MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 37704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016781	GCT	2	6	239284	239289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287810
4002	NC_016781	ACA	2	6	239335	239340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287810
4003	NC_016781	CGA	2	6	239360	239365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287810
4004	NC_016781	AAC	2	6	239545	239550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287810
4005	NC_016781	CAC	2	6	239559	239564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287810
4006	NC_016781	CCA	2	6	239582	239587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287810
4007	NC_016781	GGT	2	6	239718	239723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287810
4008	NC_016781	GC	3	6	239764	239769	0 %	0 %	50 %	50 %	375287810
4009	NC_016781	TCT	2	6	239847	239852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287811
4010	NC_016781	GAGC	2	8	239866	239873	25 %	0 %	50 %	25 %	375287811
4011	NC_016781	GCG	2	6	239897	239902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287811
4012	NC_016781	GCG	2	6	239906	239911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287811
4013	NC_016781	GTT	2	6	239950	239955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287811
4014	NC_016781	GGC	2	6	239986	239991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287811
4015	NC_016781	CGGT	2	8	240043	240050	0 %	25 %	50 %	25 %	375287811
4016	NC_016781	TGCG	2	8	240138	240145	0 %	25 %	50 %	25 %	375287811
4017	NC_016781	GCC	2	6	240233	240238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287811
4018	NC_016781	AGA	2	6	240259	240264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287811
4019	NC_016781	C	6	6	240266	240271	0 %	0 %	0 %	100 %	375287811
4020	NC_016781	GCT	2	6	240331	240336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287811
4021	NC_016781	GCC	2	6	240345	240350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287811
4022	NC_016781	AGT	2	6	240382	240387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287811
4023	NC_016781	AGA	3	9	240418	240426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287811
4024	NC_016781	GCA	2	6	240437	240442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287811
4025	NC_016781	TCC	2	6	240446	240451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287811
4026	NC_016781	GGGC	2	8	240464	240471	0 %	0 %	75 %	25 %	375287811
4027	NC_016781	GCC	2	6	240504	240509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287811
4028	NC_016781	ACG	2	6	240627	240632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287811
4029	NC_016781	A	6	6	240743	240748	100 %	0 %	0 %	0 %	375287811
4030	NC_016781	GGA	2	6	240750	240755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287811
4031	NC_016781	CGCA	2	8	240834	240841	25 %	0 %	25 %	50 %	375287811
4032	NC_016781	GTT	2	6	241356	241361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287812
4033	NC_016781	CGG	2	6	241366	241371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287812
4034	NC_016781	GCT	2	6	241405	241410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287812
4035	NC_016781	AAG	2	6	241468	241473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287812
4036	NC_016781	GA	3	6	241498	241503	50 %	0 %	50 %	0 %	375287812
4037	NC_016781	TTTTG	2	10	241547	241556	0 %	80 %	20 %	0 %	375287813
4038	NC_016781	CTA	2	6	241600	241605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287813
4039	NC_016781	AGG	2	6	241626	241631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287813
4040	NC_016781	GA	3	6	241771	241776	50 %	0 %	50 %	0 %	375287814
4041	NC_016781	ATT	2	6	241819	241824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287814
4042	NC_016781	T	6	6	241823	241828	0 %	100 %	0 %	0 %	375287814
4043	NC_016781	CGC	2	6	241929	241934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287814
4044	NC_016781	TGCC	2	8	241953	241960	0 %	25 %	25 %	50 %	375287814
4045	NC_016781	CTT	2	6	241974	241979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287814
4046	NC_016781	GAT	2	6	242014	242019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287814
4047	NC_016781	GTT	2	6	242149	242154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287814
4048	NC_016781	AGA	2	6	242160	242165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287814
4049	NC_016781	ATTGTC	2	12	242194	242205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375287814
4050	NC_016781	TTC	2	6	242269	242274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287814
4051	NC_016781	TGC	2	6	242307	242312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4052	NC_016781	GGA	2	6	242386	242391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287814
4053	NC_016781	GAG	2	6	242468	242473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287814
4054	NC_016781	CTT	2	6	242514	242519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287814
4055	NC_016781	TAA	2	6	242541	242546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287814
4056	NC_016781	TG	3	6	242593	242598	0 %	50 %	50 %	0 %	375287814
4057	NC_016781	GC	3	6	242633	242638	0 %	0 %	50 %	50 %	375287814
4058	NC_016781	TG	3	6	242648	242653	0 %	50 %	50 %	0 %	375287814
4059	NC_016781	TGC	2	6	242742	242747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4060	NC_016781	GAG	2	6	242840	242845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287814
4061	NC_016781	GCT	2	6	242964	242969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4062	NC_016781	GAG	2	6	242989	242994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287814
4063	NC_016781	AGC	2	6	243022	243027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4064	NC_016781	CGT	3	9	243156	243164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4065	NC_016781	GTA	2	6	243221	243226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287814
4066	NC_016781	AAG	2	6	243241	243246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287814
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4068	NC_016781	GGA	2	6	243268	243273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287814
