MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017287	G	6	6	77090	77095	0 %	0 %	100 %	0 %	384450159
1502	NC_017287	TGC	3	9	77102	77110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450159
1503	NC_017287	TGT	2	6	77111	77116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450159
1504	NC_017287	GCACA	2	10	77131	77140	40 %	0 %	20 %	40 %	384450159
1505	NC_017287	GGT	3	9	77160	77168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450159
1506	NC_017287	TAA	4	12	77738	77749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450160
1507	NC_017287	AGT	2	6	77819	77824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450160
1508	NC_017287	ATA	2	6	77851	77856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450160
1509	NC_017287	CTT	2	6	77873	77878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1510	NC_017287	TCT	2	6	77908	77913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1511	NC_017287	TTC	2	6	77930	77935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1512	NC_017287	ACC	2	6	77969	77974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450160
1513	NC_017287	AGT	2	6	77982	77987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450160
1514	NC_017287	TCT	2	6	77994	77999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1515	NC_017287	TCT	2	6	78003	78008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1516	NC_017287	AAAGA	2	10	78084	78093	80 %	0 %	20 %	0 %	384450160
1517	NC_017287	AAAG	2	8	78155	78162	75 %	0 %	25 %	0 %	384450160
1518	NC_017287	CACCTC	2	12	78238	78249	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384450160
1519	NC_017287	CTT	2	6	78256	78261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1520	NC_017287	AAC	2	6	78272	78277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450160
1521	NC_017287	GCT	2	6	78330	78335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450160
1522	NC_017287	AGT	2	6	78342	78347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450160
1523	NC_017287	CTC	2	6	78370	78375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450160
1524	NC_017287	CAG	2	6	78382	78387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450160
1525	NC_017287	ACC	2	6	78392	78397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450160
1526	NC_017287	GAA	2	6	78480	78485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450160
1527	NC_017287	CTG	2	6	78490	78495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450160
1528	NC_017287	CAC	2	6	78531	78536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450160
1529	NC_017287	ACAG	2	8	78638	78645	50 %	0 %	25 %	25 %	384450160
1530	NC_017287	CAA	2	6	78681	78686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450160
1531	NC_017287	GA	3	6	78769	78774	50 %	0 %	50 %	0 %	384450160
1532	NC_017287	CTT	2	6	78804	78809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450160
1533	NC_017287	GTT	2	6	78812	78817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450160
1534	NC_017287	AGTTC	2	10	79089	79098	20 %	40 %	20 %	20 %	384450160
1535	NC_017287	AG	3	6	79103	79108	50 %	0 %	50 %	0 %	384450160
1536	NC_017287	ATG	2	6	79189	79194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450160
1537	NC_017287	TAAG	2	8	79215	79222	50 %	25 %	25 %	0 %	384450160
1538	NC_017287	GGT	2	6	79249	79254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450161
1539	NC_017287	CCT	2	6	79267	79272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450161
1540	NC_017287	AGA	2	6	79335	79340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1541	NC_017287	AAG	2	6	79463	79468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1542	NC_017287	T	6	6	79471	79476	0 %	100 %	0 %	0 %	384450161
1543	NC_017287	GAA	2	6	79609	79614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1544	NC_017287	AAG	2	6	79622	79627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1545	NC_017287	A	7	7	79722	79728	100 %	0 %	0 %	0 %	384450161
1546	NC_017287	TCT	2	6	79838	79843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450161
1547	NC_017287	GTC	2	6	79929	79934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450161
1548	NC_017287	GCTGAT	2	12	80065	80076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384450161
1549	NC_017287	AC	3	6	80084	80089	50 %	0 %	0 %	50 %	384450161
1550	NC_017287	GAA	2	6	80140	80145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1551	NC_017287	TTCT	2	8	80165	80172	0 %	75 %	0 %	25 %	384450161
1552	NC_017287	AC	3	6	80238	80243	50 %	0 %	0 %	50 %	384450161
1553	NC_017287	TTG	2	6	80288	80293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450161
1554	NC_017287	ACCT	2	8	80300	80307	25 %	25 %	0 %	50 %	384450161
1555	NC_017287	AGA	2	6	80313	80318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450161
1556	NC_017287	T	6	6	80376	80381	0 %	100 %	0 %	0 %	384450161
1557	NC_017287	CAAA	2	8	80392	80399	75 %	0 %	0 %	25 %	384450161
1558	NC_017287	ATG	2	6	80555	80560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450162
1559	NC_017287	TAT	2	6	80585	80590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450162
1560	NC_017287	TGA	2	6	80617	80622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450162
1561	NC_017287	TAA	2	6	80641	80646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450162
1562	NC_017287	A	6	6	80645	80650	100 %	0 %	0 %	0 %	384450162
