MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 37704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016781	GCA	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287618
502	NC_016781	CCT	2	6	31631	31636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287619
503	NC_016781	TGA	2	6	31718	31723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287619
504	NC_016781	GGAA	2	8	31726	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	375287619
505	NC_016781	GGC	2	6	31787	31792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287619
506	NC_016781	AAC	2	6	31798	31803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287619
507	NC_016781	TTC	2	6	31882	31887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287619
508	NC_016781	ACT	2	6	31942	31947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287619
509	NC_016781	TCC	2	6	31960	31965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287619
510	NC_016781	CAA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287619
511	NC_016781	TGGC	2	8	31988	31995	0 %	25 %	50 %	25 %	375287619
512	NC_016781	TGC	2	6	32020	32025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287619
513	NC_016781	GAG	2	6	32026	32031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287619
514	NC_016781	TCC	2	6	32081	32086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287619
515	NC_016781	TTG	2	6	32094	32099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287619
516	NC_016781	GTG	2	6	32186	32191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287619
517	NC_016781	GGTT	2	8	32233	32240	0 %	50 %	50 %	0 %	375287619
518	NC_016781	CTG	2	6	32251	32256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287619
519	NC_016781	CTGA	2	8	32265	32272	25 %	25 %	25 %	25 %	375287619
520	NC_016781	GTA	2	6	32300	32305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287619
521	NC_016781	GTG	2	6	32418	32423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287619
522	NC_016781	GCC	3	9	32621	32629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287619
523	NC_016781	AGG	2	6	32678	32683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287619
524	NC_016781	AAT	2	6	32725	32730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287619
525	NC_016781	GCC	2	6	32744	32749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287619
526	NC_016781	GA	3	6	32812	32817	50 %	0 %	50 %	0 %	375287619
527	NC_016781	CAC	2	6	32820	32825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287619
528	NC_016781	GAT	2	6	32914	32919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287619
529	NC_016781	GTC	2	6	33025	33030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287619
530	NC_016781	GCC	2	6	33052	33057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287619
531	NC_016781	GTC	2	6	33085	33090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287619
532	NC_016781	GC	3	6	33157	33162	0 %	0 %	50 %	50 %	375287620
533	NC_016781	GCT	2	6	33168	33173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287620
534	NC_016781	GCT	2	6	33177	33182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287620
535	NC_016781	GGC	2	6	33206	33211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287620
536	NC_016781	ACC	2	6	33218	33223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287620
537	NC_016781	TGC	2	6	33227	33232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287620
538	NC_016781	ACC	2	6	33245	33250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287620
539	NC_016781	T	6	6	33252	33257	0 %	100 %	0 %	0 %	375287620
540	NC_016781	ACC	2	6	33258	33263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287620
541	NC_016781	CAG	2	6	33352	33357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287620
542	NC_016781	CAA	2	6	33511	33516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287620
543	NC_016781	GCC	2	6	33548	33553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287620
544	NC_016781	GGAC	2	8	33589	33596	25 %	0 %	50 %	25 %	375287620
545	NC_016781	AGA	2	6	33644	33649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287620
546	NC_016781	GCT	2	6	33720	33725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287620
547	NC_016781	CTT	2	6	33811	33816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287620
548	NC_016781	TGG	2	6	33965	33970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287620
549	NC_016781	GCA	2	6	34065	34070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287620
550	NC_016781	CTA	2	6	34129	34134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287620
551	NC_016781	CTT	2	6	34177	34182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287620
552	NC_016781	CAC	2	6	34248	34253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287620
553	NC_016781	ATC	2	6	34271	34276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287620
554	NC_016781	GATA	2	8	34335	34342	50 %	25 %	25 %	0 %	375287620
555	NC_016781	GTA	2	6	34391	34396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287620
556	NC_016781	GCC	2	6	34433	34438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287620
557	NC_016781	AGG	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287620
558	NC_016781	GAA	2	6	34567	34572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287620
559	NC_016781	CCT	2	6	34617	34622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287621
560	NC_016781	AAC	2	6	34627	34632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287621
561	NC_016781	AGA	2	6	34648	34653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287621
562	NC_016781	GA	3	6	34707	34712	50 %	0 %	50 %	0 %	375287621
563	NC_016781	AAG	2	6	34729	34734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287621
564	NC_016781	GCC	2	6	34759	34764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287621
565	NC_016781	CGG	2	6	34818	34823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287621
566	NC_016781	CAC	2	6	34825	34830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287621
567	NC_016781	CGC	2	6	35061	35066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287621
568	NC_016781	GA	3	6	35091	35096	50 %	0 %	50 %	0 %	375287621
569	NC_016781	GTA	2	6	35183	35188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287621
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571	NC_016781	ACC	2	6	35198	35203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287621
572	NC_016781	TGG	2	6	35238	35243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287621
573	NC_016781	CAG	2	6	35275	35280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287621
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576	NC_016781	CAG	2	6	35452	35457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287621
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580	NC_016781	GA	3	6	35598	35603	50 %	0 %	50 %	0 %	375287621
581	NC_016781	TAC	2	6	35632	35637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287621
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583	NC_016781	TAAC	2	8	35724	35731	50 %	25 %	0 %	25 %	375287621
584	NC_016781	CAAG	2	8	35928	35935	50 %	0 %	25 %	25 %	375287621
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587	NC_016781	GA	3	6	36014	36019	50 %	0 %	50 %	0 %	375287622
588	NC_016781	CCGGCT	2	12	36024	36035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375287622
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592	NC_016781	CTC	2	6	36133	36138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287622
593	NC_016781	GCA	2	6	36174	36179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287622
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595	NC_016781	TGC	2	6	36203	36208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287622
596	NC_016781	CGT	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287622
597	NC_016781	GA	3	6	36323	36328	50 %	0 %	50 %	0 %	375287622
598	NC_016781	CAGG	2	8	36343	36350	25 %	0 %	50 %	25 %	375287622
599	NC_016781	CGC	2	6	36399	36404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287622
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601	NC_016781	TAA	2	6	36455	36460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287622
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604	NC_016781	AAG	2	6	36517	36522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287622
605	NC_016781	TGA	2	6	36525	36530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287622
606	NC_016781	GCCC	2	8	36532	36539	0 %	0 %	25 %	75 %	375287622
607	NC_016781	TCT	2	6	36561	36566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287622
608	NC_016781	G	6	6	36577	36582	0 %	0 %	100 %	0 %	375287622
609	NC_016781	CTG	2	6	36612	36617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287622
610	NC_016781	GT	3	6	36623	36628	0 %	50 %	50 %	0 %	375287622
611	NC_016781	CG	3	6	36633	36638	0 %	0 %	50 %	50 %	375287622
612	NC_016781	TGGC	2	8	36652	36659	0 %	25 %	50 %	25 %	375287622
613	NC_016781	GCC	2	6	36662	36667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287622
614	NC_016781	GTT	2	6	36717	36722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287622
615	NC_016781	CTG	2	6	36738	36743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287622
616	NC_016781	GTC	2	6	36769	36774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287622
617	NC_016781	CCA	2	6	36824	36829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287622
618	NC_016781	CGG	2	6	36867	36872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287622
619	NC_016781	AG	3	6	36922	36927	50 %	0 %	50 %	0 %	375287622
620	NC_016781	GGC	2	6	36996	37001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287622
621	NC_016781	CTA	2	6	37074	37079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287622
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627	NC_016781	ATC	2	6	37343	37348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287622
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