MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 83295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016627	AT	3	6	25649	25654	50 %	50 %	0 %	0 %	374294511
502	NC_016627	TGCCT	2	10	25655	25664	0 %	40 %	20 %	40 %	374294511
503	NC_016627	TTA	3	9	25771	25779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294511
504	NC_016627	T	6	6	25781	25786	0 %	100 %	0 %	0 %	374294511
505	NC_016627	T	6	6	25822	25827	0 %	100 %	0 %	0 %	374294511
506	NC_016627	ATT	2	6	25848	25853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294511
507	NC_016627	AATA	2	8	25901	25908	75 %	25 %	0 %	0 %	374294511
508	NC_016627	T	7	7	25961	25967	0 %	100 %	0 %	0 %	374294511
509	NC_016627	AG	3	6	26528	26533	50 %	0 %	50 %	0 %	374294512
510	NC_016627	ATA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294512
511	NC_016627	ATG	2	6	26768	26773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294512
512	NC_016627	A	6	6	26785	26790	100 %	0 %	0 %	0 %	374294512
513	NC_016627	TA	3	6	27146	27151	50 %	50 %	0 %	0 %	374294513
514	NC_016627	AAT	2	6	27157	27162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294513
515	NC_016627	GAA	2	6	27180	27185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294513
516	NC_016627	AGT	2	6	27205	27210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294513
517	NC_016627	AGG	2	6	27238	27243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294513
518	NC_016627	T	7	7	27277	27283	0 %	100 %	0 %	0 %	374294513
519	NC_016627	TTTG	2	8	27348	27355	0 %	75 %	25 %	0 %	374294513
520	NC_016627	ATA	2	6	27356	27361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294513
521	NC_016627	AT	3	6	27370	27375	50 %	50 %	0 %	0 %	374294513
522	NC_016627	CAAT	2	8	27833	27840	50 %	25 %	0 %	25 %	374294514
523	NC_016627	GCT	3	9	27854	27862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
524	NC_016627	TGC	2	6	27889	27894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
525	NC_016627	GCT	2	6	27950	27955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
526	NC_016627	GTT	2	6	27989	27994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
527	NC_016627	TGC	2	6	28015	28020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
528	NC_016627	TGC	2	6	28042	28047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
529	NC_016627	GCC	2	6	28215	28220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294514
530	NC_016627	GAA	2	6	28305	28310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
531	NC_016627	A	6	6	28359	28364	100 %	0 %	0 %	0 %	374294514
532	NC_016627	AT	3	6	28485	28490	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
533	NC_016627	TAT	2	6	28520	28525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294514
534	NC_016627	TTG	2	6	28542	28547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
535	NC_016627	TAA	2	6	28567	28572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294514
536	NC_016627	TTG	2	6	28635	28640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
537	NC_016627	GAA	2	6	28667	28672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
538	NC_016627	TTA	2	6	28713	28718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294514
539	NC_016627	ATG	2	6	28878	28883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294514
540	NC_016627	CTC	2	6	28926	28931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294514
541	NC_016627	CAT	2	6	28932	28937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294514
542	NC_016627	AAG	2	6	28964	28969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
543	NC_016627	ATC	2	6	29138	29143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294514
544	NC_016627	AT	3	6	29161	29166	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
545	NC_016627	TTA	2	6	29254	29259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294514
546	NC_016627	TA	3	6	29258	29263	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
547	NC_016627	TTG	2	6	29277	29282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
548	NC_016627	TGA	2	6	29374	29379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294514
549	NC_016627	CCA	2	6	29388	29393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294514
550	NC_016627	AT	3	6	29416	29421	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
551	NC_016627	ACA	2	6	29427	29432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294514
552	NC_016627	TA	3	6	29442	29447	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
553	NC_016627	TTC	2	6	29505	29510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294514
554	NC_016627	TTC	2	6	29519	29524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294514
555	NC_016627	AT	3	6	29563	29568	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
556	NC_016627	AGC	2	6	29575	29580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294514
557	NC_016627	GAA	2	6	29581	29586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
558	NC_016627	TGT	2	6	29611	29616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
559	NC_016627	TGCTCC	2	12	29704	29715	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374294514
560	NC_016627	GTC	2	6	29727	29732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
561	NC_016627	ATGG	2	8	29780	29787	25 %	25 %	50 %	0 %	374294514
562	NC_016627	TCCG	2	8	29952	29959	0 %	25 %	25 %	50 %	374294514
563	NC_016627	GAA	2	6	29975	29980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
