MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 27565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016932	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714284
2	NC_016932	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
3	NC_016932	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714284
4	NC_016932	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
5	NC_016932	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714284
6	NC_016932	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714284
7	NC_016932	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714284
8	NC_016932	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
9	NC_016932	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
10	NC_016932	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714284
11	NC_016932	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714284
12	NC_016932	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714284
13	NC_016932	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714284
14	NC_016932	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714284
15	NC_016932	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714284
16	NC_016932	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714284
17	NC_016932	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714284
18	NC_016932	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714284
19	NC_016932	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714284
20	NC_016932	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714284
21	NC_016932	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714284
22	NC_016932	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
23	NC_016932	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714284
24	NC_016932	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714284
25	NC_016932	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714284
26	NC_016932	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714284
27	NC_016932	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714284
28	NC_016932	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714285
29	NC_016932	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714286
30	NC_016932	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714286
31	NC_016932	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714286
32	NC_016932	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714286
33	NC_016932	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714286
34	NC_016932	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714286
35	NC_016932	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714286
36	NC_016932	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714286
37	NC_016932	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714286
38	NC_016932	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714287
39	NC_016932	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714287
40	NC_016932	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714287
41	NC_016932	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714287
42	NC_016932	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714287
43	NC_016932	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714287
44	NC_016932	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714287
45	NC_016932	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714287
46	NC_016932	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714287
47	NC_016932	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714288
48	NC_016932	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714288
49	NC_016932	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714288
50	NC_016932	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714288
51	NC_016932	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714288
52	NC_016932	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714288
53	NC_016932	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714288
54	NC_016932	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714289
55	NC_016932	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714289
56	NC_016932	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714289
57	NC_016932	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714289
58	NC_016932	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714289
59	NC_016932	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714289
60	NC_016932	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
61	NC_016932	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714289
62	NC_016932	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714289
63	NC_016932	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714289
64	NC_016932	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714289
65	NC_016932	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
66	NC_016932	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714289
67	NC_016932	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
68	NC_016932	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714289
69	NC_016932	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714289
70	NC_016932	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714289
71	NC_016932	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714289
72	NC_016932	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
73	NC_016932	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714289
74	NC_016932	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714289
75	NC_016932	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714289
76	NC_016932	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714289
77	NC_016932	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714289
78	NC_016932	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714289
79	NC_016932	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
80	NC_016932	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
81	NC_016932	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714289
82	NC_016932	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714289
83	NC_016932	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714290
84	NC_016932	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714290
85	NC_016932	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714290
86	NC_016932	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714290
87	NC_016932	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714290
88	NC_016932	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714290
89	NC_016932	ATT	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714291
90	NC_016932	CTG	2	6	8549	8554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714292
91	NC_016932	TGT	2	6	8594	8599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714292
92	NC_016932	CTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714292
93	NC_016932	TGC	2	6	8653	8658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714292
94	NC_016932	GTC	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714292
95	NC_016932	GCG	2	6	8725	8730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714293
96	NC_016932	TGA	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714293
97	NC_016932	GCT	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714293
98	NC_016932	CGA	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714294
99	NC_016932	GCG	2	6	9103	9108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714294
100	NC_016932	GAG	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714294
101	NC_016932	CCG	2	6	9236	9241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714294
102	NC_016932	ACG	2	6	9442	9447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714294
103	NC_016932	CGC	2	6	9452	9457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714294
104	NC_016932	TTC	2	6	9574	9579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714294
105	NC_016932	TGA	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714294
106	NC_016932	TCT	2	6	9682	9687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714294
107	NC_016932	GAA	3	9	9858	9866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
108	NC_016932	ACA	2	6	9919	9924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714294
109	NC_016932	TGC	2	6	10159	10164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
110	NC_016932	TTA	2	6	10166	10171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714294
111	NC_016932	TCG	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
112	NC_016932	GAA	2	6	10221	10226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
113	NC_016932	CGA	2	6	10280	10285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714294
114	NC_016932	AGA	2	6	10423	10428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
115	NC_016932	CGT	2	6	10557	10562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
116	NC_016932	ATT	2	6	10569	10574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714294
117	NC_016932	GAA	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
118	NC_016932	GTG	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714294
119	NC_016932	CGT	2	6	10689	10694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
120	NC_016932	CTT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714294
121	NC_016932	AAG	2	6	10974	10979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
122	NC_016932	GGT	2	6	11013	11018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714294
123	NC_016932	GAA	2	6	11040	11045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
124	NC_016932	ATG	2	6	11077	11082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714294
125	NC_016932	GCT	2	6	11087	11092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
126	NC_016932	GAA	2	6	11103	11108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714294
127	NC_016932	TGA	3	9	11132	11140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714294
128	NC_016932	CGA	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714294
129	NC_016932	GCT	2	6	11207	11212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714294
130	NC_016932	TCT	2	6	11243	11248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714294
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241	NC_016932	TCA	2	6	19053	19058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714304
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247	NC_016932	ATC	2	6	19623	19628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714304
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249	NC_016932	TTG	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714304
250	NC_016932	GTT	2	6	19720	19725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714304
251	NC_016932	GCA	2	6	19775	19780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714305
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253	NC_016932	GTT	2	6	20012	20017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714306
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377	NC_016932	TTC	2	6	32428	32433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714320
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381	NC_016932	TGC	2	6	32566	32571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
382	NC_016932	GAG	2	6	32572	32577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714320
383	NC_016932	TCC	2	6	32627	32632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714320
384	NC_016932	TTG	2	6	32640	32645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714320
385	NC_016932	GTG	2	6	32732	32737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714320
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397	NC_016932	GTC	2	6	33631	33636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
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