MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 30821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	GTTT	2	8	84	91	0 %	75 %	25 %	0 %	383787662
2	NC_017096	AG	3	6	93	98	50 %	0 %	50 %	0 %	383787662
3	NC_017096	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787662
4	NC_017096	GAA	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
5	NC_017096	A	8	8	233	240	100 %	0 %	0 %	0 %	383787662
6	NC_017096	ATC	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787662
7	NC_017096	ACA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383787662
8	NC_017096	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
9	NC_017096	TGC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383787662
10	NC_017096	AC	3	6	421	426	50 %	0 %	0 %	50 %	383787662
11	NC_017096	TGCA	2	8	431	438	25 %	25 %	25 %	25 %	383787662
12	NC_017096	AAG	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
13	NC_017096	AAC	2	6	582	587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383787662
14	NC_017096	TGA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787662
15	NC_017096	GAAC	2	8	631	638	50 %	0 %	25 %	25 %	383787662
16	NC_017096	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
17	NC_017096	CA	3	6	655	660	50 %	0 %	0 %	50 %	383787662
18	NC_017096	ACC	2	6	711	716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383787662
19	NC_017096	CCT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383787662
20	NC_017096	ACA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383787662
21	NC_017096	TGAA	2	8	950	957	50 %	25 %	25 %	0 %	383787662
22	NC_017096	GTT	2	6	1045	1050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787662
23	NC_017096	ATT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787662
24	NC_017096	AGA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
25	NC_017096	CGG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383787662
26	NC_017096	CA	3	6	1201	1206	50 %	0 %	0 %	50 %	383787662
27	NC_017096	AGA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787662
28	NC_017096	TTG	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787662
29	NC_017096	GAAAA	2	10	1390	1399	80 %	0 %	20 %	0 %	383787663
30	NC_017096	TTA	2	6	1405	1410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787663
31	NC_017096	AAT	2	6	1440	1445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787663
32	NC_017096	TTA	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787663
33	NC_017096	TAT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787663
34	NC_017096	TTA	2	6	1491	1496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787663
35	NC_017096	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787663
36	NC_017096	AAT	2	6	1590	1595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787664
37	NC_017096	TTA	2	6	1647	1652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787664
38	NC_017096	TTC	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787664
39	NC_017096	AAAAG	2	10	1823	1832	80 %	0 %	20 %	0 %	383787664
40	NC_017096	TAA	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787664
41	NC_017096	AAG	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787664
42	NC_017096	TGC	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383787664
43	NC_017096	GAA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787664
44	NC_017096	GAT	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787664
45	NC_017096	GCACT	2	10	2071	2080	20 %	20 %	20 %	40 %	383787664
46	NC_017096	TAAA	2	8	2086	2093	75 %	25 %	0 %	0 %	383787664
47	NC_017096	AC	3	6	2157	2162	50 %	0 %	0 %	50 %	383787664
48	NC_017096	ATA	2	6	2176	2181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787664
49	NC_017096	TC	3	6	2223	2228	0 %	50 %	0 %	50 %	383787664
50	NC_017096	TAAT	2	8	2254	2261	50 %	50 %	0 %	0 %	383787664
51	NC_017096	ATT	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787664
52	NC_017096	AGGA	2	8	2381	2388	50 %	0 %	50 %	0 %	383787664
53	NC_017096	ATT	2	6	2418	2423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787664
54	NC_017096	TTC	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787664
55	NC_017096	GGCAA	2	10	2446	2455	40 %	0 %	40 %	20 %	383787664
56	NC_017096	AACG	2	8	2474	2481	50 %	0 %	25 %	25 %	383787664
57	NC_017096	A	6	6	2509	2514	100 %	0 %	0 %	0 %	383787664
58	NC_017096	TAA	2	6	2623	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787664
59	NC_017096	AGG	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383787665
60	NC_017096	ATT	3	9	2726	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787665
