MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 1632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	GAAAAT	2	12	2850	2861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294495
2	NC_016627	GAAATA	2	12	5619	5630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294499
3	NC_016627	ATTGAT	2	12	7927	7938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294500
4	NC_016627	CAAAAT	2	12	9777	9788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294502
5	NC_016627	AAATTA	2	12	13932	13943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294505
6	NC_016627	TATTGG	2	12	18807	18818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374294507
7	NC_016627	TTTTGC	2	12	25296	25307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	374294511
8	NC_016627	TGCTCC	2	12	29704	29715	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294514
9	NC_016627	AATATA	2	12	30036	30047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294514
10	NC_016627	ATATGT	2	12	30946	30957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294514
11	NC_016627	TTTATT	2	12	32023	32034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374294516
12	NC_016627	TAAATA	2	12	38035	38046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294521
13	NC_016627	TGGAAA	2	12	40373	40384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294524
14	NC_016627	CTTGAA	2	12	42360	42371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374294526
15	NC_016627	TGATAA	2	12	43818	43829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294528
16	NC_016627	AAGTAT	2	12	49350	49361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294532
17	NC_016627	GAAAAA	2	12	51100	51111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374294533
18	NC_016627	GTGGAT	2	12	57983	57994	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374294537
19	NC_016627	TTTTCA	2	12	58614	58625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374294538
20	NC_016627	TTTCTT	2	12	71259	71270	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374294549
21	NC_016627	AAATTG	2	12	72027	72038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294550
22	NC_016627	CAAATA	2	12	75279	75290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294552
23	NC_016627	ATAAAA	2	12	77238	77249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374294554
24	NC_016627	AATACA	2	12	80327	80338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294557
25	NC_016627	ATTTAT	2	12	85597	85608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294564
26	NC_016627	TATTGT	2	12	102172	102183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374294575
27	NC_016627	AAAGTA	2	12	105865	105876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294578
28	NC_016627	TGTTTG	2	12	108329	108340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294580
29	NC_016627	TGAGGA	2	12	108360	108371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374294580
30	NC_016627	TTTCAT	2	12	116612	116623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374294592
31	NC_016627	ATTTCC	2	12	121010	121021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374294596
32	NC_016627	TAACGG	2	12	129370	129381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294603
33	NC_016627	TCTATA	2	12	129684	129695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374294603
34	NC_016627	GATATA	2	12	139089	139100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294611
35	NC_016627	GGAAAA	2	12	141342	141353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294612
36	NC_016627	AATGCC	2	12	143153	143164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294615
37	NC_016627	AAAAGC	2	12	152936	152947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374294621
38	NC_016627	GATATT	2	12	159443	159454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294627
39	NC_016627	CCTGAA	2	12	162299	162310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294630
40	NC_016627	CAAGAG	2	12	162511	162522	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374294631
41	NC_016627	TTGCAG	2	12	166652	166663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294636
42	NC_016627	AAATTT	2	12	180817	180828	50 %	50 %	0 %	0 %	374294656
43	NC_016627	GGCTTT	2	12	182023	182034	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374294657
44	NC_016627	AAAGAG	2	12	187183	187194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294662
45	NC_016627	GGAAAG	2	12	189179	189190	50 %	0 %	50 %	0 %	374294663
46	NC_016627	ACTTTG	2	12	193299	193310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374294667
47	NC_016627	CCAGAC	2	12	194714	194725	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374294667
48	NC_016627	GTTACA	2	12	196042	196053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374294668
49	NC_016627	GTTATT	2	12	197296	197307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374294669
50	NC_016627	GGATTA	2	12	202898	202909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294674
51	NC_016627	TTAAAT	2	12	203681	203692	50 %	50 %	0 %	0 %	374294675
52	NC_016627	AAGAAA	2	12	204968	204979	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374294675
53	NC_016627	ACAAAT	2	12	206190	206201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294676
54	NC_016627	TTAGAA	2	12	207895	207906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294678
55	NC_016627	AGGCAT	2	12	209296	209307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294680
56	NC_016627	TCTATC	2	12	209682	209693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374294681
57	NC_016627	TTTACG	2	12	210936	210947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374294682
58	NC_016627	GATAAT	2	12	221133	221144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294689
59	NC_016627	AGTTAA	2	12	226710	226721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294690
60	NC_016627	GAATAT	2	12	227181	227192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294691
61	NC_016627	ATTCCA	2	12	228750	228761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294694
62	NC_016627	AAGGAG	2	12	228941	228952	50 %	0 %	50 %	0 %	374294694
63	NC_016627	GTGAAA	2	12	232947	232958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294700
64	NC_016627	CAAGAG	2	12	239136	239147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374294709
65	NC_016627	AACTTC	2	12	240690	240701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294711
