MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016790	TGC	2	6	54443	54448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1003	NC_016790	GCT	2	6	54498	54503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1004	NC_016790	CGC	2	6	54541	54546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256071
1005	NC_016790	GAT	2	6	54560	54565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256071
1006	NC_016790	GAT	2	6	54584	54589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256071
1007	NC_016790	TGCCG	2	10	54596	54605	0 %	20 %	40 %	40 %	376256071
1008	NC_016790	CAG	2	6	54620	54625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1009	NC_016790	GCAT	2	8	54640	54647	25 %	25 %	25 %	25 %	376256071
1010	NC_016790	TGC	2	6	54719	54724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1011	NC_016790	GAG	2	6	54764	54769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256071
1012	NC_016790	ATG	2	6	54801	54806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256071
1013	NC_016790	GGT	2	6	54821	54826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256071
1014	NC_016790	GTA	2	6	54844	54849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256071
1015	NC_016790	TGGG	2	8	54901	54908	0 %	25 %	75 %	0 %	376256071
1016	NC_016790	AC	3	6	54921	54926	50 %	0 %	0 %	50 %	376256071
1017	NC_016790	CGG	2	6	54964	54969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256071
1018	NC_016790	ACC	2	6	55107	55112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256071
1019	NC_016790	GAT	2	6	55115	55120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256071
1020	NC_016790	CAG	2	6	55151	55156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1021	NC_016790	GGC	2	6	55184	55189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256071
1022	NC_016790	AGG	2	6	55239	55244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256071
1023	NC_016790	CAC	2	6	55272	55277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256071
1024	NC_016790	CGA	2	6	55288	55293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1025	NC_016790	ACC	2	6	55332	55337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256071
1026	NC_016790	GAG	3	9	55421	55429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256071
1027	NC_016790	AGC	2	6	55467	55472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256071
1028	NC_016790	CAA	2	6	55525	55530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256071
1029	NC_016790	GTG	2	6	55636	55641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256071
1030	NC_016790	TGG	2	6	55819	55824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256071
1031	NC_016790	GAA	2	6	55860	55865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256072
1032	NC_016790	TTGA	2	8	55896	55903	25 %	50 %	25 %	0 %	376256072
1033	NC_016790	TGG	2	6	55978	55983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256072
1034	NC_016790	AGT	2	6	56026	56031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256072
1035	NC_016790	GC	3	6	56032	56037	0 %	0 %	50 %	50 %	376256072
1036	NC_016790	CAC	2	6	56190	56195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256072
1037	NC_016790	CAA	2	6	56232	56237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256072
1038	NC_016790	TCACC	2	10	56330	56339	20 %	20 %	0 %	60 %	376256072
1039	NC_016790	CGG	2	6	56345	56350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256072
1040	NC_016790	CAAAC	2	10	56355	56364	60 %	0 %	0 %	40 %	376256072
1041	NC_016790	AAC	2	6	56374	56379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256072
1042	NC_016790	ACAA	2	8	56583	56590	75 %	0 %	0 %	25 %	376256073
1043	NC_016790	TAG	2	6	56627	56632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256073
1044	NC_016790	AGT	2	6	56718	56723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256073
1045	NC_016790	GCT	2	6	56764	56769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256073
1046	NC_016790	TGC	2	6	56782	56787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256073
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1048	NC_016790	CGG	2	6	56923	56928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256073
1049	NC_016790	GTC	2	6	56954	56959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256073
1050	NC_016790	GTG	2	6	56964	56969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256073
1051	NC_016790	GATGCG	2	12	56978	56989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376256073
1052	NC_016790	TGC	2	6	57014	57019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256073
1053	NC_016790	CCAT	2	8	57027	57034	25 %	25 %	0 %	50 %	376256073
1054	NC_016790	TGA	2	6	57091	57096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256073
1055	NC_016790	TGG	2	6	57109	57114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256073
1056	NC_016790	GAT	2	6	57149	57154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256073
1057	NC_016790	GTC	2	6	57185	57190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256073
1058	NC_016790	TGG	2	6	57237	57242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256074
1059	NC_016790	CCG	2	6	57287	57292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256074
1060	NC_016790	CGTT	2	8	57305	57312	0 %	50 %	25 %	25 %	376256074
1061	NC_016790	CAG	2	6	57319	57324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256074
1062	NC_016790	GCT	2	6	57390	57395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256074
1063	NC_016790	CAC	2	6	57445	57450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256074
1064	NC_016790	TGG	2	6	57508	57513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256074
1065	NC_016790	GGC	2	6	57673	57678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256074
1066	NC_016790	CCA	2	6	57716	57721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256074
1067	NC_016790	CGCCTG	2	12	57730	57741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	376256074
