MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017287	AG	3	6	208961	208966	50 %	0 %	50 %	0 %	384450297
4003	NC_017287	CTC	2	6	209008	209013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450297
4004	NC_017287	ATT	2	6	209056	209061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450297
4005	NC_017287	TTCT	2	8	209093	209100	0 %	75 %	0 %	25 %	384450297
4006	NC_017287	CAAC	2	8	209148	209155	50 %	0 %	0 %	50 %	384450297
4007	NC_017287	CAGGAA	2	12	209212	209223	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384450297
4008	NC_017287	ACA	2	6	209246	209251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450297
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4010	NC_017287	A	6	6	209340	209345	100 %	0 %	0 %	0 %	384450297
4011	NC_017287	ACA	2	6	209429	209434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450297
4012	NC_017287	CTT	2	6	209474	209479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450297
4013	NC_017287	A	8	8	209513	209520	100 %	0 %	0 %	0 %	384450297
4014	NC_017287	AGA	2	6	209525	209530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450297
4015	NC_017287	CGC	2	6	209644	209649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384450298
4016	NC_017287	AG	3	6	209744	209749	50 %	0 %	50 %	0 %	384450298
4017	NC_017287	GGA	2	6	209755	209760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450298
4018	NC_017287	CTGT	2	8	209853	209860	0 %	50 %	25 %	25 %	384450298
4019	NC_017287	AGA	2	6	209921	209926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450298
4020	NC_017287	AAT	2	6	209951	209956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450298
4021	NC_017287	TCCG	2	8	209960	209967	0 %	25 %	25 %	50 %	384450298
4022	NC_017287	AG	3	6	210038	210043	50 %	0 %	50 %	0 %	384450298
4023	NC_017287	GAA	2	6	210445	210450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450299
4024	NC_017287	ATG	2	6	210490	210495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450299
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4028	NC_017287	GATT	2	8	210611	210618	25 %	50 %	25 %	0 %	384450299
4029	NC_017287	GT	3	6	210629	210634	0 %	50 %	50 %	0 %	384450299
4030	NC_017287	AG	3	6	210649	210654	50 %	0 %	50 %	0 %	384450299
4031	NC_017287	AAAG	2	8	210663	210670	75 %	0 %	25 %	0 %	384450299
4032	NC_017287	TTG	2	6	210762	210767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450299
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4034	NC_017287	CTAA	2	8	210821	210828	50 %	25 %	0 %	25 %	384450299
4035	NC_017287	AAT	2	6	211171	211176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450300
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4037	NC_017287	ATT	2	6	211231	211236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450300
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4040	NC_017287	GTA	2	6	211337	211342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450300
4041	NC_017287	GA	3	6	211371	211376	50 %	0 %	50 %	0 %	384450300
4042	NC_017287	GTAG	2	8	211658	211665	25 %	25 %	50 %	0 %	384450301
4043	NC_017287	TGA	2	6	211672	211677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450301
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4046	NC_017287	TTC	2	6	211743	211748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450301
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4048	NC_017287	T	6	6	211802	211807	0 %	100 %	0 %	0 %	384450302
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4053	NC_017287	ATT	2	6	212391	212396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450303
4054	NC_017287	ATT	2	6	212595	212600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450303
4055	NC_017287	GTT	2	6	212601	212606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450303
4056	NC_017287	TCC	2	6	212635	212640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450303
4057	NC_017287	AGA	3	9	212643	212651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450303
4058	NC_017287	TGA	2	6	212733	212738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450303
4059	NC_017287	TTG	2	6	212903	212908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450304
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4061	NC_017287	TGC	2	6	213099	213104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450304
4062	NC_017287	GAAG	2	8	213116	213123	50 %	0 %	50 %	0 %	384450304
4063	NC_017287	CAT	2	6	213153	213158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450304
4064	NC_017287	AT	3	6	213157	213162	50 %	50 %	0 %	0 %	384450304
4065	NC_017287	AAAG	2	8	213178	213185	75 %	0 %	25 %	0 %	384450304
4066	NC_017287	TAC	2	6	213204	213209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450304
4067	NC_017287	GGT	2	6	213258	213263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450304
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4069	NC_017287	TCT	2	6	213382	213387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450304
4070	NC_017287	CATA	2	8	213455	213462	50 %	25 %	0 %	25 %	384450304
4071	NC_017287	CCT	2	6	213514	213519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450304
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4083	NC_017287	AGAA	2	8	214088	214095	75 %	0 %	25 %	0 %	384450305
4084	NC_017287	GAAAA	2	10	214117	214126	80 %	0 %	20 %	0 %	384450305
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4087	NC_017287	GTA	2	6	214209	214214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450305
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4091	NC_017287	CAA	2	6	214282	214287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450305
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4095	NC_017287	TAGCA	2	10	214483	214492	40 %	20 %	20 %	20 %	384450306
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4099	NC_017287	GCT	2	6	214680	214685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450306
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4102	NC_017287	T	6	6	214913	214918	0 %	100 %	0 %	0 %	384450306
4103	NC_017287	T	7	7	214946	214952	0 %	100 %	0 %	0 %	384450306
4104	NC_017287	T	6	6	215007	215012	0 %	100 %	0 %	0 %	384450306
4105	NC_017287	TTC	2	6	215146	215151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450306
4106	NC_017287	AAGAA	2	10	215181	215190	80 %	0 %	20 %	0 %	384450306
4107	NC_017287	AAG	2	6	215197	215202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450306
4108	NC_017287	TCA	2	6	215840	215845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450307
4109	NC_017287	AG	3	6	215950	215955	50 %	0 %	50 %	0 %	384450307
4110	NC_017287	GT	3	6	216034	216039	0 %	50 %	50 %	0 %	384450307
4111	NC_017287	GACA	2	8	216071	216078	50 %	0 %	25 %	25 %	384450307
4112	NC_017287	AG	3	6	216100	216105	50 %	0 %	50 %	0 %	384450307
4113	NC_017287	CTC	2	6	216157	216162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450307
4114	NC_017287	ATT	2	6	216185	216190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450307
4115	NC_017287	TTG	2	6	216293	216298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450307
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4118	NC_017287	TTG	2	6	216425	216430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450307
4119	NC_017287	AAG	2	6	216460	216465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450308
4120	NC_017287	GAAAG	2	10	216481	216490	60 %	0 %	40 %	0 %	384450308
4121	NC_017287	TAT	2	6	216569	216574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450308
4122	NC_017287	AGA	2	6	216596	216601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450308
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4124	NC_017287	TCA	2	6	216764	216769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450308
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4247	NC_017287	TCT	2	6	223152	223157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450310
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4250	NC_017287	GTA	2	6	223329	223334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450310
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4494	NC_017287	TC	4	8	236699	236706	0 %	50 %	0 %	50 %	384450323
4495	NC_017287	CTT	2	6	236766	236771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450323
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4497	NC_017287	TGT	2	6	236816	236821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450323
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4499	NC_017287	CGA	2	6	237329	237334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450324
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