MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 1208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016802	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376292120
2	NC_016802	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376292123
3	NC_016802	GAGTC	2	10	14083	14092	20 %	20 %	40 %	20 %	376292130
4	NC_016802	TTGCG	2	10	15949	15958	0 %	40 %	40 %	20 %	376292132
5	NC_016802	CAGGG	2	10	16552	16561	20 %	0 %	60 %	20 %	376292132
6	NC_016802	GATTC	2	10	23222	23231	20 %	40 %	20 %	20 %	376292138
7	NC_016802	TGCGC	2	10	23536	23545	0 %	20 %	40 %	40 %	376292139
8	NC_016802	GCGCT	2	10	24563	24572	0 %	20 %	40 %	40 %	376292140
9	NC_016802	TGAGG	2	10	26453	26462	20 %	20 %	60 %	0 %	376292143
10	NC_016802	TGGGG	2	10	34882	34891	0 %	20 %	80 %	0 %	376292152
11	NC_016802	CACCT	2	10	35693	35702	20 %	20 %	0 %	60 %	376292152
12	NC_016802	AATTG	2	10	37388	37397	40 %	40 %	20 %	0 %	376292154
13	NC_016802	AGAAA	2	10	39989	39998	80 %	0 %	20 %	0 %	376292154
14	NC_016802	CATCA	2	10	40457	40466	40 %	20 %	0 %	40 %	376292155
15	NC_016802	CGGCA	2	10	40654	40663	20 %	0 %	40 %	40 %	376292155
16	NC_016802	GGTGT	2	10	41304	41313	0 %	40 %	60 %	0 %	376292156
17	NC_016802	CGGTG	2	10	44493	44502	0 %	20 %	60 %	20 %	376292160
18	NC_016802	GTGCT	2	10	45934	45943	0 %	40 %	40 %	20 %	376292162
19	NC_016802	GTTGC	2	10	46618	46627	0 %	40 %	40 %	20 %	376292162
20	NC_016802	GGGTT	2	10	46682	46691	0 %	40 %	60 %	0 %	376292162
21	NC_016802	TGGCG	2	10	48412	48421	0 %	20 %	60 %	20 %	376292163
22	NC_016802	GCGCA	2	10	48687	48696	20 %	0 %	40 %	40 %	376292163
23	NC_016802	CGCAG	2	10	51204	51213	20 %	0 %	40 %	40 %	376292165
24	NC_016802	TGAGG	2	10	53653	53662	20 %	20 %	60 %	0 %	376292166
25	NC_016802	TACGA	2	10	54254	54263	40 %	20 %	20 %	20 %	376292168
26	NC_016802	GGCGG	2	10	58643	58652	0 %	0 %	80 %	20 %	376292171
27	NC_016802	CACGC	2	10	59926	59935	20 %	0 %	20 %	60 %	376292173
28	NC_016802	GGTGG	2	10	60215	60224	0 %	20 %	80 %	0 %	376292173
29	NC_016802	GACGG	2	10	61109	61118	20 %	0 %	60 %	20 %	376292174
30	NC_016802	TGGCC	2	10	61147	61156	0 %	20 %	40 %	40 %	376292174
31	NC_016802	TGGCA	2	10	62004	62013	20 %	20 %	40 %	20 %	376292175
32	NC_016802	GATGT	2	10	62388	62397	20 %	40 %	40 %	0 %	376292175
33	NC_016802	CCCAT	2	10	62959	62968	20 %	20 %	0 %	60 %	376292175
34	NC_016802	TCGCT	2	10	63138	63147	0 %	40 %	20 %	40 %	376292175
35	NC_016802	CGGCC	2	10	70498	70507	0 %	0 %	40 %	60 %	376292184
36	NC_016802	CACGG	2	10	73031	73040	20 %	0 %	40 %	40 %	376292188
37	NC_016802	CAGAT	2	10	76075	76084	40 %	20 %	20 %	20 %	376292194
38	NC_016802	CTTGG	2	10	77641	77650	0 %	40 %	40 %	20 %	376292196
39	NC_016802	CCACG	2	10	79575	79584	20 %	0 %	20 %	60 %	376292198
40	NC_016802	TGACC	2	10	79888	79897	20 %	20 %	20 %	40 %	376292198
41	NC_016802	CGTGG	2	10	83008	83017	0 %	20 %	60 %	20 %	376292201
42	NC_016802	CGGCG	2	10	83491	83500	0 %	0 %	60 %	40 %	376292201
