MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 22014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017289	TCA	2	6	240182	240187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451328
4503	NC_017289	GAA	2	6	240211	240216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451328
4504	NC_017289	A	6	6	240416	240421	100 %	0 %	0 %	0 %	384451328
4505	NC_017289	A	6	6	240441	240446	100 %	0 %	0 %	0 %	384451328
4506	NC_017289	TAG	2	6	240547	240552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451328
4507	NC_017289	T	6	6	240651	240656	0 %	100 %	0 %	0 %	384451328
4508	NC_017289	AAAT	2	8	240670	240677	75 %	25 %	0 %	0 %	384451328
4509	NC_017289	TCT	2	6	240720	240725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451328
4510	NC_017289	GAG	2	6	240751	240756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451328
4511	NC_017289	CTT	2	6	240759	240764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451328
4512	NC_017289	CGT	2	6	241169	241174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451329
4513	NC_017289	GAA	2	6	241206	241211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451329
4514	NC_017289	ATC	2	6	241253	241258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451329
4515	NC_017289	TAT	2	6	241290	241295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
4516	NC_017289	GAG	2	6	241305	241310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451329
4517	NC_017289	GAT	2	6	241329	241334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
4518	NC_017289	TTCAG	2	10	241359	241368	20 %	40 %	20 %	20 %	384451329
4519	NC_017289	TTG	2	6	241434	241439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451329
4520	NC_017289	CAT	2	6	241551	241556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451329
4521	NC_017289	ATT	2	6	241561	241566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
4522	NC_017289	GTTT	2	8	241672	241679	0 %	75 %	25 %	0 %	384451329
4523	NC_017289	AGG	2	6	241698	241703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451329
4524	NC_017289	TG	3	6	241756	241761	0 %	50 %	50 %	0 %	384451329
4525	NC_017289	ATT	2	6	241796	241801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
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4528	NC_017289	TGA	2	6	241905	241910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
4529	NC_017289	TTG	2	6	241955	241960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451329
4530	NC_017289	CGG	2	6	241962	241967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384451329
4531	NC_017289	TTG	2	6	241973	241978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451329
4532	NC_017289	ATT	2	6	242008	242013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
4533	NC_017289	ATG	2	6	242078	242083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
4534	NC_017289	ATG	2	6	242110	242115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
4535	NC_017289	GCA	2	6	242140	242145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451329
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4537	NC_017289	A	6	6	242185	242190	100 %	0 %	0 %	0 %	384451329
4538	NC_017289	TCA	2	6	242196	242201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451329
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4540	NC_017289	AT	3	6	242336	242341	50 %	50 %	0 %	0 %	384451329
4541	NC_017289	TGA	2	6	242460	242465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
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4543	NC_017289	ATT	2	6	242485	242490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
4544	NC_017289	TGA	2	6	242529	242534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
4545	NC_017289	GAA	2	6	242578	242583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451329
4546	NC_017289	TTA	2	6	242605	242610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
4547	NC_017289	TTTAG	2	10	242649	242658	20 %	60 %	20 %	0 %	384451329
4548	NC_017289	AG	3	6	242719	242724	50 %	0 %	50 %	0 %	384451330
4549	NC_017289	T	7	7	242750	242756	0 %	100 %	0 %	0 %	384451330
4550	NC_017289	GCA	2	6	242780	242785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451330
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4552	NC_017289	ATG	2	6	242906	242911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451330
4553	NC_017289	ACT	2	6	242924	242929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451330
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4555	NC_017289	CGT	2	6	242990	242995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451330
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4557	NC_017289	TTTA	2	8	243123	243130	25 %	75 %	0 %	0 %	384451330
4558	NC_017289	ATCG	2	8	243170	243177	25 %	25 %	25 %	25 %	384451330
4559	NC_017289	AAT	2	6	243320	243325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451331
4560	NC_017289	TTC	2	6	243370	243375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451331
4561	NC_017289	CTT	2	6	243376	243381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451331
4562	NC_017289	CTG	2	6	243385	243390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451331
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4566	NC_017289	GTTGT	2	10	243454	243463	0 %	60 %	40 %	0 %	384451331
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4587	NC_017289	TTTCCT	2	12	244840	244851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451332
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4589	NC_017289	GA	3	6	244976	244981	50 %	0 %	50 %	0 %	384451332
4590	NC_017289	TTC	2	6	245042	245047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451332
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4592	NC_017289	TGA	2	6	245068	245073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451332
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4594	NC_017289	T	8	8	245189	245196	0 %	100 %	0 %	0 %	384451333
4595	NC_017289	GTT	2	6	245225	245230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451333
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4601	NC_017289	ATG	2	6	245730	245735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451333
4602	NC_017289	AGATA	2	10	245745	245754	60 %	20 %	20 %	0 %	384451333
4603	NC_017289	TTATC	2	10	245759	245768	20 %	60 %	0 %	20 %	384451333
4604	NC_017289	TTG	2	6	245812	245817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451334
4605	NC_017289	TAG	2	6	245823	245828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451334
4606	NC_017289	TCT	3	9	245864	245872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451334
4607	NC_017289	AGT	2	6	245895	245900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451334
4608	NC_017289	GCT	2	6	245954	245959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451334
4609	NC_017289	AG	3	6	245984	245989	50 %	0 %	50 %	0 %	384451334
4610	NC_017289	CTT	2	6	246000	246005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451334
4611	NC_017289	GAT	2	6	246027	246032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451334
4612	NC_017289	AGAA	2	8	246034	246041	75 %	0 %	25 %	0 %	384451334
4613	NC_017289	CAT	2	6	246186	246191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451334
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4615	NC_017289	CTTT	2	8	246275	246282	0 %	75 %	0 %	25 %	384451334
4616	NC_017289	AGC	2	6	246286	246291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451334
4617	NC_017289	ATGG	2	8	246393	246400	25 %	25 %	50 %	0 %	384451334
4618	NC_017289	TAA	2	6	246403	246408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451334
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4620	NC_017289	T	7	7	246603	246609	0 %	100 %	0 %	0 %	384451335
4621	NC_017289	AGA	2	6	246654	246659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451335
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4623	NC_017289	G	6	6	246820	246825	0 %	0 %	100 %	0 %	384451335
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