MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	375287587
2	NC_016781	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	375287591
3	NC_016781	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	375287600
4	NC_016781	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	375287601
5	NC_016781	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	375287605
6	NC_016781	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	375287605
7	NC_016781	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	375287611
8	NC_016781	TGCGT	2	10	24499	24508	0 %	40 %	40 %	20 %	375287612
9	NC_016781	CTGAT	2	10	28530	28539	20 %	40 %	20 %	20 %	375287616
10	NC_016781	GGAGC	2	10	29483	29492	20 %	0 %	60 %	20 %	375287617
11	NC_016781	TTGCT	2	10	30571	30580	0 %	60 %	20 %	20 %	375287618
12	NC_016781	TGAGG	2	10	37404	37413	20 %	20 %	60 %	0 %	375287622
13	NC_016781	TGCGG	2	10	40521	40530	0 %	20 %	60 %	20 %	375287626
14	NC_016781	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	375287633
15	NC_016781	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	375287633
16	NC_016781	CAGTG	2	10	49244	49253	20 %	20 %	40 %	20 %	375287635
17	NC_016781	TGAGA	2	10	49586	49595	40 %	20 %	40 %	0 %	375287635
18	NC_016781	AGTGA	2	10	49636	49645	40 %	20 %	40 %	0 %	375287635
19	NC_016781	TGCAC	2	10	52801	52810	20 %	20 %	20 %	40 %	375287640
20	NC_016781	CTGGC	2	10	53060	53069	0 %	20 %	40 %	40 %	375287641
21	NC_016781	GCAGC	2	10	53559	53568	20 %	0 %	40 %	40 %	375287641
22	NC_016781	GACTG	2	10	53575	53584	20 %	20 %	40 %	20 %	375287641
23	NC_016781	AAGGC	2	10	55816	55825	40 %	0 %	40 %	20 %	375287643
24	NC_016781	ATGGC	2	10	58676	58685	20 %	20 %	40 %	20 %	375287647
25	NC_016781	ATGTG	2	10	62845	62854	20 %	40 %	40 %	0 %	375287651
26	NC_016781	GCTGG	2	10	65006	65015	0 %	20 %	60 %	20 %	375287653
27	NC_016781	AGGGA	2	10	67614	67623	40 %	0 %	60 %	0 %	375287656
28	NC_016781	AAGAT	2	10	69421	69430	60 %	20 %	20 %	0 %	375287658
29	NC_016781	GGAGC	2	10	69528	69537	20 %	0 %	60 %	20 %	375287658
30	NC_016781	GGTCT	2	10	71242	71251	0 %	40 %	40 %	20 %	375287660
31	NC_016781	CAGCG	2	10	72698	72707	20 %	0 %	40 %	40 %	375287661
32	NC_016781	CAGGC	2	10	73104	73113	20 %	0 %	40 %	40 %	375287661
33	NC_016781	ATGGC	2	10	73949	73958	20 %	20 %	40 %	20 %	375287662
34	NC_016781	AGGCA	2	10	75269	75278	40 %	0 %	40 %	20 %	375287663
35	NC_016781	GCTTT	2	10	81110	81119	0 %	60 %	20 %	20 %	375287670
36	NC_016781	TGACC	2	10	81366	81375	20 %	20 %	20 %	40 %	375287670
37	NC_016781	CGTTA	2	10	82108	82117	20 %	40 %	20 %	20 %	375287671
38	NC_016781	TGCTG	2	10	82742	82751	0 %	40 %	40 %	20 %	375287671
39	NC_016781	TGGCC	2	10	84733	84742	0 %	20 %	40 %	40 %	375287672
40	NC_016781	GCGAC	2	10	85537	85546	20 %	0 %	40 %	40 %	375287672
41	NC_016781	TGGGA	2	10	88952	88961	20 %	20 %	60 %	0 %	375287678
42	NC_016781	GATCG	2	10	90051	90060	20 %	20 %	40 %	20 %	375287680
43	NC_016781	CAAAA	2	10	90783	90792	80 %	0 %	0 %	20 %	375287681
44	NC_016781	TGCAA	2	10	96631	96640	40 %	20 %	20 %	20 %	375287686
45	NC_016781	TGCAG	2	10	96851	96860	20 %	20 %	40 %	20 %	375287686
