MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 1014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442356
2	NC_017281	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384442357
3	NC_017281	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442357
4	NC_017281	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442361
5	NC_017281	ATTTAA	2	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	384442361
6	NC_017281	ATGGGT	2	12	17169	17180	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384442366
7	NC_017281	TTCATT	2	12	18193	18204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442369
8	NC_017281	AAGAAA	2	12	19408	19419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384442370
9	NC_017281	AAGATA	2	12	20327	20338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442371
10	NC_017281	AGCAAA	2	12	21110	21121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384442371
11	NC_017281	TTTTCT	2	12	21617	21628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384442372
12	NC_017281	TTATGC	2	12	27473	27484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442377
13	NC_017281	CTTTAA	2	12	29720	29731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384442378
14	NC_017281	CTATTT	2	12	29840	29851	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442378
15	NC_017281	ATGTGT	2	12	30534	30545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384442379
16	NC_017281	ATGGAT	2	12	34401	34412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442382
17	NC_017281	GAAATT	2	12	34610	34621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384442382
18	NC_017281	AACAAA	2	12	44052	44063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384442384
19	NC_017281	TGCTAA	2	12	50314	50325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442388
20	NC_017281	TACACT	2	12	50825	50836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442388
21	NC_017281	ATGAAA	2	12	52575	52586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442390
22	NC_017281	TAAGCT	2	12	53107	53118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442390
23	NC_017281	AGTTTT	2	12	55289	55300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442392
24	NC_017281	TTCTTT	2	12	55505	55516	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384442393
25	NC_017281	CAAAAT	2	12	59447	59458	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384442395
26	NC_017281	TTCATC	2	12	60380	60391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384442396
27	NC_017281	TAATTT	2	12	62174	62185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442398
28	NC_017281	ATTTTA	2	12	62426	62437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442398
29	NC_017281	AAATAT	2	12	62783	62794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442398
30	NC_017281	GTTGGA	2	12	63723	63734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384442398
31	NC_017281	GTTTTT	2	12	63868	63879	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384442398
32	NC_017281	TACAGC	2	12	65909	65920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384442401
33	NC_017281	CTTTTA	2	12	66063	66074	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442402
34	NC_017281	TAGCTT	2	12	72661	72672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442414
35	NC_017281	TTCATT	2	12	75020	75031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442417
36	NC_017281	CATCTT	2	12	76766	76777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384442418
37	NC_017281	TTTAAA	2	12	79186	79197	50 %	50 %	0 %	0 %	384442421
38	NC_017281	CTAGCT	2	12	79618	79629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384442422
39	NC_017281	GAATGA	2	12	79872	79883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442422
40	NC_017281	GATGCT	2	12	81032	81043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384442423
41	NC_017281	TAAATT	2	12	82746	82757	50 %	50 %	0 %	0 %	384442427
42	NC_017281	TTTTTG	2	12	89609	89620	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384442434
43	NC_017281	GAATTT	2	12	89929	89940	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384442435
44	NC_017281	AACTCA	2	12	90444	90455	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384442435
45	NC_017281	CTTTAA	2	12	92224	92235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384442436
46	NC_017281	ATATTT	2	12	92984	92995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442438
47	NC_017281	GTAACT	2	12	95397	95408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442440
48	NC_017281	CAGGAA	2	12	96104	96115	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384442441
49	NC_017281	TTGTGT	2	12	96690	96701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442441
50	NC_017281	ATAAAA	2	12	98513	98524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442442
51	NC_017281	TTAATG	2	12	100730	100741	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384442445
52	NC_017281	GCAAGC	2	12	100810	100821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442445
53	NC_017281	AACTTA	2	12	103548	103559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442449
54	NC_017281	TGTAGA	2	12	103684	103695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442449
55	NC_017281	GAACTT	2	12	105794	105805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442451
56	NC_017281	TTAGAA	2	12	105845	105856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384442451
57	NC_017281	AAAAAT	2	12	108148	108159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442454
58	NC_017281	GGTTTG	2	12	113854	113865	0 %	50 %	50 %	0 %	384442461
59	NC_017281	AAAATA	2	12	115665	115676	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442464
60	NC_017281	ATTTTG	2	12	117202	117213	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442466
61	NC_017281	GAAAAA	2	12	118109	118120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384442467
62	NC_017281	GTTGTG	2	12	118956	118967	0 %	50 %	50 %	0 %	384442468
