MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 44571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016802	TCA	2	6	28121	28126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292145
502	NC_016802	CTT	2	6	28213	28218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376292145
503	NC_016802	GTG	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292146
504	NC_016802	TGA	2	6	28549	28554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292146
505	NC_016802	GC	3	6	28603	28608	0 %	0 %	50 %	50 %	376292146
506	NC_016802	TATC	2	8	28619	28626	25 %	50 %	0 %	25 %	376292146
507	NC_016802	TGT	2	6	28634	28639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376292146
508	NC_016802	TGG	2	6	28738	28743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292146
509	NC_016802	CA	3	6	28769	28774	50 %	0 %	0 %	50 %	376292146
510	NC_016802	TTC	2	6	28800	28805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376292146
511	NC_016802	ATT	2	6	28825	28830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376292146
512	NC_016802	CTG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292146
513	NC_016802	GGTG	2	8	28919	28926	0 %	25 %	75 %	0 %	376292146
514	NC_016802	ATGG	2	8	29043	29050	25 %	25 %	50 %	0 %	376292146
515	NC_016802	TG	3	6	29091	29096	0 %	50 %	50 %	0 %	376292146
516	NC_016802	ACT	2	6	29124	29129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292146
517	NC_016802	TAA	2	6	29135	29140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376292146
518	NC_016802	TGG	2	6	29356	29361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292147
519	NC_016802	GC	3	6	29368	29373	0 %	0 %	50 %	50 %	376292147
520	NC_016802	CCA	2	6	29410	29415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292147
521	NC_016802	CAG	2	6	29472	29477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292147
522	NC_016802	TG	3	6	29502	29507	0 %	50 %	50 %	0 %	376292147
523	NC_016802	TGA	2	6	29520	29525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292147
524	NC_016802	TG	3	6	29535	29540	0 %	50 %	50 %	0 %	376292147
525	NC_016802	GAA	2	6	29598	29603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376292147
526	NC_016802	TTC	2	6	29672	29677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376292147
527	NC_016802	ATCC	2	8	30280	30287	25 %	25 %	0 %	50 %	376292148
528	NC_016802	GC	3	6	30441	30446	0 %	0 %	50 %	50 %	376292148
529	NC_016802	GAA	2	6	30475	30480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376292148
530	NC_016802	TGA	2	6	30507	30512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292148
531	NC_016802	CGT	2	6	30529	30534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292148
532	NC_016802	ATT	2	6	30631	30636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376292148
533	NC_016802	AAC	2	6	30727	30732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292148
534	NC_016802	ACC	2	6	30737	30742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292148
535	NC_016802	ATT	2	6	30760	30765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376292148
536	NC_016802	GAA	2	6	30832	30837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376292148
537	NC_016802	GAT	2	6	30901	30906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292148
538	NC_016802	CAC	2	6	30912	30917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292148
539	NC_016802	AGA	2	6	31002	31007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376292148
540	NC_016802	GT	3	6	31085	31090	0 %	50 %	50 %	0 %	376292148
541	NC_016802	ACC	2	6	31111	31116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292148
542	NC_016802	GTG	2	6	31142	31147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292148
543	NC_016802	CAT	2	6	31152	31157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292148
544	NC_016802	TCCT	2	8	31189	31196	0 %	50 %	0 %	50 %	376292148
545	NC_016802	TGA	2	6	31209	31214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292148
546	NC_016802	ACG	2	6	31238	31243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292148
547	NC_016802	ATG	2	6	31295	31300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292148
548	NC_016802	TCG	2	6	31341	31346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292148
549	NC_016802	GCT	2	6	31525	31530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292148
550	NC_016802	GGT	2	6	31543	31548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292148
551	NC_016802	TGA	2	6	31602	31607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292148
552	NC_016802	CGTG	2	8	31681	31688	0 %	25 %	50 %	25 %	376292148
553	NC_016802	CGG	2	6	31793	31798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292148
554	NC_016802	TG	3	6	31829	31834	0 %	50 %	50 %	0 %	376292148
555	NC_016802	GGC	2	6	31921	31926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292148
556	NC_016802	GGC	2	6	31944	31949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292148
557	NC_016802	GAG	2	6	31957	31962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376292148
558	NC_016802	TGC	2	6	32007	32012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292148
559	NC_016802	GC	4	8	32108	32115	0 %	0 %	50 %	50 %	376292149
560	NC_016802	GCA	2	6	32139	32144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292149
561	NC_016802	TGC	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292149
562	NC_016802	CG	3	6	32192	32197	0 %	0 %	50 %	50 %	376292149
563	NC_016802	CGA	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292149
564	NC_016802	CAT	2	6	32353	32358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292149
565	NC_016802	CAC	2	6	32365	32370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292149
566	NC_016802	GTT	2	6	32528	32533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376292149
567	NC_016802	TGC	2	6	32572	32577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292149
568	NC_016802	GC	3	6	32605	32610	0 %	0 %	50 %	50 %	376292149
569	NC_016802	AGC	2	6	32632	32637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292149
570	NC_016802	GGT	2	6	32689	32694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376292150
571	NC_016802	CGG	2	6	32793	32798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292150
572	NC_016802	CAA	2	6	32830	32835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292150
573	NC_016802	GTT	2	6	32841	32846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376292150
574	NC_016802	TGA	2	6	32852	32857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292150
575	NC_016802	GC	3	6	32859	32864	0 %	0 %	50 %	50 %	376292150
576	NC_016802	AC	3	6	32904	32909	50 %	0 %	0 %	50 %	376292150
577	NC_016802	GC	3	6	32991	32996	0 %	0 %	50 %	50 %	376292150
578	NC_016802	ACC	2	6	33034	33039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292150
579	NC_016802	CGG	2	6	33083	33088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292150
580	NC_016802	CAC	2	6	33119	33124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292150
581	NC_016802	ACT	2	6	33141	33146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292150
582	NC_016802	CAA	2	6	33214	33219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292150