46	NC_016781	AGGTC	2	10	99287	99296	20 %	20 %	40 %	20 %	375287689
47	NC_016781	ACCAA	2	10	101146	101155	60 %	0 %	0 %	40 %	375287689
48	NC_016781	TCATC	2	10	102409	102418	20 %	40 %	0 %	40 %	375287690
49	NC_016781	ACCTG	2	10	104439	104448	20 %	20 %	20 %	40 %	375287691
50	NC_016781	CGGTG	2	10	104648	104657	0 %	20 %	60 %	20 %	375287691
51	NC_016781	CGGCG	2	10	107267	107276	0 %	0 %	60 %	40 %	375287694
52	NC_016781	CGCGG	2	10	107327	107336	0 %	0 %	60 %	40 %	375287695
53	NC_016781	CAGCG	2	10	107863	107872	20 %	0 %	40 %	40 %	375287696
54	NC_016781	GGATC	2	10	118429	118438	20 %	20 %	40 %	20 %	375287706
55	NC_016781	GACTG	2	10	127807	127816	20 %	20 %	40 %	20 %	375287712
56	NC_016781	TTGGT	2	10	129116	129125	0 %	60 %	40 %	0 %	375287712
57	NC_016781	GTGCG	2	10	131440	131449	0 %	20 %	60 %	20 %	375287714
58	NC_016781	GTGGC	2	10	133177	133186	0 %	20 %	60 %	20 %	375287715
59	NC_016781	CGCGT	2	10	133497	133506	0 %	20 %	40 %	40 %	375287716
60	NC_016781	GGGGC	2	10	133625	133634	0 %	0 %	80 %	20 %	375287716
61	NC_016781	AGACG	2	10	135430	135439	40 %	0 %	40 %	20 %	375287718
62	NC_016781	GGGGC	2	10	135648	135657	0 %	0 %	80 %	20 %	375287719
63	NC_016781	ACGGT	2	10	136803	136812	20 %	20 %	40 %	20 %	375287720
64	NC_016781	CGATC	2	10	137076	137085	20 %	20 %	20 %	40 %	375287720
65	NC_016781	TGGCC	2	10	137283	137292	0 %	20 %	40 %	40 %	375287720
66	NC_016781	TGGTG	2	10	137661	137670	0 %	40 %	60 %	0 %	375287720
67	NC_016781	GGAGT	2	10	138133	138142	20 %	20 %	60 %	0 %	375287720
68	NC_016781	ATTGC	2	10	142067	142076	20 %	40 %	20 %	20 %	375287723
69	NC_016781	TCACT	2	10	145938	145947	20 %	40 %	0 %	40 %	375287728
70	NC_016781	ATTTC	2	10	146555	146564	20 %	60 %	0 %	20 %	375287728
71	NC_016781	AATGG	2	10	150255	150264	40 %	20 %	40 %	0 %	375287731
72	NC_016781	GTGAG	2	10	151238	151247	20 %	20 %	60 %	0 %	375287733
73	NC_016781	CTGAA	2	10	152036	152045	40 %	20 %	20 %	20 %	375287733
74	NC_016781	CCAGC	2	10	153328	153337	20 %	0 %	20 %	60 %	375287734
75	NC_016781	TACGC	2	10	156354	156363	20 %	20 %	20 %	40 %	375287736
76	NC_016781	GCGAC	2	10	159848	159857	20 %	0 %	40 %	40 %	375287741
77	NC_016781	CCTTG	2	10	161500	161509	0 %	40 %	20 %	40 %	375287742
78	NC_016781	CGGTG	2	10	165472	165481	0 %	20 %	60 %	20 %	375287745
79	NC_016781	CATGG	2	10	167605	167614	20 %	20 %	40 %	20 %	375287747
80	NC_016781	CAGAT	2	10	167961	167970	40 %	20 %	20 %	20 %	375287747
81	NC_016781	GGATG	2	10	168859	168868	20 %	20 %	60 %	0 %	375287747
82	NC_016781	AAACT	2	10	172543	172552	60 %	20 %	0 %	20 %	375287750
83	NC_016781	ACCGG	2	10	172938	172947	20 %	0 %	40 %	40 %	375287750
84	NC_016781	ATTGA	2	10	178748	178757	40 %	40 %	20 %	0 %	375287754
85	NC_016781	GTGGA	2	10	181157	181166	20 %	20 %	60 %	0 %	375287756
86	NC_016781	TGACC	2	10	185407	185416	20 %	20 %	20 %	40 %	375287759
87	NC_016781	TTGCA	2	10	186693	186702	20 %	40 %	20 %	20 %	375287760
88	NC_016781	GTTTG	2	10	188632	188641	0 %	60 %	40 %	0 %	375287763
89	NC_016781	CGGAT	2	10	189572	189581	20 %	20 %	40 %	20 %	375287764
90	NC_016781	AGCGC	2	10	190730	190739	20 %	0 %	40 %	40 %	375287765