63	NC_017281	GGACAT	2	12	118997	119008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384442468
64	NC_017281	TTTGAT	2	12	120582	120593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442470
65	NC_017281	TTCTTT	2	12	129725	129736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384442482
66	NC_017281	GGGCTT	2	12	130404	130415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384442483
67	NC_017281	AAAGAT	2	12	133476	133487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442485
68	NC_017281	GCTTTA	2	12	134785	134796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442487
69	NC_017281	TTGTTA	2	12	135564	135575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442489
70	NC_017281	AAAGAA	2	12	135703	135714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384442489
71	NC_017281	GAAAAA	2	12	138398	138409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384442491
72	NC_017281	ACCTTT	2	12	141934	141945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384442493
73	NC_017281	CTATAC	2	12	142582	142593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442494
74	NC_017281	TAAGGA	2	12	146950	146961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442498
75	NC_017281	TTTTAC	2	12	148965	148976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442499
76	NC_017281	CTGCTC	2	12	150841	150852	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384442502
77	NC_017281	ATTTTC	2	12	151763	151774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442503
78	NC_017281	AAAACT	2	12	154802	154813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384442506
79	NC_017281	ATAAAA	2	12	154870	154881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442506
80	NC_017281	TTTTGC	2	12	155426	155437	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384442507
81	NC_017281	AGCTAT	2	12	156481	156492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442509
82	NC_017281	GGCTAA	2	12	156880	156891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384442509
83	NC_017281	TCAAAT	2	12	158506	158517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442512
84	NC_017281	AAATAA	2	12	161275	161286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442517
85	NC_017281	ATTTTC	2	12	163347	163358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442519
86	NC_017281	AGCTTT	2	12	164043	164054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442520
87	NC_017281	GGCTGT	2	12	164681	164692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384442521
88	NC_017281	TATAAA	2	12	165346	165357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442522
89	NC_017281	AAAAGC	2	12	166850	166861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384442523
90	NC_017281	TAAAAA	2	12	167477	167488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442524
91	NC_017281	AACAAG	2	12	167642	167653	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384442524
92	NC_017281	TAAAAA	2	12	170563	170574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442527
93	NC_017281	TGGAAA	2	12	170624	170635	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442527
94	NC_017281	TATTTT	2	12	173368	173379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384442529
95	NC_017281	TTAAAT	2	12	173391	173402	50 %	50 %	0 %	0 %	384442529
96	NC_017281	CTTTCT	2	12	173478	173489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442529
97	NC_017281	ATTCTA	2	12	175479	175490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384442532
98	NC_017281	GCTATT	2	12	175706	175717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442532
99	NC_017281	TTGCAG	2	12	177053	177064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384442533
100	NC_017281	AAAACC	2	12	180847	180858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442538
101	NC_017281	CAAGGA	2	12	183217	183228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384442540
102	NC_017281	AATGAA	2	12	187621	187632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442545
103	NC_017281	AAGTGC	2	12	188826	188837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384442545
104	NC_017281	CCTAAT	2	12	188845	188856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442545
105	NC_017281	CTTACT	2	12	190445	190456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384442547
106	NC_017281	ATTAAA	2	12	191824	191835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442548
107	NC_017281	ATCAAT	2	12	192569	192580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442549
108	NC_017281	TTTTAG	2	12	201233	201244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442556
109	NC_017281	AAAGAA	2	12	201372	201383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384442557
110	NC_017281	GTTTAT	2	12	203897	203908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442560
111	NC_017281	TTTGAA	2	12	206427	206438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384442566
112	NC_017281	TGAACT	2	12	206770	206781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384442567
113	NC_017281	TTTGAT	2	12	207566	207577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442567
114	NC_017281	TAAAAT	2	12	208788	208799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442569
115	NC_017281	GAAATA	2	12	210925	210936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442572
116	NC_017281	TGATTT	2	12	211702	211713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442573
117	NC_017281	TTCTTT	2	12	213731	213742	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384442574
118	NC_017281	TTCAAA	2	12	214247	214258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442576
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234	NC_017281	GATTTT	2	12	431794	431805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442800
235	NC_017281	TAAGGA	2	12	433220	433231	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384442802
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