MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017285	ATC	2	6	208331	208336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449191
4002	NC_017285	CGT	2	6	208363	208368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449191
4003	NC_017285	TCT	2	6	208393	208398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449191
4004	NC_017285	A	6	6	208529	208534	100 %	0 %	0 %	0 %	384449191
4005	NC_017285	AAG	2	6	208538	208543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449191
4006	NC_017285	AAG	2	6	208552	208557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449191
4007	NC_017285	AGC	2	6	208572	208577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449192
4008	NC_017285	A	6	6	208584	208589	100 %	0 %	0 %	0 %	384449192
4009	NC_017285	CAG	2	6	208638	208643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449192
4010	NC_017285	TTG	2	6	208647	208652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449192
4011	NC_017285	CAC	2	6	208734	208739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449192
4012	NC_017285	A	6	6	208748	208753	100 %	0 %	0 %	0 %	384449192
4013	NC_017285	AG	3	6	208757	208762	50 %	0 %	50 %	0 %	384449192
4014	NC_017285	ACC	2	6	209128	209133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449193
4015	NC_017285	A	8	8	209145	209152	100 %	0 %	0 %	0 %	384449193
4016	NC_017285	ATG	2	6	209264	209269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449193
4017	NC_017285	ACC	2	6	209282	209287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449193
4018	NC_017285	TTG	2	6	209329	209334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449193
4019	NC_017285	CCT	2	6	209354	209359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449193
4020	NC_017285	AAT	2	6	209629	209634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449193
4021	NC_017285	T	6	6	209641	209646	0 %	100 %	0 %	0 %	384449193
4022	NC_017285	TAT	2	6	209674	209679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449193
4023	NC_017285	AGA	2	6	209700	209705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449193
4024	NC_017285	GGAA	2	8	209706	209713	50 %	0 %	50 %	0 %	384449193
4025	NC_017285	AG	4	8	209740	209747	50 %	0 %	50 %	0 %	384449193
4026	NC_017285	TCT	2	6	209772	209777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449193
4027	NC_017285	AGGG	2	8	209816	209823	25 %	0 %	75 %	0 %	384449193
4028	NC_017285	AGA	2	6	209877	209882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449193
4029	NC_017285	CCTC	2	8	209906	209913	0 %	25 %	0 %	75 %	384449193
4030	NC_017285	GTT	2	6	209932	209937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449193
4031	NC_017285	CTTC	2	8	210124	210131	0 %	50 %	0 %	50 %	384449194
4032	NC_017285	CCT	2	6	210185	210190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449194
4033	NC_017285	TCA	2	6	210235	210240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449194
4034	NC_017285	AAT	2	6	210255	210260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449194
4035	NC_017285	TTA	2	6	210262	210267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449194
4036	NC_017285	ACC	2	6	210357	210362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449194
4037	NC_017285	TTGGGC	2	12	210439	210450	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384449194
4038	NC_017285	AAGC	2	8	210937	210944	50 %	0 %	25 %	25 %	384449195
4039	NC_017285	TGAT	2	8	210969	210976	25 %	50 %	25 %	0 %	384449195
4040	NC_017285	AAG	2	6	211008	211013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449195
4041	NC_017285	AGT	2	6	211129	211134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449195
4042	NC_017285	A	6	6	211148	211153	100 %	0 %	0 %	0 %	384449195
4043	NC_017285	ATC	2	6	211164	211169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449195
4044	NC_017285	TCGT	2	8	211362	211369	0 %	50 %	25 %	25 %	384449196
4045	NC_017285	AG	3	6	211371	211376	50 %	0 %	50 %	0 %	384449196
4046	NC_017285	GAT	2	6	211418	211423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449196
4047	NC_017285	GTA	2	6	211451	211456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449196
4048	NC_017285	ACGT	2	8	211471	211478	25 %	25 %	25 %	25 %	384449196
4049	NC_017285	TGT	2	6	211486	211491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449196
4050	NC_017285	GTT	2	6	211662	211667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449197
4051	NC_017285	AGG	2	6	211697	211702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449197
4052	NC_017285	TGG	2	6	211718	211723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449197
4053	NC_017285	GGC	2	6	211728	211733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384449197
4054	NC_017285	CCA	2	6	211750	211755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449197
4055	NC_017285	GTCA	2	8	211813	211820	25 %	25 %	25 %	25 %	384449197
4056	NC_017285	AGG	2	6	211961	211966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449197
4057	NC_017285	AGGAAA	2	12	211973	211984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449197
4058	NC_017285	CTT	2	6	211988	211993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449197
4059	NC_017285	TCA	2	6	212276	212281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449197
4060	NC_017285	TTC	2	6	212305	212310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449197
4061	NC_017285	AG	4	8	212361	212368	50 %	0 %	50 %	0 %	384449197
