MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 14353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017287	CGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
2	NC_017287	AGA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450096
3	NC_017287	CTT	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
4	NC_017287	TCT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
5	NC_017287	TAT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450096
6	NC_017287	ATG	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450096
7	NC_017287	TGT	2	6	548	553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450096
8	NC_017287	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450096
9	NC_017287	ACA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450096
10	NC_017287	AGC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
11	NC_017287	GTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450096
12	NC_017287	AGC	3	9	908	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450096
13	NC_017287	CTA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450096
14	NC_017287	GGT	2	6	928	933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450096
15	NC_017287	CTT	2	6	1036	1041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450096
16	NC_017287	CTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
17	NC_017287	ACA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450097
18	NC_017287	ATG	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
19	NC_017287	TTA	2	6	1420	1425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450097
20	NC_017287	TAG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
21	NC_017287	TAG	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
22	NC_017287	CTA	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450097
23	NC_017287	TTC	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
24	NC_017287	ATA	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450097
25	NC_017287	CTT	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
26	NC_017287	GAA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450097
27	NC_017287	TGA	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
28	NC_017287	GAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450097
29	NC_017287	GTT	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450097
30	NC_017287	CTT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450097
31	NC_017287	TAA	2	6	2276	2281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450097
32	NC_017287	GAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450097
33	NC_017287	AGT	2	6	2551	2556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450098
34	NC_017287	TTA	2	6	2564	2569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
35	NC_017287	TCC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450098
36	NC_017287	TTC	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450098
37	NC_017287	TTA	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
38	NC_017287	AGA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450098
39	NC_017287	TAT	2	6	2880	2885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
40	NC_017287	TAT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450098
41	NC_017287	GAA	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
42	NC_017287	ATG	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
43	NC_017287	AGT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
44	NC_017287	CTT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450099
45	NC_017287	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450099
46	NC_017287	ATG	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
47	NC_017287	ATC	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450099
48	NC_017287	TGG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450099
49	NC_017287	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
50	NC_017287	TAA	2	6	4117	4122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450099
51	NC_017287	GAA	2	6	4154	4159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
52	NC_017287	AGC	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450099
53	NC_017287	TAA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450099
54	NC_017287	AGA	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
55	NC_017287	CTT	2	6	4358	4363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450099
56	NC_017287	ATG	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
57	NC_017287	GAT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450099
58	NC_017287	GCT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450099
59	NC_017287	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
60	NC_017287	AAG	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
61	NC_017287	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450099
62	NC_017287	AAG	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
63	NC_017287	AGA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450099
64	NC_017287	TTA	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450099
65	NC_017287	CAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450099
66	NC_017287	AGA	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450100
67	NC_017287	TGG	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450100
68	NC_017287	TAT	2	6	5529	5534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450100
69	NC_017287	GTT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
70	NC_017287	CAA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
71	NC_017287	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
72	NC_017287	TGT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
73	NC_017287	GGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450100
74	NC_017287	CAA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
75	NC_017287	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
76	NC_017287	GAT	2	6	5839	5844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
77	NC_017287	TGT	3	9	5891	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
78	NC_017287	TGA	2	6	5955	5960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
79	NC_017287	GCT	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450100
80	NC_017287	TGC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450100
81	NC_017287	TGA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450100
82	NC_017287	GAA	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450100
83	NC_017287	GAG	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450100
84	NC_017287	TTC	2	6	6205	6210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450100
85	NC_017287	CCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450100
86	NC_017287	CTT	2	6	6258	6263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450100
87	NC_017287	GTT	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450100
88	NC_017287	ACA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
89	NC_017287	ATA	2	6	6498	6503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450100
90	NC_017287	CAA	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450100
91	NC_017287	GAA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450101
92	NC_017287	CAT	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450101
93	NC_017287	ACA	2	6	6842	6847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450101
94	NC_017287	GTG	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450101
95	NC_017287	TGT	2	6	6921	6926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450101
96	NC_017287	TTC	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450101
97	NC_017287	GTT	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450101
98	NC_017287	CAT	2	6	7048	7053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450101
99	NC_017287	AGA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450101
100	NC_017287	TAA	2	6	7161	7166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450101
101	NC_017287	TTG	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450101
102	NC_017287	CTC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450101
103	NC_017287	GGA	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450101
104	NC_017287	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450101
105	NC_017287	ATT	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450101
106	NC_017287	TGC	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450101
107	NC_017287	TTC	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450101
108	NC_017287	TTG	2	6	7962	7967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450102
109	NC_017287	TGC	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450102
110	NC_017287	AAG	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
111	NC_017287	TTA	2	6	8161	8166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450102
112	NC_017287	CTT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450102
113	NC_017287	GAA	2	6	8251	8256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
114	NC_017287	TTC	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450102
115	NC_017287	TTC	2	6	8411	8416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450102
116	NC_017287	AGG	2	6	8618	8623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450102
117	NC_017287	CCT	2	6	8675	8680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450102
118	NC_017287	AAG	2	6	8723	8728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
119	NC_017287	GTT	2	6	8747	8752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450102
120	NC_017287	GAA	2	6	8797	8802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
121	NC_017287	CAT	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450102
122	NC_017287	TTC	2	6	8931	8936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450102
123	NC_017287	GAA	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
124	NC_017287	GAG	2	6	9053	9058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450102
125	NC_017287	AGT	2	6	9158	9163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450102
126	NC_017287	TTA	2	6	9350	9355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450102
127	NC_017287	AGA	2	6	9599	9604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450102
128	NC_017287	GTT	2	6	9645	9650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450102
129	NC_017287	CTT	2	6	9884	9889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450102
130	NC_017287	GCA	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450102
131	NC_017287	CCA	2	6	9948	9953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450102
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