MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 22014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017289	ACC	2	6	24966	24971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451122
503	NC_017289	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384451122
504	NC_017289	TTG	2	6	25010	25015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
505	NC_017289	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
506	NC_017289	ATT	2	6	25113	25118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
507	NC_017289	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
508	NC_017289	TTG	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
509	NC_017289	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384451122
510	NC_017289	CAG	2	6	25469	25474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451122
511	NC_017289	TA	3	6	25504	25509	50 %	50 %	0 %	0 %	384451122
512	NC_017289	GCA	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451122
513	NC_017289	GTT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
514	NC_017289	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	384451122
515	NC_017289	TAA	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451122
516	NC_017289	CTT	3	9	25649	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
517	NC_017289	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
518	NC_017289	TTA	2	6	25753	25758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
519	NC_017289	TAT	2	6	25790	25795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
520	NC_017289	TCA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451122
521	NC_017289	CCA	2	6	25816	25821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451122
522	NC_017289	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451122
523	NC_017289	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	384451122
524	NC_017289	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384451122
525	NC_017289	TTC	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
526	NC_017289	TCT	2	6	25918	25923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451122
527	NC_017289	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	384451122
528	NC_017289	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384451122
529	NC_017289	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451122
530	NC_017289	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	384451122
531	NC_017289	AAT	2	6	26118	26123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451122
532	NC_017289	TGT	2	6	26211	26216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451122
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534	NC_017289	AAC	2	6	26329	26334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451122
535	NC_017289	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	384451122
536	NC_017289	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	384451122
537	NC_017289	AGA	2	6	26523	26528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451122
538	NC_017289	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451123
539	NC_017289	A	6	6	26773	26778	100 %	0 %	0 %	0 %	384451123
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541	NC_017289	TTA	2	6	26824	26829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451123
542	NC_017289	CAA	2	6	26902	26907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451123
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547	NC_017289	GTA	2	6	27065	27070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451123
548	NC_017289	ACA	2	6	27114	27119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451123
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550	NC_017289	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	384451123
551	NC_017289	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384451123
552	NC_017289	AAG	2	6	27275	27280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451123
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560	NC_017289	GCT	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451123
561	NC_017289	GTT	2	6	27793	27798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451123
562	NC_017289	CAG	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451123
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564	NC_017289	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	384451123
565	NC_017289	TGA	2	6	27975	27980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451123
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593	NC_017289	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	384451124
594	NC_017289	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	384451124
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599	NC_017289	GAT	3	9	29600	29608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451124
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610	NC_017289	T	6	6	29941	29946	0 %	100 %	0 %	0 %	384451125
611	NC_017289	ATC	2	6	29971	29976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451125
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622	NC_017289	A	6	6	30629	30634	100 %	0 %	0 %	0 %	384451126
623	NC_017289	T	7	7	30674	30680	0 %	100 %	0 %	0 %	384451126
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