43	NC_016802	CTCGA	2	10	84047	84056	20 %	20 %	20 %	40 %	376292201
44	NC_016802	TCGTG	2	10	85474	85483	0 %	40 %	40 %	20 %	376292202
45	NC_016802	TTTGA	2	10	87095	87104	20 %	60 %	20 %	0 %	376292204
46	NC_016802	TTGTT	2	10	87566	87575	0 %	80 %	20 %	0 %	376292206
47	NC_016802	CAAGC	2	10	87983	87992	40 %	0 %	20 %	40 %	376292207
48	NC_016802	TGCCG	2	10	88618	88627	0 %	20 %	40 %	40 %	376292208
49	NC_016802	TCACC	2	10	90352	90361	20 %	20 %	0 %	60 %	376292209
50	NC_016802	AGGAG	2	10	93815	93824	40 %	0 %	60 %	0 %	376292213
51	NC_016802	ACCAA	2	10	93828	93837	60 %	0 %	0 %	40 %	376292213
52	NC_016802	CGGTG	2	10	95032	95041	0 %	20 %	60 %	20 %	376292215
53	NC_016802	GACTG	2	10	97652	97661	20 %	20 %	40 %	20 %	376292219
54	NC_016802	GGAGT	2	10	99807	99816	20 %	20 %	60 %	0 %	376292222
55	NC_016802	GCGCT	2	10	104219	104228	0 %	20 %	40 %	40 %	376292226
56	NC_016802	CCAAG	2	10	106923	106932	40 %	0 %	20 %	40 %	376292228
57	NC_016802	CTCAA	2	10	109279	109288	40 %	20 %	0 %	40 %	376292231
58	NC_016802	GCCCA	2	10	109480	109489	20 %	0 %	20 %	60 %	376292231
59	NC_016802	GAGCT	2	10	113367	113376	20 %	20 %	40 %	20 %	376292236
60	NC_016802	AGCCA	2	10	114969	114978	40 %	0 %	20 %	40 %	376292237
61	NC_016802	CATCG	2	10	117350	117359	20 %	20 %	20 %	40 %	376292240
62	NC_016802	GCGAT	2	10	120225	120234	20 %	20 %	40 %	20 %	376292242
63	NC_016802	GGCCA	2	10	121305	121314	20 %	0 %	40 %	40 %	376292242
64	NC_016802	TCCGC	2	10	124080	124089	0 %	20 %	20 %	60 %	376292246
65	NC_016802	GTGGG	2	10	127531	127540	0 %	20 %	80 %	0 %	376292249
66	NC_016802	GGCAC	2	10	127892	127901	20 %	0 %	40 %	40 %	376292249
67	NC_016802	ACACC	2	10	130019	130028	40 %	0 %	0 %	60 %	376292253
68	NC_016802	CCAGC	2	10	130155	130164	20 %	0 %	20 %	60 %	376292253
69	NC_016802	CCTCA	2	10	131259	131268	20 %	20 %	0 %	60 %	376292254
70	NC_016802	CCGCA	2	10	132635	132644	20 %	0 %	20 %	60 %	376292257
71	NC_016802	AACCG	2	10	135585	135594	40 %	0 %	20 %	40 %	376292264
72	NC_016802	GTTTC	2	10	136966	136975	0 %	60 %	20 %	20 %	376292266
73	NC_016802	ACGGT	2	10	137326	137335	20 %	20 %	40 %	20 %	376292266
74	NC_016802	TGACC	2	10	138898	138907	20 %	20 %	20 %	40 %	376292270
75	NC_016802	CTGGG	2	10	138950	138959	0 %	20 %	60 %	20 %	376292270
76	NC_016802	GGCGG	2	10	140578	140587	0 %	0 %	80 %	20 %	376292271
77	NC_016802	CCACG	2	10	143561	143570	20 %	0 %	20 %	60 %	376292273
78	NC_016802	TGGGA	2	10	144666	144675	20 %	20 %	60 %	0 %	376292275
79	NC_016802	CCAGT	2	10	147224	147233	20 %	20 %	20 %	40 %	376292278
80	NC_016802	ACCAG	2	10	149515	149524	40 %	0 %	20 %	40 %	376292278
81	NC_016802	CCTGG	2	10	152665	152674	0 %	20 %	40 %	40 %	376292280
82	NC_016802	GCTGT	2	10	156352	156361	0 %	40 %	40 %	20 %	376292284
83	NC_016802	TCTGG	2	10	156424	156433	0 %	40 %	40 %	20 %	376292284
84	NC_016802	ATGCG	2	10	156982	156991	20 %	20 %	40 %	20 %	376292285
85	NC_016802	GTCGC	2	10	157720	157729	0 %	20 %	40 %	40 %	376292286
