MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	GGGTG	2	10	39	48	0 %	20 %	80 %	0 %	347755962
2	NC_016025	TGACC	2	10	249	258	20 %	20 %	20 %	40 %	347755962
3	NC_016025	CCGGC	2	10	319	328	0 %	0 %	40 %	60 %	347755962
4	NC_016025	CGGCG	2	10	1413	1422	0 %	0 %	60 %	40 %	347755964
5	NC_016025	GGCAG	2	10	9336	9345	20 %	0 %	60 %	20 %	347755969
6	NC_016025	CCCTG	2	10	9802	9811	0 %	20 %	20 %	60 %	347755969
7	NC_016025	AGGGC	2	10	10858	10867	20 %	0 %	60 %	20 %	347755969
8	NC_016025	TGGCC	2	10	11113	11122	0 %	20 %	40 %	40 %	347755969
9	NC_016025	TCGGT	2	10	12909	12918	0 %	40 %	40 %	20 %	347755969
10	NC_016025	GCCAG	2	10	17875	17884	20 %	0 %	40 %	40 %	347755972
11	NC_016025	TGGCG	2	10	19252	19261	0 %	20 %	60 %	20 %	347755974
12	NC_016025	TGGGA	2	10	20192	20201	20 %	20 %	60 %	0 %	347755975
13	NC_016025	TCCGT	2	10	20609	20618	0 %	40 %	20 %	40 %	347755975
14	NC_016025	GGCGC	2	10	22508	22517	0 %	0 %	60 %	40 %	347755976
15	NC_016025	CGGCG	2	10	24001	24010	0 %	0 %	60 %	40 %	347755978
16	NC_016025	CGACT	2	10	24784	24793	20 %	20 %	20 %	40 %	347755978
17	NC_016025	CGACA	2	10	25691	25700	40 %	0 %	20 %	40 %	347755979
18	NC_016025	CGCGG	2	10	26027	26036	0 %	0 %	60 %	40 %	347755979
19	NC_016025	AAGCC	2	10	27634	27643	40 %	0 %	20 %	40 %	347755981
20	NC_016025	GCTGG	2	10	29237	29246	0 %	20 %	60 %	20 %	347755982
21	NC_016025	GCCAG	2	10	29890	29899	20 %	0 %	40 %	40 %	347755983
22	NC_016025	CACGC	2	10	30513	30522	20 %	0 %	20 %	60 %	347755984
23	NC_016025	GCAAC	2	10	32245	32254	40 %	0 %	20 %	40 %	347755985
24	NC_016025	TCAGC	2	10	32964	32973	20 %	20 %	20 %	40 %	347755986
25	NC_016025	GGGCA	2	10	36888	36897	20 %	0 %	60 %	20 %	347755990
26	NC_016025	ATGGC	2	10	37094	37103	20 %	20 %	40 %	20 %	347755990
27	NC_016025	CGGCT	2	10	39112	39121	0 %	20 %	40 %	40 %	347755991
28	NC_016025	TGACC	2	10	40468	40477	20 %	20 %	20 %	40 %	347755991
29	NC_016025	ACGCC	2	10	42493	42502	20 %	0 %	20 %	60 %	347755992
30	NC_016025	CCGGC	2	10	43634	43643	0 %	0 %	40 %	60 %	347755993
31	NC_016025	CCTGG	2	10	44771	44780	0 %	20 %	40 %	40 %	347755993
32	NC_016025	AGCGC	2	10	52142	52151	20 %	0 %	40 %	40 %	347755998
33	NC_016025	GCCAT	2	10	52351	52360	20 %	20 %	20 %	40 %	347755998
34	NC_016025	CCGTC	2	10	54625	54634	0 %	20 %	20 %	60 %	347756000
35	NC_016025	CTGCG	2	10	55850	55859	0 %	20 %	40 %	40 %	347756000
36	NC_016025	TGGGC	2	10	57624	57633	0 %	20 %	60 %	20 %	347756000
37	NC_016025	GGAAG	2	10	57718	57727	40 %	0 %	60 %	0 %	347756000
38	NC_016025	GCCGG	2	10	58823	58832	0 %	0 %	60 %	40 %	347756000
39	NC_016025	TCACG	2	10	62335	62344	20 %	20 %	20 %	40 %	347756004
40	NC_016025	CGGCG	2	10	68280	68289	0 %	0 %	60 %	40 %	347756007
41	NC_016025	ATTCT	2	10	72201	72210	20 %	60 %	0 %	20 %	347756010
42	NC_016025	TCTTT	2	10	74021	74030	0 %	80 %	0 %	20 %	347756012
