MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 26152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017028	TAA	2	6	28237	28242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
502	NC_017028	A	6	6	28297	28302	100 %	0 %	0 %	0 %	383311922
503	NC_017028	ATA	2	6	28329	28334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
504	NC_017028	CTAT	2	8	28370	28377	25 %	50 %	0 %	25 %	383311922
505	NC_017028	T	6	6	28392	28397	0 %	100 %	0 %	0 %	383311922
506	NC_017028	AAT	2	6	28409	28414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
507	NC_017028	TAA	2	6	28507	28512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
508	NC_017028	TTGC	2	8	28513	28520	0 %	50 %	25 %	25 %	383311922
509	NC_017028	TCT	2	6	28526	28531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
510	NC_017028	CTA	2	6	28572	28577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311922
511	NC_017028	ATTA	2	8	28597	28604	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
512	NC_017028	A	7	7	28651	28657	100 %	0 %	0 %	0 %	383311922
513	NC_017028	ATT	2	6	28661	28666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
514	NC_017028	TA	3	6	28695	28700	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
515	NC_017028	ATTA	2	8	28714	28721	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
516	NC_017028	ATTT	2	8	28743	28750	25 %	75 %	0 %	0 %	383311922
517	NC_017028	TAT	2	6	28756	28761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
518	NC_017028	TTA	2	6	28764	28769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
519	NC_017028	ATC	2	6	28832	28837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311922
520	NC_017028	CTA	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311922
521	NC_017028	ATA	3	9	28978	28986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
522	NC_017028	GCT	2	6	29057	29062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311922
523	NC_017028	TTA	2	6	29075	29080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
524	NC_017028	TA	3	6	29089	29094	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
525	NC_017028	T	6	6	29121	29126	0 %	100 %	0 %	0 %	383311922
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527	NC_017028	CTT	2	6	29388	29393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
528	NC_017028	ACA	2	6	29435	29440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311922
529	NC_017028	CTT	2	6	29463	29468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
530	NC_017028	ATT	2	6	29537	29542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
531	NC_017028	CT	4	8	29545	29552	0 %	50 %	0 %	50 %	383311922
532	NC_017028	T	6	6	29623	29628	0 %	100 %	0 %	0 %	383311922
533	NC_017028	ATT	2	6	29659	29664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311922
534	NC_017028	ATTTT	2	10	29742	29751	20 %	80 %	0 %	0 %	383311922
535	NC_017028	TATT	2	8	29786	29793	25 %	75 %	0 %	0 %	383311922
536	NC_017028	TAA	2	6	29805	29810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
537	NC_017028	T	7	7	29847	29853	0 %	100 %	0 %	0 %	383311922
538	NC_017028	ATA	2	6	29863	29868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
539	NC_017028	TAAT	2	8	29880	29887	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
540	NC_017028	TAG	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311922
541	NC_017028	TTC	2	6	29977	29982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
542	NC_017028	TTC	2	6	30076	30081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
543	NC_017028	AT	3	6	30096	30101	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
544	NC_017028	T	7	7	30122	30128	0 %	100 %	0 %	0 %	383311922
545	NC_017028	TTC	2	6	30145	30150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311922
546	NC_017028	TAA	3	9	30163	30171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311922
547	NC_017028	ACA	2	6	30204	30209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311923
548	NC_017028	AAG	2	6	30242	30247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311923
549	NC_017028	TCA	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311923
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551	NC_017028	CT	3	6	30507	30512	0 %	50 %	0 %	50 %	383311923
552	NC_017028	TCA	2	6	30517	30522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311923
553	NC_017028	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	383311923
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557	NC_017028	CCAA	2	8	30654	30661	50 %	0 %	0 %	50 %	383311923
558	NC_017028	GCA	2	6	30667	30672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311923
559	NC_017028	ATC	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311923
560	NC_017028	CAA	2	6	30701	30706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311923
561	NC_017028	ATA	2	6	30810	30815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311923
562	NC_017028	TGC	2	6	30817	30822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311923
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564	NC_017028	TCT	2	6	30861	30866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311923
565	NC_017028	AAT	2	6	30995	31000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311923
566	NC_017028	AAT	2	6	31014	31019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311923
567	NC_017028	T	6	6	31035	31040	0 %	100 %	0 %	0 %	383311923
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571	NC_017028	TCTT	2	8	31319	31326	0 %	75 %	0 %	25 %	383311924
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581	NC_017028	ACTTA	2	10	31683	31692	40 %	40 %	0 %	20 %	383311925
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589	NC_017028	A	7	7	32309	32315	100 %	0 %	0 %	0 %	383311926
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598	NC_017028	ATC	2	6	32856	32861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311927
599	NC_017028	TAC	2	6	32878	32883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311927
600	NC_017028	T	6	6	33068	33073	0 %	100 %	0 %	0 %	383311927
601	NC_017028	T	6	6	33096	33101	0 %	100 %	0 %	0 %	383311927
602	NC_017028	AT	3	6	33105	33110	50 %	50 %	0 %	0 %	383311927
603	NC_017028	TAA	2	6	33124	33129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311927
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608	NC_017028	GCT	2	6	33274	33279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311927
609	NC_017028	CGAA	2	8	33280	33287	50 %	0 %	25 %	25 %	383311927
610	NC_017028	CCT	2	6	33327	33332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383311927
611	NC_017028	ATA	2	6	33357	33362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311927
612	NC_017028	ATA	2	6	33369	33374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311927
613	NC_017028	ATA	2	6	33501	33506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311927
614	NC_017028	CCG	2	6	33507	33512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311927
615	NC_017028	TAC	2	6	33521	33526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311927
616	NC_017028	GCA	2	6	33534	33539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311927
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618	NC_017028	A	7	7	33581	33587	100 %	0 %	0 %	0 %	383311927
619	NC_017028	TGC	2	6	33588	33593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311927
620	NC_017028	TATAA	2	10	33596	33605	60 %	40 %	0 %	0 %	383311927
621	NC_017028	TAC	2	6	33668	33673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311927
622	NC_017028	CTAT	2	8	33843	33850	25 %	50 %	0 %	25 %	383311928
623	NC_017028	T	6	6	33925	33930	0 %	100 %	0 %	0 %	383311928
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627	NC_017028	CAT	3	9	34016	34024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311928
628	NC_017028	TCC	2	6	34038	34043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383311928
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