86	NC_016802	GATGC	2	10	158066	158075	20 %	20 %	40 %	20 %	376292286
87	NC_016802	TGGTC	2	10	159030	159039	0 %	40 %	40 %	20 %	376292287
88	NC_016802	GGGTG	2	10	160132	160141	0 %	20 %	80 %	0 %	376292288
89	NC_016802	GTTTG	2	10	160520	160529	0 %	60 %	40 %	0 %	376292288
90	NC_016802	GTGAT	2	10	160662	160671	20 %	40 %	40 %	0 %	376292289
91	NC_016802	GTTCG	2	10	165741	165750	0 %	40 %	40 %	20 %	376292294
92	NC_016802	GCGTG	2	10	166562	166571	0 %	20 %	60 %	20 %	376292295
93	NC_016802	GATTC	2	10	170455	170464	20 %	40 %	20 %	20 %	376292297
94	NC_016802	TCGGG	2	10	173251	173260	0 %	20 %	60 %	20 %	376292299
95	NC_016802	CAATT	2	10	173466	173475	40 %	40 %	0 %	20 %	376292299
96	NC_016802	GGTGG	2	10	173489	173498	0 %	20 %	80 %	0 %	376292299
97	NC_016802	TGCGG	2	10	173652	173661	0 %	20 %	60 %	20 %	376292299
98	NC_016802	ACTCC	2	10	173858	173867	20 %	20 %	0 %	60 %	376292299
99	NC_016802	GCGGG	2	10	175836	175845	0 %	0 %	80 %	20 %	376292301
100	NC_016802	TCTTG	2	10	178690	178699	0 %	60 %	20 %	20 %	376292304
101	NC_016802	GCGGG	2	10	178700	178709	0 %	0 %	80 %	20 %	376292304
102	NC_016802	CTGGA	2	10	180532	180541	20 %	20 %	40 %	20 %	376292305
103	NC_016802	CTGGG	2	10	185467	185476	0 %	20 %	60 %	20 %	376292308
104	NC_016802	CACTG	2	10	186209	186218	20 %	20 %	20 %	40 %	376292309
105	NC_016802	ATCTG	2	10	188399	188408	20 %	40 %	20 %	20 %	376292311
106	NC_016802	ACCAC	2	10	190350	190359	40 %	0 %	0 %	60 %	376292313
107	NC_016802	AATTA	2	10	191556	191565	60 %	40 %	0 %	0 %	376292314
108	NC_016802	TGGGT	2	10	196468	196477	0 %	40 %	60 %	0 %	376292317
109	NC_016802	GCGCT	2	10	197382	197391	0 %	20 %	40 %	40 %	376292318
110	NC_016802	ACCGG	2	10	203894	203903	20 %	0 %	40 %	40 %	376292324
111	NC_016802	CCGAA	2	10	205289	205298	40 %	0 %	20 %	40 %	376292325
112	NC_016802	AGCCA	2	10	205408	205417	40 %	0 %	20 %	40 %	376292325
113	NC_016802	GCAGA	2	10	206455	206464	40 %	0 %	40 %	20 %	376292326
114	NC_016802	TTGCC	2	10	209312	209321	0 %	40 %	20 %	40 %	376292330
115	NC_016802	GTTGC	2	10	209729	209738	0 %	40 %	40 %	20 %	376292330
116	NC_016802	CCGCC	2	10	210987	210996	0 %	0 %	20 %	80 %	376292332
117	NC_016802	AGAAA	2	10	215441	215450	80 %	0 %	20 %	0 %	376292335
118	NC_016802	ACCCC	2	10	220023	220032	20 %	0 %	0 %	80 %	376292340
119	NC_016802	GGTGC	2	10	220625	220634	0 %	20 %	60 %	20 %	376292340
120	NC_016802	GCCCA	2	10	222911	222920	20 %	0 %	20 %	60 %	376292342
121	NC_016802	CGAGG	2	10	223177	223186	20 %	0 %	60 %	20 %	376292342
122	NC_016802	GGACT	2	10	227258	227267	20 %	20 %	40 %	20 %	376292344
123	NC_016802	AAGAC	2	10	227740	227749	60 %	0 %	20 %	20 %	376292344
124	NC_016802	TCGGC	2	10	231415	231424	0 %	20 %	40 %	40 %	376292349
125	NC_016802	TTGGG	2	10	233415	233424	0 %	40 %	60 %	0 %	376292349
126	NC_016802	AAAGC	2	10	233820	233829	60 %	0 %	20 %	20 %	376292349
127	NC_016802	CTCGC	2	10	235249	235258	0 %	20 %	20 %	60 %	376292350
128	NC_016802	CGCAA	2	10	235840	235849	40 %	0 %	20 %	40 %	376292351