4062	NC_017285	GAA	2	6	212379	212384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449197
4063	NC_017285	TCA	2	6	212417	212422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449197
4064	NC_017285	AAAG	2	8	212435	212442	75 %	0 %	25 %	0 %	384449197
4065	NC_017285	TAAA	2	8	212458	212465	75 %	25 %	0 %	0 %	384449197
4066	NC_017285	TGA	2	6	212468	212473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449197
4067	NC_017285	TCT	2	6	212474	212479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449197
4068	NC_017285	GAA	2	6	212493	212498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449197
4069	NC_017285	CTT	2	6	212588	212593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449197
4070	NC_017285	CA	3	6	212594	212599	50 %	0 %	0 %	50 %	384449197
4071	NC_017285	TAACC	2	10	212613	212622	40 %	20 %	0 %	40 %	384449197
4072	NC_017285	GAG	2	6	213402	213407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449198
4073	NC_017285	ACA	2	6	213439	213444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449198
4074	NC_017285	A	6	6	213501	213506	100 %	0 %	0 %	0 %	384449198
4075	NC_017285	TTA	2	6	213509	213514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449198
4076	NC_017285	TCG	2	6	213522	213527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449198
4077	NC_017285	T	6	6	213578	213583	0 %	100 %	0 %	0 %	384449198
4078	NC_017285	TTG	2	6	213601	213606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449198
4079	NC_017285	GTC	2	6	213626	213631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449198
4080	NC_017285	TCA	2	6	213635	213640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449198
4081	NC_017285	AGG	2	6	213660	213665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449198
4082	NC_017285	TCC	2	6	213700	213705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449198
4083	NC_017285	GA	3	6	213707	213712	50 %	0 %	50 %	0 %	384449198
4084	NC_017285	GTG	4	12	213724	213735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449198
4085	NC_017285	CAA	2	6	213747	213752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449198
4086	NC_017285	TCTT	2	8	213782	213789	0 %	75 %	0 %	25 %	384449198
4087	NC_017285	ACA	2	6	213836	213841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449198
4088	NC_017285	GTTT	2	8	213911	213918	0 %	75 %	25 %	0 %	384449198
4089	NC_017285	AAGC	2	8	213967	213974	50 %	0 %	25 %	25 %	384449198
4090	NC_017285	C	6	6	214003	214008	0 %	0 %	0 %	100 %	384449198
4091	NC_017285	CAT	2	6	214041	214046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449198
4092	NC_017285	AGAA	2	8	214053	214060	75 %	0 %	25 %	0 %	384449198
4093	NC_017285	CAT	2	6	214062	214067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449198
4094	NC_017285	GTC	2	6	214147	214152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449199
4095	NC_017285	ACT	2	6	214239	214244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449199
4096	NC_017285	GAA	2	6	214265	214270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449199
4097	NC_017285	AGA	2	6	214275	214280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449199
4098	NC_017285	GA	3	6	214367	214372	50 %	0 %	50 %	0 %	384449199
4099	NC_017285	GTT	2	6	214427	214432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449199
4100	NC_017285	TC	3	6	214493	214498	0 %	50 %	0 %	50 %	384449199
4101	NC_017285	T	6	6	214533	214538	0 %	100 %	0 %	0 %	384449199
4102	NC_017285	TTG	2	6	214677	214682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449199
4103	NC_017285	TC	3	6	214695	214700	0 %	50 %	0 %	50 %	384449199
4104	NC_017285	T	6	6	214706	214711	0 %	100 %	0 %	0 %	384449199
4105	NC_017285	GAG	2	6	214769	214774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449199
4106	NC_017285	CAT	2	6	214904	214909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449199
4107	NC_017285	GAAAAC	2	12	214941	214952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384449199
4108	NC_017285	CTTTT	2	10	215437	215446	0 %	80 %	0 %	20 %	384449200
4109	NC_017285	AG	3	6	215449	215454	50 %	0 %	50 %	0 %	384449200
4110	NC_017285	ATT	2	6	215476	215481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449200
4111	NC_017285	TAT	2	6	215517	215522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449200
4112	NC_017285	AAT	2	6	215527	215532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449200
4113	NC_017285	TGAGGT	2	12	215699	215710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384449200
4114	NC_017285	T	7	7	215774	215780	0 %	100 %	0 %	0 %	384449200
4115	NC_017285	TAG	2	6	215795	215800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449200
4116	NC_017285	GAATA	2	10	215845	215854	60 %	20 %	20 %	0 %	384449200
4117	NC_017285	AGA	2	6	215880	215885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449200
4118	NC_017285	CTGA	2	8	215980	215987	25 %	25 %	25 %	25 %	384449200
4119	NC_017285	AAAT	2	8	216000	216007	75 %	25 %	0 %	0 %	384449200
4120	NC_017285	CAG	2	6	216030	216035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449200
4121	NC_017285	CTT	2	6	216084	216089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449200
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4123	NC_017285	AAT	2	6	216292	216297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449200
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