MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	376282012
2	NC_016798	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	376282013
3	NC_016798	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	376282013
4	NC_016798	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	376282013
5	NC_016798	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	376282013
6	NC_016798	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	376282014
7	NC_016798	TGGTA	2	10	8286	8295	20 %	40 %	40 %	0 %	376282016
8	NC_016798	CGAAA	2	10	9694	9703	60 %	0 %	20 %	20 %	376282017
9	NC_016798	GGCTG	2	10	10327	10336	0 %	20 %	60 %	20 %	376282018
10	NC_016798	CCTCT	2	10	11119	11128	0 %	40 %	0 %	60 %	376282019
11	NC_016798	AAAGG	2	10	11278	11287	60 %	0 %	40 %	0 %	376282019
12	NC_016798	AAGAA	2	10	12397	12406	80 %	0 %	20 %	0 %	376282020
13	NC_016798	AAAGA	2	10	13795	13804	80 %	0 %	20 %	0 %	376282021
14	NC_016798	GGTGT	2	10	13899	13908	0 %	40 %	60 %	0 %	376282021
15	NC_016798	GATTT	2	10	15642	15651	20 %	60 %	20 %	0 %	376282023
16	NC_016798	CGTTC	2	10	16753	16762	0 %	40 %	20 %	40 %	376282024
17	NC_016798	GCTTC	2	10	17126	17135	0 %	40 %	20 %	40 %	376282024
18	NC_016798	GAAGG	2	10	17497	17506	40 %	0 %	60 %	0 %	376282024
19	NC_016798	GTTGT	2	10	20923	20932	0 %	60 %	40 %	0 %	376282027
20	NC_016798	AAGAT	2	10	22035	22044	60 %	20 %	20 %	0 %	376282028
21	NC_016798	TTTGC	2	10	22646	22655	0 %	60 %	20 %	20 %	376282028
22	NC_016798	GGAAA	2	10	24400	24409	60 %	0 %	40 %	0 %	376282028
23	NC_016798	AGAGG	2	10	26125	26134	40 %	0 %	60 %	0 %	376282029
24	NC_016798	GGAGA	2	10	27904	27913	40 %	0 %	60 %	0 %	376282030
25	NC_016798	GGATA	2	10	27930	27939	40 %	20 %	40 %	0 %	376282030
26	NC_016798	ATCCG	2	10	28655	28664	20 %	20 %	20 %	40 %	376282032
27	NC_016798	AGGGT	2	10	29173	29182	20 %	20 %	60 %	0 %	376282032
28	NC_016798	CCTAT	2	10	30213	30222	20 %	40 %	0 %	40 %	376282033
29	NC_016798	GAAGG	2	10	31012	31021	40 %	0 %	60 %	0 %	376282034
30	NC_016798	GAGCT	2	10	32052	32061	20 %	20 %	40 %	20 %	376282035
31	NC_016798	CTATT	2	10	36725	36734	20 %	60 %	0 %	20 %	376282041
32	NC_016798	TCCTA	2	10	36772	36781	20 %	40 %	0 %	40 %	376282041
33	NC_016798	ACGAT	2	10	38688	38697	40 %	20 %	20 %	20 %	376282042
34	NC_016798	TTTGA	2	10	39053	39062	20 %	60 %	20 %	0 %	376282042
35	NC_016798	AGCAA	2	10	42704	42713	60 %	0 %	20 %	20 %	376282045
36	NC_016798	CGATG	2	10	42761	42770	20 %	20 %	40 %	20 %	376282045
37	NC_016798	CAAAA	2	10	43237	43246	80 %	0 %	0 %	20 %	376282046
38	NC_016798	TTTAT	2	10	44834	44843	20 %	80 %	0 %	0 %	376282050
39	NC_016798	CTTTC	2	10	46930	46939	0 %	60 %	0 %	40 %	376282052
40	NC_016798	AGTTT	2	10	47469	47478	20 %	60 %	20 %	0 %	376282052
41	NC_016798	CTTTT	2	10	50632	50641	0 %	80 %	0 %	20 %	376282055
42	NC_016798	CCGTA	2	10	54297	54306	20 %	20 %	20 %	40 %	376282058
43	NC_016798	TTATC	2	10	55700	55709	20 %	60 %	0 %	20 %	376282059
44	NC_016798	TGAGT	2	10	55721	55730	20 %	40 %	40 %	0 %	376282059
45	NC_016798	GTTGT	2	10	56756	56765	0 %	60 %	40 %	0 %	376282060
46	NC_016798	GAGCA	2	10	60284	60293	40 %	0 %	40 %	20 %	376282062
