MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	TA	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	383327285
2	NC_017021	AG	3	6	385	390	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
3	NC_017021	AG	3	6	399	404	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
4	NC_017021	TA	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	383327286
5	NC_017021	AG	3	6	1065	1070	50 %	0 %	50 %	0 %	383327286
6	NC_017021	TA	3	6	1826	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	383327287
7	NC_017021	GA	3	6	1930	1935	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
8	NC_017021	AG	3	6	2233	2238	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
9	NC_017021	AG	3	6	4247	4252	50 %	0 %	50 %	0 %	383327293
10	NC_017021	TC	4	8	4575	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	383327293
11	NC_017021	AT	3	6	4842	4847	50 %	50 %	0 %	0 %	383327293
12	NC_017021	CA	3	6	9363	9368	50 %	0 %	0 %	50 %	383327301
13	NC_017021	TA	3	6	9969	9974	50 %	50 %	0 %	0 %	383327302
14	NC_017021	AT	3	6	10140	10145	50 %	50 %	0 %	0 %	383327302
15	NC_017021	CA	3	6	10606	10611	50 %	0 %	0 %	50 %	383327303
16	NC_017021	CA	3	6	10770	10775	50 %	0 %	0 %	50 %	383327303
17	NC_017021	TC	3	6	11238	11243	0 %	50 %	0 %	50 %	383327304
18	NC_017021	AT	3	6	11871	11876	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
19	NC_017021	AT	3	6	12027	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
20	NC_017021	TA	4	8	12749	12756	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
21	NC_017021	TA	3	6	12856	12861	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
22	NC_017021	GT	3	6	13126	13131	0 %	50 %	50 %	0 %	383327305
23	NC_017021	AT	3	6	13302	13307	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
24	NC_017021	AT	3	6	13652	13657	50 %	50 %	0 %	0 %	383327306
25	NC_017021	CT	3	6	13680	13685	0 %	50 %	0 %	50 %	383327306
26	NC_017021	CA	3	6	14589	14594	50 %	0 %	0 %	50 %	383327308
27	NC_017021	AT	3	6	14842	14847	50 %	50 %	0 %	0 %	383327309
28	NC_017021	CT	3	6	15670	15675	0 %	50 %	0 %	50 %	383327312
29	NC_017021	TA	4	8	18567	18574	50 %	50 %	0 %	0 %	383327315
30	NC_017021	CT	3	6	18866	18871	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
31	NC_017021	CT	3	6	19589	19594	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
32	NC_017021	AT	3	6	19603	19608	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
33	NC_017021	TA	3	6	19817	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
34	NC_017021	GA	3	6	20048	20053	50 %	0 %	50 %	0 %	383327316
35	NC_017021	TA	3	6	20456	20461	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
36	NC_017021	GT	3	6	20486	20491	0 %	50 %	50 %	0 %	383327316
37	NC_017021	TC	3	6	20690	20695	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
38	NC_017021	AG	3	6	20715	20720	50 %	0 %	50 %	0 %	383327316
39	NC_017021	TA	4	8	21205	21212	50 %	50 %	0 %	0 %	383327317
40	NC_017021	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	383327318
41	NC_017021	TA	3	6	22146	22151	50 %	50 %	0 %	0 %	383327319

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.