MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 37606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017031	AGC	2	6	150246	150251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313337
2502	NC_017031	GGA	2	6	150281	150286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313337
2503	NC_017031	TTG	2	6	150310	150315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313337
2504	NC_017031	AGA	2	6	150361	150366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313337
2505	NC_017031	TGT	2	6	150523	150528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313338
2506	NC_017031	TGA	2	6	150554	150559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313338
2507	NC_017031	TGC	2	6	150699	150704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313338
2508	NC_017031	GTG	2	6	150771	150776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313338
2509	NC_017031	TGGG	2	8	150841	150848	0 %	25 %	75 %	0 %	383313338
2510	NC_017031	GCTA	2	8	150860	150867	25 %	25 %	25 %	25 %	383313338
2511	NC_017031	TGC	2	6	150901	150906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313338
2512	NC_017031	CTT	2	6	151039	151044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313338
2513	NC_017031	TGG	2	6	151078	151083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313338
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2515	NC_017031	GTGAG	2	10	151217	151226	20 %	20 %	60 %	0 %	383313339
2516	NC_017031	TAG	2	6	151257	151262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313339
2517	NC_017031	GCT	2	6	151395	151400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313339
2518	NC_017031	GCT	2	6	151528	151533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313339
2519	NC_017031	ATA	2	6	151547	151552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383313339
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2523	NC_017031	ACC	2	6	151708	151713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313339
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2530	NC_017031	CTGAA	2	10	152015	152024	40 %	20 %	20 %	20 %	383313339
2531	NC_017031	GCG	2	6	152054	152059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313339
2532	NC_017031	ATA	2	6	152164	152169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383313339
2533	NC_017031	GCT	2	6	152209	152214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313339
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2539	NC_017031	GC	3	6	152602	152607	0 %	0 %	50 %	50 %	383313340
2540	NC_017031	TGC	2	6	152637	152642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313340
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2543	NC_017031	TCCT	2	8	152747	152754	0 %	50 %	0 %	50 %	383313340
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2546	NC_017031	AGCGCC	2	12	152868	152879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383313340
2547	NC_017031	TTGA	2	8	152915	152922	25 %	50 %	25 %	0 %	383313340
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2553	NC_017031	GTT	2	6	153232	153237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313340
2554	NC_017031	AAC	2	6	153260	153265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313340
2555	NC_017031	GCT	2	6	153279	153284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313340
2556	NC_017031	CCAGC	2	10	153307	153316	20 %	0 %	20 %	60 %	383313340
2557	NC_017031	TGG	2	6	153385	153390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313340
2558	NC_017031	ACA	2	6	153420	153425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313340
2559	NC_017031	GA	3	6	153434	153439	50 %	0 %	50 %	0 %	383313340
2560	NC_017031	GGC	2	6	155112	155117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313341
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2562	NC_017031	TGA	2	6	155155	155160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313341
2563	NC_017031	CAG	2	6	155277	155282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313341
2564	NC_017031	GGT	2	6	155310	155315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313341
2565	NC_017031	AGC	2	6	155352	155357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313341
2566	NC_017031	GCC	3	9	155401	155409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313341
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2568	NC_017031	GATA	2	8	155453	155460	50 %	25 %	25 %	0 %	383313341
2569	NC_017031	TAAG	2	8	155628	155635	50 %	25 %	25 %	0 %	383313341
2570	NC_017031	GTTT	2	8	155643	155650	0 %	75 %	25 %	0 %	383313341
2571	NC_017031	CGG	2	6	155652	155657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313341
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2573	NC_017031	CGCA	2	8	155894	155901	25 %	0 %	25 %	50 %	383313342
2574	NC_017031	ATG	2	6	155941	155946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313342
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2578	NC_017031	CGA	2	6	156170	156175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313342
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2581	NC_017031	TGA	2	6	156301	156306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313342
2582	NC_017031	TACGC	2	10	156333	156342	20 %	20 %	20 %	40 %	383313342
2583	NC_017031	TGAA	2	8	156445	156452	50 %	25 %	25 %	0 %	383313342
2584	NC_017031	CAG	2	6	156496	156501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313342