583	NC_016802	GTT	2	6	33226	33231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376292150
584	NC_016802	GCA	2	6	33238	33243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292150
585	NC_016802	ACA	2	6	33255	33260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292150
586	NC_016802	GCG	2	6	33296	33301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292150
587	NC_016802	ACC	2	6	33365	33370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292150
588	NC_016802	CAT	2	6	33378	33383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292150
589	NC_016802	CG	3	6	33386	33391	0 %	0 %	50 %	50 %	376292150
590	NC_016802	CCA	2	6	33416	33421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292150
591	NC_016802	GTA	2	6	33490	33495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292150
592	NC_016802	TCG	2	6	33503	33508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292150
593	NC_016802	CGA	2	6	33555	33560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292150
594	NC_016802	AAC	2	6	33758	33763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292150
595	NC_016802	TCA	2	6	33982	33987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376292151
596	NC_016802	CAC	2	6	34055	34060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292151
597	NC_016802	CGC	2	6	34079	34084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376292151
598	NC_016802	CCGC	2	8	34171	34178	0 %	0 %	25 %	75 %	376292151
599	NC_016802	CCT	2	6	34222	34227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376292151
600	NC_016802	CGA	2	6	34250	34255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292151
601	NC_016802	CAC	2	6	34256	34261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292151
602	NC_016802	ACG	2	6	34312	34317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292151
603	NC_016802	CGA	2	6	34343	34348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292151
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605	NC_016802	CTC	2	6	34485	34490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376292151
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607	NC_016802	CTC	2	6	34554	34559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376292151
608	NC_016802	GAC	2	6	34630	34635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292151
609	NC_016802	CG	4	8	34637	34644	0 %	0 %	50 %	50 %	376292151
610	NC_016802	CGT	2	6	34681	34686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292151
611	NC_016802	CCT	2	6	34705	34710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376292151
612	NC_016802	CGA	2	6	34735	34740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292152
613	NC_016802	AGC	2	6	34794	34799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292152
614	NC_016802	CAA	2	6	34810	34815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292152
615	NC_016802	GCG	2	6	34874	34879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292152
616	NC_016802	TGGGG	2	10	34882	34891	0 %	20 %	80 %	0 %	376292152
617	NC_016802	CGC	2	6	34990	34995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376292152
618	NC_016802	CA	3	6	35058	35063	50 %	0 %	0 %	50 %	376292152
619	NC_016802	CCA	2	6	35121	35126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292152
620	NC_016802	GCG	2	6	35136	35141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292152
621	NC_016802	CCCA	2	8	35255	35262	25 %	0 %	0 %	75 %	376292152
622	NC_016802	ACC	2	6	35300	35305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292152
623	NC_016802	CAC	2	6	35383	35388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292152
624	NC_016802	CA	3	6	35465	35470	50 %	0 %	0 %	50 %	376292152
625	NC_016802	AC	3	6	35527	35532	50 %	0 %	0 %	50 %	376292152
626	NC_016802	GCG	2	6	35538	35543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292152
627	NC_016802	ACA	2	6	35604	35609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376292152
628	NC_016802	CAC	2	6	35611	35616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292152
629	NC_016802	GTC	3	9	35627	35635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292152
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632	NC_016802	CACCT	2	10	35693	35702	20 %	20 %	0 %	60 %	376292152
633	NC_016802	CA	3	6	35744	35749	50 %	0 %	0 %	50 %	376292153
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643	NC_016802	GCC	2	6	35989	35994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376292153
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649	NC_016802	TGC	2	6	36233	36238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292153
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671	NC_016802	GCA	2	6	38167	38172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292154
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741	NC_016802	T	7	7	42949	42955	0 %	100 %	0 %	0 %	376292157
742	NC_016802	CGTT	2	8	42980	42987	0 %	50 %	25 %	25 %	376292157
743	NC_016802	TCT	2	6	43004	43009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376292157
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748	NC_016802	CGA	2	6	43265	43270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376292157
749	NC_016802	ACACCA	2	12	43292	43303	50 %	0 %	0 %	50 %	376292157
750	NC_016802	ATG	2	6	43306	43311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292157
751	NC_016802	TTC	2	6	43357	43362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376292157
752	NC_016802	CCG	2	6	43371	43376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376292157
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754	NC_016802	GCT	3	9	43789	43797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292158
755	NC_016802	ACCT	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	376292158
756	NC_016802	CCA	2	6	43900	43905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376292159
757	NC_016802	TGA	2	6	44066	44071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292159
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762	NC_016802	TGC	2	6	44409	44414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292160
763	NC_016802	TGA	2	6	44484	44489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376292160
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780	NC_016802	CGT	2	6	46140	46145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292162
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785	NC_016802	CGG	2	6	46542	46547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376292162
786	NC_016802	GGA	2	6	46591	46596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376292162
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788	NC_016802	GGGTT	2	10	46682	46691	0 %	40 %	60 %	0 %	376292162
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832	NC_016802	GCT	2	6	48952	48957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376292163
833	NC_016802	TG	3	6	48997	49002	0 %	50 %	50 %	0 %	376292163
834	NC_016802	CCATGC	2	12	49037	49048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376292163
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