1563	NC_017287	TTC	2	6	80689	80694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450162
1564	NC_017287	T	6	6	80742	80747	0 %	100 %	0 %	0 %	384450162
1565	NC_017287	CTT	2	6	80783	80788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450162
1566	NC_017287	TAT	2	6	80791	80796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450162
1567	NC_017287	GAAA	2	8	80867	80874	75 %	0 %	25 %	0 %	384450162
1568	NC_017287	TAAA	2	8	80940	80947	75 %	25 %	0 %	0 %	384450162
1569	NC_017287	TTC	2	6	80995	81000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450162
1570	NC_017287	ATG	2	6	81018	81023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450162
1571	NC_017287	TCT	3	9	81086	81094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450162
1572	NC_017287	AG	3	6	81127	81132	50 %	0 %	50 %	0 %	384450162
1573	NC_017287	GCT	2	6	81191	81196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450162
1574	NC_017287	AGAA	2	8	81214	81221	75 %	0 %	25 %	0 %	384450162
1575	NC_017287	TCA	2	6	81297	81302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450162
1576	NC_017287	CT	3	6	81307	81312	0 %	50 %	0 %	50 %	384450162
1577	NC_017287	TAT	2	6	81348	81353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450162
1578	NC_017287	GAAG	2	8	81412	81419	50 %	0 %	50 %	0 %	384450162
1579	NC_017287	GCT	2	6	81425	81430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450162
1580	NC_017287	TTC	2	6	81450	81455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450162
1581	NC_017287	CGTAT	2	10	81458	81467	20 %	40 %	20 %	20 %	384450162
1582	NC_017287	AGA	2	6	81469	81474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450162
1583	NC_017287	GAA	2	6	81525	81530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450162
1584	NC_017287	ATG	2	6	81572	81577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450162
1585	NC_017287	TGC	2	6	81582	81587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450162
1586	NC_017287	A	7	7	81635	81641	100 %	0 %	0 %	0 %	384450162
1587	NC_017287	AC	3	6	81654	81659	50 %	0 %	0 %	50 %	384450162
1588	NC_017287	GCA	2	6	81676	81681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450162
1589	NC_017287	A	6	6	81698	81703	100 %	0 %	0 %	0 %	384450162
1590	NC_017287	CAT	2	6	81846	81851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450163
1591	NC_017287	AC	3	6	81856	81861	50 %	0 %	0 %	50 %	384450163
1592	NC_017287	ACA	2	6	81923	81928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450163
1593	NC_017287	GT	3	6	81970	81975	0 %	50 %	50 %	0 %	384450163
1594	NC_017287	TTC	2	6	81982	81987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450163
1595	NC_017287	CGG	2	6	81993	81998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450163
1596	NC_017287	AGA	2	6	82064	82069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450163
1597	NC_017287	GAT	2	6	82080	82085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450163
1598	NC_017287	TGA	2	6	82133	82138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450163
1599	NC_017287	AGA	2	6	82157	82162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450163
1600	NC_017287	AC	3	6	82234	82239	50 %	0 %	0 %	50 %	384450163
1601	NC_017287	GAA	2	6	82240	82245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450163
1602	NC_017287	GCA	2	6	82337	82342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450163
1603	NC_017287	GCA	2	6	82347	82352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450163
1604	NC_017287	A	6	6	82393	82398	100 %	0 %	0 %	0 %	384450163
1605	NC_017287	TGG	2	6	82457	82462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450163
1606	NC_017287	CAT	2	6	82491	82496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450163
1607	NC_017287	GTT	2	6	82497	82502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450163
1608	NC_017287	A	6	6	82598	82603	100 %	0 %	0 %	0 %	384450163
1609	NC_017287	GTT	2	6	82620	82625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450163
1610	NC_017287	CGT	2	6	82656	82661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450163
1611	NC_017287	GAAAA	2	10	82668	82677	80 %	0 %	20 %	0 %	384450163
1612	NC_017287	ACT	2	6	82694	82699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450163
1613	NC_017287	TG	3	6	82713	82718	0 %	50 %	50 %	0 %	384450163
1614	NC_017287	AAAG	2	8	82720	82727	75 %	0 %	25 %	0 %	384450163
1615	NC_017287	TC	3	6	82788	82793	0 %	50 %	0 %	50 %	384450163
1616	NC_017287	GAA	2	6	82800	82805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450163
1617	NC_017287	GAA	2	6	82845	82850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450163
1618	NC_017287	CAC	2	6	82865	82870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450163
1619	NC_017287	CAA	2	6	83060	83065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450164
1620	NC_017287	AGA	2	6	83073	83078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450164
1621	NC_017287	TGT	2	6	83145	83150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450164
1622	NC_017287	TCT	2	6	83151	83156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450164
1623	NC_017287	ACT	2	6	83160	83165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450164
1624	NC_017287	AAG	2	6	83188	83193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450164
1625	NC_017287	TAT	2	6	83404	83409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450165
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