MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 44847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016788	GCCA	2	8	257532	257539	25 %	0 %	25 %	50 %	376247614
5002	NC_016788	CAT	2	6	257564	257569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247614
5003	NC_016788	ATG	2	6	257589	257594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247614
5004	NC_016788	CGG	2	6	257606	257611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247614
5005	NC_016788	GCCTC	2	10	257620	257629	0 %	20 %	20 %	60 %	376247614
5006	NC_016788	GAC	2	6	257637	257642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5007	NC_016788	CGC	2	6	257651	257656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247614
5008	NC_016788	GCA	2	6	257671	257676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5009	NC_016788	CG	3	6	257691	257696	0 %	0 %	50 %	50 %	376247614
5010	NC_016788	GAC	2	6	257700	257705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5011	NC_016788	TCC	2	6	257779	257784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247614
5012	NC_016788	ACT	2	6	257798	257803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247614
5013	NC_016788	ACG	2	6	257818	257823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5014	NC_016788	ATC	2	6	257835	257840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247614
5015	NC_016788	ATCGCC	2	12	257907	257918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376247614
5016	NC_016788	CGGCAT	2	12	257927	257938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5017	NC_016788	TCG	2	6	258010	258015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5018	NC_016788	CAC	2	6	258105	258110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247614
5019	NC_016788	CGA	2	6	258113	258118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5020	NC_016788	CTAA	2	8	258272	258279	50 %	25 %	0 %	25 %	376247614
5021	NC_016788	TCA	2	6	258339	258344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5022	NC_016788	TCA	2	6	258372	258377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5023	NC_016788	GC	3	6	258407	258412	0 %	0 %	50 %	50 %	376247615
5024	NC_016788	CGC	2	6	258475	258480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5025	NC_016788	ACC	2	6	258526	258531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5026	NC_016788	CCA	2	6	258543	258548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5027	NC_016788	GCG	2	6	258617	258622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247615
5028	NC_016788	CAGC	2	8	258672	258679	25 %	0 %	25 %	50 %	376247615
5029	NC_016788	GCA	2	6	258680	258685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5030	NC_016788	TAA	2	6	258702	258707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376247615
5031	NC_016788	TTG	2	6	258713	258718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247615
5032	NC_016788	CCA	2	6	258732	258737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5033	NC_016788	CTC	2	6	258760	258765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247615
5034	NC_016788	CGC	2	6	258849	258854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5035	NC_016788	CTC	2	6	258868	258873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247615
5036	NC_016788	GC	3	6	258878	258883	0 %	0 %	50 %	50 %	376247615
5037	NC_016788	CAT	2	6	258952	258957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5038	NC_016788	CGT	2	6	258996	259001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5039	NC_016788	CCA	2	6	259074	259079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5040	NC_016788	GTG	2	6	259097	259102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247615
5041	NC_016788	GTG	2	6	259189	259194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247615
5042	NC_016788	CAA	2	6	259207	259212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247615
5043	NC_016788	CGG	2	6	259273	259278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247615
5044	NC_016788	ACG	2	6	259300	259305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5045	NC_016788	GCC	2	6	259319	259324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5046	NC_016788	CAC	2	6	259363	259368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5047	NC_016788	CAC	2	6	259377	259382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5048	NC_016788	CAC	2	6	259471	259476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5049	NC_016788	CGC	2	6	259486	259491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5050	NC_016788	CCA	2	6	259601	259606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5051	NC_016788	AGGT	2	8	259645	259652	25 %	25 %	50 %	0 %	376247615
5052	NC_016788	AAC	2	6	259709	259714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247615
5053	NC_016788	GC	3	6	259799	259804	0 %	0 %	50 %	50 %	376247615
5054	NC_016788	ACT	2	6	259823	259828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247616
5055	NC_016788	CTA	2	6	259840	259845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247616
5056	NC_016788	CCG	2	6	259944	259949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247616
5057	NC_016788	CG	4	8	259948	259955	0 %	0 %	50 %	50 %	376247616
5058	NC_016788	CGCA	2	8	259957	259964	25 %	0 %	25 %	50 %	376247616
5059	NC_016788	AC	3	6	259988	259993	50 %	0 %	0 %	50 %	376247616
5060	NC_016788	CGC	3	9	260050	260058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247616
5061	NC_016788	CCA	2	6	260076	260081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247616
5062	NC_016788	ACG	2	6	260124	260129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247616
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5064	NC_016788	ATG	2	6	260183	260188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247616
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5068	NC_016788	AGT	2	6	260242	260247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247616
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5091	NC_016788	ATAG	2	8	262131	262138	50 %	25 %	25 %	0 %	376247617
5092	NC_016788	AAC	2	6	262270	262275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247617
5093	NC_016788	TA	3	6	262285	262290	50 %	50 %	0 %	0 %	376247617
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5101	NC_016788	GAG	2	6	262719	262724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247619
