MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017285	GCT	2	6	51899	51904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1003	NC_017285	CAG	2	6	51918	51923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1004	NC_017285	TCT	2	6	51987	51992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449033
1005	NC_017285	ACC	2	6	52061	52066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449033
1006	NC_017285	AG	3	6	52081	52086	50 %	0 %	50 %	0 %	384449033
1007	NC_017285	A	7	7	52087	52093	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1008	NC_017285	ACT	2	6	52112	52117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
1009	NC_017285	CTT	2	6	52141	52146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449033
1010	NC_017285	AAG	2	6	52155	52160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1011	NC_017285	GCC	2	6	52178	52183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384449033
1012	NC_017285	GAA	2	6	52217	52222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1013	NC_017285	A	7	7	52270	52276	100 %	0 %	0 %	0 %	384449033
1014	NC_017285	GAA	2	6	52351	52356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1015	NC_017285	AGC	2	6	52399	52404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1016	NC_017285	AAC	2	6	52405	52410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449033
1017	NC_017285	GAA	3	9	52436	52444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1018	NC_017285	GTT	2	6	52540	52545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1019	NC_017285	GTAA	2	8	52553	52560	50 %	25 %	25 %	0 %	384449033
1020	NC_017285	GAAC	2	8	52569	52576	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
1021	NC_017285	TAC	2	6	52662	52667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
1022	NC_017285	GTT	2	6	52694	52699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1023	NC_017285	TATC	2	8	52720	52727	25 %	50 %	0 %	25 %	384449033
1024	NC_017285	AGT	2	6	52756	52761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1025	NC_017285	TGT	2	6	52795	52800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1026	NC_017285	GCA	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1027	NC_017285	ATT	2	6	52853	52858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449033
1028	NC_017285	ATG	2	6	52875	52880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1029	NC_017285	ATC	2	6	52916	52921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
1030	NC_017285	AGC	2	6	52963	52968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1031	NC_017285	GAT	2	6	53078	53083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1032	NC_017285	GAAC	2	8	53109	53116	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
1033	NC_017285	TCG	2	6	53124	53129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1034	NC_017285	CAC	2	6	53136	53141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449033
1035	NC_017285	AGC	2	6	53160	53165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449033
1036	NC_017285	GAT	2	6	53207	53212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1037	NC_017285	AGGAAC	2	12	53239	53250	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384449033
1038	NC_017285	TTA	2	6	53427	53432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449033
1039	NC_017285	GTT	2	6	53459	53464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1040	NC_017285	CCT	2	6	53489	53494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449033
1041	NC_017285	TGA	2	6	53578	53583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1042	NC_017285	AAAGT	2	10	53586	53595	60 %	20 %	20 %	0 %	384449033
1043	NC_017285	AAT	2	6	53618	53623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449033
1044	NC_017285	TCCC	2	8	53655	53662	0 %	25 %	0 %	75 %	384449033
1045	NC_017285	ATC	2	6	53759	53764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449033
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1049	NC_017285	TAT	2	6	53938	53943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449033
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1051	NC_017285	GTT	2	6	54144	54149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449033
1052	NC_017285	AGT	2	6	54190	54195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1053	NC_017285	TTTA	2	8	54238	54245	25 %	75 %	0 %	0 %	384449033
1054	NC_017285	ATG	2	6	54281	54286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1055	NC_017285	TTA	2	6	54288	54293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449033
1056	NC_017285	TAG	2	6	54307	54312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1057	NC_017285	GAA	2	6	54317	54322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449033
1058	NC_017285	AAGG	2	8	54341	54348	50 %	0 %	50 %	0 %	384449033
1059	NC_017285	TGA	2	6	54370	54375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1060	NC_017285	CCT	2	6	54422	54427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449033
1061	NC_017285	ATA	2	6	54455	54460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449033
1062	NC_017285	AGT	2	6	54474	54479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449033
1063	NC_017285	GCAAG	2	10	54836	54845	40 %	0 %	40 %	20 %	384449034
1064	NC_017285	AAT	2	6	54868	54873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449034
1065	NC_017285	GAT	2	6	54887	54892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449034
1066	NC_017285	T	7	7	55050	55056	0 %	100 %	0 %	0 %	384449034
1067	NC_017285	AGA	2	6	55101	55106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449034
1068	NC_017285	AAG	2	6	55107	55112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449034
1069	NC_017285	TTC	2	6	55116	55121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449034
1070	NC_017285	AAC	2	6	55136	55141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449034
1071	NC_017285	ATA	2	6	55148	55153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449034
1072	NC_017285	TAA	2	6	55188	55193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449034
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1076	NC_017285	GAT	2	6	55442	55447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449034
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1083	NC_017285	AG	3	6	55698	55703	50 %	0 %	50 %	0 %	384449034
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1088	NC_017285	CT	3	6	56007	56012	0 %	50 %	0 %	50 %	384449035
1089	NC_017285	TGG	2	6	56060	56065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449035
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1091	NC_017285	CGT	2	6	56082	56087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449035
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1094	NC_017285	ATT	2	6	56170	56175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449035
1095	NC_017285	AGGACA	2	12	56188	56199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384449035
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1097	NC_017285	CCTTAT	2	12	56226	56237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384449035
1098	NC_017285	TGG	2	6	56256	56261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449035
1099	NC_017285	TGG	2	6	56285	56290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449035
1100	NC_017285	GTGA	2	8	56295	56302	25 %	25 %	50 %	0 %	384449035
1101	NC_017285	CTT	2	6	56700	56705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449036
1102	NC_017285	TCA	2	6	56720	56725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449036
1103	NC_017285	GCT	2	6	56727	56732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449036
1104	NC_017285	T	7	7	56760	56766	0 %	100 %	0 %	0 %	384449036
1105	NC_017285	ACA	2	6	56780	56785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449036
1106	NC_017285	TCT	2	6	56786	56791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449036
1107	NC_017285	T	6	6	56806	56811	0 %	100 %	0 %	0 %	384449036
1108	NC_017285	GCG	2	6	56872	56877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384449036
1109	NC_017285	ATC	2	6	56888	56893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449036
1110	NC_017285	CAG	2	6	56907	56912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449036
1111	NC_017285	AAT	2	6	56935	56940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449036
1112	NC_017285	AAT	2	6	56980	56985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449036
1113	NC_017285	ACA	2	6	57107	57112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449036
1114	NC_017285	CTA	2	6	57117	57122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449036
1115	NC_017285	CTT	2	6	57159	57164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449036
1116	NC_017285	A	7	7	57169	57175	100 %	0 %	0 %	0 %	384449036
1117	NC_017285	T	7	7	57192	57198	0 %	100 %	0 %	0 %	384449036
1118	NC_017285	TAAT	2	8	57238	57245	50 %	50 %	0 %	0 %	384449037
1119	NC_017285	AG	3	6	57279	57284	50 %	0 %	50 %	0 %	384449037
1120	NC_017285	CATA	2	8	57326	57333	50 %	25 %	0 %	25 %	384449037
1121	NC_017285	A	6	6	57375	57380	100 %	0 %	0 %	0 %	384449037
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1124	NC_017285	CCG	2	6	57789	57794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384449037
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