MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	AT	3	6	983	988	50 %	50 %	0 %	0 %	383327250
2	NC_017020	GT	3	6	1300	1305	0 %	50 %	50 %	0 %	383327250
3	NC_017020	CT	3	6	1504	1509	0 %	50 %	0 %	50 %	383327250
4	NC_017020	AT	4	8	6032	6039	50 %	50 %	0 %	0 %	383327254
5	NC_017020	CT	3	6	6330	6335	0 %	50 %	0 %	50 %	383327255
6	NC_017020	AC	3	6	6638	6643	50 %	0 %	0 %	50 %	383327255
7	NC_017020	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	383327255
8	NC_017020	TA	3	6	6862	6867	50 %	50 %	0 %	0 %	383327255
9	NC_017020	AT	3	6	7649	7654	50 %	50 %	0 %	0 %	383327258
10	NC_017020	TA	3	6	7748	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	383327258
11	NC_017020	AT	3	6	8769	8774	50 %	50 %	0 %	0 %	383327260
12	NC_017020	AT	3	6	9396	9401	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
13	NC_017020	TA	3	6	9540	9545	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
14	NC_017020	AT	3	6	9564	9569	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
15	NC_017020	TA	3	6	9682	9687	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
16	NC_017020	AT	3	6	9795	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
17	NC_017020	AT	3	6	9847	9852	50 %	50 %	0 %	0 %	383327263
18	NC_017020	TA	3	6	10096	10101	50 %	50 %	0 %	0 %	383327263
19	NC_017020	AT	3	6	11204	11209	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
20	NC_017020	AC	4	8	12043	12050	50 %	0 %	0 %	50 %	383327265
21	NC_017020	TA	3	6	12152	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
22	NC_017020	TA	3	6	12199	12204	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
23	NC_017020	AT	3	6	12413	12418	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
24	NC_017020	AG	3	6	12571	12576	50 %	0 %	50 %	0 %	383327265
25	NC_017020	TA	3	6	12614	12619	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
26	NC_017020	TA	3	6	13979	13984	50 %	50 %	0 %	0 %	383327267
27	NC_017020	TA	3	6	14225	14230	50 %	50 %	0 %	0 %	383327268
28	NC_017020	AC	3	6	14279	14284	50 %	0 %	0 %	50 %	383327268
29	NC_017020	TA	3	6	14486	14491	50 %	50 %	0 %	0 %	383327268
30	NC_017020	AC	3	6	14839	14844	50 %	0 %	0 %	50 %	383327268
31	NC_017020	TA	3	6	15716	15721	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
32	NC_017020	AT	3	6	15829	15834	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
33	NC_017020	AT	3	6	15948	15953	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
34	NC_017020	TA	3	6	15972	15977	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
35	NC_017020	AT	3	6	16116	16121	50 %	50 %	0 %	0 %	383327271
36	NC_017020	AG	3	6	17019	17024	50 %	0 %	50 %	0 %	383327272
37	NC_017020	AT	3	6	21293	21298	50 %	50 %	0 %	0 %	383327276
38	NC_017020	AT	3	6	22310	22315	50 %	50 %	0 %	0 %	383327277
39	NC_017020	TA	3	6	23009	23014	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
40	NC_017020	TA	3	6	24158	24163	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
41	NC_017020	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	383327278
42	NC_017020	CT	3	6	25256	25261	0 %	50 %	0 %	50 %	383327279
43	NC_017020	CT	3	6	29742	29747	0 %	50 %	0 %	50 %	383327280
44	NC_017020	TA	3	6	30158	30163	50 %	50 %	0 %	0 %	383327282

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.