MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 85127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016791	T	6	6	214196	214201	0 %	100 %	0 %	0 %	376259578
4002	NC_016791	TTC	2	6	214260	214265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259578
4003	NC_016791	GAA	2	6	214267	214272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259578
4004	NC_016791	GCA	2	6	214273	214278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259578
4005	NC_016791	ACTT	2	8	214296	214303	25 %	50 %	0 %	25 %	376259578
4006	NC_016791	TC	3	6	214315	214320	0 %	50 %	0 %	50 %	376259578
4007	NC_016791	TTTA	2	8	214335	214342	25 %	75 %	0 %	0 %	376259578
4008	NC_016791	AAG	2	6	214343	214348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259578
4009	NC_016791	GT	3	6	214427	214432	0 %	50 %	50 %	0 %	376259578
4010	NC_016791	T	7	7	214440	214446	0 %	100 %	0 %	0 %	376259578
4011	NC_016791	TTA	2	6	214484	214489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259578
4012	NC_016791	ATT	2	6	214516	214521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259578
4013	NC_016791	CAT	2	6	214571	214576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259578
4014	NC_016791	TAAC	2	8	214898	214905	50 %	25 %	0 %	25 %	376259578
4015	NC_016791	TAA	2	6	214911	214916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259578
4016	NC_016791	TAATAC	3	18	215022	215039	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	376259578
4017	NC_016791	TGA	2	6	215048	215053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259578
4018	NC_016791	T	7	7	215055	215061	0 %	100 %	0 %	0 %	376259578
4019	NC_016791	TTC	2	6	216097	216102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259579
4020	NC_016791	CAT	2	6	216207	216212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259579
4021	NC_016791	TAA	2	6	216234	216239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259579
4022	NC_016791	TCTT	2	8	216280	216287	0 %	75 %	0 %	25 %	376259579
4023	NC_016791	CTT	2	6	216344	216349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259579
4024	NC_016791	TCCAA	2	10	216353	216362	40 %	20 %	0 %	40 %	376259579
4025	NC_016791	TGG	2	6	216392	216397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259579
4026	NC_016791	GGTA	2	8	216450	216457	25 %	25 %	50 %	0 %	376259579
4027	NC_016791	ATGT	2	8	216462	216469	25 %	50 %	25 %	0 %	376259579
4028	NC_016791	CTG	2	6	216581	216586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259579
4029	NC_016791	AGC	2	6	216631	216636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259579
4030	NC_016791	AAT	2	6	216679	216684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259579
4031	NC_016791	TG	3	6	216687	216692	0 %	50 %	50 %	0 %	376259579
4032	NC_016791	ATT	2	6	216749	216754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259579
4033	NC_016791	CTG	2	6	216837	216842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259579
4034	NC_016791	TA	3	6	216886	216891	50 %	50 %	0 %	0 %	376259579
4035	NC_016791	T	6	6	216892	216897	0 %	100 %	0 %	0 %	376259579
4036	NC_016791	CTG	2	6	216898	216903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259579
4037	NC_016791	TCTG	2	8	216940	216947	0 %	50 %	25 %	25 %	376259579
4038	NC_016791	GGA	2	6	216954	216959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259579
4039	NC_016791	TTTC	2	8	217008	217015	0 %	75 %	0 %	25 %	376259579
4040	NC_016791	TAT	2	6	217036	217041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259579
4041	NC_016791	GAA	2	6	217074	217079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259579
4042	NC_016791	CAAA	2	8	217158	217165	75 %	0 %	0 %	25 %	376259579
4043	NC_016791	AAGC	2	8	217186	217193	50 %	0 %	25 %	25 %	376259579
4044	NC_016791	AT	3	6	217259	217264	50 %	50 %	0 %	0 %	376259579
4045	NC_016791	CT	3	6	217269	217274	0 %	50 %	0 %	50 %	376259579
4046	NC_016791	TGA	2	6	217277	217282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259579
4047	NC_016791	GTAT	2	8	217347	217354	25 %	50 %	25 %	0 %	376259579
4048	NC_016791	GGT	2	6	217605	217610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259580
4049	NC_016791	GT	3	6	217706	217711	0 %	50 %	50 %	0 %	376259580
4050	NC_016791	AGG	2	6	217751	217756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259580
4051	NC_016791	GAT	2	6	217793	217798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259580
4052	NC_016791	TA	3	6	217803	217808	50 %	50 %	0 %	0 %	376259580
4053	NC_016791	TTA	2	6	217861	217866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259580
4054	NC_016791	AG	4	8	217892	217899	50 %	0 %	50 %	0 %	376259580
4055	NC_016791	ATG	2	6	217926	217931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259580
4056	NC_016791	GATTT	2	10	217953	217962	20 %	60 %	20 %	0 %	376259580