129	NC_016802	ACGCC	2	10	235996	236005	20 %	0 %	20 %	60 %	376292351
130	NC_016802	GGGCA	2	10	236248	236257	20 %	0 %	60 %	20 %	376292351
131	NC_016802	CCGCA	2	10	245625	245634	20 %	0 %	20 %	60 %	376292360
132	NC_016802	CGCTG	2	10	246184	246193	0 %	20 %	40 %	40 %	376292360
133	NC_016802	ACTGA	2	10	249472	249481	40 %	20 %	20 %	20 %	376292365
134	NC_016802	GCCAC	2	10	249500	249509	20 %	0 %	20 %	60 %	376292365
135	NC_016802	CGCCA	2	10	249974	249983	20 %	0 %	20 %	60 %	376292366
136	NC_016802	CAAAC	2	10	250680	250689	60 %	0 %	0 %	40 %	376292367
137	NC_016802	CACAA	2	10	253290	253299	60 %	0 %	0 %	40 %	376292368
138	NC_016802	AAACC	2	10	253989	253998	60 %	0 %	0 %	40 %	376292368
139	NC_016802	AAAAT	2	10	256901	256910	80 %	20 %	0 %	0 %	376292372
140	NC_016802	TGACC	2	10	258733	258742	20 %	20 %	20 %	40 %	376292373
141	NC_016802	GTGCC	2	10	260137	260146	0 %	20 %	40 %	40 %	376292374
142	NC_016802	GATCA	2	10	261670	261679	40 %	20 %	20 %	20 %	376292377
143	NC_016802	GCGCT	2	10	261793	261802	0 %	20 %	40 %	40 %	376292377
144	NC_016802	GACCT	2	10	263078	263087	20 %	20 %	20 %	40 %	376292379
145	NC_016802	TGGTC	2	10	264949	264958	0 %	40 %	40 %	20 %	376292381
146	NC_016802	GGCGA	2	10	266599	266608	20 %	0 %	60 %	20 %	376292383
147	NC_016802	GGCGC	2	10	266791	266800	0 %	0 %	60 %	40 %	376292383
148	NC_016802	GCAAC	2	10	273871	273880	40 %	0 %	20 %	40 %	376292392
149	NC_016802	GCGCA	2	10	275522	275531	20 %	0 %	40 %	40 %	376292393
150	NC_016802	CGCAG	2	10	282253	282262	20 %	0 %	40 %	40 %	376292399
151	NC_016802	AGGGG	2	10	283651	283660	20 %	0 %	80 %	0 %	376292400
152	NC_016802	GGTGA	2	10	283883	283892	20 %	20 %	60 %	0 %	376292400
153	NC_016802	CAACC	2	10	285237	285246	40 %	0 %	0 %	60 %	376292401
154	NC_016802	AAAAG	2	10	286866	286875	80 %	0 %	20 %	0 %	376292401
155	NC_016802	TGGTG	2	10	289451	289460	0 %	40 %	60 %	0 %	376292403
156	NC_016802	GAAAA	2	10	290573	290582	80 %	0 %	20 %	0 %	376292403
157	NC_016802	CACCG	2	10	290948	290957	20 %	0 %	20 %	60 %	376292404
158	NC_016802	GTTGG	2	10	291449	291458	0 %	40 %	60 %	0 %	376292404
159	NC_016802	GCCAC	2	10	292131	292140	20 %	0 %	20 %	60 %	376292404
160	NC_016802	GTGGG	2	10	292285	292294	0 %	20 %	80 %	0 %	376292404
161	NC_016802	ACACC	2	10	292741	292750	40 %	0 %	0 %	60 %	376292405
162	NC_016802	GCCTC	2	10	292981	292990	0 %	20 %	20 %	60 %	376292405
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164	NC_016802	GCTTC	2	10	299169	299178	0 %	40 %	20 %	40 %	376292412
165	NC_016802	CCAGT	2	10	299338	299347	20 %	20 %	20 %	40 %	376292412
166	NC_016802	GATTT	2	10	299476	299485	20 %	60 %	20 %	0 %	376292412
167	NC_016802	CTTTT	2	10	302153	302162	0 %	80 %	0 %	20 %	376292417
168	NC_016802	CAATC	2	10	303346	303355	40 %	20 %	0 %	40 %	376292419
169	NC_016802	GTCTC	2	10	304716	304725	0 %	40 %	20 %	40 %	376292420
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172	NC_016802	CGGAA	2	10	307399	307408	40 %	0 %	40 %	20 %	376292424
