MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 2591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017290	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	384452083
2	NC_017290	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	384452083
3	NC_017290	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	384452084
4	NC_017290	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	384452084
5	NC_017290	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	384452085
6	NC_017290	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	384452085
7	NC_017290	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	384452085
8	NC_017290	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	384452086
9	NC_017290	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	384452086
10	NC_017290	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	384452086
11	NC_017290	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	384452087
12	NC_017290	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	384452088
13	NC_017290	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	384452088
14	NC_017290	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	384452088
15	NC_017290	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	384452089
16	NC_017290	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	384452089
17	NC_017290	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	384452089
18	NC_017290	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	384452089
19	NC_017290	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	384452089
20	NC_017290	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	384452089
21	NC_017290	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	384452089
22	NC_017290	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	384452089
23	NC_017290	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	384452089
24	NC_017290	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	384452090
25	NC_017290	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	384452090
26	NC_017290	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	384452090
27	NC_017290	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	384452090
28	NC_017290	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	384452090
29	NC_017290	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	384452090
30	NC_017290	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	384452090
31	NC_017290	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	384452090
32	NC_017290	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	384452090
33	NC_017290	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	384452090
34	NC_017290	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	384452090
35	NC_017290	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	384452091
36	NC_017290	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	384452091
37	NC_017290	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	384452091
38	NC_017290	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	384452091
39	NC_017290	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	384452093
40	NC_017290	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	384452093
41	NC_017290	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	384452094
42	NC_017290	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	384452094
43	NC_017290	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	384452094
44	NC_017290	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	384452095
45	NC_017290	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	384452095
46	NC_017290	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	384452095
47	NC_017290	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	384452095
48	NC_017290	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	384452095
49	NC_017290	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	384452096
50	NC_017290	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	384452096
51	NC_017290	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	384452096
52	NC_017290	CAAT	2	8	22282	22289	50 %	25 %	0 %	25 %	384452097
53	NC_017290	AGAA	2	8	22699	22706	75 %	0 %	25 %	0 %	384452097
54	NC_017290	TGAT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	384452097
55	NC_017290	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384452098
56	NC_017290	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384452098
57	NC_017290	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384452098
58	NC_017290	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384452098
59	NC_017290	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384452098
60	NC_017290	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384452098
61	NC_017290	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384452098
62	NC_017290	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384452098
63	NC_017290	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384452098
64	NC_017290	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	384452098
