MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 chromosome

Total Repeats: 43927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016785	CTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241701
2	NC_016785	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241701
3	NC_016785	CGT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241701
4	NC_016785	CAC	2	6	343	348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241701
5	NC_016785	ACT	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241701
6	NC_016785	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241701
7	NC_016785	CAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241701
8	NC_016785	CAGCA	2	10	506	515	40 %	0 %	20 %	40 %	376241701
9	NC_016785	TCG	3	9	540	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241701
10	NC_016785	AGC	3	9	557	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
11	NC_016785	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241701
12	NC_016785	CGC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241701
13	NC_016785	GA	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	376241701
14	NC_016785	CAA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241701
15	NC_016785	CGG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241701
16	NC_016785	GC	4	8	742	749	0 %	0 %	50 %	50 %	376241701
17	NC_016785	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241701
18	NC_016785	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241701
19	NC_016785	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
20	NC_016785	TTC	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241701
21	NC_016785	GCA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
22	NC_016785	CCA	2	6	1069	1074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241701
23	NC_016785	CCA	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241701
24	NC_016785	CGG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241701
25	NC_016785	ATG	2	6	1354	1359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241701
26	NC_016785	GCAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	376241701
27	NC_016785	CGG	2	6	1385	1390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241701
28	NC_016785	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241701
29	NC_016785	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241701
30	NC_016785	ACG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
31	NC_016785	CAG	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
32	NC_016785	GCA	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241701
33	NC_016785	GAC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241702
34	NC_016785	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376241702
35	NC_016785	CCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241702
36	NC_016785	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	376241702
37	NC_016785	TCA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241702
38	NC_016785	CCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241702
39	NC_016785	GCCA	2	8	2515	2522	25 %	0 %	25 %	50 %	376241702
40	NC_016785	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241702
41	NC_016785	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241702
42	NC_016785	TTC	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241702
43	NC_016785	CGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241702
44	NC_016785	TGC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241702
45	NC_016785	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241702
46	NC_016785	ACG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241702
47	NC_016785	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241702
48	NC_016785	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241702
49	NC_016785	ACC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241702
50	NC_016785	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241702
51	NC_016785	CCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241702
52	NC_016785	CGA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241702
53	NC_016785	TC	3	6	3221	3226	0 %	50 %	0 %	50 %	376241702
54	NC_016785	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241702
55	NC_016785	AAGC	2	8	3424	3431	50 %	0 %	25 %	25 %	376241702
56	NC_016785	ACCT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	376241702
57	NC_016785	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376241703
58	NC_016785	GT	3	6	3699	3704	0 %	50 %	50 %	0 %	376241703
59	NC_016785	GT	3	6	3747	3752	0 %	50 %	50 %	0 %	376241703
60	NC_016785	CTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
61	NC_016785	GCT	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
62	NC_016785	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376241703
63	NC_016785	GTG	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241703
64	NC_016785	TGC	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
65	NC_016785	CAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241703
66	NC_016785	TGC	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
67	NC_016785	CGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
68	NC_016785	GAT	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241703
69	NC_016785	TG	3	6	4102	4107	0 %	50 %	50 %	0 %	376241703
70	NC_016785	TGG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241703
71	NC_016785	TCAT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	376241703
72	NC_016785	ATG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241703
73	NC_016785	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241703
74	NC_016785	TGCT	2	8	4305	4312	0 %	50 %	25 %	25 %	376241703
75	NC_016785	G	6	6	4347	4352	0 %	0 %	100 %	0 %	376241703
76	NC_016785	TGG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241703
77	NC_016785	TGA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241703
78	NC_016785	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
79	NC_016785	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241703
80	NC_016785	CGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241703
81	NC_016785	GGTG	2	8	4606	4613	0 %	25 %	75 %	0 %	376241703
82	NC_016785	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241703
83	NC_016785	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241703
84	NC_016785	ATG	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241703
85	NC_016785	CTG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241704
86	NC_016785	AGG	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376241704
87	NC_016785	A	6	6	4779	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	376241704
88	NC_016785	ACG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241704
89	NC_016785	AAC	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241704
90	NC_016785	GTC	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241704
91	NC_016785	GGC	3	9	4909	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241704
92	NC_016785	A	6	6	4965	4970	100 %	0 %	0 %	0 %	376241704
93	NC_016785	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241704
94	NC_016785	TGC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241704
95	NC_016785	ATG	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241704
96	NC_016785	ATT	2	6	5139	5144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376241704
97	NC_016785	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241704
98	NC_016785	GGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241704
99	NC_016785	CAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241705
100	NC_016785	CGA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241705
101	NC_016785	CGG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241705
102	NC_016785	GGT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241705
103	NC_016785	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241705
104	NC_016785	CG	3	6	5867	5872	0 %	0 %	50 %	50 %	376241705
105	NC_016785	ACC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241705
106	NC_016785	ACC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241705
107	NC_016785	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241705
108	NC_016785	GAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241705
109	NC_016785	TCGATG	2	12	6091	6102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376241705
110	NC_016785	CTG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241705
