MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 38511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	ATG	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753733
2	NC_016024	GAC	2	6	7	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
3	NC_016024	GAA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753733
4	NC_016024	TTG	2	6	365	370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753733
5	NC_016024	TGT	2	6	423	428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753733
6	NC_016024	GGC	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753733
7	NC_016024	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753733
8	NC_016024	TGC	2	6	692	697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753733
9	NC_016024	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753733
10	NC_016024	CAC	2	6	812	817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753733
11	NC_016024	GGA	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753733
12	NC_016024	GCC	2	6	885	890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753733
13	NC_016024	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753733
14	NC_016024	AGC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
15	NC_016024	GAA	3	9	1099	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753733
16	NC_016024	GTC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753733
17	NC_016024	AAC	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753733
18	NC_016024	AGC	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753733
19	NC_016024	CAA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753733
20	NC_016024	TCA	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753733
21	NC_016024	GCC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
22	NC_016024	GCA	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
23	NC_016024	CTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
24	NC_016024	CAC	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753734
25	NC_016024	GCC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
26	NC_016024	GGT	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
27	NC_016024	ATG	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
28	NC_016024	GCA	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
29	NC_016024	GTG	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
30	NC_016024	CGG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
31	NC_016024	TGA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
32	NC_016024	CAG	2	6	2410	2415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
33	NC_016024	GCC	2	6	2419	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
34	NC_016024	GAT	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
35	NC_016024	CGG	2	6	2501	2506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
36	NC_016024	CTT	2	6	2563	2568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753734
37	NC_016024	CGA	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
38	NC_016024	CCT	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753734
39	NC_016024	GGT	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
40	NC_016024	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
41	NC_016024	TCG	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
42	NC_016024	CCA	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753734
43	NC_016024	CGT	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753734
44	NC_016024	ACG	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753734
45	NC_016024	GGT	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753734
46	NC_016024	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753734
47	NC_016024	ATG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753734
48	NC_016024	CGC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753734
49	NC_016024	AGG	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753734
50	NC_016024	GCC	2	6	3789	3794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
51	NC_016024	CGC	2	6	3819	3824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
52	NC_016024	GCC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753735
53	NC_016024	CAT	3	9	3905	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
54	NC_016024	GCT	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
55	NC_016024	GCG	2	6	4087	4092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
56	NC_016024	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
57	NC_016024	TCA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
58	NC_016024	CTG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
59	NC_016024	TCG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
60	NC_016024	GCG	2	6	4306	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753735
61	NC_016024	TCA	2	6	4333	4338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753735
62	NC_016024	TCG	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753735
63	NC_016024	AGT	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753735
64	NC_016024	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753736
65	NC_016024	ATT	2	6	4662	4667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
66	NC_016024	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
67	NC_016024	CGG	2	6	4723	4728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
68	NC_016024	GAA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753736
69	NC_016024	CGG	2	6	4852	4857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
70	NC_016024	CAT	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
71	NC_016024	TGG	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753736
72	NC_016024	CAT	3	9	4964	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
73	NC_016024	CTG	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753736
74	NC_016024	TTG	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753736
75	NC_016024	GCG	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
76	NC_016024	GAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753736
77	NC_016024	GCC	2	6	5346	5351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753736
78	NC_016024	CGG	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753736
79	NC_016024	CTA	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753736
80	NC_016024	ATT	2	6	5457	5462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753736
81	NC_016024	CCA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753736
82	NC_016024	GTG	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753737
83	NC_016024	ATT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753737
84	NC_016024	TCC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753738
85	NC_016024	CGC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753738
86	NC_016024	GCT	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753738
87	NC_016024	CTT	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753738
88	NC_016024	CAG	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753738
89	NC_016024	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753738
90	NC_016024	CGC	2	6	6476	6481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753738
91	NC_016024	TGA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753738
92	NC_016024	TTG	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753738
93	NC_016024	CAT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753738
94	NC_016024	CGG	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753738
95	NC_016024	ACC	2	6	6813	6818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753738
96	NC_016024	CGT	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753738
97	NC_016024	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753738
98	NC_016024	CAG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753739
99	NC_016024	CGG	2	6	7220	7225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753739
100	NC_016024	GTA	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753739
101	NC_016024	GAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753739
102	NC_016024	GCC	2	6	7697	7702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753739
103	NC_016024	TGA	2	6	7732	7737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753739
104	NC_016024	CCG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753739
105	NC_016024	CAG	2	6	7847	7852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753739
106	NC_016024	GCG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753739
107	NC_016024	GGC	2	6	7977	7982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753739
108	NC_016024	CCA	2	6	7990	7995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753739
109	NC_016024	CCG	2	6	7997	8002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753739
110	NC_016024	CAT	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753739
111	NC_016024	GCC	2	6	8204	8209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753739
112	NC_016024	GTA	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753739
113	NC_016024	CCA	2	6	8353	8358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753739
114	NC_016024	CAC	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753739
115	NC_016024	CCG	2	6	8661	8666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753739
116	NC_016024	TTG	2	6	8783	8788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753740
117	NC_016024	GCC	2	6	8846	8851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753740
118	NC_016024	CAG	2	6	8869	8874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753740
119	NC_016024	TGC	3	9	8884	8892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753740
120	NC_016024	GGC	2	6	8906	8911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753740
121	NC_016024	GCC	2	6	8951	8956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753740
122	NC_016024	CTC	2	6	9025	9030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753740
123	NC_016024	ACG	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753740
124	NC_016024	CGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753740
125	NC_016024	CCG	2	6	9128	9133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753740
126	NC_016024	CGC	2	6	9327	9332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753741
127	NC_016024	GCG	2	6	9500	9505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753741
128	NC_016024	TGG	2	6	9548	9553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753741
129	NC_016024	ACC	2	6	9629	9634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753741
130	NC_016024	CCG	2	6	9696	9701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753741
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