MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 21898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017290	CTAA	2	8	210915	210922	50 %	25 %	0 %	25 %	384452278
4002	NC_017290	AAT	2	6	211265	211270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452279
4003	NC_017290	AAGC	2	8	211280	211287	50 %	0 %	25 %	25 %	384452279
4004	NC_017290	ATT	2	6	211325	211330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452279
4005	NC_017290	AAG	2	6	211351	211356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452279
4006	NC_017290	GTT	2	6	211373	211378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452279
4007	NC_017290	GTA	2	6	211431	211436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452279
4008	NC_017290	GA	3	6	211465	211470	50 %	0 %	50 %	0 %	384452279
4009	NC_017290	GTAG	2	8	211752	211759	25 %	25 %	50 %	0 %	384452280
4010	NC_017290	TGA	2	6	211766	211771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452280
4011	NC_017290	TTG	2	6	211798	211803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452280
4012	NC_017290	AT	3	6	211826	211831	50 %	50 %	0 %	0 %	384452280
4013	NC_017290	TTC	2	6	211837	211842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452280
4014	NC_017290	GGT	2	6	212078	212083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452281
4015	NC_017290	GAA	2	6	212203	212208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452281
4016	NC_017290	GTT	2	6	212309	212314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452281
4017	NC_017290	AGG	2	6	212329	212334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452281
4018	NC_017290	ATT	2	6	212485	212490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452281
4019	NC_017290	ATT	2	6	212689	212694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452281
4020	NC_017290	GTT	2	6	212695	212700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452281
4021	NC_017290	TCC	2	6	212729	212734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452281
4022	NC_017290	AGA	3	9	212737	212745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452281
4023	NC_017290	TGA	2	6	212827	212832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452281
4024	NC_017290	TTG	2	6	212997	213002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452282
4025	NC_017290	ATC	2	6	213077	213082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4026	NC_017290	TGC	2	6	213193	213198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452282
4027	NC_017290	GAAG	2	8	213210	213217	50 %	0 %	50 %	0 %	384452282
4028	NC_017290	CAT	2	6	213247	213252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4029	NC_017290	AT	3	6	213251	213256	50 %	50 %	0 %	0 %	384452282
4030	NC_017290	AAAG	2	8	213272	213279	75 %	0 %	25 %	0 %	384452282
4031	NC_017290	TAC	2	6	213298	213303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452282
4032	NC_017290	GGT	2	6	213352	213357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452282
4033	NC_017290	ATA	2	6	213428	213433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452282
4034	NC_017290	TCT	2	6	213476	213481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452282
4035	NC_017290	CATA	2	8	213549	213556	50 %	25 %	0 %	25 %	384452282
4036	NC_017290	CCT	2	6	213608	213613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452282
4037	NC_017290	ATGT	2	8	213665	213672	25 %	50 %	25 %	0 %	384452282
4038	NC_017290	ACA	2	6	213677	213682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452282
4039	NC_017290	GCC	2	6	213707	213712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384452282
4040	NC_017290	AAG	2	6	213717	213722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452282
4041	NC_017290	A	7	7	213751	213757	100 %	0 %	0 %	0 %	384452282
4042	NC_017290	T	7	7	213775	213781	0 %	100 %	0 %	0 %	384452283
4043	NC_017290	TTG	2	6	213812	213817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4044	NC_017290	GTT	2	6	213832	213837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4045	NC_017290	ATG	2	6	213882	213887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452283
4046	NC_017290	GTT	2	6	213953	213958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4047	NC_017290	AGAT	2	8	214059	214066	50 %	25 %	25 %	0 %	384452283
4048	NC_017290	AGAA	2	8	214182	214189	75 %	0 %	25 %	0 %	384452283
4049	NC_017290	GAAAA	2	10	214211	214220	80 %	0 %	20 %	0 %	384452283
4050	NC_017290	TGC	2	6	214234	214239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452283
4051	NC_017290	T	7	7	214266	214272	0 %	100 %	0 %	0 %	384452283
4052	NC_017290	GTA	2	6	214303	214308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452283
4053	NC_017290	AAC	2	6	214324	214329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452283
4054	NC_017290	GTT	2	6	214342	214347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452283
4055	NC_017290	C	6	6	214350	214355	0 %	0 %	0 %	100 %	384452283
4056	NC_017290	CAA	2	6	214376	214381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452283
4057	NC_017290	GTT	2	6	214494	214499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452284
4058	NC_017290	ATT	2	6	214514	214519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452284
4059	NC_017290	TTC	2	6	214529	214534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452284
4060	NC_017290	TAGCA	2	10	214577	214586	40 %	20 %	20 %	20 %	384452284
4061	NC_017290	AGC	2	6	214652	214657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4062	NC_017290	ACA	2	6	214662	214667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452284
4063	NC_017290	ACG	2	6	214704	214709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4064	NC_017290	GCT	2	6	214774	214779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4065	NC_017290	AGC	2	6	214781	214786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452284
4066	NC_017290	AG	3	6	214888	214893	50 %	0 %	50 %	0 %	384452284