111	NC_016785	GAA	3	9	6146	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241705
112	NC_016785	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241705
113	NC_016785	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376241705
114	NC_016785	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241705
115	NC_016785	AAC	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241705
116	NC_016785	TGA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241705
117	NC_016785	GCT	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241705
118	NC_016785	AAGGAA	2	12	6423	6434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241705
119	NC_016785	GAC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241705
120	NC_016785	CCG	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241705
121	NC_016785	ATC	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241705
122	NC_016785	GGC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241705
123	NC_016785	GC	3	6	6675	6680	0 %	0 %	50 %	50 %	376241705
124	NC_016785	CGT	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241705
125	NC_016785	CGG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241705
126	NC_016785	GGT	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241705
127	NC_016785	TTC	2	6	6841	6846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241705
128	NC_016785	ATC	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241705
129	NC_016785	ATG	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241705
130	NC_016785	AAG	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241705
131	NC_016785	TGC	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241705
132	NC_016785	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241705
133	NC_016785	CTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	25 %	25 %	376241705
134	NC_016785	CAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376241705
135	NC_016785	GAC	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241705
136	NC_016785	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241705
137	NC_016785	TCT	2	6	7348	7353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241705
138	NC_016785	GAC	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241705
139	NC_016785	TTA	2	6	7393	7398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376241705
140	NC_016785	CCG	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241705
141	NC_016785	TGC	2	6	7563	7568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241706
142	NC_016785	TGC	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241706
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144	NC_016785	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241706
145	NC_016785	GCT	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241706
146	NC_016785	A	6	6	8235	8240	100 %	0 %	0 %	0 %	376241707
147	NC_016785	ATC	2	6	8261	8266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241707
148	NC_016785	GGT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241707
149	NC_016785	CGG	2	6	8362	8367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241707
150	NC_016785	GC	3	6	8419	8424	0 %	0 %	50 %	50 %	376241707
151	NC_016785	GCCTA	2	10	8484	8493	20 %	20 %	20 %	40 %	376241708
152	NC_016785	GGCG	2	8	8525	8532	0 %	0 %	75 %	25 %	376241708
153	NC_016785	CTT	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241708
154	NC_016785	GCT	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241708
155	NC_016785	GCG	2	6	8572	8577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241708
156	NC_016785	TGG	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241708
157	NC_016785	TGC	2	6	8606	8611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241708
158	NC_016785	GAG	2	6	8628	8633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376241708
159	NC_016785	GC	3	6	8639	8644	0 %	0 %	50 %	50 %	376241708
160	NC_016785	CTG	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241708
161	NC_016785	TCG	2	6	8895	8900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241709
162	NC_016785	CCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241709
163	NC_016785	GC	3	6	9008	9013	0 %	0 %	50 %	50 %	376241709
164	NC_016785	ACG	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241709
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167	NC_016785	CTG	2	6	9305	9310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241709
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171	NC_016785	GCT	2	6	9397	9402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241709
172	NC_016785	TCG	2	6	9489	9494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241709
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243	NC_016785	CTT	2	6	12860	12865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376241711
244	NC_016785	GAG	2	6	13043	13048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376241712
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246	NC_016785	GCG	2	6	13116	13121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241712
247	NC_016785	ATC	2	6	13143	13148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376241712
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250	NC_016785	CGG	2	6	13273	13278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241712
251	NC_016785	AGCC	2	8	13284	13291	25 %	0 %	25 %	50 %	376241712
252	NC_016785	GAA	2	6	13304	13309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241712
253	NC_016785	TGC	2	6	13316	13321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241712
254	NC_016785	AAAG	2	8	13386	13393	75 %	0 %	25 %	0 %	376241712
255	NC_016785	GTC	2	6	13490	13495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241712
256	NC_016785	CGA	2	6	13516	13521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
257	NC_016785	CAG	2	6	13535	13540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
258	NC_016785	GTG	2	6	13578	13583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241712
259	NC_016785	CGA	2	6	13717	13722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
260	NC_016785	CCAT	2	8	13744	13751	25 %	25 %	0 %	50 %	376241712
261	NC_016785	CGG	2	6	13774	13779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241712
262	NC_016785	GCA	2	6	13843	13848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
263	NC_016785	CGG	2	6	13855	13860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241712
264	NC_016785	CGA	2	6	13882	13887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
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268	NC_016785	GAT	2	6	14012	14017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376241712
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272	NC_016785	CGA	2	6	14056	14061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376241712
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274	NC_016785	CGG	2	6	14101	14106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241712
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371	NC_016785	GCC	2	6	18851	18856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376241715
372	NC_016785	CAC	2	6	18876	18881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241715
373	NC_016785	ACCT	2	8	18907	18914	25 %	25 %	0 %	50 %	376241715
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376	NC_016785	CTG	2	6	19787	19792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376241716
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379	NC_016785	ACC	2	6	20035	20040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376241716
380	NC_016785	AAG	2	6	20072	20077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241716
381	NC_016785	GAA	2	6	20693	20698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376241717
382	NC_016785	TGG	2	6	20843	20848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241717
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384	NC_016785	GCG	2	6	20997	21002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376241717
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498	NC_016785	TGT	2	6	27249	27254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376241724
499	NC_016785	TGG	2	6	27353	27358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376241724
500	NC_016785	CA	3	6	27384	27389	50 %	0 %	0 %	50 %	376241724

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