MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017285	AGA	2	6	263095	263100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
5002	NC_017285	GAA	2	6	263302	263307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
5003	NC_017285	TTA	2	6	263377	263382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449241
5004	NC_017285	T	6	6	263475	263480	0 %	100 %	0 %	0 %	384449241
5005	NC_017285	GCGTG	2	10	263496	263505	0 %	20 %	60 %	20 %	384449241
5006	NC_017285	GAA	2	6	263560	263565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
5007	NC_017285	GAA	2	6	263650	263655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
5008	NC_017285	TTTG	2	8	263668	263675	0 %	75 %	25 %	0 %	384449241
5009	NC_017285	TCT	2	6	263736	263741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449241
5010	NC_017285	AAG	2	6	263810	263815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449241
5011	NC_017285	AGT	2	6	263842	263847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449241
5012	NC_017285	GCT	2	6	264008	264013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449241
5013	NC_017285	GTT	2	6	264029	264034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449241
5014	NC_017285	GAT	2	6	264038	264043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449241
5015	NC_017285	ATG	2	6	264159	264164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449242
5016	NC_017285	TTA	2	6	264176	264181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449242
5017	NC_017285	GAAA	2	8	264240	264247	75 %	0 %	25 %	0 %	384449242
5018	NC_017285	TCT	2	6	264253	264258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449242
5019	NC_017285	ATT	2	6	264278	264283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449242
5020	NC_017285	T	6	6	264282	264287	0 %	100 %	0 %	0 %	384449242
5021	NC_017285	T	6	6	264351	264356	0 %	100 %	0 %	0 %	384449243
5022	NC_017285	TGA	2	6	264416	264421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449243
5023	NC_017285	GGT	2	6	264435	264440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449243
5024	NC_017285	GGT	2	6	264506	264511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449243
5025	NC_017285	T	6	6	264540	264545	0 %	100 %	0 %	0 %	384449243
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5027	NC_017285	TCG	2	6	264595	264600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449243
5028	NC_017285	CTT	2	6	264650	264655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449243
5029	NC_017285	TGC	2	6	264734	264739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449243
5030	NC_017285	TGAT	2	8	264889	264896	25 %	50 %	25 %	0 %	384449243
5031	NC_017285	GAGC	2	8	265072	265079	25 %	0 %	50 %	25 %	384449243
5032	NC_017285	ACA	2	6	265120	265125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449243
5033	NC_017285	TCT	2	6	265180	265185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449243
5034	NC_017285	AGGAG	2	10	265224	265233	40 %	0 %	60 %	0 %	384449243
5035	NC_017285	AGAAA	2	10	265287	265296	80 %	0 %	20 %	0 %	384449243
5036	NC_017285	GA	3	6	265307	265312	50 %	0 %	50 %	0 %	384449243
5037	NC_017285	AAG	2	6	265485	265490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449244
5038	NC_017285	CTT	2	6	265501	265506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449244
5039	NC_017285	CCA	2	6	265557	265562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384449244
5040	NC_017285	T	7	7	265591	265597	0 %	100 %	0 %	0 %	384449244
5041	NC_017285	AAAT	2	8	265646	265653	75 %	25 %	0 %	0 %	384449244
5042	NC_017285	CTT	2	6	265672	265677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449244
5043	NC_017285	GAG	2	6	265682	265687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449244
5044	NC_017285	CAAG	2	8	265782	265789	50 %	0 %	25 %	25 %	384449244
5045	NC_017285	TAGG	2	8	265876	265883	25 %	25 %	50 %	0 %	384449244
5046	NC_017285	GTT	2	6	265969	265974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449244
5047	NC_017285	GTT	2	6	266000	266005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449244
5048	NC_017285	TTG	2	6	266036	266041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449244
5049	NC_017285	TTTCT	2	10	266068	266077	0 %	80 %	0 %	20 %	384449244
5050	NC_017285	A	7	7	266177	266183	100 %	0 %	0 %	0 %	384449244
5051	NC_017285	AG	3	6	266380	266385	50 %	0 %	50 %	0 %	384449244
5052	NC_017285	GAGAA	2	10	266492	266501	60 %	0 %	40 %	0 %	384449244
5053	NC_017285	AGA	2	6	266811	266816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449245
5054	NC_017285	TCG	2	6	266859	266864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449245
5055	NC_017285	TGG	2	6	266865	266870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449245