61	NC_017096	A	6	6	2737	2742	100 %	0 %	0 %	0 %	383787665
62	NC_017096	AAC	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383787665
63	NC_017096	AT	3	6	2774	2779	50 %	50 %	0 %	0 %	383787665
64	NC_017096	CGTAAA	2	12	2827	2838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383787665
65	NC_017096	TGA	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787665
66	NC_017096	T	7	7	2848	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	383787665
67	NC_017096	TAA	2	6	2869	2874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787665
68	NC_017096	TAG	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787665
69	NC_017096	A	7	7	2930	2936	100 %	0 %	0 %	0 %	383787665
70	NC_017096	AAAG	2	8	2952	2959	75 %	0 %	25 %	0 %	383787665
71	NC_017096	TTG	2	6	3018	3023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787665
72	NC_017096	TGA	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787665
73	NC_017096	TAC	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787665
74	NC_017096	GA	3	6	3131	3136	50 %	0 %	50 %	0 %	383787665
75	NC_017096	AG	3	6	3231	3236	50 %	0 %	50 %	0 %	383787665
76	NC_017096	ATA	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787665
77	NC_017096	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	383787665
78	NC_017096	TAAA	2	8	3375	3382	75 %	25 %	0 %	0 %	383787665
79	NC_017096	A	7	7	3380	3386	100 %	0 %	0 %	0 %	383787665
80	NC_017096	TGA	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787665
81	NC_017096	AAAT	2	8	3435	3442	75 %	25 %	0 %	0 %	383787665
82	NC_017096	AATT	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	383787665
83	NC_017096	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787665
84	NC_017096	T	7	7	3560	3566	0 %	100 %	0 %	0 %	383787665
85	NC_017096	TGA	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787665
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90	NC_017096	GAGAG	2	10	3744	3753	40 %	0 %	60 %	0 %	383787666
91	NC_017096	A	6	6	3761	3766	100 %	0 %	0 %	0 %	383787666
92	NC_017096	TTG	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787666
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100	NC_017096	A	6	6	4016	4021	100 %	0 %	0 %	0 %	383787666
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103	NC_017096	TGA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787666
104	NC_017096	A	7	7	4170	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	383787666
105	NC_017096	A	7	7	4266	4272	100 %	0 %	0 %	0 %	383787666
106	NC_017096	T	6	6	4520	4525	0 %	100 %	0 %	0 %	383787667
107	NC_017096	AAT	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787667
108	NC_017096	GAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787667
109	NC_017096	CTT	2	6	4639	4644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787667
110	NC_017096	CAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383787667
111	NC_017096	CCA	3	9	4822	4830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383787667
112	NC_017096	CTT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787667
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114	NC_017096	TTTTC	2	10	5054	5063	0 %	80 %	0 %	20 %	383787667
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117	NC_017096	TC	3	6	5421	5426	0 %	50 %	0 %	50 %	383787668
118	NC_017096	AGA	2	6	5459	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383787668
119	NC_017096	CAT	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787668
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121	NC_017096	ATG	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787668
122	NC_017096	TAAA	2	8	5760	5767	75 %	25 %	0 %	0 %	383787668
123	NC_017096	AT	3	6	5861	5866	50 %	50 %	0 %	0 %	383787668
124	NC_017096	T	6	6	5882	5887	0 %	100 %	0 %	0 %	383787668
125	NC_017096	TCT	2	6	5918	5923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787668
126	NC_017096	CTTTG	2	10	6085	6094	0 %	60 %	20 %	20 %	383787668
127	NC_017096	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383787668
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131	NC_017096	TGT	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787669
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133	NC_017096	AG	3	6	6365	6370	50 %	0 %	50 %	0 %	383787669
134	NC_017096	TTTC	2	8	6412	6419	0 %	75 %	0 %	25 %	383787670
135	NC_017096	AGG	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383787671
136	NC_017096	A	7	7	6729	6735	100 %	0 %	0 %	0 %	383787671
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