MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 19996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016025	CCG	2	6	180084	180089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756105
3502	NC_016025	TCG	2	6	180098	180103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3503	NC_016025	GAGCA	2	10	180109	180118	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
3504	NC_016025	GAC	2	6	180169	180174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3505	NC_016025	GGC	2	6	180211	180216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756105
3506	NC_016025	CGA	2	6	180227	180232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3507	NC_016025	GCGG	2	8	180286	180293	0 %	0 %	75 %	25 %	347756105
3508	NC_016025	AAC	2	6	180352	180357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756105
3509	NC_016025	GC	3	6	180381	180386	0 %	0 %	50 %	50 %	347756105
3510	NC_016025	TCG	2	6	180461	180466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3511	NC_016025	GAC	2	6	180517	180522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3512	NC_016025	GC	3	6	180585	180590	0 %	0 %	50 %	50 %	347756105
3513	NC_016025	CAA	2	6	180591	180596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756105
3514	NC_016025	GAA	2	6	180633	180638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756105
3515	NC_016025	GATC	2	8	180657	180664	25 %	25 %	25 %	25 %	347756105
3516	NC_016025	GAG	2	6	180675	180680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756105
3517	NC_016025	TCGC	2	8	180685	180692	0 %	25 %	25 %	50 %	347756105
3518	NC_016025	GAA	2	6	180702	180707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756105
3519	NC_016025	TCC	2	6	180710	180715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347756105
3520	NC_016025	CAA	3	9	180750	180758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756105
3521	NC_016025	ACCTG	2	10	180821	180830	20 %	20 %	20 %	40 %	347756105
3522	NC_016025	TCA	2	6	180856	180861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756105
3523	NC_016025	ACC	2	6	180871	180876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347756105
3524	NC_016025	GAAGC	2	10	180892	180901	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
3525	NC_016025	GTCC	2	8	180926	180933	0 %	25 %	25 %	50 %	347756105
3526	NC_016025	GAC	2	6	180979	180984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3527	NC_016025	GC	3	6	181019	181024	0 %	0 %	50 %	50 %	347756105
3528	NC_016025	TCA	2	6	181025	181030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756105
3529	NC_016025	AAG	2	6	181079	181084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756105
3530	NC_016025	GTC	2	6	181125	181130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3531	NC_016025	ACG	2	6	181145	181150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3532	NC_016025	TGG	2	6	181157	181162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756105
3533	NC_016025	GAA	2	6	181212	181217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756105
3534	NC_016025	GCA	2	6	181223	181228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756105
3535	NC_016025	GCC	2	6	181231	181236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756105
3536	NC_016025	CAA	2	6	181237	181242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756105
3537	NC_016025	GGCG	2	8	181263	181270	0 %	0 %	75 %	25 %	347756105
3538	NC_016025	TC	3	6	181313	181318	0 %	50 %	0 %	50 %	347756106
3539	NC_016025	CCTC	2	8	181380	181387	0 %	25 %	0 %	75 %	347756106
3540	NC_016025	CTC	2	6	181398	181403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347756106
3541	NC_016025	CTA	2	6	181571	181576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756106
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3543	NC_016025	CCG	2	6	181677	181682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756106
3544	NC_016025	GC	3	6	181749	181754	0 %	0 %	50 %	50 %	347756106
3545	NC_016025	TGG	2	6	181762	181767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756106
3546	NC_016025	GCC	2	6	181778	181783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756106
3547	NC_016025	TCG	2	6	181801	181806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756106
3548	NC_016025	TCAC	2	8	181807	181814	25 %	25 %	0 %	50 %	347756106
3549	NC_016025	ACG	2	6	181842	181847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756106
3550	NC_016025	CACTAC	2	12	181848	181859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347756106
3551	NC_016025	CGG	2	6	181860	181865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756106
3552	NC_016025	GGC	2	6	181920	181925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756106
3553	NC_016025	CG	3	6	181949	181954	0 %	0 %	50 %	50 %	347756106
3554	NC_016025	TGG	2	6	181978	181983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756106
3555	NC_016025	GAG	2	6	181995	182000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756106
3556	NC_016025	CG	3	6	182077	182082	0 %	0 %	50 %	50 %	347756106
3557	NC_016025	GCCAA	2	10	182097	182106	40 %	0 %	20 %	40 %	347756106
3558	NC_016025	CGC	2	6	182142	182147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756106
3559	NC_016025	TCA	2	6	182285	182290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756106
3560	NC_016025	TAC	2	6	182298	182303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756106
3561	NC_016025	CG	3	6	182314	182319	0 %	0 %	50 %	50 %	347756106
3562	NC_016025	CGG	2	6	182360	182365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756106
