MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 21898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017290	TCC	2	6	159188	159193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452232
3003	NC_017290	GTC	2	6	159197	159202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452232
3004	NC_017290	GTT	2	6	159426	159431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452233
3005	NC_017290	TGA	2	6	159509	159514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452233
3006	NC_017290	A	7	7	159717	159723	100 %	0 %	0 %	0 %	384452233
3007	NC_017290	T	7	7	159733	159739	0 %	100 %	0 %	0 %	384452233
3008	NC_017290	CCTT	2	8	159748	159755	0 %	50 %	0 %	50 %	384452233
3009	NC_017290	TTG	2	6	159775	159780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452233
3010	NC_017290	TCT	2	6	159807	159812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452233
3011	NC_017290	ACTG	2	8	159852	159859	25 %	25 %	25 %	25 %	384452233
3012	NC_017290	GGA	2	6	159982	159987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452233
3013	NC_017290	GAA	2	6	160015	160020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452233
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3015	NC_017290	TTC	2	6	160037	160042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452233
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3017	NC_017290	CTT	2	6	160789	160794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452234
3018	NC_017290	CTC	2	6	160808	160813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452234
3019	NC_017290	TGGATT	2	12	160822	160833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384452234
3020	NC_017290	GA	3	6	160848	160853	50 %	0 %	50 %	0 %	384452234
3021	NC_017290	CGA	2	6	160858	160863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452234
3022	NC_017290	GAA	2	6	160907	160912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452234
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3030	NC_017290	TGT	2	6	161343	161348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452235
3031	NC_017290	GA	3	6	161350	161355	50 %	0 %	50 %	0 %	384452235
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3033	NC_017290	A	6	6	161459	161464	100 %	0 %	0 %	0 %	384452235
3034	NC_017290	GTA	2	6	161531	161536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452235
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3039	NC_017290	ATG	2	6	161739	161744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452235
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3042	NC_017290	TGTT	2	8	161911	161918	0 %	75 %	25 %	0 %	384452236
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3044	NC_017290	ACA	2	6	161933	161938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452236
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3054	NC_017290	AAT	2	6	162181	162186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452236
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3074	NC_017290	AGCAT	2	10	163326	163335	40 %	20 %	20 %	20 %	384452238
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3081	NC_017290	AGGG	2	8	163537	163544	25 %	0 %	75 %	0 %	384452238
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3091	NC_017290	A	6	6	163928	163933	100 %	0 %	0 %	0 %	384452238
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3108	NC_017290	ATC	2	6	164764	164769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452239
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3110	NC_017290	AG	3	6	164790	164795	50 %	0 %	50 %	0 %	384452239
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3122	NC_017290	TGA	2	6	165310	165315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452239
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3249	NC_017290	GGA	2	6	172097	172102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452245
3250	NC_017290	ACA	2	6	172219	172224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452246
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3252	NC_017290	AGA	2	6	172308	172313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452246
3253	NC_017290	GA	4	8	172476	172483	50 %	0 %	50 %	0 %	384452246
3254	NC_017290	CAGG	2	8	172491	172498	25 %	0 %	50 %	25 %	384452246
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3279	NC_017290	A	6	6	174720	174725	100 %	0 %	0 %	0 %	384452248
3280	NC_017290	ATG	2	6	174825	174830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452248
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3363	NC_017290	TC	3	6	178855	178860	0 %	50 %	0 %	50 %	384452252
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3492	NC_017290	CCA	2	6	184969	184974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452258
3493	NC_017290	TAA	2	6	184983	184988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452258
3494	NC_017290	T	7	7	185060	185066	0 %	100 %	0 %	0 %	384452258
3495	NC_017290	ATG	2	6	185079	185084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452258
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3497	NC_017290	CCA	2	6	185119	185124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452258
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3499	NC_017290	A	6	6	185300	185305	100 %	0 %	0 %	0 %	384452258
3500	NC_017290	CTT	2	6	185315	185320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452258

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