4057	NC_016791	ATT	2	6	217998	218003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259580
4058	NC_016791	TA	3	6	218031	218036	50 %	50 %	0 %	0 %	376259580
4059	NC_016791	TTG	2	6	218050	218055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259580
4060	NC_016791	GCA	2	6	218070	218075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259580
4061	NC_016791	GAAA	2	8	218096	218103	75 %	0 %	25 %	0 %	376259580
4062	NC_016791	TTTTC	2	10	218125	218134	0 %	80 %	0 %	20 %	376259580
4063	NC_016791	TAT	2	6	218180	218185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259580
4064	NC_016791	TTA	2	6	218200	218205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259580
4065	NC_016791	GTG	2	6	218209	218214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259580
4066	NC_016791	ATT	2	6	218252	218257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259580
4067	NC_016791	GATA	2	8	218267	218274	50 %	25 %	25 %	0 %	376259580
4068	NC_016791	T	8	8	218287	218294	0 %	100 %	0 %	0 %	376259581
4069	NC_016791	TAAT	2	8	218309	218316	50 %	50 %	0 %	0 %	376259581
4070	NC_016791	AAAATC	2	12	218340	218351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	376259581
4071	NC_016791	TAC	2	6	218437	218442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259581
4072	NC_016791	ACT	2	6	218509	218514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259581
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4074	NC_016791	GAT	2	6	218628	218633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259581
4075	NC_016791	TGC	2	6	218736	218741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259581
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4077	NC_016791	TA	3	6	218797	218802	50 %	50 %	0 %	0 %	376259581
4078	NC_016791	TCC	2	6	218815	218820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259581
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4080	NC_016791	TTA	3	9	218864	218872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259581
4081	NC_016791	GCG	2	6	219043	219048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376259581
4082	NC_016791	AT	5	10	219210	219219	50 %	50 %	0 %	0 %	376259581
4083	NC_016791	TAA	2	6	219242	219247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259581
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4087	NC_016791	GGT	2	6	219342	219347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259581
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4091	NC_016791	AGT	2	6	219669	219674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259581
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4093	NC_016791	TGT	2	6	219795	219800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259581
4094	NC_016791	TATC	2	8	219981	219988	25 %	50 %	0 %	25 %	376259582
4095	NC_016791	TA	3	6	219993	219998	50 %	50 %	0 %	0 %	376259582
4096	NC_016791	GTA	2	6	220054	220059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259582
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4098	NC_016791	GGCT	2	8	220207	220214	0 %	25 %	50 %	25 %	376259582
4099	NC_016791	TTC	2	6	220225	220230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259582
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4102	NC_016791	ACGG	2	8	220274	220281	25 %	0 %	50 %	25 %	376259582
4103	NC_016791	AAT	2	6	220311	220316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259582
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4105	NC_016791	GCA	2	6	220414	220419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259582
4106	NC_016791	AATGT	2	10	220606	220615	40 %	40 %	20 %	0 %	376259582
4107	NC_016791	AG	3	6	220618	220623	50 %	0 %	50 %	0 %	376259582
4108	NC_016791	TTAA	2	8	220666	220673	50 %	50 %	0 %	0 %	376259582
4109	NC_016791	ACC	2	6	220718	220723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376259582
4110	NC_016791	GGA	2	6	220759	220764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259582
4111	NC_016791	T	6	6	220830	220835	0 %	100 %	0 %	0 %	376259583
4112	NC_016791	AGT	2	6	220850	220855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259583
4113	NC_016791	TATC	2	8	220931	220938	25 %	50 %	0 %	25 %	376259583
4114	NC_016791	T	7	7	220979	220985	0 %	100 %	0 %	0 %	376259583
4115	NC_016791	CAA	2	6	221030	221035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259583
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4118	NC_016791	T	6	6	221080	221085	0 %	100 %	0 %	0 %	376259583
4119	NC_016791	TTG	2	6	221110	221115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259583
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4122	NC_016791	TA	3	6	221277	221282	50 %	50 %	0 %	0 %	376259583
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4124	NC_016791	TCAG	2	8	221419	221426	25 %	25 %	25 %	25 %	376259583
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