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2587	NC_017031	CAA	2	6	156692	156697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313342
2588	NC_017031	GCT	2	6	156835	156840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313343
2589	NC_017031	CAG	2	6	156853	156858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313343
2590	NC_017031	TTCA	2	8	156892	156899	25 %	50 %	0 %	25 %	383313343
2591	NC_017031	CAT	2	6	156900	156905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313343
2592	NC_017031	TCC	2	6	156929	156934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313343
2593	NC_017031	TGG	2	6	157013	157018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313343
2594	NC_017031	GT	3	6	157022	157027	0 %	50 %	50 %	0 %	383313343
2595	NC_017031	TG	3	6	157095	157100	0 %	50 %	50 %	0 %	383313344
2596	NC_017031	ACC	2	6	157124	157129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313344
2597	NC_017031	AT	3	6	157165	157170	50 %	50 %	0 %	0 %	383313344
2598	NC_017031	TCG	2	6	157344	157349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313345
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2602	NC_017031	CGGC	2	8	157782	157789	0 %	0 %	50 %	50 %	383313345
2603	NC_017031	TGC	2	6	157793	157798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313345
2604	NC_017031	GCC	2	6	157808	157813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313345
2605	NC_017031	CTG	2	6	157831	157836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313345
2606	NC_017031	CGT	2	6	157978	157983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313345
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2608	NC_017031	GTCA	2	8	158030	158037	25 %	25 %	25 %	25 %	383313345
2609	NC_017031	AG	3	6	158227	158232	50 %	0 %	50 %	0 %	383313346
2610	NC_017031	CTC	2	6	158242	158247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313346
2611	NC_017031	AG	3	6	158269	158274	50 %	0 %	50 %	0 %	383313346
2612	NC_017031	TGC	2	6	158396	158401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313346
2613	NC_017031	TCG	2	6	158435	158440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313346
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2615	NC_017031	CCT	2	6	158565	158570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313346
2616	NC_017031	CGA	2	6	158596	158601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313346
2617	NC_017031	GA	3	6	158616	158621	50 %	0 %	50 %	0 %	383313346
2618	NC_017031	CGT	2	6	158712	158717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313346
2619	NC_017031	CGT	2	6	158802	158807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313346
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2621	NC_017031	CA	3	6	158872	158877	50 %	0 %	0 %	50 %	383313346
2622	NC_017031	GC	3	6	158888	158893	0 %	0 %	50 %	50 %	383313346
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2732	NC_017031	TG	3	6	166030	166035	0 %	50 %	50 %	0 %	383313351
2733	NC_017031	TTAT	2	8	166056	166063	25 %	75 %	0 %	0 %	383313351
2734	NC_017031	TCT	2	6	166083	166088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313351
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2736	NC_017031	GTA	2	6	166606	166611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313351
2737	NC_017031	GTC	2	6	166671	166676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313352
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2739	NC_017031	GAT	2	6	166704	166709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313352
2740	NC_017031	GCT	2	6	166812	166817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313352
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2742	NC_017031	GAA	2	6	166933	166938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313352
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2983	NC_017031	TGA	2	6	182118	182123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313360
2984	NC_017031	CAG	2	6	182299	182304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313360
2985	NC_017031	GAA	2	6	182343	182348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313360
2986	NC_017031	GCAC	2	8	182356	182363	25 %	0 %	25 %	50 %	383313360
2987	NC_017031	TGC	2	6	182394	182399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313360
2988	NC_017031	TCC	2	6	182423	182428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313360
2989	NC_017031	TGACTA	2	12	182701	182712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383313361
2990	NC_017031	CGT	2	6	182720	182725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313361
2991	NC_017031	GAG	2	6	182769	182774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313361
2992	NC_017031	T	6	6	182801	182806	0 %	100 %	0 %	0 %	383313361
2993	NC_017031	CTG	2	6	182821	182826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313361
2994	NC_017031	TC	3	6	182892	182897	0 %	50 %	0 %	50 %	383313361
2995	NC_017031	GCA	2	6	182932	182937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313361
2996	NC_017031	GCC	2	6	182967	182972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313361
2997	NC_017031	TGG	2	6	182983	182988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313361
2998	NC_017031	AAC	2	6	183060	183065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313361
2999	NC_017031	ATT	2	6	183078	183083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313361
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