4067	NC_017290	T	6	6	215007	215012	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4068	NC_017290	T	7	7	215040	215046	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4069	NC_017290	T	6	6	215101	215106	0 %	100 %	0 %	0 %	384452284
4070	NC_017290	TTC	2	6	215240	215245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452284
4071	NC_017290	AAGAA	2	10	215275	215284	80 %	0 %	20 %	0 %	384452284
4072	NC_017290	AAG	2	6	215291	215296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452284
4073	NC_017290	GAA	2	6	215909	215914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452285
4074	NC_017290	TCA	2	6	215934	215939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452285
4075	NC_017290	AG	3	6	216044	216049	50 %	0 %	50 %	0 %	384452285
4076	NC_017290	GT	3	6	216128	216133	0 %	50 %	50 %	0 %	384452285
4077	NC_017290	GACA	2	8	216165	216172	50 %	0 %	25 %	25 %	384452285
4078	NC_017290	AG	3	6	216194	216199	50 %	0 %	50 %	0 %	384452285
4079	NC_017290	CTC	2	6	216251	216256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452285
4080	NC_017290	ATT	2	6	216279	216284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452285
4081	NC_017290	TTG	2	6	216387	216392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452285
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4083	NC_017290	AGC	2	6	216454	216459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452285
4084	NC_017290	TTG	2	6	216519	216524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452285
4085	NC_017290	AAG	2	6	216554	216559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452286
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4087	NC_017290	TAT	2	6	216663	216668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452286
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4089	NC_017290	ATTT	2	8	216746	216753	25 %	75 %	0 %	0 %	384452286
4090	NC_017290	TCA	2	6	216858	216863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452286
4091	NC_017290	GTG	2	6	216941	216946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452286
4092	NC_017290	ACTC	2	8	216955	216962	25 %	25 %	0 %	50 %	384452286
4093	NC_017290	TTA	2	6	217049	217054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452286
4094	NC_017290	TGT	2	6	217107	217112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452286
4095	NC_017290	TG	3	6	217211	217216	0 %	50 %	50 %	0 %	384452286
4096	NC_017290	TAG	2	6	217296	217301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452286
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4099	NC_017290	AGAA	2	8	217852	217859	75 %	0 %	25 %	0 %	384452287
4100	NC_017290	TTG	2	6	217864	217869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452287
4101	NC_017290	CAAC	2	8	217919	217926	50 %	0 %	0 %	50 %	384452287
4102	NC_017290	TTC	2	6	218258	218263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452287
4103	NC_017290	AGC	2	6	218318	218323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452287
4104	NC_017290	ATC	2	6	218324	218329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452287
4105	NC_017290	TGT	2	6	218350	218355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452287
4106	NC_017290	GA	3	6	218381	218386	50 %	0 %	50 %	0 %	384452287
4107	NC_017290	AGT	2	6	218419	218424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452287
4108	NC_017290	GCG	2	6	218447	218452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384452287
4109	NC_017290	CTC	2	6	218456	218461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452287
4110	NC_017290	AT	3	6	218523	218528	50 %	50 %	0 %	0 %	384452287
4111	NC_017290	GTTAG	2	10	218559	218568	20 %	40 %	40 %	0 %	384452287
4112	NC_017290	CTA	2	6	218583	218588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452287
4113	NC_017290	TAAG	2	8	218627	218634	50 %	25 %	25 %	0 %	384452287
4114	NC_017290	TGGAT	2	10	218711	218720	20 %	40 %	40 %	0 %	384452287
4115	NC_017290	CTG	4	12	218773	218784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452287
4116	NC_017290	AGG	2	6	218810	218815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452287
4117	NC_017290	TCT	2	6	218829	218834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452287
4118	NC_017290	GTT	2	6	218864	218869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452287
4119	NC_017290	T	6	6	218991	218996	0 %	100 %	0 %	0 %	384452287
4120	NC_017290	AAT	2	6	219072	219077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452287
4121	NC_017290	TTA	2	6	219120	219125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452287
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4123	NC_017290	CAT	2	6	219181	219186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452287
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4371	NC_017290	TCT	2	6	232581	232586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452298
4372	NC_017290	GGT	2	6	232617	232622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384452298
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4490	NC_017290	T	6	6	238990	238995	0 %	100 %	0 %	0 %	384452303
4491	NC_017290	AGA	2	6	239142	239147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452303
4492	NC_017290	GATT	2	8	239153	239160	25 %	50 %	25 %	0 %	384452303
4493	NC_017290	GCA	2	6	239186	239191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452303
4494	NC_017290	ACTA	2	8	239362	239369	50 %	25 %	0 %	25 %	384452303
4495	NC_017290	TTG	2	6	239449	239454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452303
4496	NC_017290	GGA	2	6	239497	239502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452303
4497	NC_017290	AGGC	2	8	239520	239527	25 %	0 %	50 %	25 %	384452303
4498	NC_017290	AAG	2	6	239598	239603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452303
4499	NC_017290	T	7	7	239626	239632	0 %	100 %	0 %	0 %	384452303
4500	NC_017290	TCA	2	6	240180	240185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452304

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