MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 27620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	CAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287587
2	NC_016781	CTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287587
3	NC_016781	TCA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287587
4	NC_016781	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287587
5	NC_016781	CGC	2	6	721	726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287587
6	NC_016781	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
7	NC_016781	CAG	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
8	NC_016781	GAT	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
9	NC_016781	TCC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287587
10	NC_016781	AAG	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
11	NC_016781	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
12	NC_016781	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
13	NC_016781	GGC	2	6	1304	1309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287587
14	NC_016781	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287587
15	NC_016781	ATG	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
16	NC_016781	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287587
17	NC_016781	ATG	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287587
18	NC_016781	GCA	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287587
19	NC_016781	TTC	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287587
20	NC_016781	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
21	NC_016781	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
22	NC_016781	GAT	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287588
23	NC_016781	GCT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287588
24	NC_016781	CAT	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287588
25	NC_016781	GCA	3	9	2827	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287588
26	NC_016781	GCT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287588
27	NC_016781	CGG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287588
28	NC_016781	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287588
29	NC_016781	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287588
30	NC_016781	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287589
31	NC_016781	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287589
32	NC_016781	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287589
33	NC_016781	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287589
34	NC_016781	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287589
35	NC_016781	CGT	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287589
36	NC_016781	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287589
37	NC_016781	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287589
38	NC_016781	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287590
39	NC_016781	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287590
40	NC_016781	TGC	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287590
41	NC_016781	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287590
42	NC_016781	ACG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287590
43	NC_016781	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287590
44	NC_016781	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287590
45	NC_016781	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287590
46	NC_016781	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287590
47	NC_016781	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287591
48	NC_016781	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
49	NC_016781	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
50	NC_016781	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287591
51	NC_016781	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287591
52	NC_016781	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287591
53	NC_016781	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
54	NC_016781	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
55	NC_016781	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
56	NC_016781	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
57	NC_016781	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
58	NC_016781	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
59	NC_016781	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287591
60	NC_016781	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
61	NC_016781	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
62	NC_016781	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
63	NC_016781	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287591
64	NC_016781	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287591
65	NC_016781	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
66	NC_016781	GGT	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287591
67	NC_016781	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287591
68	NC_016781	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
69	NC_016781	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287591
70	NC_016781	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
71	NC_016781	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287591
72	NC_016781	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287591
73	NC_016781	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287591
74	NC_016781	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287591
75	NC_016781	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
76	NC_016781	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
77	NC_016781	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287591
78	NC_016781	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287591
79	NC_016781	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287592
80	NC_016781	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287592
81	NC_016781	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287592
82	NC_016781	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287592
83	NC_016781	CTG	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
84	NC_016781	GGA	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287593
85	NC_016781	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287593
86	NC_016781	CTG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
87	NC_016781	TGC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
88	NC_016781	GTC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287593
89	NC_016781	GCG	2	6	8721	8726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287594
90	NC_016781	TGA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287594
91	NC_016781	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
92	NC_016781	GCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287595
93	NC_016781	GAG	2	6	9140	9145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287595
94	NC_016781	CCG	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287595
95	NC_016781	ACG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
96	NC_016781	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287595
97	NC_016781	TTC	2	6	9570	9575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287595
98	NC_016781	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287595
99	NC_016781	TCT	2	6	9678	9683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287595
100	NC_016781	GAA	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
101	NC_016781	TGC	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
102	NC_016781	TTA	2	6	10162	10167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287595
103	NC_016781	TCG	2	6	10195	10200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
104	NC_016781	GAA	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
105	NC_016781	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
106	NC_016781	AGA	2	6	10419	10424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
107	NC_016781	CGT	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
108	NC_016781	ATT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287595
109	NC_016781	GAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
110	NC_016781	GTG	3	9	10619	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287595
111	NC_016781	CGT	2	6	10685	10690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
112	NC_016781	CTT	2	6	10744	10749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287595
113	NC_016781	AAG	2	6	10970	10975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
114	NC_016781	GGT	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287595
115	NC_016781	GAA	2	6	11036	11041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
116	NC_016781	ATG	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287595
117	NC_016781	GCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
118	NC_016781	GAA	2	6	11099	11104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287595
119	NC_016781	TGA	3	9	11128	11136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287595
120	NC_016781	CGA	2	6	11194	11199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
121	NC_016781	GCT	2	6	11203	11208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287595
122	NC_016781	TCT	2	6	11239	11244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287595
123	NC_016781	GGC	2	6	11258	11263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287595
124	NC_016781	CAG	2	6	11297	11302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287595
125	NC_016781	GTG	2	6	11307	11312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287595
126	NC_016781	GGT	2	6	11368	11373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287595
127	NC_016781	TGA	2	6	11377	11382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287595
128	NC_016781	CCA	2	6	11463	11468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287595
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251	NC_016781	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287608
252	NC_016781	AGC	3	9	21988	21996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287608
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372	NC_016781	TGA	2	6	31718	31723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287619
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499	NC_016781	CGA	2	6	40018	40023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287625
500	NC_016781	TGC	2	6	40036	40041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287625

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