1068	NC_016790	CAT	2	6	57774	57779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256074
1069	NC_016790	CAG	2	6	57796	57801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256074
1070	NC_016790	TCT	2	6	57806	57811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256074
1071	NC_016790	GC	3	6	57862	57867	0 %	0 %	50 %	50 %	376256074
1072	NC_016790	AGA	2	6	57950	57955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256074
1073	NC_016790	CG	3	6	58049	58054	0 %	0 %	50 %	50 %	376256074
1074	NC_016790	CTG	2	6	58131	58136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256074
1075	NC_016790	GAG	2	6	58147	58152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256074
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1080	NC_016790	AGT	2	6	58363	58368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256074
1081	NC_016790	GCG	2	6	58393	58398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256074
1082	NC_016790	A	6	6	58422	58427	100 %	0 %	0 %	0 %	376256074
1083	NC_016790	CAT	2	6	58586	58591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256075
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1087	NC_016790	ATT	2	6	59017	59022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256076
1088	NC_016790	TGC	2	6	59067	59072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256076
1089	NC_016790	CAA	2	6	59101	59106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256076
1090	NC_016790	CTT	2	6	59130	59135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256076
1091	NC_016790	GGTGCG	2	12	59152	59163	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	376256077
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1093	NC_016790	GCC	2	6	59237	59242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256077
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1097	NC_016790	GGC	2	6	59440	59445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256077
1098	NC_016790	CG	3	6	59455	59460	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
1099	NC_016790	CGG	2	6	59466	59471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256077
1100	NC_016790	GCCA	2	8	59488	59495	25 %	0 %	25 %	50 %	376256077
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1102	NC_016790	AGCC	2	8	59557	59564	25 %	0 %	25 %	50 %	376256077
1103	NC_016790	GC	3	6	59595	59600	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
1104	NC_016790	GCA	2	6	59603	59608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256077
1105	NC_016790	ACC	2	6	59617	59622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256077
1106	NC_016790	CCGG	2	8	59663	59670	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
1107	NC_016790	CCA	2	6	59755	59760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256077
1108	NC_016790	GTG	2	6	59771	59776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256077
1109	NC_016790	AGGAG	2	10	59781	59790	40 %	0 %	60 %	0 %	376256077
1110	NC_016790	ACCAA	2	10	59794	59803	60 %	0 %	0 %	40 %	376256077
1111	NC_016790	GAG	2	6	59893	59898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256078
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1113	NC_016790	CGG	2	6	59928	59933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256078
1114	NC_016790	GC	3	6	59991	59996	0 %	0 %	50 %	50 %	376256078
1115	NC_016790	CGG	2	6	60120	60125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256078
1116	NC_016790	TCC	2	6	60134	60139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256078
1117	NC_016790	ACG	2	6	60294	60299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256078
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1119	NC_016790	ACCC	2	8	60319	60326	25 %	0 %	0 %	75 %	376256078
1120	NC_016790	AGC	2	6	60398	60403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256078
1121	NC_016790	GC	4	8	60408	60415	0 %	0 %	50 %	50 %	376256078
1122	NC_016790	GCAT	2	8	60440	60447	25 %	25 %	25 %	25 %	376256078
1123	NC_016790	AAG	2	6	60565	60570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256079
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1125	NC_016790	CTG	2	6	60621	60626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256079
1126	NC_016790	CAC	2	6	60651	60656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256079
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1128	NC_016790	TGACCA	2	12	60698	60709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376256079
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1246	NC_016790	TGAC	2	8	67120	67127	25 %	25 %	25 %	25 %	376256087
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1248	NC_016790	AGA	2	6	67181	67186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256087
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1359	NC_016790	TTC	2	6	71983	71988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256092
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1363	NC_016790	CGA	2	6	72121	72126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256092
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1369	NC_016790	TGG	2	6	72313	72318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256092
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1494	NC_016790	GTC	2	6	78411	78416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256098
1495	NC_016790	GCCGT	2	10	78610	78619	0 %	20 %	40 %	40 %	376256099
1496	NC_016790	TGG	2	6	78724	78729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256099
1497	NC_016790	TCG	2	6	78811	78816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256099
1498	NC_016790	CTC	2	6	78849	78854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256099
1499	NC_016790	CGC	2	6	78866	78871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256099
1500	NC_016790	CTT	2	6	78884	78889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256099

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