564	NC_016627	GCT	2	6	29987	29992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
565	NC_016627	AATATA	2	12	30036	30047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294514
566	NC_016627	AGC	2	6	30150	30155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294514
567	NC_016627	ATT	2	6	30165	30170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294514
568	NC_016627	CTG	2	6	30204	30209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
569	NC_016627	CTT	2	6	30245	30250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294514
570	NC_016627	GTT	2	6	30310	30315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
571	NC_016627	TA	3	6	30329	30334	50 %	50 %	0 %	0 %	374294514
572	NC_016627	GTT	2	6	30348	30353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294514
573	NC_016627	CTG	2	6	30372	30377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
574	NC_016627	TAAA	2	8	30396	30403	75 %	25 %	0 %	0 %	374294514
575	NC_016627	CCTG	2	8	30419	30426	0 %	25 %	25 %	50 %	374294514
576	NC_016627	GTAT	2	8	30468	30475	25 %	50 %	25 %	0 %	374294514
577	NC_016627	AGC	2	6	30526	30531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294514
578	NC_016627	GAA	2	6	30548	30553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
579	NC_016627	ATA	2	6	30591	30596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294514
580	NC_016627	GCT	2	6	30647	30652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
581	NC_016627	AAG	2	6	30675	30680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294514
582	NC_016627	TGG	2	6	30727	30732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294514
583	NC_016627	GGT	2	6	30761	30766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294514
584	NC_016627	GACA	2	8	30843	30850	50 %	0 %	25 %	25 %	374294514
585	NC_016627	TGC	2	6	30886	30891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
586	NC_016627	ATATGT	2	12	30946	30957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374294514
587	NC_016627	ATT	2	6	31040	31045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294514
588	NC_016627	ATGAA	2	10	31101	31110	60 %	20 %	20 %	0 %	374294514
589	NC_016627	A	6	6	31109	31114	100 %	0 %	0 %	0 %	374294514
590	NC_016627	TCT	2	6	31140	31145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294514
591	NC_016627	TCT	2	6	31193	31198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294514
592	NC_016627	GCT	2	6	31310	31315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294514
593	NC_016627	TAA	2	6	31357	31362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294514
594	NC_016627	A	7	7	31527	31533	100 %	0 %	0 %	0 %	374294515
595	NC_016627	A	6	6	31557	31562	100 %	0 %	0 %	0 %	374294515
596	NC_016627	A	6	6	31597	31602	100 %	0 %	0 %	0 %	374294515
597	NC_016627	T	6	6	31603	31608	0 %	100 %	0 %	0 %	374294515
598	NC_016627	TTAT	2	8	31904	31911	25 %	75 %	0 %	0 %	374294516
599	NC_016627	TTC	2	6	31963	31968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294516
600	NC_016627	TTTATT	2	12	32023	32034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374294516
601	NC_016627	GGT	2	6	32047	32052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294516
602	NC_016627	T	6	6	32054	32059	0 %	100 %	0 %	0 %	374294516
603	NC_016627	ATG	2	6	32075	32080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294516
604	NC_016627	ACAA	2	8	32084	32091	75 %	0 %	0 %	25 %	374294516
605	NC_016627	AT	3	6	32098	32103	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
606	NC_016627	A	7	7	32186	32192	100 %	0 %	0 %	0 %	374294516
607	NC_016627	TACT	2	8	32199	32206	25 %	50 %	0 %	25 %	374294516
608	NC_016627	AAT	2	6	32221	32226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294516
609	NC_016627	TA	3	6	32230	32235	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
610	NC_016627	T	8	8	32243	32250	0 %	100 %	0 %	0 %	374294516
611	NC_016627	CTTT	2	8	32257	32264	0 %	75 %	0 %	25 %	374294516
612	NC_016627	ATT	2	6	32303	32308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294516
613	NC_016627	AT	3	6	32368	32373	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
614	NC_016627	TTGC	2	8	32384	32391	0 %	50 %	25 %	25 %	374294516
615	NC_016627	TTA	2	6	32430	32435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294516
616	NC_016627	AAT	2	6	32464	32469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294516
617	NC_016627	TAA	2	6	32491	32496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294516
618	NC_016627	TAAT	2	8	32517	32524	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
619	NC_016627	AT	4	8	32523	32530	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
620	NC_016627	TTC	2	6	32542	32547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294516
621	NC_016627	TAT	2	6	32559	32564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294516
622	NC_016627	TGC	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294516
623	NC_016627	AT	3	6	32599	32604	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
624	NC_016627	TTA	2	6	32613	32618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294516
625	NC_016627	T	8	8	32621	32628	0 %	100 %	0 %	0 %	374294516
626	NC_016627	A	7	7	32638	32644	100 %	0 %	0 %	0 %	374294516
627	NC_016627	ATT	2	6	32728	32733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294516
628	NC_016627	TTTTA	2	10	32943	32952	20 %	80 %	0 %	0 %	374294517
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