43	NC_016025	CTGCT	2	10	74705	74714	0 %	40 %	20 %	40 %	347756012
44	NC_016025	GTACA	2	10	75069	75078	40 %	20 %	20 %	20 %	347756013
45	NC_016025	GCCGT	2	10	76127	76136	0 %	20 %	40 %	40 %	347756013
46	NC_016025	GGCGT	2	10	76335	76344	0 %	20 %	60 %	20 %	347756013
47	NC_016025	GCGGG	2	10	80206	80215	0 %	0 %	80 %	20 %	347756016
48	NC_016025	CGCCA	2	10	82054	82063	20 %	0 %	20 %	60 %	347756018
49	NC_016025	AGCGC	2	10	82958	82967	20 %	0 %	40 %	40 %	347756018
50	NC_016025	GCCCC	2	10	84010	84019	0 %	0 %	20 %	80 %	347756020
51	NC_016025	CGGGA	2	10	84242	84251	20 %	0 %	60 %	20 %	347756020
52	NC_016025	TTGGG	2	10	85967	85976	0 %	40 %	60 %	0 %	347756022
53	NC_016025	CCGGG	2	10	87685	87694	0 %	0 %	60 %	40 %	347756024
54	NC_016025	CGGCG	2	10	88969	88978	0 %	0 %	60 %	40 %	347756025
55	NC_016025	CAACC	2	10	90682	90691	40 %	0 %	0 %	60 %	347756026
56	NC_016025	GGCTG	2	10	92994	93003	0 %	20 %	60 %	20 %	347756030
57	NC_016025	CGGCG	2	10	93255	93264	0 %	0 %	60 %	40 %	347756030
58	NC_016025	TGGGC	2	10	93606	93615	0 %	20 %	60 %	20 %	347756030
59	NC_016025	CAGCC	2	10	97741	97750	20 %	0 %	20 %	60 %	347756036
60	NC_016025	GGACG	2	10	98441	98450	20 %	0 %	60 %	20 %	347756036
61	NC_016025	GGTTG	2	10	99116	99125	0 %	40 %	60 %	0 %	347756036
62	NC_016025	CGCCA	2	10	102979	102988	20 %	0 %	20 %	60 %	347756038
63	NC_016025	GACCG	2	10	103160	103169	20 %	0 %	40 %	40 %	347756038
64	NC_016025	ATGAG	2	10	106163	106172	40 %	20 %	40 %	0 %	347756041
65	NC_016025	AGCTG	2	10	108523	108532	20 %	20 %	40 %	20 %	347756043
66	NC_016025	GTTCC	2	10	109716	109725	0 %	40 %	20 %	40 %	347756044
67	NC_016025	GCGCG	2	10	109918	109927	0 %	0 %	60 %	40 %	347756045
68	NC_016025	AGTCG	2	10	110854	110863	20 %	20 %	40 %	20 %	347756046
69	NC_016025	CGGCG	2	10	112603	112612	0 %	0 %	60 %	40 %	347756049
70	NC_016025	GTTTT	2	10	112698	112707	0 %	80 %	20 %	0 %	347756049
71	NC_016025	GCCGC	2	10	113970	113979	0 %	0 %	40 %	60 %	347756050
72	NC_016025	CGGGC	2	10	118930	118939	0 %	0 %	60 %	40 %	347756054
73	NC_016025	CCGTG	2	10	120714	120723	0 %	20 %	40 %	40 %	347756054
74	NC_016025	CGATC	2	10	120927	120936	20 %	20 %	20 %	40 %	347756054
75	NC_016025	TTTGC	2	10	121264	121273	0 %	60 %	20 %	20 %	347756054
76	NC_016025	GTCAC	2	10	123024	123033	20 %	20 %	20 %	40 %	347756055
77	NC_016025	GTTGG	2	10	123158	123167	0 %	40 %	60 %	0 %	347756056
78	NC_016025	CATCG	2	10	127266	127275	20 %	20 %	20 %	40 %	347756058
79	NC_016025	CGAAA	2	10	127610	127619	60 %	0 %	20 %	20 %	347756058
80	NC_016025	AAGCC	2	10	134266	134275	40 %	0 %	20 %	40 %	347756067
81	NC_016025	CGGCG	2	10	138093	138102	0 %	0 %	60 %	40 %	347756071
82	NC_016025	AAGCC	2	10	138618	138627	40 %	0 %	20 %	40 %	347756072
83	NC_016025	CGGGC	2	10	142360	142369	0 %	0 %	60 %	40 %	347756074
84	NC_016025	GGACA	2	10	142759	142768	40 %	0 %	40 %	20 %	347756074
