MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 26152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017028	ATC	2	6	288914	288919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312166
5502	NC_017028	ATG	2	6	288950	288955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312166
5503	NC_017028	TTC	2	6	288998	289003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312166
5504	NC_017028	TCT	2	6	289013	289018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312166
5505	NC_017028	TCTT	2	8	289085	289092	0 %	75 %	0 %	25 %	383312166
5506	NC_017028	CCGT	2	8	289128	289135	0 %	25 %	25 %	50 %	383312166
5507	NC_017028	GAT	2	6	289182	289187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312166
5508	NC_017028	GTT	2	6	290437	290442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312167
5509	NC_017028	T	7	7	290459	290465	0 %	100 %	0 %	0 %	383312167
5510	NC_017028	GAT	2	6	290497	290502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312167
5511	NC_017028	TGCA	2	8	290511	290518	25 %	25 %	25 %	25 %	383312167
5512	NC_017028	TAA	2	6	290520	290525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312167
5513	NC_017028	ATT	3	9	290529	290537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312167
5514	NC_017028	ATT	2	6	290587	290592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312167
5515	NC_017028	TCT	2	6	290602	290607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312167
5516	NC_017028	TCTT	2	8	290651	290658	0 %	75 %	0 %	25 %	383312167
5517	NC_017028	ATT	2	6	290665	290670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312167
5518	NC_017028	TAA	2	6	290672	290677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312167
5519	NC_017028	TAA	3	9	290703	290711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312167
5520	NC_017028	TAG	2	6	290791	290796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312168
5521	NC_017028	TATAAA	2	12	290800	290811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5522	NC_017028	AT	3	6	290832	290837	50 %	50 %	0 %	0 %	383312168
5523	NC_017028	TATT	2	8	290838	290845	25 %	75 %	0 %	0 %	383312168
5524	NC_017028	CAT	2	6	290859	290864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312168
5525	NC_017028	TTTG	2	8	290872	290879	0 %	75 %	25 %	0 %	383312168
5526	NC_017028	TAA	2	6	290881	290886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5527	NC_017028	ATG	2	6	290892	290897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312168
5528	NC_017028	TAA	2	6	290926	290931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5529	NC_017028	GTT	2	6	290949	290954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312168
5530	NC_017028	AGTA	2	8	291022	291029	50 %	25 %	25 %	0 %	383312168
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5533	NC_017028	CTTT	2	8	291107	291114	0 %	75 %	0 %	25 %	383312168
5534	NC_017028	TAT	2	6	291135	291140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312168
5535	NC_017028	AAAAC	2	10	291151	291160	80 %	0 %	0 %	20 %	383312168
5536	NC_017028	GCA	2	6	291200	291205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312168
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5538	NC_017028	GTG	2	6	291321	291326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312168
5539	NC_017028	CAT	2	6	291355	291360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312168
5540	NC_017028	AT	4	8	291417	291424	50 %	50 %	0 %	0 %	383312168
5541	NC_017028	AACG	2	8	291451	291458	50 %	0 %	25 %	25 %	383312168
5542	NC_017028	AAAGT	2	10	291473	291482	60 %	20 %	20 %	0 %	383312168
5543	NC_017028	TAA	2	6	291519	291524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5544	NC_017028	TAA	2	6	291544	291549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5545	NC_017028	ACT	2	6	291563	291568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312168
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5547	NC_017028	T	6	6	291610	291615	0 %	100 %	0 %	0 %	383312168
5548	NC_017028	CTT	2	6	291621	291626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312168
5549	NC_017028	TAA	2	6	291640	291645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5550	NC_017028	TAA	2	6	291664	291669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5551	NC_017028	A	7	7	291731	291737	100 %	0 %	0 %	0 %	383312168
5552	NC_017028	TAA	2	6	291772	291777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5553	NC_017028	AT	3	6	291809	291814	50 %	50 %	0 %	0 %	383312168
5554	NC_017028	TAC	2	6	291850	291855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312168
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5556	NC_017028	A	7	7	291946	291952	100 %	0 %	0 %	0 %	383312168
5557	NC_017028	ATA	2	6	292005	292010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5558	NC_017028	AATAA	2	10	292039	292048	80 %	20 %	0 %	0 %	383312168
5559	NC_017028	TAG	2	6	292056	292061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312168
5560	NC_017028	AAT	2	6	292093	292098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
5561	NC_017028	ATG	2	6	292119	292124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312168
5562	NC_017028	A	7	7	292240	292246	100 %	0 %	0 %	0 %	383312168
5563	NC_017028	AAT	2	6	292250	292255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
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5570	NC_017028	TTA	2	6	293257	293262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312170
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5580	NC_017028	TA	3	6	295281	295286	50 %	50 %	0 %	0 %	383312171
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5591	NC_017028	TCA	2	6	295825	295830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312171
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5594	NC_017028	AGCTA	2	10	295872	295881	40 %	20 %	20 %	20 %	383312171
5595	NC_017028	AAT	2	6	295898	295903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312171
5596	NC_017028	AT	3	6	295936	295941	50 %	50 %	0 %	0 %	383312171
5597	NC_017028	ATTA	2	8	295947	295954	50 %	50 %	0 %	0 %	383312171
5598	NC_017028	CTT	2	6	295961	295966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312171
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5604	NC_017028	T	6	6	296156	296161	0 %	100 %	0 %	0 %	383312171
5605	NC_017028	ATC	2	6	296169	296174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312171
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5607	NC_017028	TTA	2	6	296221	296226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312171
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5609	NC_017028	TGCCGA	2	12	296346	296357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383312171
5610	NC_017028	CT	3	6	296397	296402	0 %	50 %	0 %	50 %	383312171
5611	NC_017028	A	6	6	296458	296463	100 %	0 %	0 %	0 %	383312171
5612	NC_017028	AT	3	6	296542	296547	50 %	50 %	0 %	0 %	383312171
5613	NC_017028	TGT	2	6	296597	296602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312171
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