173	NC_016802	CGCAG	2	10	308639	308648	20 %	0 %	40 %	40 %	376292425
174	NC_016802	TCCGC	2	10	308881	308890	0 %	20 %	20 %	60 %	376292425
175	NC_016802	CTTGC	2	10	309251	309260	0 %	40 %	20 %	40 %	376292426
176	NC_016802	CGTAC	2	10	311658	311667	20 %	20 %	20 %	40 %	376292428
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181	NC_016802	CTTGG	2	10	321484	321493	0 %	40 %	40 %	20 %	376292434
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191	NC_016802	CATGG	2	10	339165	339174	20 %	20 %	40 %	20 %	376292452
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193	NC_016802	GCCCA	2	10	345518	345527	20 %	0 %	20 %	60 %	376292460
194	NC_016802	GCCAG	2	10	346038	346047	20 %	0 %	40 %	40 %	376292461
195	NC_016802	CCACG	2	10	346200	346209	20 %	0 %	20 %	60 %	376292461
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198	NC_016802	TGACG	2	10	350006	350015	20 %	20 %	40 %	20 %	376292465
199	NC_016802	GTTTG	2	10	350354	350363	0 %	60 %	40 %	0 %	376292465
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201	NC_016802	TGACG	2	10	354213	354222	20 %	20 %	40 %	20 %	376292468
202	NC_016802	CGGTG	2	10	355381	355390	0 %	20 %	60 %	20 %	376292469
203	NC_016802	ATGCC	2	10	355540	355549	20 %	20 %	20 %	40 %	376292469
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224	NC_016802	ACTGA	2	10	388596	388605	40 %	20 %	20 %	20 %	376292504
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242	NC_016802	GGTGC	2	10	435194	435203	0 %	20 %	60 %	20 %	376292552
243	NC_016802	GGCAA	2	10	440715	440724	40 %	0 %	40 %	20 %	376292556
244	NC_016802	TTATG	2	10	441939	441948	20 %	60 %	20 %	0 %	376292558
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246	NC_016802	TCATC	2	10	446149	446158	20 %	40 %	0 %	40 %	376292561
247	NC_016802	AACGC	2	10	451424	451433	40 %	0 %	20 %	40 %	376292563
248	NC_016802	GCTCA	2	10	452521	452530	20 %	20 %	20 %	40 %	376292565
249	NC_016802	TGCGG	2	10	453248	453257	0 %	20 %	60 %	20 %	376292566
250	NC_016802	ACCTG	2	10	461455	461464	20 %	20 %	20 %	40 %	376292572
251	NC_016802	GGCTG	2	10	464009	464018	0 %	20 %	60 %	20 %	376292573
252	NC_016802	ACGCG	2	10	467201	467210	20 %	0 %	40 %	40 %	376292576
253	NC_016802	GGCTG	2	10	467316	467325	0 %	20 %	60 %	20 %	376292576
254	NC_016802	GGCAT	2	10	471565	471574	20 %	20 %	40 %	20 %	376292580
255	NC_016802	CAGGA	2	10	476338	476347	40 %	0 %	40 %	20 %	376292585
256	NC_016802	CGTGC	2	10	478633	478642	0 %	20 %	40 %	40 %	376292589
257	NC_016802	TCATC	2	10	479492	479501	20 %	40 %	0 %	40 %	376292590
258	NC_016802	AGTCG	2	10	481870	481879	20 %	20 %	40 %	20 %	376292591
259	NC_016802	TTGTC	2	10	485110	485119	0 %	60 %	20 %	20 %	376292593
260	NC_016802	TGTTC	2	10	485482	485491	0 %	60 %	20 %	20 %	376292594
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262	NC_016802	GGTTG	2	10	492165	492174	0 %	40 %	60 %	0 %	376292600
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