MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017287	A	6	6	49829	49834	100 %	0 %	0 %	0 %	384450136
1003	NC_017287	GAA	3	9	49858	49866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450136
1004	NC_017287	GC	3	6	49884	49889	0 %	0 %	50 %	50 %	384450136
1005	NC_017287	A	6	6	49930	49935	100 %	0 %	0 %	0 %	384450136
1006	NC_017287	AGA	2	6	49941	49946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450136
1007	NC_017287	AAG	3	9	49967	49975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450136
1008	NC_017287	AAC	2	6	50036	50041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450136
1009	NC_017287	CAA	2	6	50075	50080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450136
1010	NC_017287	AAG	3	9	50081	50089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450136
1011	NC_017287	TTA	2	6	50182	50187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450136
1012	NC_017287	TC	3	6	50289	50294	0 %	50 %	0 %	50 %	384450136
1013	NC_017287	TGT	2	6	50436	50441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450136
1014	NC_017287	TA	3	6	50462	50467	50 %	50 %	0 %	0 %	384450136
1015	NC_017287	ATT	2	6	50494	50499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450136
1016	NC_017287	ATG	2	6	50516	50521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1017	NC_017287	AGC	2	6	50604	50609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450136
1018	NC_017287	TCC	2	6	50773	50778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450136
1019	NC_017287	AACA	2	8	50787	50794	75 %	0 %	0 %	25 %	384450136
1020	NC_017287	ACT	2	6	50805	50810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450136
1021	NC_017287	GAT	2	6	50848	50853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1022	NC_017287	GCA	2	6	50866	50871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450136
1023	NC_017287	ATC	2	6	50880	50885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450136
1024	NC_017287	TCA	2	6	51017	51022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450136
1025	NC_017287	AAT	2	6	51055	51060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450136
1026	NC_017287	AGT	2	6	51099	51104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1027	NC_017287	TGA	2	6	51219	51224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1028	NC_017287	CCT	2	6	51298	51303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450136
1029	NC_017287	ATG	2	6	51367	51372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1030	NC_017287	TTTGG	2	10	51388	51397	0 %	60 %	40 %	0 %	384450136
1031	NC_017287	CTC	2	6	51454	51459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450136
1032	NC_017287	CAA	2	6	51526	51531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450136
1033	NC_017287	CAT	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450136
1034	NC_017287	TTG	2	6	51542	51547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450136
1035	NC_017287	AAC	2	6	51567	51572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450136
1036	NC_017287	ATT	2	6	51580	51585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450136
1037	NC_017287	TTG	3	9	51641	51649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450136
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1039	NC_017287	GTT	2	6	51785	51790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450136
1040	NC_017287	CAG	2	6	51885	51890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450136
1041	NC_017287	ATG	2	6	51922	51927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
1042	NC_017287	TTA	2	6	51944	51949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450136
1043	NC_017287	CAA	2	6	51978	51983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450136
1044	NC_017287	TGA	2	6	52011	52016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450136
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1046	NC_017287	CCT	2	6	52644	52649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450137
1047	NC_017287	T	6	6	52656	52661	0 %	100 %	0 %	0 %	384450137
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1050	NC_017287	TGC	2	6	52734	52739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450137
1051	NC_017287	CTT	2	6	52830	52835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450138
1052	NC_017287	TTA	2	6	52847	52852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450138
1053	NC_017287	GTT	2	6	52860	52865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450138
1054	NC_017287	ACG	2	6	52885	52890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450138
1055	NC_017287	TGT	2	6	52923	52928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450138
1056	NC_017287	ATCC	2	8	52940	52947	25 %	25 %	0 %	50 %	384450138
1057	NC_017287	GT	3	6	53014	53019	0 %	50 %	50 %	0 %	384450138
1058	NC_017287	T	6	6	53048	53053	0 %	100 %	0 %	0 %	384450138
1059	NC_017287	CTT	2	6	53080	53085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450138
1060	NC_017287	T	6	6	53084	53089	0 %	100 %	0 %	0 %	384450138
1061	NC_017287	TTC	2	6	53149	53154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450138
1062	NC_017287	AT	3	6	53201	53206	50 %	50 %	0 %	0 %	384450138
1063	NC_017287	AGCA	2	8	53232	53239	50 %	0 %	25 %	25 %	384450138
1064	NC_017287	AAT	2	6	53257	53262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450138
1065	NC_017287	TTCA	2	8	53392	53399	25 %	50 %	0 %	25 %	384450138
1066	NC_017287	A	6	6	53570	53575	100 %	0 %	0 %	0 %	384450138
1067	NC_017287	TCA	2	6	53636	53641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450138
1068	NC_017287	T	6	6	53692	53697	0 %	100 %	0 %	0 %	384450138
1069	NC_017287	CGT	2	6	53755	53760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450138
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1072	NC_017287	GAA	2	6	53829	53834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450138
1073	NC_017287	T	6	6	53850	53855	0 %	100 %	0 %	0 %	384450139
1074	NC_017287	CAG	2	6	53881	53886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450139
1075	NC_017287	AGG	2	6	53949	53954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450139
1076	NC_017287	CGC	2	6	53966	53971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384450139
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1081	NC_017287	TGT	2	6	54196	54201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450139
1082	NC_017287	GTA	2	6	54209	54214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450139
1083	NC_017287	CATA	2	8	54240	54247	50 %	25 %	0 %	25 %	384450139
1084	NC_017287	CTTATC	2	12	54260	54271	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384450139
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1090	NC_017287	T	7	7	54871	54877	0 %	100 %	0 %	0 %	384450140
1091	NC_017287	CTT	2	6	54924	54929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450140
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1094	NC_017287	CTG	2	6	54972	54977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450140
1095	NC_017287	AAATTT	2	12	55028	55039	50 %	50 %	0 %	0 %	384450140
1096	NC_017287	GCA	2	6	55040	55045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450140
1097	NC_017287	ATA	2	6	55046	55051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450140
1098	NC_017287	CTA	2	6	55182	55187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450140
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1106	NC_017287	CTT	2	6	55648	55653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450141
1107	NC_017287	GAG	2	6	55663	55668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450141
1108	NC_017287	TAA	2	6	55709	55714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450141
1109	NC_017287	TCA	2	6	55725	55730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450141
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1111	NC_017287	CAG	2	6	55792	55797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450141
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1115	NC_017287	AG	4	8	55958	55965	50 %	0 %	50 %	0 %	384450141
1116	NC_017287	TAG	2	6	56147	56152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450142
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1118	NC_017287	TGA	2	6	56188	56193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450142
1119	NC_017287	GAA	2	6	56232	56237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450142
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1121	NC_017287	GCT	2	6	56304	56309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450142
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1123	NC_017287	AGAA	2	8	56360	56367	75 %	0 %	25 %	0 %	384450142
1124	NC_017287	GTT	2	6	56424	56429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450142
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