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4070	NC_016781	CGT	2	6	243356	243361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287814
4071	NC_016781	CAG	2	6	243609	243614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287815
4072	NC_016781	TAT	2	6	243688	243693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287815
4073	NC_016781	CGG	2	6	243859	243864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287815
4074	NC_016781	CG	3	6	243922	243927	0 %	0 %	50 %	50 %	375287815
4075	NC_016781	AGT	2	6	243928	243933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287815
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4077	NC_016781	GCA	2	6	244040	244045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287815
4078	NC_016781	CAT	2	6	244117	244122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287815
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4080	NC_016781	GCA	2	6	244515	244520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287816
4081	NC_016781	GC	3	6	244592	244597	0 %	0 %	50 %	50 %	375287816
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4085	NC_016781	CGCT	2	8	244790	244797	0 %	25 %	25 %	50 %	375287816
4086	NC_016781	AGC	2	6	244822	244827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287816
4087	NC_016781	TTC	2	6	244888	244893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287816
4088	NC_016781	GCCAT	2	10	244904	244913	20 %	20 %	20 %	40 %	375287816
4089	NC_016781	ACT	2	6	244928	244933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287816
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4091	NC_016781	CGT	2	6	245058	245063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287816
4092	NC_016781	CTG	2	6	245185	245190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287816
4093	NC_016781	TGA	2	6	245205	245210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287816
4094	NC_016781	CCTG	2	8	245228	245235	0 %	25 %	25 %	50 %	375287816
4095	NC_016781	TAG	2	6	245255	245260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287816
4096	NC_016781	ATC	2	6	245261	245266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287816
4097	NC_016781	GCT	2	6	245289	245294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287816
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4099	NC_016781	CCTT	2	8	245369	245376	0 %	50 %	0 %	50 %	375287817
4100	NC_016781	GTG	2	6	245387	245392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287817
4101	NC_016781	GCCT	2	8	245691	245698	0 %	25 %	25 %	50 %	375287817
4102	NC_016781	ACC	2	6	245711	245716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287817
4103	NC_016781	GA	3	6	245721	245726	50 %	0 %	50 %	0 %	375287817
4104	NC_016781	TGCG	2	8	245730	245737	0 %	25 %	50 %	25 %	375287817
4105	NC_016781	CAC	2	6	245779	245784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287817
4106	NC_016781	CAG	2	6	245826	245831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287817
4107	NC_016781	CAG	2	6	245838	245843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287817
4108	NC_016781	AG	3	6	245929	245934	50 %	0 %	50 %	0 %	375287817
4109	NC_016781	AGC	2	6	245959	245964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287817
4110	NC_016781	AGC	2	6	246007	246012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287817
4111	NC_016781	GCG	2	6	246029	246034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287817
4112	NC_016781	T	6	6	246158	246163	0 %	100 %	0 %	0 %	375287817
4113	NC_016781	GGT	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287817
4114	NC_016781	TCTT	2	8	246254	246261	0 %	75 %	0 %	25 %	375287817
4115	NC_016781	AAT	2	6	246333	246338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287817
4116	NC_016781	C	6	6	246414	246419	0 %	0 %	0 %	100 %	375287817
4117	NC_016781	GATG	2	8	246702	246709	25 %	25 %	50 %	0 %	375287817
4118	NC_016781	CAT	2	6	246712	246717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287817
4119	NC_016781	TCA	2	6	246744	246749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287817
4120	NC_016781	GTT	2	6	246768	246773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287818
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4122	NC_016781	TGG	2	6	246908	246913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287818
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4355	NC_016781	TGGG	2	8	260980	260987	0 %	25 %	75 %	0 %	375287829
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4359	NC_016781	TTA	2	6	261323	261328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287829
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4361	NC_016781	CAG	2	6	261391	261396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287829
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4363	NC_016781	AAG	2	6	261454	261459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287829
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4483	NC_016781	TAC	2	6	269082	269087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287837
4484	NC_016781	ACG	2	6	269236	269241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287837
4485	NC_016781	TGCA	2	8	269271	269278	25 %	25 %	25 %	25 %	375287837
4486	NC_016781	GCTG	2	8	269287	269294	0 %	25 %	50 %	25 %	375287837
4487	NC_016781	AGC	2	6	269406	269411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287838
4488	NC_016781	CT	3	6	269431	269436	0 %	50 %	0 %	50 %	375287838
4489	NC_016781	CAC	2	6	269452	269457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287838
4490	NC_016781	CGG	2	6	269467	269472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287838
4491	NC_016781	CGC	2	6	269482	269487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287838
4492	NC_016781	CG	3	6	269504	269509	0 %	0 %	50 %	50 %	375287838
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4497	NC_016781	G	6	6	269729	269734	0 %	0 %	100 %	0 %	375287838
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4500	NC_016781	CGGGG	2	10	269922	269931	0 %	0 %	80 %	20 %	375287838

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