATTT	2	12	1160477	1160488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454026
359	NC_017291	CACAGG	2	12	1165977	1165988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454031

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.