65	NC_017290	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	384452098
66	NC_017290	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384452099
67	NC_017290	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	384452099
68	NC_017290	AAAT	2	8	28809	28816	75 %	25 %	0 %	0 %	384452099
69	NC_017290	GGCA	2	8	29087	29094	25 %	0 %	50 %	25 %	384452099
70	NC_017290	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	384452100
71	NC_017290	GAAT	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	384452101
72	NC_017290	AGAA	2	8	29791	29798	75 %	0 %	25 %	0 %	384452101
73	NC_017290	ACCA	2	8	30241	30248	50 %	0 %	0 %	50 %	384452101
74	NC_017290	GTTT	2	8	31412	31419	0 %	75 %	25 %	0 %	384452103
75	NC_017290	ATTT	2	8	32435	32442	25 %	75 %	0 %	0 %	384452105
76	NC_017290	TTGT	2	8	32461	32468	0 %	75 %	25 %	0 %	384452105
77	NC_017290	TAGA	2	8	32667	32674	50 %	25 %	25 %	0 %	384452105
78	NC_017290	TTTA	2	8	33121	33128	25 %	75 %	0 %	0 %	384452105
79	NC_017290	TGAA	2	8	34018	34025	50 %	25 %	25 %	0 %	384452107
80	NC_017290	GTAC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	25 %	25 %	384452107
81	NC_017290	GATA	2	8	34132	34139	50 %	25 %	25 %	0 %	384452107
82	NC_017290	TCTT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	384452108
83	NC_017290	AGGA	2	8	35344	35351	50 %	0 %	50 %	0 %	384452108
84	NC_017290	TAAT	2	8	36132	36139	50 %	50 %	0 %	0 %	384452109
85	NC_017290	CGCT	2	8	36848	36855	0 %	25 %	25 %	50 %	384452109
86	NC_017290	AAAG	2	8	38203	38210	75 %	0 %	25 %	0 %	384452110
87	NC_017290	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	384452110
88	NC_017290	TCAA	2	8	38355	38362	50 %	25 %	0 %	25 %	384452110
89	NC_017290	TTTA	2	8	38688	38695	25 %	75 %	0 %	0 %	384452110
90	NC_017290	CTTT	2	8	38818	38825	0 %	75 %	0 %	25 %	384452110
91	NC_017290	AGCG	2	8	39007	39014	25 %	0 %	50 %	25 %	384452110
92	NC_017290	CCTG	2	8	40303	40310	0 %	25 %	25 %	50 %	384452113
93	NC_017290	GAAA	2	8	41244	41251	75 %	0 %	25 %	0 %	384452113
94	NC_017290	AGCA	2	8	41415	41422	50 %	0 %	25 %	25 %	384452113
95	NC_017290	CTGT	2	8	41883	41890	0 %	50 %	25 %	25 %	384452113
96	NC_017290	TCTT	2	8	41923	41930	0 %	75 %	0 %	25 %	384452113
97	NC_017290	GAAG	2	8	42334	42341	50 %	0 %	50 %	0 %	384452113
98	NC_017290	AATA	2	8	42365	42372	75 %	25 %	0 %	0 %	384452113
99	NC_017290	GAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	384452117
100	NC_017290	TTAA	2	8	44230	44237	50 %	50 %	0 %	0 %	384452118
101	NC_017290	ATCA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	0 %	25 %	384452118
102	NC_017290	ATGA	2	8	45097	45104	50 %	25 %	25 %	0 %	384452118
103	NC_017290	TAAA	2	8	45996	46003	75 %	25 %	0 %	0 %	384452119
104	NC_017290	GAAA	2	8	46978	46985	75 %	0 %	25 %	0 %	384452121
105	NC_017290	TCTT	2	8	47084	47091	0 %	75 %	0 %	25 %	384452121
106	NC_017290	GCTT	2	8	47613	47620	0 %	50 %	25 %	25 %	384452121
107	NC_017290	AAGA	2	8	48055	48062	75 %	0 %	25 %	0 %	384452122
108	NC_017290	TGTT	2	8	48465	48472	0 %	75 %	25 %	0 %	384452122
109	NC_017290	TAAA	2	8	49702	49709	75 %	25 %	0 %	0 %	384452123
110	NC_017290	AAGC	2	8	49731	49738	50 %	0 %	25 %	25 %	384452123
111	NC_017290	CCAA	2	8	49755	49762	50 %	0 %	0 %	50 %	384452123
112	NC_017290	TTCC	2	8	49902	49909	0 %	50 %	0 %	50 %	384452123
113	NC_017290	AACA	2	8	50879	50886	75 %	0 %	0 %	25 %	384452123
114	NC_017290	ATCC	2	8	53032	53039	25 %	25 %	0 %	50 %	384452124
115	NC_017290	AGCA	2	8	53324	53331	50 %	0 %	25 %	25 %	384452124
116	NC_017290	TTCA	2	8	53484	53491	25 %	50 %	0 %	25 %	384452124
117	NC_017290	GTAT	2	8	54137	54144	25 %	50 %	25 %	0 %	384452125
118	NC_017290	CATA	2	8	54332	54339	50 %	25 %	0 %	25 %	384452125
119	NC_017290	TAGC	2	8	55863	55870	25 %	25 %	25 %	25 %	384452127
120	NC_017290	CTGT	2	8	56042	56049	0 %	50 %	25 %	25 %	384452127
121	NC_017290	CTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	0 %	25 %	384452128
122	NC_017290	AGAA	2	8	56452	56459	75 %	0 %	25 %	0 %	384452128
123	NC_017290	GAAG	2	8	56621	56628	50 %	0 %	50 %	0 %	384452128
124	NC_017290	GTAA	2	8	56844	56851	50 %	25 %	25 %	0 %	384452128
125	NC_017290	TTAG	2	8	56967	56974	25 %	50 %	25 %	0 %	384452128
126	NC_017290	CTTT	2	8	57317	57324	0 %	75 %	0 %	25 %	384452129
127	NC_017290	GTTA	2	8	57474	57481	25 %	50 %	25 %	0 %	384452129
128	NC_017290	AGCT	2	8	58632	58639	25 %	25 %	25 %	25 %	384452130
129	NC_017290	CCAA	2	8	58907	58914	50 %	0 %	0 %	50 %	384452130
130	NC_017290	CGTA	2	8	60467	60474	25 %	25 %	25 %	25 %	384452132
131	NC_017290	CCGT	2	8	60524	60531	0 %	25 %	25 %	50 %	384452132
132	NC_017290	GTTG	2	8	61167	61174	0 %	50 %	50 %	0 %	384452132
133	NC_017290	TCTG	2	8	62015	62022	0 %	50 %	25 %	25 %	384452132
134	NC_017290	GCTT	2	8	62661	62668	0 %	50 %	25 %	25 %	384452132
135	NC_017290	AAGA	2	8	63845	63852	75 %	0 %	25 %	0 %	384452133
136	NC_017290	ATGA	2	8	65136	65143	50 %	25 %	25 %	0 %	384452134
137	NC_017290	TGCA	2	8	65422	65429	25 %	25 %	25 %	25 %	384452134
138	NC_017290	GAAA	2	8	65645	65652	75 %	0 %	25 %	0 %	384452134
139	NC_017290	TATC	2	8	66286	66293	25 %	50 %	0 %	25 %	384452135
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