85	NC_016025	TTTCA	2	10	143620	143629	20 %	60 %	0 %	20 %	347756075
86	NC_016025	CGCCA	2	10	144040	144049	20 %	0 %	20 %	60 %	347756076
87	NC_016025	ACCTC	2	10	146048	146057	20 %	20 %	0 %	60 %	347756078
88	NC_016025	CGGCA	2	10	146686	146695	20 %	0 %	40 %	40 %	347756079
89	NC_016025	TACGG	2	10	152755	152764	20 %	20 %	40 %	20 %	347756086
90	NC_016025	TTCGG	2	10	155048	155057	0 %	40 %	40 %	20 %	347756088
91	NC_016025	GGTCG	2	10	155207	155216	0 %	20 %	60 %	20 %	347756088
92	NC_016025	CGGCT	2	10	158661	158670	0 %	20 %	40 %	40 %	347756089
93	NC_016025	AGAAC	2	10	159452	159461	60 %	0 %	20 %	20 %	347756089
94	NC_016025	CGGCT	2	10	162067	162076	0 %	20 %	40 %	40 %	347756093
95	NC_016025	GTCCA	2	10	166304	166313	20 %	20 %	20 %	40 %	347756095
96	NC_016025	CGGCT	2	10	167369	167378	0 %	20 %	40 %	40 %	347756097
97	NC_016025	AGAGC	2	10	168916	168925	40 %	0 %	40 %	20 %	347756097
98	NC_016025	GTCCA	2	10	170944	170953	20 %	20 %	20 %	40 %	347756099
99	NC_016025	TCCAG	2	10	172451	172460	20 %	20 %	20 %	40 %	347756101
100	NC_016025	GGCAA	2	10	176319	176328	40 %	0 %	40 %	20 %	347756103
101	NC_016025	GAGCT	2	10	176433	176442	20 %	20 %	40 %	20 %	347756103
102	NC_016025	GAGCA	2	10	180109	180118	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
103	NC_016025	ACCTG	2	10	180821	180830	20 %	20 %	20 %	40 %	347756105
104	NC_016025	GAAGC	2	10	180892	180901	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
105	NC_016025	GCCAA	2	10	182097	182106	40 %	0 %	20 %	40 %	347756106
106	NC_016025	AGGGA	2	10	182542	182551	40 %	0 %	60 %	0 %	347756106
107	NC_016025	GGCTT	2	10	182716	182725	0 %	40 %	40 %	20 %	347756106
108	NC_016025	GCCGC	2	10	184861	184870	0 %	0 %	40 %	60 %	347756109
109	NC_016025	AGCAC	2	10	186072	186081	40 %	0 %	20 %	40 %	347756110
110	NC_016025	GGACA	2	10	187666	187675	40 %	0 %	40 %	20 %	347756110
111	NC_016025	CTGGC	2	10	187717	187726	0 %	20 %	40 %	40 %	347756110
112	NC_016025	CCGAA	2	10	187922	187931	40 %	0 %	20 %	40 %	347756110
113	NC_016025	TTTCG	2	10	189688	189697	0 %	60 %	20 %	20 %	347756110
114	NC_016025	CAGCT	2	10	190132	190141	20 %	20 %	20 %	40 %	347756110
115	NC_016025	AACCC	2	10	190162	190171	40 %	0 %	0 %	60 %	347756110
116	NC_016025	CGCAC	2	10	191545	191554	20 %	0 %	20 %	60 %	347756111
117	NC_016025	CGGCC	2	10	194747	194756	0 %	0 %	40 %	60 %	347756112
118	NC_016025	GCGCA	2	10	198469	198478	20 %	0 %	40 %	40 %	347756113
119	NC_016025	TGGCG	2	10	202213	202222	0 %	20 %	60 %	20 %	347756115
120	NC_016025	TCGGA	2	10	205469	205478	20 %	20 %	40 %	20 %	347756117
121	NC_016025	GCCGC	2	10	208632	208641	0 %	0 %	40 %	60 %	347756118
122	NC_016025	CGCTC	2	10	209571	209580	0 %	20 %	20 %	60 %	347756119
123	NC_016025	TTGAG	2	10	212494	212503	20 %	40 %	40 %	0 %	347756122
124	NC_016025	CTGAC	2	10	213718	213727	20 %	20 %	20 %	40 %	347756122
