MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016790	CGC	2	6	102286	102291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256125
2003	NC_016790	CGG	2	6	102313	102318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256125
2004	NC_016790	ATC	2	6	102365	102370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256125
2005	NC_016790	AGA	2	6	102421	102426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256125
2006	NC_016790	TGA	2	6	102824	102829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256126
2007	NC_016790	A	6	6	102832	102837	100 %	0 %	0 %	0 %	376256126
2008	NC_016790	CTC	2	6	102928	102933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256126
2009	NC_016790	GCTA	2	8	102967	102974	25 %	25 %	25 %	25 %	376256126
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2011	NC_016790	GGA	2	6	103123	103128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256126
2012	NC_016790	GTG	2	6	103187	103192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256126
2013	NC_016790	CCA	2	6	103330	103335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256126
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2015	NC_016790	GGCGG	2	10	103378	103387	0 %	0 %	80 %	20 %	376256126
2016	NC_016790	GGT	2	6	103420	103425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256126
2017	NC_016790	AGCATG	2	12	103478	103489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376256126
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2021	NC_016790	GCG	2	6	103598	103603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256126
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2122	NC_016790	CCA	2	6	109094	109099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256132
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2237	NC_016790	AGT	2	6	114391	114396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256134
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2239	NC_016790	CA	3	6	114446	114451	50 %	0 %	0 %	50 %	376256134
2240	NC_016790	AC	3	6	114459	114464	50 %	0 %	0 %	50 %	376256134
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2243	NC_016790	GA	3	6	114693	114698	50 %	0 %	50 %	0 %	376256134
2244	NC_016790	GTG	2	6	114785	114790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256134
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2247	NC_016790	ACC	2	6	114911	114916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256134
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2362	NC_016790	CAT	2	6	120760	120765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256142
2363	NC_016790	GGC	2	6	120776	120781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256142
2364	NC_016790	TGGTC	2	10	120848	120857	0 %	40 %	40 %	20 %	376256142
2365	NC_016790	GGC	2	6	120910	120915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256142
2366	NC_016790	GTG	2	6	121028	121033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256142
2367	NC_016790	GAA	2	6	121045	121050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256142
2368	NC_016790	GCT	2	6	121076	121081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256142
2369	NC_016790	AAG	2	6	121109	121114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256142
2370	NC_016790	CGA	2	6	121120	121125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256142
2371	NC_016790	CTG	2	6	121128	121133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256142
2372	NC_016790	GATC	2	8	121150	121157	25 %	25 %	25 %	25 %	376256142
2373	NC_016790	ATG	2	6	121194	121199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256142
2374	NC_016790	GAA	2	6	121315	121320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256142
2375	NC_016790	TGTC	2	8	121625	121632	0 %	50 %	25 %	25 %	376256143
2376	NC_016790	CTG	2	6	121727	121732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256143
2377	NC_016790	GATT	2	8	121794	121801	25 %	50 %	25 %	0 %	376256143
2378	NC_016790	TGAT	2	8	121802	121809	25 %	50 %	25 %	0 %	376256143
2379	NC_016790	GGT	2	6	121923	121928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256143
2380	NC_016790	GGT	2	6	121955	121960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256143
2381	NC_016790	CGT	3	9	122068	122076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256143
2382	NC_016790	GT	3	6	122075	122080	0 %	50 %	50 %	0 %	376256143
2383	NC_016790	CAG	2	6	122101	122106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256143
2384	NC_016790	ATTT	2	8	122113	122120	25 %	75 %	0 %	0 %	376256143
2385	NC_016790	TGC	2	6	122148	122153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256143
2386	NC_016790	GTG	2	6	122171	122176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256143
2387	NC_016790	GGT	2	6	122208	122213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256143
2388	NC_016790	GAG	2	6	122242	122247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256143
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2391	NC_016790	GCT	2	6	122349	122354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256143
2392	NC_016790	CGT	2	6	122391	122396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256144
2393	NC_016790	GTG	2	6	122397	122402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256144
2394	NC_016790	GCAG	2	8	122461	122468	25 %	0 %	50 %	25 %	376256144
2395	NC_016790	GAT	2	6	122471	122476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256144
2396	NC_016790	GTGAT	2	10	122479	122488	20 %	40 %	40 %	0 %	376256144
2397	NC_016790	TGT	2	6	122527	122532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256144
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2399	NC_016790	CGA	2	6	122668	122673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256144
2400	NC_016790	TGT	2	6	122707	122712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256144
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2402	NC_016790	TGC	2	6	122740	122745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256144
2403	NC_016790	AAGGGC	2	12	122769	122780	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	376256144
2404	NC_016790	TGA	2	6	122786	122791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256144
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2408	NC_016790	TGA	2	6	123022	123027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256144
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2422	NC_016790	TCG	2	6	123584	123589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256145
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2428	NC_016790	GC	3	6	123773	123778	0 %	0 %	50 %	50 %	376256145
2429	NC_016790	TGA	2	6	123816	123821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256145
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2433	NC_016790	CTG	2	6	123897	123902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256145
2434	NC_016790	TGA	2	6	123912	123917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256145
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2449	NC_016790	AGC	2	6	124554	124559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256146
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2452	NC_016790	GTT	2	6	124721	124726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256146
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2455	NC_016790	GCT	2	6	124751	124756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256146
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2462	NC_016790	CAAGGT	2	12	125095	125106	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376256146
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2465	NC_016790	TCG	2	6	125575	125580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256147
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2468	NC_016790	TTTG	2	8	125723	125730	0 %	75 %	25 %	0 %	376256147
2469	NC_016790	GGGT	2	8	125852	125859	0 %	25 %	75 %	0 %	376256147
2470	NC_016790	AG	3	6	125871	125876	50 %	0 %	50 %	0 %	376256147
2471	NC_016790	CGA	2	6	125915	125920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256147
2472	NC_016790	GCAGGT	2	12	125942	125953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376256147
2473	NC_016790	CGA	2	6	125972	125977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256147
2474	NC_016790	TTG	2	6	125992	125997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256147
2475	NC_016790	GCC	2	6	126009	126014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256147
2476	NC_016790	T	6	6	126033	126038	0 %	100 %	0 %	0 %	376256147
2477	NC_016790	GATA	2	8	126096	126103	50 %	25 %	25 %	0 %	376256147
2478	NC_016790	CTT	2	6	126122	126127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256148
2479	NC_016790	GCA	2	6	126198	126203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256148
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2481	NC_016790	GGT	2	6	126345	126350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256148
2482	NC_016790	AGC	2	6	126397	126402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256148
2483	NC_016790	GAA	2	6	126438	126443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256148
2484	NC_016790	CAG	2	6	126471	126476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256148
2485	NC_016790	GAG	2	6	126495	126500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256148
2486	NC_016790	TGT	2	6	126557	126562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256148
2487	NC_016790	GTTT	2	8	126577	126584	0 %	75 %	25 %	0 %	376256148
2488	NC_016790	CCTT	2	8	126667	126674	0 %	50 %	0 %	50 %	376256148
2489	NC_016790	GGA	2	6	126725	126730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256148
2490	NC_016790	CAG	2	6	126765	126770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256148
2491	NC_016790	GCT	2	6	126842	126847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256148
2492	NC_016790	GGC	2	6	126915	126920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256148
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2496	NC_016790	GC	3	6	127137	127142	0 %	0 %	50 %	50 %	376256149
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