5102	NC_016788	GTT	2	6	262736	262741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247619
5103	NC_016788	GTC	2	6	262755	262760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247619
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5105	NC_016788	CAC	2	6	262778	262783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247619
5106	NC_016788	CGC	2	6	262793	262798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247619
5107	NC_016788	GGT	2	6	262799	262804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247619
5108	NC_016788	TCG	2	6	262837	262842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247619
5109	NC_016788	ACG	2	6	262848	262853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247619
5110	NC_016788	GCT	2	6	262978	262983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247619
5111	NC_016788	GCG	2	6	263016	263021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247619
5112	NC_016788	TTTTGT	2	12	263060	263071	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	376247619
5113	NC_016788	ATG	2	6	263074	263079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247619
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5115	NC_016788	GAG	2	6	263100	263105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247619
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5117	NC_016788	GAGCCG	2	12	263137	263148	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	376247619
5118	NC_016788	GCA	2	6	263275	263280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247620
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5120	NC_016788	T	6	6	263470	263475	0 %	100 %	0 %	0 %	376247621
5121	NC_016788	GTTGGG	2	12	263547	263558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247621
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5237	NC_016788	CAACC	2	10	271971	271980	40 %	0 %	0 %	60 %	376247635
5238	NC_016788	CG	3	6	271984	271989	0 %	0 %	50 %	50 %	376247635
5239	NC_016788	GCA	2	6	272049	272054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
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5241	NC_016788	CGA	2	6	272200	272205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5242	NC_016788	ACA	2	6	272208	272213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247635
5243	NC_016788	CATCG	2	10	272270	272279	20 %	20 %	20 %	40 %	376247635
5244	NC_016788	ACG	2	6	272322	272327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5245	NC_016788	AAAGAC	2	12	272333	272344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376247635
5246	NC_016788	TCG	2	6	272346	272351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247635
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5248	NC_016788	CTA	2	6	272497	272502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247635
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5265	NC_016788	AGA	2	6	273235	273240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247635
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5322	NC_016788	TCGAGG	2	12	275682	275693	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376247635
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5325	NC_016788	CAG	2	6	275915	275920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
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5330	NC_016788	ACA	2	6	276313	276318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247635
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5341	NC_016788	AATTC	2	10	276870	276879	40 %	40 %	0 %	20 %	376247635
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5343	NC_016788	CTGT	2	8	277001	277008	0 %	50 %	25 %	25 %	376247635
5344	NC_016788	GAT	2	6	277037	277042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247635
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5346	NC_016788	ACG	2	6	277275	277280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
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5350	NC_016788	GC	3	6	277664	277669	0 %	0 %	50 %	50 %	376247635
5351	NC_016788	TCA	2	6	277708	277713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247635
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5355	NC_016788	GAA	2	6	278110	278115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247635
5356	NC_016788	CCA	2	6	278118	278123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247635
5357	NC_016788	GTT	2	6	278237	278242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247635
5358	NC_016788	GCT	2	6	278321	278326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5359	NC_016788	GAT	2	6	278393	278398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247635
5360	NC_016788	TCAAGG	2	12	278439	278450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376247635
5361	NC_016788	CGTCAC	2	12	278575	278586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376247635
5362	NC_016788	TGC	2	6	278779	278784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5363	NC_016788	CAC	2	6	278836	278841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247635
5364	NC_016788	CT	3	6	278854	278859	0 %	50 %	0 %	50 %	376247635
5365	NC_016788	CGA	2	6	278911	278916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5366	NC_016788	TGC	2	6	279007	279012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247635
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5429	NC_016788	CG	3	6	281876	281881	0 %	0 %	50 %	50 %	376247637
5430	NC_016788	TTTG	2	8	281943	281950	0 %	75 %	25 %	0 %	376247637
5431	NC_016788	TGC	2	6	281983	281988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247637
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5434	NC_016788	TCCGC	2	10	282072	282081	0 %	20 %	20 %	60 %	376247637
5435	NC_016788	TG	3	6	282099	282104	0 %	50 %	50 %	0 %	376247637
5436	NC_016788	AGC	2	6	282114	282119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247637
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5470	NC_016788	ACG	2	6	283484	283489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247639
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5481	NC_016788	GTG	2	6	283901	283906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247639
5482	NC_016788	GGA	2	6	283966	283971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247639
5483	NC_016788	CAAT	2	8	283978	283985	50 %	25 %	0 %	25 %	376247639
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