MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 22850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017285	GCT	2	6	236219	236224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449217
4502	NC_017285	ATA	2	6	236260	236265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449217
4503	NC_017285	GAA	2	6	236325	236330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449217
4504	NC_017285	CTTTT	2	10	236333	236342	0 %	80 %	0 %	20 %	384449217
4505	NC_017285	TAC	2	6	236398	236403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449217
4506	NC_017285	TCT	2	6	236429	236434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449217
4507	NC_017285	TTGC	2	8	236458	236465	0 %	50 %	25 %	25 %	384449217
4508	NC_017285	TAG	2	6	236508	236513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449217
4509	NC_017285	AG	3	6	236512	236517	50 %	0 %	50 %	0 %	384449217
4510	NC_017285	GAT	2	6	236566	236571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449217
4511	NC_017285	GATT	2	8	236579	236586	25 %	50 %	25 %	0 %	384449217
4512	NC_017285	T	7	7	236585	236591	0 %	100 %	0 %	0 %	384449217
4513	NC_017285	ATT	2	6	236680	236685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449217
4514	NC_017285	T	7	7	236720	236726	0 %	100 %	0 %	0 %	384449217
4515	NC_017285	AGA	2	6	236782	236787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449217
4516	NC_017285	TGG	2	6	236804	236809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449217
4517	NC_017285	AAG	2	6	236816	236821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449217
4518	NC_017285	CTAAAG	2	12	236916	236927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384449217
4519	NC_017285	T	6	6	236971	236976	0 %	100 %	0 %	0 %	384449217
4520	NC_017285	GAC	2	6	237162	237167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449218
4521	NC_017285	TGCG	2	8	237188	237195	0 %	25 %	50 %	25 %	384449218
4522	NC_017285	TGG	2	6	237290	237295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449218
4523	NC_017285	AG	3	6	237388	237393	50 %	0 %	50 %	0 %	384449218
4524	NC_017285	GAA	2	6	237424	237429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449218
4525	NC_017285	TCCT	2	8	237585	237592	0 %	50 %	0 %	50 %	384449219
4526	NC_017285	T	6	6	237606	237611	0 %	100 %	0 %	0 %	384449219
4527	NC_017285	T	8	8	237695	237702	0 %	100 %	0 %	0 %	384449219
4528	NC_017285	A	6	6	237740	237745	100 %	0 %	0 %	0 %	384449219
4529	NC_017285	GAGG	2	8	237787	237794	25 %	0 %	75 %	0 %	384449219
4530	NC_017285	AG	3	6	237901	237906	50 %	0 %	50 %	0 %	384449219
4531	NC_017285	TCTT	2	8	237910	237917	0 %	75 %	0 %	25 %	384449219
4532	NC_017285	TGG	2	6	237918	237923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449219
4533	NC_017285	AGGT	2	8	237938	237945	25 %	25 %	50 %	0 %	384449219
4534	NC_017285	AGAA	2	8	237967	237974	75 %	0 %	25 %	0 %	384449219
4535	NC_017285	GGAA	2	8	238043	238050	50 %	0 %	50 %	0 %	384449219
4536	NC_017285	AG	3	6	238095	238100	50 %	0 %	50 %	0 %	384449219
4537	NC_017285	AAT	2	6	238113	238118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449219
4538	NC_017285	T	6	6	238140	238145	0 %	100 %	0 %	0 %	384449219
4539	NC_017285	GGT	2	6	238425	238430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449220
4540	NC_017285	GTT	2	6	238434	238439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449220
4541	NC_017285	AGC	2	6	238503	238508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449220
4542	NC_017285	TTCC	2	8	238532	238539	0 %	50 %	0 %	50 %	384449220
4543	NC_017285	GA	3	6	238546	238551	50 %	0 %	50 %	0 %	384449220
4544	NC_017285	TGA	2	6	238557	238562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4545	NC_017285	GAT	2	6	238590	238595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4546	NC_017285	TTC	2	6	238611	238616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449220
4547	NC_017285	GAAG	2	8	238666	238673	50 %	0 %	50 %	0 %	384449220
4548	NC_017285	TGT	2	6	238696	238701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449220
4549	NC_017285	GT	3	6	238728	238733	0 %	50 %	50 %	0 %	384449220
4550	NC_017285	TGC	2	6	238755	238760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449220
4551	NC_017285	AGA	3	9	238890	238898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449220
4552	NC_017285	TCT	2	6	238924	238929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449220
4553	NC_017285	ATG	2	6	239027	239032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4554	NC_017285	TTC	2	6	239118	239123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449220
4555	NC_017285	TGA	2	6	239238	239243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4556	NC_017285	CAA	3	9	239276	239284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449220
4557	NC_017285	TGA	2	6	239369	239374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4558	NC_017285	GCT	2	6	239401	239406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449220
4559	NC_017285	GAAG	2	8	239421	239428	50 %	0 %	50 %	0 %	384449220
4560	NC_017285	CT	4	8	239429	239436	0 %	50 %	0 %	50 %	384449220
4561	NC_017285	TCA	2	6	239457	239462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449220
4562	NC_017285	TCG	2	6	239478	239483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449220
4563	NC_017285	AG	3	6	239490	239495	50 %	0 %	50 %	0 %	384449220
4564	NC_017285	GGA	2	6	239527	239532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449220
4565	NC_017285	ATG	2	6	239545	239550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449220
