MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 44847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016788	CTTG	2	8	155174	155181	0 %	50 %	25 %	25 %	376247521
3002	NC_016788	AAG	2	6	155216	155221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247521
3003	NC_016788	AAC	2	6	155451	155456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247521
3004	NC_016788	A	6	6	155482	155487	100 %	0 %	0 %	0 %	376247521
3005	NC_016788	CAA	2	6	155499	155504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247521
3006	NC_016788	TCA	2	6	155507	155512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247521
3007	NC_016788	GT	3	6	155601	155606	0 %	50 %	50 %	0 %	376247521
3008	NC_016788	CCA	2	6	155613	155618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247521
3009	NC_016788	AAC	2	6	155629	155634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247521
3010	NC_016788	CAA	2	6	155641	155646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247521
3011	NC_016788	TG	3	6	155731	155736	0 %	50 %	50 %	0 %	376247522
3012	NC_016788	GCC	2	6	155828	155833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247522
3013	NC_016788	TCA	2	6	155872	155877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247522
3014	NC_016788	TGCATC	2	12	156045	156056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376247522
3015	NC_016788	GTT	2	6	156070	156075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247522
3016	NC_016788	ATG	2	6	156082	156087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247522
3017	NC_016788	ACAT	2	8	156097	156104	50 %	25 %	0 %	25 %	376247522
3018	NC_016788	ATCTG	2	10	156105	156114	20 %	40 %	20 %	20 %	376247522
3019	NC_016788	AGCTG	2	10	156228	156237	20 %	20 %	40 %	20 %	376247522
3020	NC_016788	GCA	2	6	156354	156359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247522
3021	NC_016788	TGT	2	6	156365	156370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247522
3022	NC_016788	TGTA	2	8	156374	156381	25 %	50 %	25 %	0 %	376247522
3023	NC_016788	AT	3	6	156394	156399	50 %	50 %	0 %	0 %	376247522
3024	NC_016788	CTC	2	6	156717	156722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247523
3025	NC_016788	GC	3	6	156749	156754	0 %	0 %	50 %	50 %	376247523
3026	NC_016788	CGT	2	6	156758	156763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247523
3027	NC_016788	TCA	2	6	156781	156786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247523
3028	NC_016788	CA	3	6	156818	156823	50 %	0 %	0 %	50 %	376247523
3029	NC_016788	CGC	2	6	156882	156887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247523
3030	NC_016788	CCA	2	6	156907	156912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247523
3031	NC_016788	CCG	2	6	156974	156979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247523
3032	NC_016788	CAT	2	6	156980	156985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247523
3033	NC_016788	CACC	2	8	157016	157023	25 %	0 %	0 %	75 %	376247523
3034	NC_016788	CAC	2	6	157038	157043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247523
3035	NC_016788	ACC	2	6	157099	157104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247523
3036	NC_016788	GC	3	6	157111	157116	0 %	0 %	50 %	50 %	376247523
3037	NC_016788	ACAA	2	8	157117	157124	75 %	0 %	0 %	25 %	376247523
3038	NC_016788	ACC	2	6	157176	157181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247523
3039	NC_016788	CAC	2	6	157242	157247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247523
3040	NC_016788	CAA	2	6	157290	157295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247523
3041	NC_016788	CCT	2	6	157394	157399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247523
3042	NC_016788	TTG	2	6	157400	157405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247523
3043	NC_016788	GCA	2	6	157414	157419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247523
3044	NC_016788	CG	3	6	157467	157472	0 %	0 %	50 %	50 %	376247523
3045	NC_016788	CCAAGG	2	12	157495	157506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247523
3046	NC_016788	ACAG	2	8	157509	157516	50 %	0 %	25 %	25 %	376247523
3047	NC_016788	ACG	2	6	157643	157648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247523
3048	NC_016788	GCA	2	6	158042	158047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247524
3049	NC_016788	ATG	2	6	158070	158075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247524
3050	NC_016788	CAT	2	6	158132	158137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247524
3051	NC_016788	CCG	2	6	158177	158182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247524
3052	NC_016788	TCG	2	6	158323	158328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247524
3053	NC_016788	CAT	2	6	158345	158350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247524
3054	NC_016788	TCC	2	6	158419	158424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247524
3055	NC_016788	CGG	2	6	158441	158446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247524
3056	NC_016788	CTT	2	6	158483	158488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247524
3057	NC_016788	ACA	2	6	158860	158865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247525
3058	NC_016788	CAAA	2	8	158866	158873	75 %	0 %	0 %	25 %	376247525
3059	NC_016788	GC	3	6	158904	158909	0 %	0 %	50 %	50 %	376247525
3060	NC_016788	CG	3	6	158951	158956	0 %	0 %	50 %	50 %	376247525
3061	NC_016788	AGC	2	6	159037	159042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247525
3062	NC_016788	AGC	2	6	159047	159052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247525
3063	NC_016788	CAAA	2	8	159135	159142	75 %	0 %	0 %	25 %	376247525
3064	NC_016788	A	6	6	159207	159212	100 %	0 %	0 %	0 %	376247525
3065	NC_016788	GCT	2	6	159284	159289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247525
3066	NC_016788	CAA	2	6	159331	159336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247525
3067	NC_016788	CTA	2	6	159390	159395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247525