91	NC_016781	GCAGT	2	10	192217	192226	20 %	20 %	40 %	20 %	375287766
92	NC_016781	CAATG	2	10	192488	192497	40 %	20 %	20 %	20 %	375287766
93	NC_016781	TAACG	2	10	193463	193472	40 %	20 %	20 %	20 %	375287767
94	NC_016781	AAGCC	2	10	194790	194799	40 %	0 %	20 %	40 %	375287768
95	NC_016781	GGCCC	2	10	196862	196871	0 %	0 %	40 %	60 %	375287771
96	NC_016781	GAATT	2	10	200427	200436	40 %	40 %	20 %	0 %	375287776
97	NC_016781	CAAGG	2	10	201316	201325	40 %	0 %	40 %	20 %	375287776
98	NC_016781	GATGG	2	10	203765	203774	20 %	20 %	60 %	0 %	375287777
99	NC_016781	TGGCG	2	10	204499	204508	0 %	20 %	60 %	20 %	375287778
100	NC_016781	TGCCA	2	10	206522	206531	20 %	20 %	20 %	40 %	375287779
101	NC_016781	AAATA	2	10	206624	206633	80 %	20 %	0 %	0 %	375287779
102	NC_016781	ATTCT	2	10	207220	207229	20 %	60 %	0 %	20 %	375287780
103	NC_016781	CAGGC	2	10	212037	212046	20 %	0 %	40 %	40 %	375287782
104	NC_016781	TTGTA	2	10	212447	212456	20 %	60 %	20 %	0 %	375287783
105	NC_016781	GCGAC	2	10	216963	216972	20 %	0 %	40 %	40 %	375287788
106	NC_016781	AGATC	2	10	216988	216997	40 %	20 %	20 %	20 %	375287788
107	NC_016781	CAAGG	2	10	217902	217911	40 %	0 %	40 %	20 %	375287789
108	NC_016781	AGAAA	2	10	218631	218640	80 %	0 %	20 %	0 %	375287790
109	NC_016781	CGGGG	2	10	224665	224674	0 %	0 %	80 %	20 %	375287797
110	NC_016781	TGCGC	2	10	227105	227114	0 %	20 %	40 %	40 %	375287800
111	NC_016781	CACTG	2	10	228265	228274	20 %	20 %	20 %	40 %	375287801
112	NC_016781	CATTG	2	10	228954	228963	20 %	40 %	20 %	20 %	375287802
113	NC_016781	CGCAA	2	10	229768	229777	40 %	0 %	20 %	40 %	375287805
114	NC_016781	GATCG	2	10	230086	230095	20 %	20 %	40 %	20 %	375287806
115	NC_016781	CAAGA	2	10	231998	232007	60 %	0 %	20 %	20 %	375287806
116	NC_016781	TGGCT	2	10	232194	232203	0 %	40 %	40 %	20 %	375287806
117	NC_016781	CTGTG	2	10	233513	233522	0 %	40 %	40 %	20 %	375287808
118	NC_016781	GCCGT	2	10	234914	234923	0 %	20 %	40 %	40 %	375287808
119	NC_016781	AGAAA	2	10	235821	235830	80 %	0 %	20 %	0 %	375287808
120	NC_016781	AGAGT	2	10	239248	239257	40 %	20 %	40 %	0 %	375287810
121	NC_016781	TTTTG	2	10	241547	241556	0 %	80 %	20 %	0 %	375287813
122	NC_016781	GCCAT	2	10	244904	244913	20 %	20 %	20 %	40 %	375287816
123	NC_016781	CGCAG	2	10	247960	247969	20 %	0 %	40 %	40 %	375287819
124	NC_016781	CATGC	2	10	249731	249740	20 %	20 %	20 %	40 %	375287820
125	NC_016781	CCATG	2	10	249962	249971	20 %	20 %	20 %	40 %	375287820
126	NC_016781	AATTG	2	10	250135	250144	40 %	40 %	20 %	0 %	375287820
127	NC_016781	CCCCG	2	10	254787	254796	0 %	0 %	20 %	80 %	375287824
128	NC_016781	GAAGT	2	10	255328	255337	40 %	20 %	40 %	0 %	375287824
129	NC_016781	CCGTG	2	10	255514	255523	0 %	20 %	40 %	40 %	375287824
130	NC_016781	TGCTC	2	10	260454	260463	0 %	40 %	20 %	40 %	375287828
131	NC_016781	TTGGA	2	10	262372	262381	20 %	40 %	40 %	0 %	375287830
132	NC_016781	GGCTC	2	10	262694	262703	0 %	20 %	40 %	40 %	375287831
133	NC_016781	TCCTT	2	10	263424	263433	0 %	60 %	0 %	40 %	375287832
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