MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 35589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_017279	TATC	2	8	1628872	1628879	25 %	50 %	0 %	25 %	384448929
35502	NC_017279	TTC	2	6	1628884	1628889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448929
35503	NC_017279	CAT	2	6	1628914	1628919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448929
35504	NC_017279	TCA	2	6	1628970	1628975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448929
35505	NC_017279	T	7	7	1628981	1628987	0 %	100 %	0 %	0 %	384448929
35506	NC_017279	ATATCT	2	12	1629072	1629083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384448929
35507	NC_017279	TGAT	2	8	1629240	1629247	25 %	50 %	25 %	0 %	384448929
35508	NC_017279	TAT	2	6	1629310	1629315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448929
35509	NC_017279	A	6	6	1629666	1629671	100 %	0 %	0 %	0 %	384448930
35510	NC_017279	A	7	7	1629740	1629746	100 %	0 %	0 %	0 %	384448930
35511	NC_017279	A	6	6	1629854	1629859	100 %	0 %	0 %	0 %	384448930
35512	NC_017279	TTG	2	6	1629877	1629882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448930
35513	NC_017279	AAAG	2	8	1629891	1629898	75 %	0 %	25 %	0 %	384448930
35514	NC_017279	GTA	2	6	1630047	1630052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448930
35515	NC_017279	TGC	2	6	1630076	1630081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448930
35516	NC_017279	ACTC	2	8	1630127	1630134	25 %	25 %	0 %	50 %	384448930
35517	NC_017279	CAG	2	6	1630150	1630155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448930
35518	NC_017279	GTA	2	6	1630191	1630196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448930
35519	NC_017279	A	7	7	1630198	1630204	100 %	0 %	0 %	0 %	384448930
35520	NC_017279	ACT	2	6	1630229	1630234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448930
35521	NC_017279	TGA	2	6	1630235	1630240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448930
35522	NC_017279	CAA	2	6	1631149	1631154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448931
35523	NC_017279	TAT	2	6	1631191	1631196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448931
35524	NC_017279	TTA	2	6	1631286	1631291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448931
35525	NC_017279	ACA	3	9	1631342	1631350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448931
35526	NC_017279	CAT	2	6	1631395	1631400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448931
35527	NC_017279	ATT	2	6	1631705	1631710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35528	NC_017279	ATA	2	6	1631791	1631796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448932
35529	NC_017279	CAC	2	6	1631858	1631863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448932
35530	NC_017279	CCT	2	6	1631866	1631871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384448932
35531	NC_017279	CTA	3	9	1631885	1631893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448932
35532	NC_017279	CCA	2	6	1631929	1631934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448932
35533	NC_017279	CCTGT	2	10	1632089	1632098	0 %	40 %	20 %	40 %	384448932
35534	NC_017279	TTG	2	6	1632168	1632173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448932
35535	NC_017279	GCA	2	6	1632181	1632186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448932
35536	NC_017279	CAT	2	6	1632239	1632244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448932
35537	NC_017279	ACA	2	6	1632265	1632270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448932
35538	NC_017279	CAG	2	6	1632305	1632310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448932
35539	NC_017279	GAT	2	6	1632324	1632329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448932
35540	NC_017279	CATT	2	8	1632337	1632344	25 %	50 %	0 %	25 %	384448932
35541	NC_017279	CTTT	2	8	1632460	1632467	0 %	75 %	0 %	25 %	384448932
35542	NC_017279	CAT	2	6	1632524	1632529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448932
35543	NC_017279	TTA	2	6	1632550	1632555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35544	NC_017279	TAT	2	6	1632581	1632586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35545	NC_017279	GTT	2	6	1632589	1632594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448932
35546	NC_017279	ATT	2	6	1632603	1632608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35547	NC_017279	TGG	2	6	1632618	1632623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448932
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35549	NC_017279	CAT	2	6	1632731	1632736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448932
35550	NC_017279	CT	3	6	1632771	1632776	0 %	50 %	0 %	50 %	384448932
35551	NC_017279	ATT	2	6	1632846	1632851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35552	NC_017279	GT	3	6	1632892	1632897	0 %	50 %	50 %	0 %	384448932
35553	NC_017279	CCA	2	6	1632898	1632903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448932
35554	NC_017279	GGT	2	6	1632919	1632924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448932
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35556	NC_017279	AT	3	6	1632949	1632954	50 %	50 %	0 %	0 %	384448932
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35558	NC_017279	TAT	2	6	1633032	1633037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35559	NC_017279	ATT	2	6	1633065	1633070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
35560	NC_017279	TAA	2	6	1633109	1633114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448932
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35567	NC_017279	T	7	7	1633652	1633658	0 %	100 %	0 %	0 %	384448932
35568	NC_017279	AT	3	6	1633686	1633691	50 %	50 %	0 %	0 %	384448932
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35571	NC_017279	CTAT	2	8	1633816	1633823	25 %	50 %	0 %	25 %	384448932
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35574	NC_017279	ATC	2	6	1633944	1633949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448932
35575	NC_017279	A	7	7	1633959	1633965	100 %	0 %	0 %	0 %	384448932
35576	NC_017279	TGAAC	2	10	1634008	1634017	40 %	20 %	20 %	20 %	384448932
35577	NC_017279	GAAT	2	8	1634023	1634030	50 %	25 %	25 %	0 %	384448932
35578	NC_017279	TTA	2	6	1634191	1634196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448932
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35583	NC_017279	GAA	2	6	1634668	1634673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448933
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35585	NC_017279	TCT	2	6	1634745	1634750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448933
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35589	NC_017279	TTG	2	6	1634880	1634885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448933

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.