MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 22019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017287	GAT	2	6	289574	289579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450373
5502	NC_017287	G	6	6	289647	289652	0 %	0 %	100 %	0 %	384450373
5503	NC_017287	T	6	6	289686	289691	0 %	100 %	0 %	0 %	384450373
5504	NC_017287	TAAA	2	8	289704	289711	75 %	25 %	0 %	0 %	384450373
5505	NC_017287	TC	4	8	289911	289918	0 %	50 %	0 %	50 %	384450374
5506	NC_017287	TGA	2	6	289971	289976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450374
5507	NC_017287	TC	3	6	289997	290002	0 %	50 %	0 %	50 %	384450374
5508	NC_017287	TTA	2	6	290014	290019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450374
5509	NC_017287	TTG	3	9	290054	290062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450374
5510	NC_017287	GTATT	2	10	290099	290108	20 %	60 %	20 %	0 %	384450374
5511	NC_017287	GGT	2	6	290137	290142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450374
5512	NC_017287	TGA	2	6	290150	290155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450374
5513	NC_017287	TGC	2	6	290223	290228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450374
5514	NC_017287	GGATTA	2	12	290251	290262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450374
5515	NC_017287	GTT	2	6	290308	290313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450374
5516	NC_017287	GAG	2	6	290324	290329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450374
5517	NC_017287	GGC	2	6	290409	290414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384450374
5518	NC_017287	AAG	2	6	290458	290463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5519	NC_017287	AGG	2	6	290553	290558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450374
5520	NC_017287	CTG	2	6	290564	290569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450374
5521	NC_017287	ATTG	2	8	290577	290584	25 %	50 %	25 %	0 %	384450374
5522	NC_017287	TGCT	2	8	290585	290592	0 %	50 %	25 %	25 %	384450374
5523	NC_017287	CCT	2	6	290593	290598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450374
5524	NC_017287	GAA	2	6	290661	290666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5525	NC_017287	T	6	6	290667	290672	0 %	100 %	0 %	0 %	384450374
5526	NC_017287	GAA	2	6	290715	290720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5527	NC_017287	TGA	2	6	290727	290732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450374
5528	NC_017287	GTT	2	6	290752	290757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450374
5529	NC_017287	A	6	6	290771	290776	100 %	0 %	0 %	0 %	384450374
5530	NC_017287	AAGA	2	8	290782	290789	75 %	0 %	25 %	0 %	384450374
5531	NC_017287	ATAGAA	2	12	290791	290802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384450374
5532	NC_017287	CTG	2	6	290858	290863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450374
5533	NC_017287	TGCT	2	8	290933	290940	0 %	50 %	25 %	25 %	384450374
5534	NC_017287	TGT	2	6	290952	290957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450374
5535	NC_017287	TTG	2	6	290999	291004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450374
5536	NC_017287	AAG	2	6	291116	291121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5537	NC_017287	A	6	6	291142	291147	100 %	0 %	0 %	0 %	384450374
5538	NC_017287	G	6	6	291156	291161	0 %	0 %	100 %	0 %	384450374
5539	NC_017287	GAA	2	6	291247	291252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5540	NC_017287	CTT	2	6	291334	291339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450374
5541	NC_017287	ATC	2	6	291452	291457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450374
5542	NC_017287	AG	3	6	291469	291474	50 %	0 %	50 %	0 %	384450374
5543	NC_017287	ACT	2	6	291494	291499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450374
5544	NC_017287	AGA	2	6	291534	291539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450374
5545	NC_017287	TCG	2	6	291545	291550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450374
5546	NC_017287	CGA	2	6	291561	291566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450374
5547	NC_017287	CATA	2	8	291807	291814	50 %	25 %	0 %	25 %	384450375
5548	NC_017287	AGG	2	6	291843	291848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450375
5549	NC_017287	CTC	2	6	291863	291868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450375
5550	NC_017287	GAT	3	9	291877	291885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450375
5551	NC_017287	AGA	2	6	291966	291971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450375
5552	NC_017287	ATC	2	6	292035	292040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450375
5553	NC_017287	AGG	2	6	292053	292058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450375
5554	NC_017287	TTC	2	6	292072	292077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450375
5555	NC_017287	GAAA	2	8	292112	292119	75 %	0 %	25 %	0 %	384450375
5556	NC_017287	A	6	6	292171	292176	100 %	0 %	0 %	0 %	384450375
5557	NC_017287	AC	3	6	292209	292214	50 %	0 %	0 %	50 %	384450375
5558	NC_017287	TTC	2	6	292320	292325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450375
5559	NC_017287	TGGT	2	8	292383	292390	0 %	50 %	50 %	0 %	384450375
5560	NC_017287	ACA	2	6	292407	292412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450375
5561	NC_017287	TGG	2	6	292466	292471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450375
5562	NC_017287	GAT	2	6	292485	292490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450375
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5564	NC_017287	GATA	2	8	292597	292604	50 %	25 %	25 %	0 %	384450375
5565	NC_017287	TGA	2	6	292626	292631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450375
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5568	NC_017287	GAT	2	6	293047	293052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450375
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5594	NC_017287	CTT	2	6	294393	294398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450376
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5603	NC_017287	CGTA	2	8	294750	294757	25 %	25 %	25 %	25 %	384450376
5604	NC_017287	AG	3	6	294788	294793	50 %	0 %	50 %	0 %	384450376
5605	NC_017287	AT	3	6	294814	294819	50 %	50 %	0 %	0 %	384450376
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5609	NC_017287	GATT	2	8	295049	295056	25 %	50 %	25 %	0 %	384450376
5610	NC_017287	AG	3	6	295062	295067	50 %	0 %	50 %	0 %	384450376
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