5056	NC_017285	CTT	2	6	266933	266938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449245
5057	NC_017285	AGA	2	6	266942	266947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449245
5058	NC_017285	AAG	2	6	267073	267078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449245
5059	NC_017285	AC	3	6	267131	267136	50 %	0 %	0 %	50 %	384449245
5060	NC_017285	GTG	2	6	267152	267157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449245
5061	NC_017285	AG	3	6	267159	267164	50 %	0 %	50 %	0 %	384449245
5062	NC_017285	CCT	2	6	267294	267299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449246
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5064	NC_017285	TTG	2	6	267595	267600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449247
5065	NC_017285	CTT	2	6	267610	267615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449247
5066	NC_017285	ATC	2	6	267711	267716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449247
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5070	NC_017285	TCT	2	6	267947	267952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449247
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5072	NC_017285	AGG	2	6	268216	268221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449247
5073	NC_017285	TCT	2	6	268224	268229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449247
5074	NC_017285	ATC	2	6	268245	268250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449247
5075	NC_017285	TTG	2	6	268281	268286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449247
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5079	NC_017285	GGC	2	6	268466	268471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384449247
5080	NC_017285	GA	3	6	268558	268563	50 %	0 %	50 %	0 %	384449247
5081	NC_017285	GTT	2	6	268605	268610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449247
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5087	NC_017285	TAC	2	6	268760	268765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449247
5088	NC_017285	TGCC	2	8	268875	268882	0 %	25 %	25 %	50 %	384449248
5089	NC_017285	T	6	6	269026	269031	0 %	100 %	0 %	0 %	384449248
5090	NC_017285	TAA	2	6	269046	269051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449248
5091	NC_017285	ATAGC	2	10	269147	269156	40 %	20 %	20 %	20 %	384449248
5092	NC_017285	AG	3	6	269212	269217	50 %	0 %	50 %	0 %	384449248
5093	NC_017285	CCT	2	6	269270	269275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449248
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5098	NC_017285	A	6	6	269741	269746	100 %	0 %	0 %	0 %	384449248
5099	NC_017285	TGG	2	6	269803	269808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449248
5100	NC_017285	TGA	2	6	269823	269828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449248
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5102	NC_017285	GAG	2	6	269934	269939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449248
5103	NC_017285	AGA	2	6	269970	269975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449248
5104	NC_017285	A	6	6	270007	270012	100 %	0 %	0 %	0 %	384449248
5105	NC_017285	TC	3	6	270025	270030	0 %	50 %	0 %	50 %	384449248
5106	NC_017285	TGC	2	6	270045	270050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449248
5107	NC_017285	TG	3	6	270080	270085	0 %	50 %	50 %	0 %	384449248
5108	NC_017285	GAA	2	6	270192	270197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449248
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5110	NC_017285	GAA	2	6	270249	270254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449248
5111	NC_017285	GTGA	2	8	270281	270288	25 %	25 %	50 %	0 %	384449248
5112	NC_017285	GGAA	2	8	270302	270309	50 %	0 %	50 %	0 %	384449248
5113	NC_017285	GGAA	2	8	270353	270360	50 %	0 %	50 %	0 %	384449248
5114	NC_017285	ACA	2	6	270362	270367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449248
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5121	NC_017285	TTTA	2	8	270616	270623	25 %	75 %	0 %	0 %	384449248
5122	NC_017285	GTC	2	6	270795	270800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449248
5123	NC_017285	CAT	2	6	270816	270821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449248
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5235	NC_017285	CAGGA	2	10	276726	276735	40 %	0 %	40 %	20 %	384449254
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5491	NC_017285	AG	3	6	291620	291625	50 %	0 %	50 %	0 %	384449265
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5494	NC_017285	TGC	2	6	291776	291781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449265
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5499	NC_017285	A	6	6	292044	292049	100 %	0 %	0 %	0 %	384449265
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