MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 22098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017291	TCA	2	6	240178	240183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453278
4502	NC_017291	GAA	2	6	240207	240212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453278
4503	NC_017291	A	6	6	240412	240417	100 %	0 %	0 %	0 %	384453278
4504	NC_017291	A	6	6	240437	240442	100 %	0 %	0 %	0 %	384453278
4505	NC_017291	TAG	2	6	240543	240548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453278
4506	NC_017291	T	6	6	240647	240652	0 %	100 %	0 %	0 %	384453278
4507	NC_017291	AAAT	2	8	240666	240673	75 %	25 %	0 %	0 %	384453278
4508	NC_017291	TCT	2	6	240716	240721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453278
4509	NC_017291	GAG	2	6	240747	240752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453278
4510	NC_017291	CTT	2	6	240755	240760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453278
4511	NC_017291	CGT	2	6	241165	241170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453279
4512	NC_017291	GAA	2	6	241202	241207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453279
4513	NC_017291	ATC	2	6	241249	241254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453279
4514	NC_017291	TAT	2	6	241286	241291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4515	NC_017291	GAG	2	6	241301	241306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453279
4516	NC_017291	GAT	2	6	241325	241330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
4517	NC_017291	TTCAG	2	10	241355	241364	20 %	40 %	20 %	20 %	384453279
4518	NC_017291	TTG	2	6	241430	241435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453279
4519	NC_017291	CAT	2	6	241547	241552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453279
4520	NC_017291	ATT	2	6	241557	241562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4521	NC_017291	GTTT	2	8	241668	241675	0 %	75 %	25 %	0 %	384453279
4522	NC_017291	AGG	2	6	241694	241699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453279
4523	NC_017291	TG	3	6	241752	241757	0 %	50 %	50 %	0 %	384453279
4524	NC_017291	ATT	2	6	241792	241797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4525	NC_017291	TTC	2	6	241853	241858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453279
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4527	NC_017291	TGA	2	6	241901	241906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
4528	NC_017291	TTG	2	6	241951	241956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453279
4529	NC_017291	CGG	2	6	241958	241963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384453279
4530	NC_017291	TTG	2	6	241969	241974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453279
4531	NC_017291	ATT	2	6	242004	242009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4532	NC_017291	ATG	2	6	242074	242079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
4533	NC_017291	ATG	2	6	242106	242111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
4534	NC_017291	GCA	2	6	242136	242141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453279
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4536	NC_017291	A	6	6	242181	242186	100 %	0 %	0 %	0 %	384453279
4537	NC_017291	TCA	2	6	242192	242197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453279
4538	NC_017291	GCTT	2	8	242251	242258	0 %	50 %	25 %	25 %	384453279
4539	NC_017291	AT	3	6	242332	242337	50 %	50 %	0 %	0 %	384453279
4540	NC_017291	TGA	2	6	242456	242461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
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4542	NC_017291	ATT	2	6	242481	242486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4543	NC_017291	TGA	2	6	242525	242530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453279
4544	NC_017291	GAA	2	6	242574	242579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453279
4545	NC_017291	TTA	2	6	242601	242606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453279
4546	NC_017291	TTTAG	2	10	242645	242654	20 %	60 %	20 %	0 %	384453279
4547	NC_017291	AG	3	6	242715	242720	50 %	0 %	50 %	0 %	384453280
4548	NC_017291	T	7	7	242746	242752	0 %	100 %	0 %	0 %	384453280
4549	NC_017291	GCA	2	6	242776	242781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453280
4550	NC_017291	TAAT	2	8	242843	242850	50 %	50 %	0 %	0 %	384453280
4551	NC_017291	ATG	2	6	242902	242907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453280
4552	NC_017291	ACT	2	6	242920	242925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453280
4553	NC_017291	GCT	2	6	242941	242946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453280
4554	NC_017291	CGT	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453280
4555	NC_017291	G	6	6	243037	243042	0 %	0 %	100 %	0 %	384453280
4556	NC_017291	TTTA	2	8	243119	243126	25 %	75 %	0 %	0 %	384453280
4557	NC_017291	ATCG	2	8	243166	243173	25 %	25 %	25 %	25 %	384453280
4558	NC_017291	AAT	2	6	243316	243321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453281
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4561	NC_017291	CTG	2	6	243381	243386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453281
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4563	NC_017291	ATG	2	6	243408	243413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453281
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4565	NC_017291	GTTGT	2	10	243450	243459	0 %	60 %	40 %	0 %	384453281
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4570	NC_017291	TTG	2	6	243663	243668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453281
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4580	NC_017291	GCA	2	6	244512	244517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453282
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4583	NC_017291	GAA	2	6	244588	244593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453282
4584	NC_017291	GTT	2	6	244683	244688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453282
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4588	NC_017291	GA	3	6	244972	244977	50 %	0 %	50 %	0 %	384453282
4589	NC_017291	TTC	2	6	245038	245043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453282
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4591	NC_017291	TGA	2	6	245064	245069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453282
4592	NC_017291	AGCT	2	8	245174	245181	25 %	25 %	25 %	25 %	384453283
4593	NC_017291	T	8	8	245185	245192	0 %	100 %	0 %	0 %	384453283
4594	NC_017291	GTT	2	6	245221	245226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453283
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4596	NC_017291	TTTAGG	2	12	245444	245455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384453283
4597	NC_017291	CTC	2	6	245498	245503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453283
4598	NC_017291	TAAAAG	2	12	245536	245547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384453283
4599	NC_017291	GTT	2	6	245563	245568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453283
4600	NC_017291	ATG	2	6	245726	245731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453283
4601	NC_017291	AGATA	2	10	245741	245750	60 %	20 %	20 %	0 %	384453283
4602	NC_017291	TTATC	2	10	245755	245764	20 %	60 %	0 %	20 %	384453283
4603	NC_017291	TTG	2	6	245808	245813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453284
4604	NC_017291	TAG	2	6	245819	245824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453284
4605	NC_017291	TCT	3	9	245860	245868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453284
4606	NC_017291	AGT	2	6	245891	245896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453284
4607	NC_017291	GCT	2	6	245950	245955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453284
4608	NC_017291	AG	3	6	245980	245985	50 %	0 %	50 %	0 %	384453284
4609	NC_017291	CTT	2	6	245996	246001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453284
4610	NC_017291	GAT	2	6	246023	246028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453284
4611	NC_017291	AGAA	2	8	246030	246037	75 %	0 %	25 %	0 %	384453284
4612	NC_017291	CAT	2	6	246182	246187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453284
4613	NC_017291	ATT	2	6	246256	246261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453284
4614	NC_017291	CTTT	2	8	246271	246278	0 %	75 %	0 %	25 %	384453284
4615	NC_017291	AGC	2	6	246282	246287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453284
4616	NC_017291	ATGG	2	8	246389	246396	25 %	25 %	50 %	0 %	384453284
4617	NC_017291	TAA	2	6	246399	246404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453284
4618	NC_017291	AAG	2	6	246444	246449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453284
4619	NC_017291	T	7	7	246599	246605	0 %	100 %	0 %	0 %	384453285
4620	NC_017291	AGA	2	6	246650	246655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453285
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4622	NC_017291	G	6	6	246816	246821	0 %	0 %	100 %	0 %	384453285
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