125	NC_016025	ACCCG	2	10	214105	214114	20 %	0 %	20 %	60 %	347756123
126	NC_016025	GCCTG	2	10	215942	215951	0 %	20 %	40 %	40 %	347756124
127	NC_016025	CTGAC	2	10	217774	217783	20 %	20 %	20 %	40 %	347756125
128	NC_016025	TTGGA	2	10	222856	222865	20 %	40 %	40 %	0 %	347756130
129	NC_016025	TCGCC	2	10	224374	224383	0 %	20 %	20 %	60 %	347756132
130	NC_016025	TGGGG	2	10	226304	226313	0 %	20 %	80 %	0 %	347756134
131	NC_016025	TCACT	2	10	229086	229095	20 %	40 %	0 %	40 %	347756137
132	NC_016025	ACGCC	2	10	229612	229621	20 %	0 %	20 %	60 %	347756138
133	NC_016025	GCCGG	2	10	232593	232602	0 %	0 %	60 %	40 %	347756140
134	NC_016025	AACTC	2	10	234806	234815	40 %	20 %	0 %	40 %	347756142
135	NC_016025	CGCAG	2	10	238134	238143	20 %	0 %	40 %	40 %	347756147
136	NC_016025	CGCAG	2	10	240135	240144	20 %	0 %	40 %	40 %	347756149
137	NC_016025	CGCAG	2	10	242089	242098	20 %	0 %	40 %	40 %	347756150
138	NC_016025	CACCG	2	10	242924	242933	20 %	0 %	20 %	60 %	347756151
139	NC_016025	GCTGG	2	10	247724	247733	0 %	20 %	60 %	20 %	347756156
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141	NC_016025	CTGGA	2	10	250543	250552	20 %	20 %	40 %	20 %	347756160
142	NC_016025	GGCTG	2	10	252596	252605	0 %	20 %	60 %	20 %	347756162
143	NC_016025	GCCGG	2	10	257336	257345	0 %	0 %	60 %	40 %	347756165
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152	NC_016025	CGCTG	2	10	277956	277965	0 %	20 %	40 %	40 %	347756183
153	NC_016025	GCGCC	2	10	278007	278016	0 %	0 %	40 %	60 %	347756183
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156	NC_016025	GGGGT	2	10	279767	279776	0 %	20 %	80 %	0 %	347756184
157	NC_016025	GCCGT	2	10	280811	280820	0 %	20 %	40 %	40 %	347756184
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249	NC_016025	CCGGC	2	10	392896	392905	0 %	0 %	40 %	60 %	347756279
250	NC_016025	AGGTC	2	10	398354	398363	20 %	20 %	40 %	20 %	347756283
251	NC_016025	CATCC	2	10	398721	398730	20 %	20 %	0 %	60 %	347756283
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253	NC_016025	GCACG	2	10	401714	401723	20 %	0 %	40 %	40 %	347756287
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257	NC_016025	TTGGG	2	10	404997	405006	0 %	40 %	60 %	0 %	347756290
258	NC_016025	GCACC	2	10	405535	405544	20 %	0 %	20 %	60 %	347756291
259	NC_016025	GACGT	2	10	406076	406085	20 %	20 %	40 %	20 %	347756291
260	NC_016025	GGCCG	2	10	409944	409953	0 %	0 %	60 %	40 %	347756295
261	NC_016025	GACAG	2	10	410038	410047	40 %	0 %	40 %	20 %	347756295
262	NC_016025	TCCCG	2	10	410333	410342	0 %	20 %	20 %	60 %	347756296
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389	NC_016025	ACTGT	2	10	616512	616521	20 %	40 %	20 %	20 %	347756468
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391	NC_016025	GGATG	2	10	624054	624063	20 %	20 %	60 %	0 %	347756474
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