MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	TTTTG	2	10	2542	2551	0 %	80 %	20 %	0 %	384448991
2	NC_017285	AAAGT	2	10	3160	3169	60 %	20 %	20 %	0 %	384448992
3	NC_017285	AAAGA	2	10	4329	4338	80 %	0 %	20 %	0 %	384448992
4	NC_017285	AGAGA	2	10	4881	4890	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
5	NC_017285	AAGGA	2	10	5144	5153	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
6	NC_017285	AGATG	2	10	5566	5575	40 %	20 %	40 %	0 %	384448993
7	NC_017285	TGTAA	2	10	12481	12490	40 %	40 %	20 %	0 %	384448996
8	NC_017285	AAGGG	2	10	13407	13416	40 %	0 %	60 %	0 %	384448996
9	NC_017285	CCCTT	2	10	13864	13873	0 %	40 %	0 %	60 %	384448997
10	NC_017285	CTTGC	2	10	14161	14170	0 %	40 %	20 %	40 %	384448997
11	NC_017285	AATTT	2	10	15881	15890	40 %	60 %	0 %	0 %	384448998
12	NC_017285	GTACA	2	10	16903	16912	40 %	20 %	20 %	20 %	384448999
13	NC_017285	TAATA	2	10	17399	17408	60 %	40 %	0 %	0 %	384448999
14	NC_017285	AGATA	2	10	18628	18637	60 %	20 %	20 %	0 %	384449001
15	NC_017285	GAAAA	2	10	22449	22458	80 %	0 %	20 %	0 %	384449005
16	NC_017285	GTGAT	2	10	24438	24447	20 %	40 %	40 %	0 %	384449006
17	NC_017285	TTTGA	2	10	26371	26380	20 %	60 %	20 %	0 %	384449007
18	NC_017285	TAAAT	2	10	28500	28509	60 %	40 %	0 %	0 %	384449008
19	NC_017285	GATTA	2	10	30816	30825	40 %	40 %	20 %	0 %	384449009
20	NC_017285	GATCC	2	10	33606	33615	20 %	20 %	20 %	40 %	384449013
21	NC_017285	ATTTT	2	10	38707	38716	20 %	80 %	0 %	0 %	384449019
22	NC_017285	GGAAG	2	10	40713	40722	40 %	0 %	60 %	0 %	384449021
23	NC_017285	TCGAT	2	10	43198	43207	20 %	40 %	20 %	20 %	384449024
24	NC_017285	CCTTT	2	10	43966	43975	0 %	60 %	0 %	40 %	384449024
25	NC_017285	CTTTG	2	10	45242	45251	0 %	60 %	20 %	20 %	384449026
26	NC_017285	AGAGA	2	10	48978	48987	60 %	0 %	40 %	0 %	384449030
27	NC_017285	CTAAC	2	10	49930	49939	40 %	20 %	0 %	40 %	384449031
28	NC_017285	CTCCC	2	10	49984	49993	0 %	20 %	0 %	80 %	384449031
29	NC_017285	GGTTA	2	10	51187	51196	20 %	40 %	40 %	0 %	384449032
30	NC_017285	AAAGT	2	10	53586	53595	60 %	20 %	20 %	0 %	384449033
31	NC_017285	GCAAG	2	10	54836	54845	40 %	0 %	40 %	20 %	384449034
32	NC_017285	ATTGC	2	10	61895	61904	20 %	40 %	20 %	20 %	384449041
33	NC_017285	TTATG	2	10	63077	63086	20 %	60 %	20 %	0 %	384449041
34	NC_017285	TTTTC	2	10	63124	63133	0 %	80 %	0 %	20 %	384449041
35	NC_017285	GTTTT	2	10	71925	71934	0 %	80 %	20 %	0 %	384449048
36	NC_017285	TGGGG	2	10	72469	72478	0 %	20 %	80 %	0 %	384449050
37	NC_017285	TTTTG	2	10	74341	74350	0 %	80 %	20 %	0 %	384449053
38	NC_017285	TCTTT	2	10	76019	76028	0 %	80 %	0 %	20 %	384449055
39	NC_017285	TCTTT	2	10	77620	77629	0 %	80 %	0 %	20 %	384449057
40	NC_017285	TGCAA	2	10	81242	81251	40 %	20 %	20 %	20 %	384449061
41	NC_017285	AAAAC	2	10	82484	82493	80 %	0 %	0 %	20 %	384449062
42	NC_017285	AGAAA	2	10	84399	84408	80 %	0 %	20 %	0 %	384449063
43	NC_017285	GAGAG	2	10	86188	86197	40 %	0 %	60 %	0 %	384449065
44	NC_017285	ACAAT	2	10	88094	88103	60 %	20 %	0 %	20 %	384449067
45	NC_017285	ACGTC	2	10	90534	90543	20 %	20 %	20 %	40 %	384449071
