MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN plasmid unnamed

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017286	AGG	2	6	35	40	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450087
2	NC_017286	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450087
3	NC_017286	TAC	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450087
4	NC_017286	CCA	2	6	381	386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384450087
5	NC_017286	GAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450087
6	NC_017286	CAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450087
7	NC_017286	AGA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450087
8	NC_017286	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450087
9	NC_017286	AAG	2	6	804	809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450088
10	NC_017286	AGA	3	9	844	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450088
11	NC_017286	AGA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450088
12	NC_017286	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450088
13	NC_017286	ACA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450088
14	NC_017286	AAC	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450088
15	NC_017286	TAC	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450088
16	NC_017286	GCT	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450088
17	NC_017286	TTG	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450088
18	NC_017286	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450088
19	NC_017286	TTC	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450088
20	NC_017286	CTC	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450088
21	NC_017286	ATT	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450089
22	NC_017286	AGC	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450089
23	NC_017286	GTT	2	6	2069	2074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450089
24	NC_017286	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450089
25	NC_017286	TGA	2	6	2370	2375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450089
26	NC_017286	TAT	3	9	2465	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450089
27	NC_017286	CTC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384450089
28	NC_017286	TCT	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450089
29	NC_017286	TGT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450090
30	NC_017286	ATT	2	6	2766	2771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450090
31	NC_017286	TGA	3	9	2825	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450090
32	NC_017286	CTG	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450090
33	NC_017286	AAT	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450090
34	NC_017286	TAA	2	6	3076	3081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450090
35	NC_017286	CGT	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450090
36	NC_017286	TTG	2	6	3332	3337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450090
37	NC_017286	GCT	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450090
38	NC_017286	TAT	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450090
39	NC_017286	CTT	2	6	3619	3624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450090
40	NC_017286	TGT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450090
41	NC_017286	TGT	3	9	3735	3743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450090
42	NC_017286	ATT	2	6	3798	3803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450090
43	NC_017286	TGT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450091
44	NC_017286	GAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450091
45	NC_017286	GAA	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450091
46	NC_017286	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450091
47	NC_017286	TTC	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450091
48	NC_017286	TTA	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450091
49	NC_017286	CTT	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450091
50	NC_017286	CAA	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450091
51	NC_017286	CTA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450091
52	NC_017286	CAG	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384450091
53	NC_017286	ATT	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450091
54	NC_017286	AAG	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450091
55	NC_017286	TCT	2	6	4756	4761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450091
56	NC_017286	TGT	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450091
57	NC_017286	GTG	2	6	5009	5014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450091
58	NC_017286	GTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384450091
59	NC_017286	ATT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450091
60	NC_017286	ACT	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450091
61	NC_017286	TAA	2	6	5138	5143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450091
62	NC_017286	TTC	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450091
63	NC_017286	AAG	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450091
64	NC_017286	GCT	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384450092
65	NC_017286	CAA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450092
66	NC_017286	AAG	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450092
67	NC_017286	AAG	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450092
68	NC_017286	CAA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450092
69	NC_017286	TTA	2	6	5764	5769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450092
70	NC_017286	TAG	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450092
71	NC_017286	CAA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450092
72	NC_017286	CAA	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450092
73	NC_017286	CAA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384450092
74	NC_017286	TTA	2	6	6404	6409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384450093
75	NC_017286	TAC	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450093
76	NC_017286	ACT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450093
77	NC_017286	AAG	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450093
78	NC_017286	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450093
79	NC_017286	CTT	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384450093
80	NC_017286	TAA	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384450093
81	NC_017286	GGA	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450093
82	NC_017286	AAG	2	6	6863	6868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450093
83	NC_017286	AGG	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384450093
84	NC_017286	GTG	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384450093
85	NC_017286	ATC	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384450094
86	NC_017286	AGT	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384450094
87	NC_017286	GAA	2	6	7416	7421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384450094

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.