4566	NC_017285	TGAT	2	8	239552	239559	25 %	50 %	25 %	0 %	384449220
4567	NC_017285	TGGGTA	2	12	239708	239719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384449220
4568	NC_017285	GAA	2	6	239731	239736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449220
4569	NC_017285	ATT	2	6	239746	239751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449220
4570	NC_017285	TTG	2	6	239866	239871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449220
4571	NC_017285	TTTAG	2	10	239910	239919	20 %	60 %	20 %	0 %	384449220
4572	NC_017285	GC	3	6	239996	240001	0 %	0 %	50 %	50 %	384449221
4573	NC_017285	ACT	2	6	240182	240187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449221
4574	NC_017285	CTC	2	6	240261	240266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449221
4575	NC_017285	TCA	2	6	240283	240288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449221
4576	NC_017285	GA	4	8	240343	240350	50 %	0 %	50 %	0 %	384449221
4577	NC_017285	CTT	2	6	240549	240554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449222
4578	NC_017285	T	6	6	240617	240622	0 %	100 %	0 %	0 %	384449222
4579	NC_017285	CTT	2	6	240637	240642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449222
4580	NC_017285	ATT	2	6	240660	240665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449222
4581	NC_017285	TG	3	6	240694	240699	0 %	50 %	50 %	0 %	384449222
4582	NC_017285	TTC	2	6	240934	240939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449222
4583	NC_017285	TTC	2	6	240979	240984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449222
4584	NC_017285	ATC	2	6	240988	240993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449222
4585	NC_017285	TC	3	6	241000	241005	0 %	50 %	0 %	50 %	384449222
4586	NC_017285	TTG	2	6	241129	241134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449222
4587	NC_017285	ATGG	2	8	241147	241154	25 %	25 %	50 %	0 %	384449222
4588	NC_017285	ATG	2	6	241354	241359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449223
4589	NC_017285	CTT	2	6	241384	241389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449223
4590	NC_017285	TTTA	2	8	241445	241452	25 %	75 %	0 %	0 %	384449223
4591	NC_017285	AGA	2	6	241530	241535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449223
4592	NC_017285	A	8	8	241584	241591	100 %	0 %	0 %	0 %	384449223
4593	NC_017285	TTTA	2	8	241693	241700	25 %	75 %	0 %	0 %	384449223
4594	NC_017285	GCA	2	6	241728	241733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384449223
4595	NC_017285	TCGAAT	2	12	241752	241763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384449223
4596	NC_017285	AAT	2	6	241780	241785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384449223
4597	NC_017285	GAA	2	6	241804	241809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449223
4598	NC_017285	TTTG	2	8	241854	241861	0 %	75 %	25 %	0 %	384449223
4599	NC_017285	GAAA	2	8	241875	241882	75 %	0 %	25 %	0 %	384449223
4600	NC_017285	GTT	2	6	241899	241904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384449223
4601	NC_017285	TCC	2	6	241968	241973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449223
4602	NC_017285	AGAAAC	2	12	241992	242003	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384449223
4603	NC_017285	GCT	2	6	242041	242046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449223
4604	NC_017285	CGT	2	6	242047	242052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449223
4605	NC_017285	GAA	3	9	242116	242124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449223
4606	NC_017285	AG	3	6	242187	242192	50 %	0 %	50 %	0 %	384449223
4607	NC_017285	CT	3	6	242235	242240	0 %	50 %	0 %	50 %	384449223
4608	NC_017285	TGA	3	9	242262	242270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449223
4609	NC_017285	GGA	4	12	242271	242282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384449223
4610	NC_017285	A	6	6	242320	242325	100 %	0 %	0 %	0 %	384449223
4611	NC_017285	TCT	2	6	242326	242331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449223
4612	NC_017285	TCA	2	6	242538	242543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449224
4613	NC_017285	GAA	2	6	242604	242609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449224
4614	NC_017285	ATT	2	6	242676	242681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449224
4615	NC_017285	GCTC	2	8	242684	242691	0 %	25 %	25 %	50 %	384449224
4616	NC_017285	CT	3	6	242695	242700	0 %	50 %	0 %	50 %	384449224
4617	NC_017285	CCT	2	6	242734	242739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449224
4618	NC_017285	AGTT	2	8	242752	242759	25 %	50 %	25 %	0 %	384449224
4619	NC_017285	TAC	2	6	242880	242885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384449224
4620	NC_017285	TCT	2	6	242916	242921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449224
4621	NC_017285	TTAT	2	8	243012	243019	25 %	75 %	0 %	0 %	384449224
4622	NC_017285	GCC	2	6	243038	243043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384449224
4623	NC_017285	TGG	2	6	243055	243060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384449224
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4991	NC_017285	GAA	2	6	262538	262543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449240
4992	NC_017285	CGT	2	6	262580	262585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384449240
4993	NC_017285	ACA	2	6	262626	262631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384449240
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