MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TA	3	6	2681	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	384442306
2	NC_017282	TA	3	6	3646	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
3	NC_017282	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
4	NC_017282	AT	3	6	5544	5549	50 %	50 %	0 %	0 %	384442311
5	NC_017282	CT	3	6	5888	5893	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
6	NC_017282	TC	3	6	5925	5930	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
7	NC_017282	GA	3	6	6978	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	384442314
8	NC_017282	AT	4	8	7371	7378	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
9	NC_017282	TA	4	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
10	NC_017282	AT	3	6	8064	8069	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
11	NC_017282	TA	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
12	NC_017282	AT	3	6	9795	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
13	NC_017282	TA	3	6	10004	10009	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
14	NC_017282	TA	3	6	11280	11285	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
15	NC_017282	CT	3	6	11286	11291	0 %	50 %	0 %	50 %	384442317
16	NC_017282	TA	3	6	12819	12824	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
17	NC_017282	AT	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
18	NC_017282	TA	3	6	13351	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
19	NC_017282	AT	3	6	13499	13504	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
20	NC_017282	TA	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
21	NC_017282	TA	3	6	14523	14528	50 %	50 %	0 %	0 %	384442320
22	NC_017282	TC	3	6	15289	15294	0 %	50 %	0 %	50 %	384442321
23	NC_017282	GA	3	6	15307	15312	50 %	0 %	50 %	0 %	384442321
24	NC_017282	CT	3	6	16700	16705	0 %	50 %	0 %	50 %	384442323
25	NC_017282	TA	3	6	17030	17035	50 %	50 %	0 %	0 %	384442323
26	NC_017282	TC	3	6	18131	18136	0 %	50 %	0 %	50 %	384442324
27	NC_017282	TA	3	6	18703	18708	50 %	50 %	0 %	0 %	384442324
28	NC_017282	TA	3	6	19689	19694	50 %	50 %	0 %	0 %	384442325
29	NC_017282	TG	3	6	20244	20249	0 %	50 %	50 %	0 %	384442325
30	NC_017282	GA	3	6	21580	21585	50 %	0 %	50 %	0 %	384442327
31	NC_017282	CT	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	384442332
32	NC_017282	AG	3	6	24614	24619	50 %	0 %	50 %	0 %	384442332
33	NC_017282	CT	3	6	24911	24916	0 %	50 %	0 %	50 %	384442333
34	NC_017282	AG	3	6	25648	25653	50 %	0 %	50 %	0 %	384442334
35	NC_017282	TA	4	8	25673	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	384442334
36	NC_017282	TG	3	6	26033	26038	0 %	50 %	50 %	0 %	384442335
37	NC_017282	AT	3	6	26167	26172	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
38	NC_017282	TG	3	6	26821	26826	0 %	50 %	50 %	0 %	384442335
39	NC_017282	AT	3	6	26878	26883	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
40	NC_017282	TA	4	8	29349	29356	50 %	50 %	0 %	0 %	384442337
41	NC_017282	AT	3	6	29887	29892	50 %	50 %	0 %	0 %	384442339
42	NC_017282	TA	3	6	34492	34497	50 %	50 %	0 %	0 %	384442345
43	NC_017282	AT	3	6	35792	35797	50 %	50 %	0 %	0 %	384442346
44	NC_017282	AT	3	6	36175	36180	50 %	50 %	0 %	0 %	384442347
45	NC_017282	AT	3	6	36529	36534	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
46	NC_017282	AT	4	8	36867	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
47	NC_017282	AT	3	6	36966	36971	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
48	NC_017282	TA	3	6	37376	37381	50 %	50 %	0 %	0 %	384442349
49	NC_017282	AG	3	6	38068	38073	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
50	NC_017282	GA	4	8	38149	38156	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
51	NC_017282	TA	3	6	38413	38418	50 %	50 %	0 %	0 %	384442350
52	NC_017282	TA	3	6	38838	38843	50 %	50 %	0 %	0 %	384442351
53	NC_017282	GA	3	6	39800	39805	50 %	0 %	50 %	0 %	384442353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.