46	NC_017285	TAAAG	2	10	92128	92137	60 %	20 %	20 %	0 %	384449072
47	NC_017285	TTTTC	2	10	93144	93153	0 %	80 %	0 %	20 %	384449072
48	NC_017285	AAATC	2	10	93710	93719	60 %	20 %	0 %	20 %	384449072
49	NC_017285	GGATT	2	10	96114	96123	20 %	40 %	40 %	0 %	384449073
50	NC_017285	CACTT	2	10	97288	97297	20 %	40 %	0 %	40 %	384449075
51	NC_017285	TTCTT	2	10	97501	97510	0 %	80 %	0 %	20 %	384449075
52	NC_017285	GCTTT	2	10	97667	97676	0 %	60 %	20 %	20 %	384449075
53	NC_017285	CGATA	2	10	97754	97763	40 %	20 %	20 %	20 %	384449075
54	NC_017285	TTAAA	2	10	99367	99376	60 %	40 %	0 %	0 %	384449076
55	NC_017285	GGGTG	2	10	102604	102613	0 %	20 %	80 %	0 %	384449080
56	NC_017285	TCAAA	2	10	103793	103802	60 %	20 %	0 %	20 %	384449083
57	NC_017285	TTAAC	2	10	106187	106196	40 %	40 %	0 %	20 %	384449085
58	NC_017285	TTGGA	2	10	111422	111431	20 %	40 %	40 %	0 %	384449091
59	NC_017285	AAATA	2	10	111827	111836	80 %	20 %	0 %	0 %	384449092
60	NC_017285	GCAAT	2	10	114747	114756	40 %	20 %	20 %	20 %	384449097
61	NC_017285	ATGCA	2	10	115133	115142	40 %	20 %	20 %	20 %	384449098
62	NC_017285	TGCTT	2	10	119621	119630	0 %	60 %	20 %	20 %	384449109
63	NC_017285	AGTTT	2	10	120531	120540	20 %	60 %	20 %	0 %	384449109
64	NC_017285	TATGT	2	10	120547	120556	20 %	60 %	20 %	0 %	384449109
65	NC_017285	TGAAA	2	10	120623	120632	60 %	20 %	20 %	0 %	384449109
66	NC_017285	ACAAT	2	10	121472	121481	60 %	20 %	0 %	20 %	384449111
67	NC_017285	TGCTT	2	10	121961	121970	0 %	60 %	20 %	20 %	384449112
68	NC_017285	TTGAC	2	10	124125	124134	20 %	40 %	20 %	20 %	384449114
69	NC_017285	GTTTA	2	10	128401	128410	20 %	60 %	20 %	0 %	384449119
70	NC_017285	ACGTA	2	10	128547	128556	40 %	20 %	20 %	20 %	384449120
71	NC_017285	TTGGT	2	10	130667	130676	0 %	60 %	40 %	0 %	384449121
72	NC_017285	CAACT	2	10	130790	130799	40 %	20 %	0 %	40 %	384449121
73	NC_017285	GAAAA	2	10	134834	134843	80 %	0 %	20 %	0 %	384449125
74	NC_017285	TCCTA	2	10	134919	134928	20 %	40 %	0 %	40 %	384449125
75	NC_017285	CTGGA	2	10	135235	135244	20 %	20 %	40 %	20 %	384449125
76	NC_017285	CTTTG	2	10	136836	136845	0 %	60 %	20 %	20 %	384449127
77	NC_017285	AGAGA	2	10	137149	137158	60 %	0 %	40 %	0 %	384449127
78	NC_017285	TTTGG	2	10	138928	138937	0 %	60 %	40 %	0 %	384449127
79	NC_017285	TCTCC	2	10	141908	141917	0 %	40 %	0 %	60 %	384449131
80	NC_017285	GAGGG	2	10	142607	142616	20 %	0 %	80 %	0 %	384449132
81	NC_017285	TACCT	2	10	142750	142759	20 %	40 %	0 %	40 %	384449132
82	NC_017285	GGATA	2	10	144052	144061	40 %	20 %	40 %	0 %	384449133
83	NC_017285	ATCTA	2	10	145053	145062	40 %	40 %	0 %	20 %	384449134
84	NC_017285	GTCCT	2	10	145821	145830	0 %	40 %	20 %	40 %	384449135
85	NC_017285	GACGA	2	10	148964	148973	40 %	0 %	40 %	20 %	384449139
86	NC_017285	TATGG	2	10	151689	151698	20 %	40 %	40 %	0 %	384449141
87	NC_017285	AGAGA	2	10	154049	154058	60 %	0 %	40 %	0 %	384449143
88	NC_017285	TGGAG	2	10	155383	155392	20 %	20 %	60 %	0 %	384449144
89	NC_017285	TTTTC	2	10	157263	157272	0 %	80 %	0 %	20 %	384449146
90	NC_017285	AAGAA	2	10	158173	158182	80 %	0 %	20 %	0 %	384449146
