MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	CTTT	2	8	3236	3243	0 %	75 %	0 %	25 %	384442307
2	NC_017282	AAAT	2	8	3525	3532	75 %	25 %	0 %	0 %	384442308
3	NC_017282	TTTA	2	8	3737	3744	25 %	75 %	0 %	0 %	384442308
4	NC_017282	TAAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
5	NC_017282	ATTT	2	8	4577	4584	25 %	75 %	0 %	0 %	384442310
6	NC_017282	ATAA	2	8	4736	4743	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
7	NC_017282	AATC	2	8	5510	5517	50 %	25 %	0 %	25 %	384442311
8	NC_017282	AAAT	2	8	5744	5751	75 %	25 %	0 %	0 %	384442311
9	NC_017282	CCTG	2	8	6016	6023	0 %	25 %	25 %	50 %	384442312
10	NC_017282	TCAT	2	8	6091	6098	25 %	50 %	0 %	25 %	384442312
11	NC_017282	AATC	2	8	6536	6543	50 %	25 %	0 %	25 %	384442313
12	NC_017282	TCCT	2	8	6594	6601	0 %	50 %	0 %	50 %	384442313
13	NC_017282	AAAT	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	384442314
14	NC_017282	GCTG	2	8	6795	6802	0 %	25 %	50 %	25 %	384442314
15	NC_017282	TCCA	2	8	7156	7163	25 %	25 %	0 %	50 %	384442314
16	NC_017282	GATT	2	8	7218	7225	25 %	50 %	25 %	0 %	384442314
17	NC_017282	ACAT	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
18	NC_017282	AATC	2	8	8224	8231	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
19	NC_017282	TTTG	2	8	9156	9163	0 %	75 %	25 %	0 %	384442315
20	NC_017282	ATTT	2	8	9278	9285	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
21	NC_017282	TTAA	2	8	9580	9587	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
22	NC_017282	CTTT	2	8	9661	9668	0 %	75 %	0 %	25 %	384442316
23	NC_017282	ATTT	2	8	9902	9909	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
24	NC_017282	AATT	2	8	9917	9924	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
25	NC_017282	ATTT	2	8	10062	10069	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
26	NC_017282	ATTT	2	8	10248	10255	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
27	NC_017282	TATT	2	8	10591	10598	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
28	NC_017282	TTGC	2	8	10876	10883	0 %	50 %	25 %	25 %	384442317
29	NC_017282	GTTT	2	8	11033	11040	0 %	75 %	25 %	0 %	384442317
30	NC_017282	TTAA	2	8	11218	11225	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
31	NC_017282	TACT	2	8	11270	11277	25 %	50 %	0 %	25 %	384442317
32	NC_017282	TTTG	2	8	11470	11477	0 %	75 %	25 %	0 %	384442317
33	NC_017282	AGAT	2	8	11528	11535	50 %	25 %	25 %	0 %	384442317
34	NC_017282	CTAT	2	8	11578	11585	25 %	50 %	0 %	25 %	384442317
35	NC_017282	AATT	2	8	12119	12126	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
36	NC_017282	CTAC	2	8	12328	12335	25 %	25 %	0 %	50 %	384442317
37	NC_017282	ATTA	2	8	12513	12520	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
38	NC_017282	CTTT	2	8	12670	12677	0 %	75 %	0 %	25 %	384442317
39	NC_017282	AATT	2	8	13084	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
40	NC_017282	AAAT	2	8	13297	13304	75 %	25 %	0 %	0 %	384442318
41	NC_017282	AATT	2	8	13908	13915	50 %	50 %	0 %	0 %	384442319
42	NC_017282	CTTT	2	8	14172	14179	0 %	75 %	0 %	25 %	384442319
43	NC_017282	CCTT	2	8	14191	14198	0 %	50 %	0 %	50 %	384442319
44	NC_017282	TTGT	2	8	14218	14225	0 %	75 %	25 %	0 %	384442319
45	NC_017282	TTCA	2	8	14342	14349	25 %	50 %	0 %	25 %	384442320
46	NC_017282	CTTT	2	8	14491	14498	0 %	75 %	0 %	25 %	384442320
47	NC_017282	AATT	2	8	15122	15129	50 %	50 %	0 %	0 %	384442320
48	NC_017282	TTCA	2	8	15132	15139	25 %	50 %	0 %	25 %	384442320
49	NC_017282	CTTT	2	8	15233	15240	0 %	75 %	0 %	25 %	384442321
50	NC_017282	TCCA	2	8	15599	15606	25 %	25 %	0 %	50 %	384442321
51	NC_017282	AGTT	2	8	15915	15922	25 %	50 %	25 %	0 %	384442322
52	NC_017282	CTAC	2	8	16049	16056	25 %	25 %	0 %	50 %	384442322
53	NC_017282	CCTT	2	8	16755	16762	0 %	50 %	0 %	50 %	384442323
54	NC_017282	AAAT	2	8	16990	16997	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
55	NC_017282	ATAA	2	8	17398	17405	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
56	NC_017282	GTCT	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	384442323
57	NC_017282	AAAT	2	8	17813	17820	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
58	NC_017282	AAAG	2	8	17940	17947	75 %	0 %	25 %	0 %	384442323
59	NC_017282	TTTA	2	8	18029	18036	25 %	75 %	0 %	0 %	384442323
60	NC_017282	AAAT	2	8	18162	18169	75 %	25 %	0 %	0 %	384442324