47	NC_016798	TGTGA	2	10	62733	62742	20 %	40 %	40 %	0 %	376282064
48	NC_016798	AGTGA	2	10	64254	64263	40 %	20 %	40 %	0 %	376282065
49	NC_016798	CCTTC	2	10	64528	64537	0 %	40 %	0 %	60 %	376282065
50	NC_016798	AGGAG	2	10	66756	66765	40 %	0 %	60 %	0 %	376282067
51	NC_016798	GTTAA	2	10	66886	66895	40 %	40 %	20 %	0 %	376282067
52	NC_016798	CAAGC	2	10	69264	69273	40 %	0 %	20 %	40 %	376282068
53	NC_016798	GGAGC	2	10	70134	70143	20 %	0 %	60 %	20 %	376282069
54	NC_016798	GCGAT	2	10	70324	70333	20 %	20 %	40 %	20 %	376282069
55	NC_016798	CTCTT	2	10	70678	70687	0 %	60 %	0 %	40 %	376282069
56	NC_016798	AGGGG	2	10	71324	71333	20 %	0 %	80 %	0 %	376282069
57	NC_016798	AAGAA	2	10	71366	71375	80 %	0 %	20 %	0 %	376282069
58	NC_016798	ATTGG	2	10	72656	72665	20 %	40 %	40 %	0 %	376282071
59	NC_016798	GAAAA	2	10	73728	73737	80 %	0 %	20 %	0 %	376282071
60	NC_016798	TATTT	2	10	76672	76681	20 %	80 %	0 %	0 %	376282073
61	NC_016798	TGTCT	2	10	80459	80468	0 %	60 %	20 %	20 %	376282076
62	NC_016798	TTACT	2	10	80966	80975	20 %	60 %	0 %	20 %	376282076
63	NC_016798	AGAAA	2	10	82356	82365	80 %	0 %	20 %	0 %	376282078
64	NC_016798	GGAAG	2	10	82869	82878	40 %	0 %	60 %	0 %	376282078
65	NC_016798	GATCC	2	10	86420	86429	20 %	20 %	20 %	40 %	376282081
66	NC_016798	AGAGC	2	10	87755	87764	40 %	0 %	40 %	20 %	376282082
67	NC_016798	TTTTC	2	10	91487	91496	0 %	80 %	0 %	20 %	376282085
68	NC_016798	GGATG	2	10	91747	91756	20 %	20 %	60 %	0 %	376282086
69	NC_016798	CAACA	2	10	93286	93295	60 %	0 %	0 %	40 %	376282087
70	NC_016798	ACAGC	2	10	94330	94339	40 %	0 %	20 %	40 %	376282089
71	NC_016798	CTTTT	2	10	94704	94713	0 %	80 %	0 %	20 %	376282090
72	NC_016798	GGAAC	2	10	95042	95051	40 %	0 %	40 %	20 %	376282091
73	NC_016798	GGATT	2	10	95942	95951	20 %	40 %	40 %	0 %	376282091
74	NC_016798	CAATC	2	10	97044	97053	40 %	20 %	0 %	40 %	376282093
75	NC_016798	TTTGC	2	10	97178	97187	0 %	60 %	20 %	20 %	376282093
76	NC_016798	ATTCA	2	10	97442	97451	40 %	40 %	0 %	20 %	376282093
77	NC_016798	GATCC	2	10	97701	97710	20 %	20 %	20 %	40 %	376282093
78	NC_016798	GTTTT	2	10	98122	98131	0 %	80 %	20 %	0 %	376282093
79	NC_016798	AAGCT	2	10	99325	99334	40 %	20 %	20 %	20 %	376282094
80	NC_016798	AGGGG	2	10	99684	99693	20 %	0 %	80 %	0 %	376282094
81	NC_016798	ATAGC	2	10	100382	100391	40 %	20 %	20 %	20 %	376282095
82	NC_016798	TTCCC	2	10	100986	100995	0 %	40 %	0 %	60 %	376282096
83	NC_016798	AGCGA	2	10	103310	103319	40 %	0 %	40 %	20 %	376282098
84	NC_016798	TTTCT	2	10	103668	103677	0 %	80 %	0 %	20 %	376282098
85	NC_016798	CTTCT	2	10	103722	103731	0 %	60 %	0 %	40 %	376282098
86	NC_016798	ACAGG	2	10	104071	104080	40 %	0 %	40 %	20 %	376282099
87	NC_016798	ATCAT	2	10	104874	104883	40 %	40 %	0 %	20 %	376282099
88	NC_016798	GGCAT	2	10	105582	105591	20 %	20 %	40 %	20 %	376282099
89	NC_016798	AAAGC	2	10	109308	109317	60 %	0 %	20 %	20 %	376282102
90	NC_016798	GCATT	2	10	110468	110477	20 %	40 %	20 %	20 %	376282104
91	NC_016798	TGTTT	2	10	115145	115154	0 %	80 %	20 %	0 %	376282107
92	NC_016798	CATGT	2	10	115523	115532	20 %	40 %	20 %	20 %	376282107