66	NC_016627	ATTTTT	2	12	247047	247058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374294719
67	NC_016627	TAATTG	2	12	249595	249606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294721
68	NC_016627	AAATAT	2	12	249833	249844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294721
69	NC_016627	TGATTC	2	12	254629	254640	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374294726
70	NC_016627	AAATAT	2	12	255965	255976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294726
71	NC_016627	AACTAA	2	12	256107	256118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294726
72	NC_016627	AGGAAC	2	12	264205	264216	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374294729
73	NC_016627	ATAAAG	2	12	265144	265155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294729
74	NC_016627	TAAAGA	2	12	266241	266252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294730
75	NC_016627	TGCTTC	2	12	266319	266330	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294730
76	NC_016627	TGAAGA	2	12	272131	272142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294737
77	NC_016627	ATGGGT	2	12	283064	283075	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374294748
78	NC_016627	TGAAAG	2	12	285210	285221	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294751
79	NC_016627	ATAAAG	2	12	286943	286954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294751
80	NC_016627	GCATTG	2	12	294366	294377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374294755
81	NC_016627	GATAGC	2	12	295292	295303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374294756
82	NC_016627	AAATGC	2	12	297998	298009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374294756
83	NC_016627	AAAAGT	2	12	298871	298882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294756
84	NC_016627	AGTAAT	2	12	301030	301041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294758
85	NC_016627	AATGGA	2	12	312040	312051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294771
86	NC_016627	TCAAAA	2	12	316852	316863	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294776
87	NC_016627	GGAAGA	2	12	319150	319161	50 %	0 %	50 %	0 %	374294777
88	NC_016627	TGTTCC	2	12	319315	319326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374294777
89	NC_016627	TTAATG	2	12	319341	319352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294777
90	NC_016627	ATATAA	2	12	323790	323801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294778
91	NC_016627	AAATAA	2	12	326276	326287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374294779
92	NC_016627	GCAAAA	2	12	327951	327962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374294780
93	NC_016627	AATAAA	2	12	328857	328868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374294781
94	NC_016627	TGATTA	2	12	329755	329766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294782
95	NC_016627	CATAAA	2	12	333507	333518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374294784
96	NC_016627	AATGGG	2	12	340489	340500	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374294792
97	NC_016627	AGATAT	2	12	342779	342790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294794
98	NC_016627	TTGTAA	2	12	343120	343131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294794
99	NC_016627	AAAAGC	2	12	346530	346541	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374294797
100	NC_016627	ATCAAG	2	12	346758	346769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374294797
101	NC_016627	ATGTTT	2	12	347340	347351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374294798
102	NC_016627	ATGTAA	2	12	351067	351078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374294799
103	NC_016627	GGCTTT	2	12	351254	351265	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374294799
104	NC_016627	GAATAA	2	12	351722	351733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294800
105	NC_016627	AAAGTA	2	12	352308	352319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294800
106	NC_016627	CAACAG	2	12	353883	353894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	374294802
107	NC_016627	TTAACA	2	12	364229	364240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374294813
108	NC_016627	TTGTTT	2	12	365161	365172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374294814
109	NC_016627	AAATTA	2	12	367123	367134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294815
110	NC_016627	TTTTAA	2	12	374220	374231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294820
111	NC_016627	GAAAAA	2	12	376502	376513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374294822
112	NC_016627	CTTTTA	2	12	379136	379147	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374294824
113	NC_016627	CATTGT	2	12	381094	381105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374294825
114	NC_016627	TTTCTT	2	12	382736	382747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374294826
115	NC_016627	TTTCTT	2	12	387793	387804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374294830
116	NC_016627	ATAAAA	2	12	393618	393629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374294835
117	NC_016627	AATGGA	2	12	393753	393764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294835
118	NC_016627	TTTGAT	2	12	394230	394241	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374294836
119	NC_016627	GAAGTA	2	12	403499	403510	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294841
120	NC_016627	GAAGTA	2	12	404072	404083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294841
121	NC_016627	CCGATA	2	12	404807	404818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374294841
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229	NC_016627	GGAAAG	2	12	708917	708928	50 %	0 %	50 %	0 %	374295060
230	NC_016627	ACACCA	2	12	710276	710287	50 %	0 %	0 %	50 %	374295060
231	NC_016627	ATTTAA	2	12	725145	725156	50 %	50 %	0 %	0 %	374295068
232	NC_016627	ATATGT	2	12	728777	728788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374295069
233	NC_016627	TGAAGC	2	12	728840	728851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374295069
234	NC_016627	CAATAA	2	12	733678	733689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374295071
235	NC_016627	TTATGT	2	12	733784	733795	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374295071
236	NC_016627	TGAAAA	2	12	734072	734083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374295072
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