3068	NC_016788	ACT	2	6	159396	159401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247525
3069	NC_016788	GTA	2	6	159414	159419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247525
3070	NC_016788	GCC	3	9	159462	159470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247525
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3072	NC_016788	ACG	2	6	159524	159529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247525
3073	NC_016788	CGT	2	6	159554	159559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247525
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3077	NC_016788	GCT	2	6	159707	159712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247525
3078	NC_016788	CGGG	2	8	159776	159783	0 %	0 %	75 %	25 %	376247525
3079	NC_016788	TGA	2	6	159800	159805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247525
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3082	NC_016788	CGT	2	6	159940	159945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247525
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3084	NC_016788	GGTG	2	8	160206	160213	0 %	25 %	75 %	0 %	376247526
3085	NC_016788	GTT	2	6	160301	160306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247526
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3087	NC_016788	ATT	2	6	160377	160382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247526
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3089	NC_016788	AGC	2	6	160623	160628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247526
3090	NC_016788	GCG	2	6	160669	160674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247526
3091	NC_016788	CTG	2	6	160901	160906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247527
3092	NC_016788	AGC	2	6	160968	160973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247527
3093	NC_016788	TAG	2	6	161185	161190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247528
3094	NC_016788	TCGG	2	8	161197	161204	0 %	25 %	50 %	25 %	376247528
3095	NC_016788	TAC	2	6	161248	161253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247528
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3098	NC_016788	CA	3	6	161559	161564	50 %	0 %	0 %	50 %	376247529
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3101	NC_016788	CAA	2	6	161717	161722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247529
3102	NC_016788	GC	3	6	161863	161868	0 %	0 %	50 %	50 %	376247529
3103	NC_016788	CGC	2	6	161959	161964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247529
3104	NC_016788	CG	3	6	162032	162037	0 %	0 %	50 %	50 %	376247529
3105	NC_016788	ACT	2	6	162159	162164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247530
3106	NC_016788	GCCG	2	8	162273	162280	0 %	0 %	50 %	50 %	376247530
3107	NC_016788	TTC	2	6	162302	162307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247530
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3109	NC_016788	ATT	2	6	162627	162632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247530
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3111	NC_016788	TGCC	2	8	162689	162696	0 %	25 %	25 %	50 %	376247530
3112	NC_016788	GTT	2	6	162698	162703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247530
3113	NC_016788	GCT	2	6	162859	162864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3114	NC_016788	CAA	2	6	162921	162926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247530
3115	NC_016788	GGC	2	6	163011	163016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247530
3116	NC_016788	TAC	2	6	163028	163033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247530
3117	NC_016788	CAG	2	6	163038	163043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3118	NC_016788	ACA	2	6	163157	163162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247530
3119	NC_016788	CGA	2	6	163173	163178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3120	NC_016788	AAG	2	6	163211	163216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247530
3121	NC_016788	CA	3	6	163230	163235	50 %	0 %	0 %	50 %	376247530
3122	NC_016788	ATT	2	6	163372	163377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247530
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3230	NC_016788	GCAA	2	8	170073	170080	50 %	0 %	25 %	25 %	376247535
3231	NC_016788	AGG	2	6	170081	170086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247535
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3240	NC_016788	CAA	2	6	170378	170383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247536
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3483	NC_016788	ACC	2	6	182276	182281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247547
3484	NC_016788	GCC	2	6	182288	182293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247547
3485	NC_016788	CTG	2	6	182406	182411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247548
3486	NC_016788	CGCA	2	8	182437	182444	25 %	0 %	25 %	50 %	376247548
3487	NC_016788	TTC	2	6	182449	182454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247548
3488	NC_016788	TCA	2	6	182460	182465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247548
3489	NC_016788	TTGCC	2	10	182493	182502	0 %	40 %	20 %	40 %	376247548
3490	NC_016788	CA	3	6	182525	182530	50 %	0 %	0 %	50 %	376247548
3491	NC_016788	CCA	2	6	182628	182633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247548
3492	NC_016788	CG	3	6	182694	182699	0 %	0 %	50 %	50 %	376247548
3493	NC_016788	CG	3	6	182752	182757	0 %	0 %	50 %	50 %	376247548
3494	NC_016788	CCA	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247548
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3496	NC_016788	GC	5	10	182865	182874	0 %	0 %	50 %	50 %	376247548
3497	NC_016788	GTTGC	2	10	182910	182919	0 %	40 %	40 %	20 %	376247548
3498	NC_016788	GGC	2	6	182958	182963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247548
3499	NC_016788	AGCG	2	8	182971	182978	25 %	0 %	50 %	25 %	376247548
3500	NC_016788	CTGC	2	8	183019	183026	0 %	25 %	25 %	50 %	376247548

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