93	NC_016798	TATCG	2	10	116227	116236	20 %	40 %	20 %	20 %	376282107
94	NC_016798	TTTCT	2	10	116743	116752	0 %	80 %	0 %	20 %	376282108
95	NC_016798	AAAGA	2	10	118989	118998	80 %	0 %	20 %	0 %	376282111
96	NC_016798	TACAA	2	10	126768	126777	60 %	20 %	0 %	20 %	376282117
97	NC_016798	ATCCA	2	10	129173	129182	40 %	20 %	0 %	40 %	376282120
98	NC_016798	GAAGA	2	10	130723	130732	60 %	0 %	40 %	0 %	376282120
99	NC_016798	AAAAG	2	10	132636	132645	80 %	0 %	20 %	0 %	376282121
100	NC_016798	GATTC	2	10	132967	132976	20 %	40 %	20 %	20 %	376282121
101	NC_016798	GGATA	2	10	135573	135582	40 %	20 %	40 %	0 %	376282123
102	NC_016798	ATTGG	2	10	136238	136247	20 %	40 %	40 %	0 %	376282124
103	NC_016798	ATTGT	2	10	136271	136280	20 %	60 %	20 %	0 %	376282124
104	NC_016798	TGTTT	2	10	136697	136706	0 %	80 %	20 %	0 %	376282125
105	NC_016798	TCCAG	2	10	140441	140450	20 %	20 %	20 %	40 %	376282130
106	NC_016798	GTACA	2	10	141172	141181	40 %	20 %	20 %	20 %	376282131
107	NC_016798	TAGAT	2	10	141545	141554	40 %	40 %	20 %	0 %	376282131
108	NC_016798	AAAAC	2	10	142437	142446	80 %	0 %	0 %	20 %	376282132
109	NC_016798	TGCTA	2	10	143523	143532	20 %	40 %	20 %	20 %	376282134
110	NC_016798	GGAGC	2	10	143570	143579	20 %	0 %	60 %	20 %	376282134
111	NC_016798	CTGGG	2	10	144984	144993	0 %	20 %	60 %	20 %	376282136
112	NC_016798	GTTTT	2	10	145731	145740	0 %	80 %	20 %	0 %	376282137
113	NC_016798	GAACC	2	10	149465	149474	40 %	0 %	20 %	40 %	376282138
114	NC_016798	TTCTT	2	10	155644	155653	0 %	80 %	0 %	20 %	376282144
115	NC_016798	AGGAA	2	10	160204	160213	60 %	0 %	40 %	0 %	376282148
116	NC_016798	AGAGA	2	10	163435	163444	60 %	0 %	40 %	0 %	376282151
117	NC_016798	AGCAA	2	10	163870	163879	60 %	0 %	20 %	20 %	376282151
118	NC_016798	CAAAA	2	10	167370	167379	80 %	0 %	0 %	20 %	376282153
119	NC_016798	AAGAG	2	10	168203	168212	60 %	0 %	40 %	0 %	376282153
120	NC_016798	GATTG	2	10	168548	168557	20 %	40 %	40 %	0 %	376282153
121	NC_016798	GTTTT	2	10	175031	175040	0 %	80 %	20 %	0 %	376282157
122	NC_016798	TATTG	2	10	175054	175063	20 %	60 %	20 %	0 %	376282157
123	NC_016798	CAGCA	2	10	175413	175422	40 %	0 %	20 %	40 %	376282157
124	NC_016798	TAGGA	2	10	175718	175727	40 %	20 %	40 %	0 %	376282158
125	NC_016798	TGATT	2	10	177645	177654	20 %	60 %	20 %	0 %	376282159
126	NC_016798	TTTTC	2	10	178325	178334	0 %	80 %	0 %	20 %	376282159
127	NC_016798	GGAAT	2	10	179885	179894	40 %	20 %	40 %	0 %	376282160
128	NC_016798	AGAGT	2	10	181273	181282	40 %	20 %	40 %	0 %	376282161
129	NC_016798	ACGAT	2	10	187715	187724	40 %	20 %	20 %	20 %	376282165
130	NC_016798	GGATC	2	10	190820	190829	20 %	20 %	40 %	20 %	376282168
131	NC_016798	GCAAG	2	10	191182	191191	40 %	0 %	40 %	20 %	376282169
132	NC_016798	CCATG	2	10	191449	191458	20 %	20 %	20 %	40 %	376282169
133	NC_016798	ACGAT	2	10	192799	192808	40 %	20 %	20 %	20 %	376282170
134	NC_016798	TTGTA	2	10	193776	193785	20 %	60 %	20 %	0 %	376282172
135	NC_016798	TATGC	2	10	194181	194190	20 %	40 %	20 %	20 %	376282173
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