MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017287	AAGC	2	8	158057	158064	50 %	0 %	25 %	25 %	384450250
3003	NC_017287	T	7	7	158094	158100	0 %	100 %	0 %	0 %	384450250
3004	NC_017287	TAG	2	6	158166	158171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450250
3005	NC_017287	A	6	6	158190	158195	100 %	0 %	0 %	0 %	384450250
3006	NC_017287	T	6	6	158206	158211	0 %	100 %	0 %	0 %	384450250
3007	NC_017287	GAA	2	6	158237	158242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450250
3008	NC_017287	TTG	2	6	158252	158257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450250
3009	NC_017287	GTA	2	6	158379	158384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450250
3010	NC_017287	TGC	2	6	158400	158405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450250
3011	NC_017287	TGA	2	6	158413	158418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450250
3012	NC_017287	ACG	2	6	158437	158442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450250
3013	NC_017287	TTAT	2	8	158443	158450	25 %	75 %	0 %	0 %	384450250
3014	NC_017287	GTT	2	6	158482	158487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450250
3015	NC_017287	TTG	2	6	158520	158525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450250
3016	NC_017287	TTGT	2	8	158533	158540	0 %	75 %	25 %	0 %	384450250
3017	NC_017287	CTT	2	6	158619	158624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450250
3018	NC_017287	AGCA	2	8	158626	158633	50 %	0 %	25 %	25 %	384450250
3019	NC_017287	T	9	9	158658	158666	0 %	100 %	0 %	0 %	384450250
3020	NC_017287	GAA	2	6	158680	158685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450250
3021	NC_017287	CAA	2	6	158708	158713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450250
3022	NC_017287	TTTA	2	8	158725	158732	25 %	75 %	0 %	0 %	384450250
3023	NC_017287	ATG	2	6	158781	158786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450250
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3031	NC_017287	GTC	2	6	159103	159108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450250
3032	NC_017287	TCC	2	6	159126	159131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450251
3033	NC_017287	TAT	2	6	159165	159170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450251
3034	NC_017287	ATG	2	6	159195	159200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450251
3035	NC_017287	GATG	2	8	159287	159294	25 %	25 %	50 %	0 %	384450251
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3038	NC_017287	GTT	2	6	159332	159337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450251
3039	NC_017287	TGA	2	6	159415	159420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450252
3040	NC_017287	A	7	7	159623	159629	100 %	0 %	0 %	0 %	384450252
3041	NC_017287	T	7	7	159639	159645	0 %	100 %	0 %	0 %	384450252
3042	NC_017287	CCTT	2	8	159654	159661	0 %	50 %	0 %	50 %	384450252
3043	NC_017287	TTG	2	6	159681	159686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450252
3044	NC_017287	TCT	2	6	159713	159718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450252
3045	NC_017287	ACTG	2	8	159758	159765	25 %	25 %	25 %	25 %	384450252
3046	NC_017287	GGA	2	6	159888	159893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450252
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3053	NC_017287	CTC	2	6	160714	160719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450253
3054	NC_017287	TGGATT	2	12	160728	160739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384450253
3055	NC_017287	GA	3	6	160754	160759	50 %	0 %	50 %	0 %	384450253
3056	NC_017287	CGA	2	6	160764	160769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450253
3057	NC_017287	GAA	2	6	160813	160818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450253
3058	NC_017287	AAGGT	2	10	160854	160863	40 %	20 %	40 %	0 %	384450253
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3061	NC_017287	TCT	2	6	161136	161141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450254
3062	NC_017287	CAG	2	6	161158	161163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450254
3063	NC_017287	T	7	7	161230	161236	0 %	100 %	0 %	0 %	384450254
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3065	NC_017287	TGT	2	6	161249	161254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450254
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3069	NC_017287	GTA	2	6	161437	161442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450254
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3073	NC_017287	AAG	2	6	161609	161614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450254
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3085	NC_017287	GGGGC	2	10	161940	161949	0 %	0 %	80 %	20 %	384450255
3086	NC_017287	GAC	2	6	162017	162022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450255
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3088	NC_017287	AGA	2	6	162052	162057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450255
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3091	NC_017287	TCG	2	6	162218	162223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450255
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3093	NC_017287	AGAA	2	8	162391	162398	75 %	0 %	25 %	0 %	384450256
3094	NC_017287	GATT	2	8	162405	162412	25 %	50 %	25 %	0 %	384450256
3095	NC_017287	TTCT	2	8	162413	162420	0 %	75 %	0 %	25 %	384450256
3096	NC_017287	AG	3	6	162421	162426	50 %	0 %	50 %	0 %	384450256
3097	NC_017287	T	7	7	162430	162436	0 %	100 %	0 %	0 %	384450256
3098	NC_017287	ATA	2	6	162457	162462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450256
3099	NC_017287	AG	3	6	162467	162472	50 %	0 %	50 %	0 %	384450256
3100	NC_017287	AT	3	6	162501	162506	50 %	50 %	0 %	0 %	384450256
3101	NC_017287	CTT	2	6	162549	162554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450256
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3103	NC_017287	T	6	6	162577	162582	0 %	100 %	0 %	0 %	384450256
3104	NC_017287	T	7	7	162627	162633	0 %	100 %	0 %	0 %	384450256
3105	NC_017287	TGT	2	6	162668	162673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450256
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3107	NC_017287	ATG	2	6	162800	162805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450256
3108	NC_017287	T	8	8	162880	162887	0 %	100 %	0 %	0 %	384450256
3109	NC_017287	AGCAT	2	10	163232	163241	40 %	20 %	20 %	20 %	384450257
3110	NC_017287	GGTG	2	8	163248	163255	0 %	25 %	75 %	0 %	384450257
3111	NC_017287	CT	3	6	163277	163282	0 %	50 %	0 %	50 %	384450257
3112	NC_017287	AAG	2	6	163327	163332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450257
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3116	NC_017287	AGGG	2	8	163443	163450	25 %	0 %	75 %	0 %	384450257
3117	NC_017287	T	6	6	163500	163505	0 %	100 %	0 %	0 %	384450257
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3120	NC_017287	AGT	2	6	163616	163621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450257
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3122	NC_017287	A	6	6	163744	163749	100 %	0 %	0 %	0 %	384450257
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3492	NC_017287	CTT	2	6	183318	183323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450275
3493	NC_017287	GC	3	6	183365	183370	0 %	0 %	50 %	50 %	384450275
3494	NC_017287	CTTC	2	8	183437	183444	0 %	50 %	0 %	50 %	384450275
3495	NC_017287	CTT	2	6	183543	183548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450275
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3497	NC_017287	A	6	6	183584	183589	100 %	0 %	0 %	0 %	384450275
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3499	NC_017287	GA	3	6	183656	183661	50 %	0 %	50 %	0 %	384450275
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