MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017287	CTGT	2	8	320597	320604	0 %	50 %	25 %	25 %	384450386
6002	NC_017287	TGC	2	6	320608	320613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450386
6003	NC_017287	C	14	14	320637	320650	0 %	0 %	0 %	100 %	384450386
6004	NC_017287	TCTG	2	8	320753	320760	0 %	50 %	25 %	25 %	384450386
6005	NC_017287	T	7	7	320767	320773	0 %	100 %	0 %	0 %	384450386
6006	NC_017287	TG	3	6	320831	320836	0 %	50 %	50 %	0 %	384450386
6007	NC_017287	T	6	6	320865	320870	0 %	100 %	0 %	0 %	384450386
6008	NC_017287	TAAT	2	8	320915	320922	50 %	50 %	0 %	0 %	384450386
6009	NC_017287	CAG	2	6	320928	320933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450386
6010	NC_017287	TTTA	2	8	320935	320942	25 %	75 %	0 %	0 %	384450386
6011	NC_017287	AGA	2	6	320988	320993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450386
6012	NC_017287	CTT	2	6	321006	321011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450386
6013	NC_017287	AGA	2	6	321040	321045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450386
6014	NC_017287	GCA	2	6	321077	321082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450386
6015	NC_017287	TGA	2	6	321099	321104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450386
6016	NC_017287	ATA	2	6	321122	321127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450386
6017	NC_017287	CAC	2	6	321156	321161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450386
6018	NC_017287	GTT	2	6	321217	321222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450386
6019	NC_017287	AGA	2	6	321292	321297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450386
6020	NC_017287	ATT	2	6	321322	321327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450386
6021	NC_017287	TGT	2	6	321382	321387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450386
6022	NC_017287	AAGAC	2	10	321404	321413	60 %	0 %	20 %	20 %	384450386
6023	NC_017287	AGT	2	6	321571	321576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450386
6024	NC_017287	AT	3	6	321690	321695	50 %	50 %	0 %	0 %	384450386
6025	NC_017287	TGT	2	6	321712	321717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450386
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6027	NC_017287	CAG	2	6	321786	321791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450386
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6029	NC_017287	TAT	2	6	322045	322050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450387
6030	NC_017287	GTA	2	6	322135	322140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450387
6031	NC_017287	CG	3	6	322152	322157	0 %	0 %	50 %	50 %	384450387
6032	NC_017287	CAG	2	6	322183	322188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450387
6033	NC_017287	CTT	2	6	322230	322235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450387
6034	NC_017287	ATG	2	6	322236	322241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450387
6035	NC_017287	AAG	2	6	322270	322275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450387
6036	NC_017287	CAT	2	6	322279	322284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450387
6037	NC_017287	AG	3	6	322322	322327	50 %	0 %	50 %	0 %	384450387
6038	NC_017287	TAC	2	6	322339	322344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450387
6039	NC_017287	GA	3	6	322445	322450	50 %	0 %	50 %	0 %	384450387
6040	NC_017287	TGT	2	6	322532	322537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450387
6041	NC_017287	GAG	2	6	322543	322548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450387
6042	NC_017287	TGTT	2	8	322564	322571	0 %	75 %	25 %	0 %	384450387
6043	NC_017287	ATT	2	6	322577	322582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450387
6044	NC_017287	TAG	2	6	322689	322694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450387
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6046	NC_017287	T	6	6	322722	322727	0 %	100 %	0 %	0 %	384450387
6047	NC_017287	AAT	2	6	322735	322740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450387
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6052	NC_017287	TGG	2	6	323153	323158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450387
6053	NC_017287	CGA	2	6	323248	323253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450387
6054	NC_017287	TGC	2	6	323294	323299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450387
6055	NC_017287	C	14	14	323320	323333	0 %	0 %	0 %	100 %	384450387
6056	NC_017287	TTAG	2	8	323358	323365	25 %	50 %	25 %	0 %	384450387
6057	NC_017287	AAC	2	6	323420	323425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450387
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6059	NC_017287	TG	3	6	323442	323447	0 %	50 %	50 %	0 %	384450387
6060	NC_017287	GTT	2	6	323512	323517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450387
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6062	NC_017287	GTC	2	6	323615	323620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450387
6063	NC_017287	TTTA	2	8	323624	323631	25 %	75 %	0 %	0 %	384450387
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6075	NC_017287	AGT	2	6	324302	324307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450387
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6089	NC_017287	TGC	2	6	324999	325004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450388
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6093	NC_017287	GTA	2	6	325308	325313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450388
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6104	NC_017287	C	14	14	325980	325993	0 %	0 %	0 %	100 %	384450388
6105	NC_017287	TTAG	2	8	326018	326025	25 %	50 %	25 %	0 %	384450388
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6110	NC_017287	T	6	6	326205	326210	0 %	100 %	0 %	0 %	384450388
6111	NC_017287	TCA	2	6	326213	326218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450388
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6491	NC_017287	A	6	6	354219	354224	100 %	0 %	0 %	0 %	384450404
6492	NC_017287	ATGATC	2	12	354243	354254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384450404
6493	NC_017287	TTCC	2	8	354287	354294	0 %	50 %	0 %	50 %	384450404
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