61	NC_017282	TCTT	2	8	18695	18702	0 %	75 %	0 %	25 %	384442324
62	NC_017282	AAGA	2	8	18904	18911	75 %	0 %	25 %	0 %	384442324
63	NC_017282	ATCA	2	8	19236	19243	50 %	25 %	0 %	25 %	384442325
64	NC_017282	TATT	2	8	20312	20319	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
65	NC_017282	TTTA	2	8	20355	20362	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
66	NC_017282	CTTT	2	8	20497	20504	0 %	75 %	0 %	25 %	384442326
67	NC_017282	TTTA	2	8	20658	20665	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
68	NC_017282	GTTT	2	8	20829	20836	0 %	75 %	25 %	0 %	384442326
69	NC_017282	AGTA	2	8	21518	21525	50 %	25 %	25 %	0 %	384442327
70	NC_017282	AGTA	2	8	21707	21714	50 %	25 %	25 %	0 %	384442327
71	NC_017282	TCAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	0 %	25 %	384442327
72	NC_017282	TTTA	2	8	21861	21868	25 %	75 %	0 %	0 %	384442328
73	NC_017282	TGAT	2	8	21880	21887	25 %	50 %	25 %	0 %	384442328
74	NC_017282	ATCC	2	8	21892	21899	25 %	25 %	0 %	50 %	384442328
75	NC_017282	AATT	2	8	21987	21994	50 %	50 %	0 %	0 %	384442328
76	NC_017282	ATCC	2	8	22337	22344	25 %	25 %	0 %	50 %	384442329
77	NC_017282	TCCA	2	8	22714	22721	25 %	25 %	0 %	50 %	384442329
78	NC_017282	AAGT	2	8	22800	22807	50 %	25 %	25 %	0 %	384442329
79	NC_017282	GAAA	2	8	22974	22981	75 %	0 %	25 %	0 %	384442329
80	NC_017282	CTTT	2	8	23195	23202	0 %	75 %	0 %	25 %	384442330
81	NC_017282	TGAT	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	384442331
82	NC_017282	TGCA	2	8	24480	24487	25 %	25 %	25 %	25 %	384442332
83	NC_017282	TTAT	2	8	24752	24759	25 %	75 %	0 %	0 %	384442333
84	NC_017282	CTTT	2	8	25232	25239	0 %	75 %	0 %	25 %	384442333
85	NC_017282	ATAA	2	8	25506	25513	75 %	25 %	0 %	0 %	384442334
86	NC_017282	TATT	2	8	25534	25541	25 %	75 %	0 %	0 %	384442334
87	NC_017282	AAAT	2	8	26523	26530	75 %	25 %	0 %	0 %	384442335
88	NC_017282	TCTT	2	8	26685	26692	0 %	75 %	0 %	25 %	384442335
89	NC_017282	TAAA	2	8	26931	26938	75 %	25 %	0 %	0 %	384442335
90	NC_017282	TTTA	2	8	27102	27109	25 %	75 %	0 %	0 %	384442335
91	NC_017282	GATG	2	8	27246	27253	25 %	25 %	50 %	0 %	384442335
92	NC_017282	AATT	2	8	28350	28357	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
93	NC_017282	TTTA	2	8	29343	29350	25 %	75 %	0 %	0 %	384442337
94	NC_017282	TGAT	2	8	29363	29370	25 %	50 %	25 %	0 %	384442337
95	NC_017282	TAAT	2	8	30114	30121	50 %	50 %	0 %	0 %	384442339
96	NC_017282	TATC	2	8	30390	30397	25 %	50 %	0 %	25 %	384442339
97	NC_017282	TAAA	2	8	32695	32702	75 %	25 %	0 %	0 %	384442341
98	NC_017282	ATCC	2	8	32793	32800	25 %	25 %	0 %	50 %	384442341
99	NC_017282	TTTC	2	8	33470	33477	0 %	75 %	0 %	25 %	384442343
100	NC_017282	AGCA	2	8	33930	33937	50 %	0 %	25 %	25 %	384442344
101	NC_017282	TCAC	2	8	34243	34250	25 %	25 %	0 %	50 %	384442345
102	NC_017282	CCAT	2	8	35083	35090	25 %	25 %	0 %	50 %	384442345
103	NC_017282	ATTC	2	8	35433	35440	25 %	50 %	0 %	25 %	384442346
104	NC_017282	ATTA	2	8	35698	35705	50 %	50 %	0 %	0 %	384442346
105	NC_017282	TTTA	2	8	35863	35870	25 %	75 %	0 %	0 %	384442346
106	NC_017282	TTAT	2	8	36050	36057	25 %	75 %	0 %	0 %	384442347
107	NC_017282	ATTT	2	8	36133	36140	25 %	75 %	0 %	0 %	384442347
108	NC_017282	CTTT	2	8	36263	36270	0 %	75 %	0 %	25 %	384442347
109	NC_017282	AAAT	2	8	36643	36650	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
110	NC_017282	AAAT	2	8	36912	36919	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
111	NC_017282	TAAA	2	8	36930	36937	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
112	NC_017282	GATA	2	8	37303	37310	50 %	25 %	25 %	0 %	384442349
113	NC_017282	AAAT	2	8	37703	37710	75 %	25 %	0 %	0 %	384442349
114	NC_017282	AAAG	2	8	37985	37992	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
115	NC_017282	AAGA	2	8	38231	38238	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
116	NC_017282	GTTT	2	8	38489	38496	0 %	75 %	25 %	0 %	384442351
117	NC_017282	TAAT	2	8	38724	38731	50 %	50 %	0 %	0 %	384442351
118	NC_017282	TAAA	2	8	39041	39048	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
119	NC_017282	AAAT	2	8	39072	39079	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
120	NC_017282	TTGT	2	8	39116	39123	0 %	75 %	25 %	0 %	384442352
121	NC_017282	CATA	2	8	39713	39720	50 %	25 %	0 %	25 %	384442353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.