MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 21898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017290	AAG	3	9	50059	50067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452123
1003	NC_017290	AAC	2	6	50128	50133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452123
1004	NC_017290	CAA	2	6	50167	50172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452123
1005	NC_017290	AAG	3	9	50173	50181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452123
1006	NC_017290	TTA	2	6	50274	50279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452123
1007	NC_017290	TC	3	6	50381	50386	0 %	50 %	0 %	50 %	384452123
1008	NC_017290	TGT	2	6	50528	50533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452123
1009	NC_017290	TA	3	6	50554	50559	50 %	50 %	0 %	0 %	384452123
1010	NC_017290	ATT	2	6	50586	50591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452123
1011	NC_017290	ATG	2	6	50608	50613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1012	NC_017290	AGC	2	6	50696	50701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452123
1013	NC_017290	TCC	2	6	50865	50870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452123
1014	NC_017290	AACA	2	8	50879	50886	75 %	0 %	0 %	25 %	384452123
1015	NC_017290	ACT	2	6	50897	50902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452123
1016	NC_017290	GAT	2	6	50940	50945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1017	NC_017290	GCA	2	6	50958	50963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452123
1018	NC_017290	ATC	2	6	50972	50977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452123
1019	NC_017290	TCA	2	6	51109	51114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452123
1020	NC_017290	AAT	2	6	51147	51152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452123
1021	NC_017290	AGT	2	6	51191	51196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1022	NC_017290	TGA	2	6	51311	51316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1023	NC_017290	CCT	2	6	51390	51395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452123
1024	NC_017290	ATG	2	6	51459	51464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1025	NC_017290	TTTGG	2	10	51480	51489	0 %	60 %	40 %	0 %	384452123
1026	NC_017290	CTC	2	6	51546	51551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452123
1027	NC_017290	CAA	2	6	51618	51623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452123
1028	NC_017290	CAT	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452123
1029	NC_017290	TTG	2	6	51634	51639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452123
1030	NC_017290	AAC	2	6	51659	51664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452123
1031	NC_017290	ATT	2	6	51672	51677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452123
1032	NC_017290	TTG	3	9	51733	51741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452123
1033	NC_017290	GTT	2	6	51765	51770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452123
1034	NC_017290	GTT	2	6	51877	51882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452123
1035	NC_017290	CAG	2	6	51977	51982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452123
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1037	NC_017290	TTA	2	6	52036	52041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452123
1038	NC_017290	CAA	2	6	52070	52075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452123
1039	NC_017290	TGA	2	6	52103	52108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452123
1040	NC_017290	C	6	6	52154	52159	0 %	0 %	0 %	100 %	384452123
1041	NC_017290	CTT	2	6	52922	52927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452124
1042	NC_017290	TTA	2	6	52939	52944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452124
1043	NC_017290	GTT	2	6	52952	52957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452124
1044	NC_017290	ACG	2	6	52977	52982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452124
1045	NC_017290	TGT	2	6	53015	53020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452124
1046	NC_017290	ATCC	2	8	53032	53039	25 %	25 %	0 %	50 %	384452124
1047	NC_017290	GT	3	6	53106	53111	0 %	50 %	50 %	0 %	384452124
1048	NC_017290	T	6	6	53140	53145	0 %	100 %	0 %	0 %	384452124
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1050	NC_017290	T	6	6	53176	53181	0 %	100 %	0 %	0 %	384452124
1051	NC_017290	TTC	2	6	53241	53246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452124
1052	NC_017290	AT	3	6	53293	53298	50 %	50 %	0 %	0 %	384452124
1053	NC_017290	AGCA	2	8	53324	53331	50 %	0 %	25 %	25 %	384452124
1054	NC_017290	AAT	2	6	53349	53354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452124
1055	NC_017290	TTCA	2	8	53484	53491	25 %	50 %	0 %	25 %	384452124
1056	NC_017290	A	6	6	53662	53667	100 %	0 %	0 %	0 %	384452124
1057	NC_017290	TCA	2	6	53728	53733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452124
1058	NC_017290	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	384452124
1059	NC_017290	CGT	2	6	53847	53852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452124
1060	NC_017290	AGG	2	6	53874	53879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452124
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1062	NC_017290	GAA	2	6	53921	53926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452124
1063	NC_017290	T	6	6	53942	53947	0 %	100 %	0 %	0 %	384452125
1064	NC_017290	CAG	2	6	53973	53978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452125
1065	NC_017290	AGG	2	6	54041	54046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452125
1066	NC_017290	CGC	2	6	54058	54063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384452125
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1068	NC_017290	GTAT	2	8	54137	54144	25 %	50 %	25 %	0 %	384452125
1069	NC_017290	TCA	2	6	54209	54214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452125
1070	NC_017290	CAG	2	6	54261	54266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452125
1071	NC_017290	TGT	2	6	54288	54293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452125
1072	NC_017290	GTA	2	6	54301	54306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452125
1073	NC_017290	CATA	2	8	54332	54339	50 %	25 %	0 %	25 %	384452125
1074	NC_017290	CTTATC	2	12	54352	54363	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384452125
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1080	NC_017290	T	7	7	54963	54969	0 %	100 %	0 %	0 %	384452126
1081	NC_017290	CTT	2	6	55016	55021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452126
1082	NC_017290	ACG	2	6	55029	55034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452126
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1084	NC_017290	CTG	2	6	55064	55069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452126
1085	NC_017290	AAATTT	2	12	55120	55131	50 %	50 %	0 %	0 %	384452126
1086	NC_017290	GCA	2	6	55132	55137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452126
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1088	NC_017290	CTA	2	6	55274	55279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452126
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1090	NC_017290	AGC	2	6	55338	55343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452126
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1097	NC_017290	GAG	2	6	55755	55760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452127
1098	NC_017290	TAA	2	6	55801	55806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452127
1099	NC_017290	TCA	2	6	55817	55822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452127
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1101	NC_017290	CAG	2	6	55884	55889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452127
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1103	NC_017290	TGA	2	6	55932	55937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452127
1104	NC_017290	CTGT	2	8	56042	56049	0 %	50 %	25 %	25 %	384452127
1105	NC_017290	AG	4	8	56050	56057	50 %	0 %	50 %	0 %	384452127
1106	NC_017290	TAG	2	6	56239	56244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452128
1107	NC_017290	GAA	2	6	56257	56262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452128
1108	NC_017290	TGA	2	6	56280	56285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452128
1109	NC_017290	GAA	2	6	56324	56329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452128
1110	NC_017290	CTT	2	6	56334	56339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452128
1111	NC_017290	GCT	2	6	56396	56401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452128
1112	NC_017290	CTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	0 %	25 %	384452128
1113	NC_017290	AGAA	2	8	56452	56459	75 %	0 %	25 %	0 %	384452128
1114	NC_017290	GTT	2	6	56516	56521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452128
1115	NC_017290	GAAG	2	8	56621	56628	50 %	0 %	50 %	0 %	384452128
1116	NC_017290	GTA	2	6	56631	56636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452128
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1118	NC_017290	ATT	2	6	56710	56715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452128
1119	NC_017290	CAG	2	6	56751	56756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452128
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1122	NC_017290	T	6	6	56812	56817	0 %	100 %	0 %	0 %	384452128
1123	NC_017290	GTAA	2	8	56844	56851	50 %	25 %	25 %	0 %	384452128
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1125	NC_017290	TTAG	2	8	56967	56974	25 %	50 %	25 %	0 %	384452128
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