91	NC_017285	TTATT	2	10	159018	159027	20 %	80 %	0 %	0 %	384449147
92	NC_017285	TTGTT	2	10	161342	161351	0 %	80 %	20 %	0 %	384449149
93	NC_017285	AAGCT	2	10	163937	163946	40 %	20 %	20 %	20 %	384449152
94	NC_017285	GCTTT	2	10	165178	165187	0 %	60 %	20 %	20 %	384449153
95	NC_017285	TCCAG	2	10	165724	165733	20 %	20 %	20 %	40 %	384449154
96	NC_017285	AAGAG	2	10	168035	168044	60 %	0 %	40 %	0 %	384449155
97	NC_017285	TTTGA	2	10	168861	168870	20 %	60 %	20 %	0 %	384449156
98	NC_017285	TTTGT	2	10	169272	169281	0 %	80 %	20 %	0 %	384449157
99	NC_017285	GGGGA	2	10	169449	169458	20 %	0 %	80 %	0 %	384449157
100	NC_017285	CTTGT	2	10	170306	170315	0 %	60 %	20 %	20 %	384449158
101	NC_017285	TTTGA	2	10	171480	171489	20 %	60 %	20 %	0 %	384449159
102	NC_017285	AGGAG	2	10	172555	172564	40 %	0 %	60 %	0 %	384449160
103	NC_017285	CAAAA	2	10	173617	173626	80 %	0 %	0 %	20 %	384449162
104	NC_017285	ACTTG	2	10	176909	176918	20 %	40 %	20 %	20 %	384449166
105	NC_017285	TTTGA	2	10	177846	177855	20 %	60 %	20 %	0 %	384449166
106	NC_017285	CGTCC	2	10	178994	179003	0 %	20 %	20 %	60 %	384449166
107	NC_017285	AAAAG	2	10	181729	181738	80 %	0 %	20 %	0 %	384449168
108	NC_017285	CATCG	2	10	182890	182899	20 %	20 %	20 %	40 %	384449168
109	NC_017285	AGATA	2	10	183004	183013	60 %	20 %	20 %	0 %	384449168
110	NC_017285	AAGAA	2	10	184725	184734	80 %	0 %	20 %	0 %	384449171
111	NC_017285	TATTC	2	10	186147	186156	20 %	60 %	0 %	20 %	384449173
112	NC_017285	CAAAA	2	10	188775	188784	80 %	0 %	0 %	20 %	384449177
113	NC_017285	AAATC	2	10	189346	189355	60 %	20 %	0 %	20 %	384449177
114	NC_017285	AAACG	2	10	191428	191437	60 %	0 %	20 %	20 %	384449177
115	NC_017285	ACAAG	2	10	192570	192579	60 %	0 %	20 %	20 %	384449178
116	NC_017285	GGCAT	2	10	193193	193202	20 %	20 %	40 %	20 %	384449178
117	NC_017285	CTCTT	2	10	193451	193460	0 %	60 %	0 %	40 %	384449178
118	NC_017285	ACCTC	2	10	197634	197643	20 %	20 %	0 %	60 %	384449181
119	NC_017285	ATTTC	2	10	198385	198394	20 %	60 %	0 %	20 %	384449182
120	NC_017285	CGTAA	2	10	200022	200031	40 %	20 %	20 %	20 %	384449184
121	NC_017285	ATAGG	2	10	201971	201980	40 %	20 %	40 %	0 %	384449186
122	NC_017285	TTCCC	2	10	202384	202393	0 %	40 %	0 %	60 %	384449186
123	NC_017285	GTAAC	2	10	202750	202759	40 %	20 %	20 %	20 %	384449186
124	NC_017285	AAGAT	2	10	203621	203630	60 %	20 %	20 %	0 %	384449186
125	NC_017285	AGGTA	2	10	204001	204010	40 %	20 %	40 %	0 %	384449187
126	NC_017285	AAGTC	2	10	205586	205595	40 %	20 %	20 %	20 %	384449189
127	NC_017285	AAAGC	2	10	208273	208282	60 %	0 %	20 %	20 %	384449191
128	NC_017285	TAACC	2	10	212613	212622	40 %	20 %	0 %	40 %	384449197
129	NC_017285	CTTTT	2	10	215437	215446	0 %	80 %	0 %	20 %	384449200
130	NC_017285	GAATA	2	10	215845	215854	60 %	20 %	20 %	0 %	384449200
131	NC_017285	ATCTT	2	10	216512	216521	20 %	60 %	0 %	20 %	384449200
132	NC_017285	TTGTG	2	10	219727	219736	0 %	60 %	40 %	0 %	384449200
133	NC_017285	TTTTC	2	10	221590	221599	0 %	80 %	0 %	20 %	384449201
134	NC_017285	AAAAT	2	10	225888	225897	80 %	20 %	0 %	0 %	384449205
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