3563	NC_016025	AGG	2	6	182377	182382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756106
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3565	NC_016025	GTG	2	6	182445	182450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756106
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3567	NC_016025	GCC	2	6	182522	182527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756106
3568	NC_016025	AGGGA	2	10	182542	182551	40 %	0 %	60 %	0 %	347756106
3569	NC_016025	TGG	2	6	182639	182644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756106
3570	NC_016025	GAC	2	6	182708	182713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756106
3571	NC_016025	GGCTT	2	10	182716	182725	0 %	40 %	40 %	20 %	347756106
3572	NC_016025	GAA	2	6	182826	182831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756106
3573	NC_016025	CGT	2	6	183426	183431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756107
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3578	NC_016025	GTG	2	6	184155	184160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756109
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3580	NC_016025	TCT	2	6	184244	184249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347756109
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3582	NC_016025	ACC	2	6	184387	184392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347756109
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3584	NC_016025	CGG	2	6	184471	184476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756109
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3587	NC_016025	GTC	2	6	184588	184593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756109
3588	NC_016025	GAT	2	6	184609	184614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756109
3589	NC_016025	GCG	2	6	184635	184640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756109
3590	NC_016025	CTG	2	6	184654	184659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756109
3591	NC_016025	ACC	2	6	184686	184691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347756109
3592	NC_016025	TGA	2	6	184725	184730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756109
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3594	NC_016025	CGC	2	6	184793	184798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756109
3595	NC_016025	CAGCGC	2	12	184806	184817	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347756109
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3597	NC_016025	CAG	2	6	184840	184845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756109
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3599	NC_016025	TGG	2	6	184895	184900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756109
3600	NC_016025	TCA	2	6	184931	184936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756109
3601	NC_016025	GCCC	2	8	185028	185035	0 %	0 %	25 %	75 %	347756109
3602	NC_016025	GTT	2	6	185130	185135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347756109
3603	NC_016025	GCCC	2	8	185217	185224	0 %	0 %	25 %	75 %	347756109
3604	NC_016025	CTG	2	6	185254	185259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756109
3605	NC_016025	GCTG	2	8	185310	185317	0 %	25 %	50 %	25 %	347756109
3606	NC_016025	AGA	2	6	185349	185354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756109
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3609	NC_016025	GCT	2	6	185475	185480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756109
3610	NC_016025	CGG	2	6	185528	185533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756109
3611	NC_016025	CG	4	8	185545	185552	0 %	0 %	50 %	50 %	347756109
3612	NC_016025	AGC	2	6	185636	185641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756109
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3617	NC_016025	GC	3	6	185833	185838	0 %	0 %	50 %	50 %	347756109
3618	NC_016025	CAAG	2	8	185931	185938	50 %	0 %	25 %	25 %	347756110
3619	NC_016025	T	6	6	185958	185963	0 %	100 %	0 %	0 %	347756110
3620	NC_016025	CCG	2	6	186030	186035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756110
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3985	NC_016025	TCGC	2	8	203523	203530	0 %	25 %	25 %	50 %	347756116
3986	NC_016025	GGA	2	6	203582	203587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756116
3987	NC_016025	TGC	2	6	203590	203595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756116
3988	NC_016025	GTT	3	9	203642	203650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347756116
3989	NC_016025	GCT	2	6	203660	203665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756116
3990	NC_016025	CTG	2	6	203712	203717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756116
3991	NC_016025	CTG	2	6	203763	203768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756116
3992	NC_016025	GCGG	2	8	203888	203895	0 %	0 %	75 %	25 %	347756116
3993	NC_016025	GCC	2	6	203921	203926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756116
3994	NC_016025	GTCC	2	8	203960	203967	0 %	25 %	25 %	50 %	347756116
3995	NC_016025	GACGCC	2	12	204027	204038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347756116
3996	NC_016025	GCTG	2	8	204053	204060	0 %	25 %	50 %	25 %	347756116
3997	NC_016025	GC	3	6	204144	204149	0 %	0 %	50 %	50 %	347756116
3998	NC_016025	GCG	2	6	204174	204179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756116
3999	NC_016025	G	6	6	204185	204190	0 %	0 %	100 %	0 %	347756116
4000	NC_016025	CGG	2	6	204241	204246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756116

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